MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021151	CCG	2	6	631497	631502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903146
11502	NC_021151	TAT	2	6	631508	631513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903146
11503	NC_021151	TTG	2	6	631588	631593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903146
11504	NC_021151	GAG	2	6	631656	631661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903146
11505	NC_021151	CTT	2	6	631684	631689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903146
11506	NC_021151	TGC	2	6	631786	631791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903146
11507	NC_021151	TTC	2	6	631893	631898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903146
11508	NC_021151	TAAA	2	8	631928	631935	75 %	25 %	0 %	0 %	482903146
11509	NC_021151	TGGC	2	8	632029	632036	0 %	25 %	50 %	25 %	482903147
11510	NC_021151	CGG	2	6	632156	632161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903147
11511	NC_021151	GCG	2	6	632185	632190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903147
11512	NC_021151	GTC	2	6	632200	632205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11513	NC_021151	CCA	2	6	632227	632232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903147
11514	NC_021151	CGA	2	6	632333	632338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11515	NC_021151	CGG	2	6	632362	632367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903147
11516	NC_021151	GAC	2	6	632409	632414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11517	NC_021151	ATC	2	6	632463	632468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903147
11518	NC_021151	GC	3	6	632475	632480	0 %	0 %	50 %	50 %	482903147
11519	NC_021151	GGT	2	6	632606	632611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903147
11520	NC_021151	CGC	2	6	632638	632643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903147
11521	NC_021151	GGT	2	6	632693	632698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903147
11522	NC_021151	TGC	2	6	632716	632721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11523	NC_021151	ATGC	2	8	632739	632746	25 %	25 %	25 %	25 %	482903147
11524	NC_021151	CGT	2	6	632807	632812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11525	NC_021151	CTG	2	6	632814	632819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11526	NC_021151	AGCGA	2	10	632826	632835	40 %	0 %	40 %	20 %	482903147
11527	NC_021151	GGC	2	6	632901	632906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903147
11528	NC_021151	TGC	2	6	632941	632946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11529	NC_021151	CGC	2	6	632991	632996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903147
11530	NC_021151	GC	3	6	633071	633076	0 %	0 %	50 %	50 %	482903147
11531	NC_021151	CTT	2	6	633087	633092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903147
11532	NC_021151	CCA	2	6	633160	633165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903147
11533	NC_021151	CAT	2	6	633204	633209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903147
11534	NC_021151	CGT	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11535	NC_021151	GAA	2	6	633321	633326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903147
11536	NC_021151	TGG	2	6	633331	633336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903147
11537	NC_021151	ACA	2	6	633509	633514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903147
11538	NC_021151	CATC	2	8	633518	633525	25 %	25 %	0 %	50 %	482903147
11539	NC_021151	GCT	3	9	633539	633547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11540	NC_021151	GTCT	2	8	633583	633590	0 %	50 %	25 %	25 %	482903147
11541	NC_021151	TTG	2	6	633603	633608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903147
11542	NC_021151	GGT	2	6	633614	633619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903147
11543	NC_021151	CAG	2	6	633636	633641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903147
11544	NC_021151	GCTG	2	8	633722	633729	0 %	25 %	50 %	25 %	482903147
11545	NC_021151	ATG	2	6	633751	633756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903147
11546	NC_021151	GCG	2	6	633897	633902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903147
11547	NC_021151	GTT	2	6	633939	633944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903147
11548	NC_021151	TGGAA	2	10	634000	634009	40 %	20 %	40 %	0 %	482903147
11549	NC_021151	GTT	3	9	634083	634091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903147
11550	NC_021151	GAA	2	6	634257	634262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903147
11551	NC_021151	GAG	2	6	634263	634268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903147
11552	NC_021151	CAT	2	6	634321	634326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903147
11553	NC_021151	CGT	2	6	634444	634449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903148
11554	NC_021151	CT	3	6	634477	634482	0 %	50 %	0 %	50 %	482903148
11555	NC_021151	GTG	2	6	634573	634578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903148
11556	NC_021151	AGA	2	6	634632	634637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903148
11557	NC_021151	CAA	2	6	634862	634867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903149
11558	NC_021151	CGA	2	6	634871	634876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11559	NC_021151	CTG	2	6	634904	634909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11560	NC_021151	G	6	6	634983	634988	0 %	0 %	100 %	0 %	482903149
11561	NC_021151	GCGCT	2	10	635043	635052	0 %	20 %	40 %	40 %	482903149
11562	NC_021151	GCC	2	6	635150	635155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903149
11563	NC_021151	GGGGCA	2	12	635164	635175	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	482903149
11564	NC_021151	GC	3	6	635214	635219	0 %	0 %	50 %	50 %	482903149
11565	NC_021151	ATT	2	6	635222	635227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903149
11566	NC_021151	CTG	2	6	635237	635242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11567	NC_021151	GC	3	6	635249	635254	0 %	0 %	50 %	50 %	482903149
11568	NC_021151	TC	3	6	635260	635265	0 %	50 %	0 %	50 %	482903149
11569	NC_021151	TTG	3	9	635276	635284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903149
11570	NC_021151	GC	3	6	635313	635318	0 %	0 %	50 %	50 %	482903149
