MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021151	CTG	2	6	686430	686435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903194
12502	NC_021151	GGC	2	6	686657	686662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903195
12503	NC_021151	GCG	2	6	686725	686730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903195
12504	NC_021151	AGG	2	6	686833	686838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903195
12505	NC_021151	AACC	2	8	686870	686877	50 %	0 %	0 %	50 %	482903195
12506	NC_021151	CGCTG	2	10	686911	686920	0 %	20 %	40 %	40 %	482903195
12507	NC_021151	CG	3	6	686941	686946	0 %	0 %	50 %	50 %	482903195
12508	NC_021151	CAC	2	6	687008	687013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903195
12509	NC_021151	GGC	2	6	687066	687071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903195
12510	NC_021151	TATT	2	8	687072	687079	25 %	75 %	0 %	0 %	482903195
12511	NC_021151	TGC	2	6	687172	687177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12512	NC_021151	GGC	2	6	687194	687199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903195
12513	NC_021151	AGGA	2	8	687235	687242	50 %	0 %	50 %	0 %	482903195
12514	NC_021151	TAA	2	6	687248	687253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903195
12515	NC_021151	GCT	2	6	687269	687274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12516	NC_021151	CGAC	2	8	687279	687286	25 %	0 %	25 %	50 %	482903195
12517	NC_021151	CGCC	2	8	687397	687404	0 %	0 %	25 %	75 %	482903195
12518	NC_021151	GC	3	6	687424	687429	0 %	0 %	50 %	50 %	482903195
12519	NC_021151	CCA	2	6	687436	687441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903195
12520	NC_021151	TGC	2	6	687457	687462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12521	NC_021151	CAG	2	6	687483	687488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12522	NC_021151	CGG	2	6	687542	687547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903195
12523	NC_021151	TTG	2	6	687564	687569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903195
12524	NC_021151	TGC	2	6	687595	687600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12525	NC_021151	TTC	2	6	687643	687648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903195
12526	NC_021151	GC	3	6	687782	687787	0 %	0 %	50 %	50 %	482903195
12527	NC_021151	TGC	2	6	687808	687813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12528	NC_021151	CAG	2	6	687834	687839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12529	NC_021151	TTG	2	6	687966	687971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903195
12530	NC_021151	GCGCT	2	10	688018	688027	0 %	20 %	40 %	40 %	482903195
12531	NC_021151	TGC	2	6	688048	688053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903195
12532	NC_021151	GGCG	2	8	688094	688101	0 %	0 %	75 %	25 %	482903195
12533	NC_021151	ACC	2	6	688218	688223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903195
12534	NC_021151	GGGCG	2	10	688278	688287	0 %	0 %	80 %	20 %	482903195
12535	NC_021151	GGT	2	6	688334	688339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903195
12536	NC_021151	GAT	3	9	688396	688404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903195
12537	NC_021151	CGG	2	6	688406	688411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903196
12538	NC_021151	T	6	6	688482	688487	0 %	100 %	0 %	0 %	482903196
12539	NC_021151	ATG	2	6	688565	688570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903196
12540	NC_021151	GTT	2	6	688600	688605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903196
12541	NC_021151	GGC	2	6	688704	688709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903196
12542	NC_021151	CGT	2	6	688750	688755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903196
12543	NC_021151	CAG	2	6	688774	688779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903196
12544	NC_021151	TGG	2	6	688811	688816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903196
12545	NC_021151	A	6	6	688901	688906	100 %	0 %	0 %	0 %	482903196
12546	NC_021151	A	6	6	688946	688951	100 %	0 %	0 %	0 %	482903196
12547	NC_021151	AAC	2	6	688977	688982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903196
12548	NC_021151	AAT	2	6	688995	689000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903196
12549	NC_021151	GTG	2	6	689141	689146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903197
12550	NC_021151	AT	3	6	689191	689196	50 %	50 %	0 %	0 %	482903197
12551	NC_021151	AAT	2	6	689448	689453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903198
12552	NC_021151	CAG	2	6	689500	689505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903198
12553	NC_021151	GCCC	2	8	689533	689540	0 %	0 %	25 %	75 %	482903198
12554	NC_021151	CG	3	6	689569	689574	0 %	0 %	50 %	50 %	482903198
12555	NC_021151	CTG	2	6	689579	689584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903198
12556	NC_021151	CG	3	6	689590	689595	0 %	0 %	50 %	50 %	482903198
12557	NC_021151	AAG	2	6	689693	689698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903198
12558	NC_021151	CG	3	6	689726	689731	0 %	0 %	50 %	50 %	482903198
12559	NC_021151	TGG	3	9	689762	689770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903198
12560	NC_021151	GAC	2	6	689817	689822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903198
12561	NC_021151	GC	3	6	689832	689837	0 %	0 %	50 %	50 %	482903198
12562	NC_021151	GTA	2	6	689889	689894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903198
12563	NC_021151	CAT	2	6	689947	689952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903198
12564	NC_021151	CGG	2	6	689955	689960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903198
12565	NC_021151	TCA	2	6	690002	690007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903198
12566	NC_021151	CA	4	8	690048	690055	50 %	0 %	0 %	50 %	482903198
