MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_021151	ATG	2	6	658822	658827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903171
12002	NC_021151	TAA	2	6	658900	658905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
12003	NC_021151	TAA	2	6	658917	658922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
12004	NC_021151	AGGA	2	8	658943	658950	50 %	0 %	50 %	0 %	482903171
12005	NC_021151	TAA	2	6	658978	658983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
12006	NC_021151	ATA	2	6	658988	658993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
12007	NC_021151	CAA	2	6	658999	659004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903171
12008	NC_021151	A	6	6	659102	659107	100 %	0 %	0 %	0 %	482903171
12009	NC_021151	A	7	7	659180	659186	100 %	0 %	0 %	0 %	482903171
12010	NC_021151	GGT	2	6	659197	659202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903171
12011	NC_021151	TCA	2	6	659358	659363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903171
12012	NC_021151	CCATG	2	10	659373	659382	20 %	20 %	20 %	40 %	482903171
12013	NC_021151	GCA	2	6	659614	659619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903172
12014	NC_021151	AGA	2	6	659676	659681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903172
12015	NC_021151	TAT	2	6	659705	659710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903172
12016	NC_021151	TTAT	2	8	659722	659729	25 %	75 %	0 %	0 %	482903172
12017	NC_021151	CAA	2	6	659735	659740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903172
12018	NC_021151	TCG	2	6	659751	659756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903172
12019	NC_021151	GA	3	6	659801	659806	50 %	0 %	50 %	0 %	482903172
12020	NC_021151	ATT	2	6	659847	659852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903172
12021	NC_021151	TTC	2	6	659877	659882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903172
12022	NC_021151	TCA	2	6	659930	659935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903172
12023	NC_021151	TTG	2	6	660404	660409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903173
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12025	NC_021151	TCG	2	6	660456	660461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903173
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12033	NC_021151	ACC	2	6	660854	660859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903173
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12036	NC_021151	CGC	2	6	660912	660917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903173
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12040	NC_021151	CAT	2	6	661018	661023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903173
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12043	NC_021151	CAG	2	6	661120	661125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903173
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12045	NC_021151	ATT	2	6	661168	661173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903173
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12049	NC_021151	AGCG	2	8	661319	661326	25 %	0 %	50 %	25 %	482903173
12050	NC_021151	T	6	6	661341	661346	0 %	100 %	0 %	0 %	482903173
12051	NC_021151	ATG	2	6	661445	661450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903173
12052	NC_021151	AGC	2	6	661469	661474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903173
12053	NC_021151	CGT	2	6	661806	661811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903174
12054	NC_021151	T	6	6	661827	661832	0 %	100 %	0 %	0 %	482903174
12055	NC_021151	AGC	2	6	661844	661849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903174
12056	NC_021151	CTT	2	6	661924	661929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903174
12057	NC_021151	TGT	2	6	661938	661943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903174
12058	NC_021151	CTT	2	6	661972	661977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903174
12059	NC_021151	GGC	2	6	661986	661991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903174
12060	NC_021151	GGC	2	6	662029	662034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903174
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12062	NC_021151	ATT	2	6	662104	662109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903174
12063	NC_021151	T	7	7	662196	662202	0 %	100 %	0 %	0 %	482903174
12064	NC_021151	CCA	2	6	662216	662221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903174
12065	NC_021151	TTG	2	6	662326	662331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903174
12066	NC_021151	G	6	6	662331	662336	0 %	0 %	100 %	0 %	482903174
12067	NC_021151	ACG	3	9	662395	662403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903174
12068	NC_021151	CCTG	2	8	662435	662442	0 %	25 %	25 %	50 %	482903174
12069	NC_021151	ATGAC	2	10	662525	662534	40 %	20 %	20 %	20 %	482903174
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12072	NC_021151	GC	4	8	662698	662705	0 %	0 %	50 %	50 %	482903174