11571	NC_021151	TGA	2	6	635319	635324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903149
11572	NC_021151	CTAT	2	8	635331	635338	25 %	50 %	0 %	25 %	482903149
11573	NC_021151	GAT	2	6	635377	635382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903149
11574	NC_021151	GGA	2	6	635384	635389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903149
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11576	NC_021151	GCA	2	6	635407	635412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11577	NC_021151	GTC	2	6	635549	635554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11578	NC_021151	TGG	2	6	635568	635573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903149
11579	NC_021151	GC	3	6	635679	635684	0 %	0 %	50 %	50 %	482903149
11580	NC_021151	ACTGGC	2	12	635728	635739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482903149
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11582	NC_021151	GCT	2	6	635800	635805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903149
11583	NC_021151	CG	3	6	635815	635820	0 %	0 %	50 %	50 %	482903149
11584	NC_021151	CTT	2	6	635928	635933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903150
11585	NC_021151	ACG	2	6	635946	635951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903150
11586	NC_021151	TGC	2	6	635995	636000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903150
11587	NC_021151	CGC	2	6	636034	636039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903150
11588	NC_021151	CG	3	6	636221	636226	0 %	0 %	50 %	50 %	482903150
11589	NC_021151	GAT	2	6	636336	636341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903150
11590	NC_021151	GGT	2	6	636386	636391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903150
11591	NC_021151	AAT	2	6	636463	636468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903150
11592	NC_021151	GA	3	6	636543	636548	50 %	0 %	50 %	0 %	482903151
11593	NC_021151	CCG	2	6	636716	636721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903151
11594	NC_021151	TGC	2	6	636877	636882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903151
11595	NC_021151	TAC	2	6	636888	636893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903151
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11598	NC_021151	GCT	2	6	636931	636936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903151
11599	NC_021151	TGA	2	6	636937	636942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903151
11600	NC_021151	CAA	2	6	636968	636973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903151
11601	NC_021151	CAT	2	6	636995	637000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903151
11602	NC_021151	CAGG	2	8	637007	637014	25 %	0 %	50 %	25 %	482903151
11603	NC_021151	TGA	2	6	637026	637031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903151
11604	NC_021151	GCC	2	6	637110	637115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903151
11605	NC_021151	CGA	2	6	637169	637174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903151
11606	NC_021151	CTT	2	6	637305	637310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903152
11607	NC_021151	CGG	2	6	637448	637453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903152
11608	NC_021151	TGC	2	6	637582	637587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903152
11609	NC_021151	AAT	2	6	637656	637661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903152
11610	NC_021151	A	6	6	637727	637732	100 %	0 %	0 %	0 %	482903152
11611	NC_021151	GGCA	2	8	637738	637745	25 %	0 %	50 %	25 %	482903152
11612	NC_021151	TGA	2	6	638085	638090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903153
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11617	NC_021151	CTGT	2	8	638244	638251	0 %	50 %	25 %	25 %	482903153
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11619	NC_021151	GTT	2	6	638268	638273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903153
11620	NC_021151	T	6	6	638290	638295	0 %	100 %	0 %	0 %	482903153
11621	NC_021151	TTA	4	12	638347	638358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903153
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11623	NC_021151	GC	3	6	638383	638388	0 %	0 %	50 %	50 %	482903153
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11979	NC_021151	ATC	2	6	657554	657559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903170
11980	NC_021151	GAA	2	6	657583	657588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903170
11981	NC_021151	AT	3	6	657596	657601	50 %	50 %	0 %	0 %	482903170
11982	NC_021151	TAT	2	6	657619	657624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903170
11983	NC_021151	GAC	2	6	657678	657683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903170
11984	NC_021151	TAA	2	6	657771	657776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903170
11985	NC_021151	AAAT	2	8	657803	657810	75 %	25 %	0 %	0 %	482903170
11986	NC_021151	CAGC	2	8	657819	657826	25 %	0 %	25 %	50 %	482903170
11987	NC_021151	GCT	2	6	658241	658246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903171
11988	NC_021151	TGT	2	6	658256	658261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903171
11989	NC_021151	GAG	2	6	658297	658302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903171
11990	NC_021151	GCG	2	6	658313	658318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903171
11991	NC_021151	ATA	2	6	658337	658342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
11992	NC_021151	TAA	2	6	658415	658420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
11993	NC_021151	TAC	2	6	658483	658488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903171
11994	NC_021151	CGG	2	6	658494	658499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903171
11995	NC_021151	GCAG	2	8	658551	658558	25 %	0 %	50 %	25 %	482903171
11996	NC_021151	AAT	2	6	658601	658606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
11997	NC_021151	TAA	2	6	658644	658649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903171
11998	NC_021151	CGA	2	6	658719	658724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903171
11999	NC_021151	GCCA	2	8	658739	658746	25 %	0 %	25 %	50 %	482903171
12000	NC_021151	GATAA	2	10	658753	658762	60 %	20 %	20 %	0 %	482903171

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