12567	NC_021151	TTG	2	6	690078	690083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903198
12568	NC_021151	CATT	2	8	690105	690112	25 %	50 %	0 %	25 %	482903198
12569	NC_021151	GTC	2	6	690170	690175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903198
12570	NC_021151	CGCAG	2	10	690185	690194	20 %	0 %	40 %	40 %	482903198
12571	NC_021151	CCAC	2	8	690246	690253	25 %	0 %	0 %	75 %	482903198
12572	NC_021151	AG	3	6	690260	690265	50 %	0 %	50 %	0 %	482903198
12573	NC_021151	AGCGA	2	10	690552	690561	40 %	0 %	40 %	20 %	482903199
12574	NC_021151	T	6	6	690587	690592	0 %	100 %	0 %	0 %	482903199
12575	NC_021151	GGT	2	6	690614	690619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903199
12576	NC_021151	CCAG	2	8	690724	690731	25 %	0 %	25 %	50 %	482903199
12577	NC_021151	GA	3	6	690747	690752	50 %	0 %	50 %	0 %	482903199
12578	NC_021151	TAA	2	6	690763	690768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903199
12579	NC_021151	TTG	2	6	690774	690779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903199
12580	NC_021151	AAT	2	6	690824	690829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903199
12581	NC_021151	TCA	2	6	690856	690861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903199
12582	NC_021151	CGG	2	6	690862	690867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903199
12583	NC_021151	TGC	2	6	690886	690891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903199
12584	NC_021151	GGC	2	6	691211	691216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903199
12585	NC_021151	TTC	2	6	691460	691465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903200
12586	NC_021151	TCA	2	6	691511	691516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903200
12587	NC_021151	GT	3	6	691527	691532	0 %	50 %	50 %	0 %	482903200
12588	NC_021151	TGA	2	6	691636	691641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903200
12589	NC_021151	ACT	2	6	691752	691757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903200
12590	NC_021151	TTG	2	6	691815	691820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903200
12591	NC_021151	TAA	2	6	692007	692012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903200
12592	NC_021151	ATG	2	6	692032	692037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903200
12593	NC_021151	CTA	2	6	692051	692056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903200
12594	NC_021151	TCC	2	6	692167	692172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903201
12595	NC_021151	GAT	2	6	692178	692183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903201
12596	NC_021151	TG	3	6	692268	692273	0 %	50 %	50 %	0 %	482903201
12597	NC_021151	T	6	6	692288	692293	0 %	100 %	0 %	0 %	482903201
12598	NC_021151	CAGC	2	8	692321	692328	25 %	0 %	25 %	50 %	482903201
12599	NC_021151	ATC	2	6	692370	692375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903201
12600	NC_021151	AGC	2	6	692393	692398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903201
12601	NC_021151	TGTAA	2	10	692496	692505	40 %	40 %	20 %	0 %	482903201
12602	NC_021151	TGA	2	6	692506	692511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903201
12603	NC_021151	T	8	8	692518	692525	0 %	100 %	0 %	0 %	482903201
12604	NC_021151	TCT	2	6	692539	692544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903201
12605	NC_021151	CGCTA	2	10	692547	692556	20 %	20 %	20 %	40 %	482903201
12606	NC_021151	ATT	2	6	692592	692597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903201
12607	NC_021151	TCA	2	6	692602	692607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903201
12608	NC_021151	GCT	2	6	692678	692683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903201
12609	NC_021151	TAC	2	6	692708	692713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903201
12610	NC_021151	GGC	2	6	692715	692720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903201
12611	NC_021151	GAT	2	6	692760	692765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903201
12612	NC_021151	CAT	2	6	692783	692788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903201
12613	NC_021151	GGT	2	6	692815	692820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903201
12614	NC_021151	ATT	2	6	692826	692831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903201
12615	NC_021151	TGG	2	6	692932	692937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903201
12616	NC_021151	GGT	2	6	692938	692943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903201
12617	NC_021151	GCAG	2	8	692978	692985	25 %	0 %	50 %	25 %	482903201
12618	NC_021151	GGC	2	6	693019	693024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903201
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12981	NC_021151	CG	3	6	712291	712296	0 %	0 %	50 %	50 %	482903225
12982	NC_021151	CAG	2	6	712337	712342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903225
12983	NC_021151	ATT	2	6	712352	712357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903225
12984	NC_021151	CAG	2	6	712364	712369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903225
12985	NC_021151	CG	3	6	712380	712385	0 %	0 %	50 %	50 %	482903225
12986	NC_021151	TTG	2	6	712451	712456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903225
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12989	NC_021151	CAG	2	6	712538	712543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903225
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12993	NC_021151	A	6	6	712602	712607	100 %	0 %	0 %	0 %	482903225
12994	NC_021151	TGCCA	2	10	712660	712669	20 %	20 %	20 %	40 %	482903226
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13000	NC_021151	GCA	2	6	712764	712769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903226

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