12073	NC_021151	CG	3	6	662745	662750	0 %	0 %	50 %	50 %	482903174
12074	NC_021151	A	6	6	662983	662988	100 %	0 %	0 %	0 %	482903174
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12084	NC_021151	GAT	2	6	663420	663425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903174
12085	NC_021151	GGCGC	2	10	663491	663500	0 %	0 %	60 %	40 %	482903174
12086	NC_021151	GGGC	2	8	663601	663608	0 %	0 %	75 %	25 %	482903174
12087	NC_021151	ACGC	2	8	663702	663709	25 %	0 %	25 %	50 %	482903174
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12091	NC_021151	T	6	6	663970	663975	0 %	100 %	0 %	0 %	482903174
12092	NC_021151	AACC	2	8	663979	663986	50 %	0 %	0 %	50 %	482903174
12093	NC_021151	GGT	2	6	663987	663992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903174
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12102	NC_021151	CGC	2	6	664338	664343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903174
12103	NC_021151	TGG	2	6	664358	664363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903174
12104	NC_021151	CGA	2	6	664395	664400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903174
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12106	NC_021151	TGGC	2	8	664459	664466	0 %	25 %	50 %	25 %	482903174
12107	NC_021151	AAAT	2	8	664472	664479	75 %	25 %	0 %	0 %	482903174
12108	NC_021151	GCG	2	6	664502	664507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903174
12109	NC_021151	T	6	6	664519	664524	0 %	100 %	0 %	0 %	482903174
12110	NC_021151	GC	3	6	664556	664561	0 %	0 %	50 %	50 %	482903174
12111	NC_021151	GCC	2	6	664573	664578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903174
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12114	NC_021151	GGGAA	2	10	664876	664885	40 %	0 %	60 %	0 %	482903175
12115	NC_021151	ATC	2	6	664957	664962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903175
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12118	NC_021151	TGA	2	6	665186	665191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903175
12119	NC_021151	TTC	2	6	665210	665215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903175
12120	NC_021151	TAC	2	6	665222	665227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903175
12121	NC_021151	TG	3	6	665234	665239	0 %	50 %	50 %	0 %	482903175
12122	NC_021151	ACCCA	2	10	665355	665364	40 %	0 %	0 %	60 %	482903176
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12143	NC_021151	CTT	2	6	666729	666734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903177
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12231	NC_021151	TGG	2	6	672050	672055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903182
12232	NC_021151	CGGCAT	2	12	672150	672161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482903182
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12236	NC_021151	GGC	2	6	672301	672306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903182
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12239	NC_021151	ACG	2	6	672491	672496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903182
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12480	NC_021151	A	6	6	685619	685624	100 %	0 %	0 %	0 %	482903193
12481	NC_021151	CAGC	2	8	685646	685653	25 %	0 %	25 %	50 %	482903193
12482	NC_021151	CTT	2	6	685678	685683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903193
12483	NC_021151	ATG	2	6	685686	685691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903193
12484	NC_021151	CCT	2	6	685711	685716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903194
12485	NC_021151	CGT	2	6	685762	685767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903194
12486	NC_021151	TGA	2	6	685839	685844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903194
12487	NC_021151	TGG	2	6	685849	685854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903194
12488	NC_021151	AAT	2	6	685886	685891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903194
12489	NC_021151	CG	3	6	685893	685898	0 %	0 %	50 %	50 %	482903194
12490	NC_021151	CCG	2	6	685899	685904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903194
12491	NC_021151	TGAT	2	8	685989	685996	25 %	50 %	25 %	0 %	482903194
12492	NC_021151	CGT	2	6	686005	686010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903194
12493	NC_021151	CCA	3	9	686059	686067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903194
12494	NC_021151	CA	3	6	686114	686119	50 %	0 %	0 %	50 %	482903194
12495	NC_021151	G	7	7	686120	686126	0 %	0 %	100 %	0 %	482903194
12496	NC_021151	CGT	2	6	686210	686215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903194
12497	NC_021151	GCG	2	6	686230	686235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903194
12498	NC_021151	CGC	2	6	686286	686291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903194
12499	NC_021151	CAGC	2	8	686365	686372	25 %	0 %	25 %	50 %	482903194
12500	NC_021151	GCT	2	6	686407	686412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903194

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