MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021151	CAT	2	6	602985	602990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903117
11002	NC_021151	TCA	2	6	603083	603088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903117
11003	NC_021151	CGG	2	6	603095	603100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903117
11004	NC_021151	GC	3	6	603133	603138	0 %	0 %	50 %	50 %	482903117
11005	NC_021151	CGC	3	9	603262	603270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903117
11006	NC_021151	GTG	2	6	603282	603287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903117
11007	NC_021151	GAG	2	6	603381	603386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903117
11008	NC_021151	GTGACG	2	12	603399	603410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482903117
11009	NC_021151	ACTG	2	8	603838	603845	25 %	25 %	25 %	25 %	482903118
11010	NC_021151	TTG	2	6	603852	603857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903118
11011	NC_021151	TGC	2	6	603877	603882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903118
11012	NC_021151	ACC	2	6	603908	603913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903118
11013	NC_021151	ATG	2	6	603938	603943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903118
11014	NC_021151	ATG	2	6	603977	603982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903118
11015	NC_021151	ACCTGA	2	12	603990	604001	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482903118
11016	NC_021151	CAA	2	6	604016	604021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903118
11017	NC_021151	AGCGC	2	10	604039	604048	20 %	0 %	40 %	40 %	482903118
11018	NC_021151	GCT	2	6	604066	604071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903118
11019	NC_021151	CATG	2	8	604087	604094	25 %	25 %	25 %	25 %	482903118
11020	NC_021151	AAAGCC	2	12	604121	604132	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482903118
11021	NC_021151	AGCGC	2	10	604156	604165	20 %	0 %	40 %	40 %	482903118
11022	NC_021151	AAG	2	6	604284	604289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903118
11023	NC_021151	CTG	2	6	604299	604304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903118
11024	NC_021151	GGC	2	6	604507	604512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903119
11025	NC_021151	TTG	2	6	604550	604555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903119
11026	NC_021151	CT	3	6	604586	604591	0 %	50 %	0 %	50 %	482903119
11027	NC_021151	GAA	2	6	604659	604664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903119
11028	NC_021151	CAGCG	2	10	604701	604710	20 %	0 %	40 %	40 %	482903119
11029	NC_021151	CGAAA	2	10	604719	604728	60 %	0 %	20 %	20 %	482903119
11030	NC_021151	GC	3	6	604733	604738	0 %	0 %	50 %	50 %	482903119
11031	NC_021151	CAG	2	6	604762	604767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903119
11032	NC_021151	GCC	2	6	604817	604822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903119
11033	NC_021151	GCGG	2	8	604876	604883	0 %	0 %	75 %	25 %	482903119
11034	NC_021151	GA	3	6	604915	604920	50 %	0 %	50 %	0 %	482903119
11035	NC_021151	TGT	2	6	604964	604969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903119
11036	NC_021151	CAG	2	6	604990	604995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903119
11037	NC_021151	CCG	2	6	605035	605040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903119
11038	NC_021151	GCA	2	6	605049	605054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903119
11039	NC_021151	AT	3	6	605154	605159	50 %	50 %	0 %	0 %	482903119
11040	NC_021151	GCC	2	6	605225	605230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903119
11041	NC_021151	G	6	6	605247	605252	0 %	0 %	100 %	0 %	482903119
11042	NC_021151	GTC	2	6	605407	605412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903120
11043	NC_021151	TCA	2	6	605549	605554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903120
11044	NC_021151	GTC	2	6	605569	605574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903120
11045	NC_021151	CGG	2	6	605583	605588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903120
11046	NC_021151	T	6	6	605596	605601	0 %	100 %	0 %	0 %	482903120
11047	NC_021151	CCG	2	6	605687	605692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903120
11048	NC_021151	GAA	2	6	605707	605712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903120
11049	NC_021151	CCG	2	6	605727	605732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903120
11050	NC_021151	CAC	2	6	605746	605751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903120
11051	NC_021151	GCTCA	2	10	605830	605839	20 %	20 %	20 %	40 %	482903120
11052	NC_021151	TCA	2	6	605948	605953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903120
11053	NC_021151	TCT	2	6	606011	606016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903120
11054	NC_021151	CGC	2	6	606072	606077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903120
11055	NC_021151	GCG	2	6	606145	606150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903120
11056	NC_021151	TCT	2	6	606155	606160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903120
11057	NC_021151	TGC	2	6	606206	606211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903120
11058	NC_021151	GCG	2	6	606471	606476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903121
11059	NC_021151	TTG	2	6	606529	606534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903121
11060	NC_021151	A	6	6	606555	606560	100 %	0 %	0 %	0 %	482903121
11061	NC_021151	GC	3	6	606627	606632	0 %	0 %	50 %	50 %	482903121
11062	NC_021151	TTG	2	6	606688	606693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903121
11063	NC_021151	GAT	2	6	606699	606704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903121
11064	NC_021151	AAC	2	6	606778	606783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903121
11065	NC_021151	GC	3	6	607148	607153	0 %	0 %	50 %	50 %	482903122
11066	NC_021151	ATT	2	6	607182	607187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903122
11067	NC_021151	CGT	2	6	607235	607240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903122
11068	NC_021151	TTA	2	6	607242	607247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903122
11069	NC_021151	TTA	2	6	607287	607292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903122
11070	NC_021151	TGT	2	6	607324	607329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903122
11071	NC_021151	A	6	6	607380	607385	100 %	0 %	0 %	0 %	482903122
11072	NC_021151	GCC	2	6	607386	607391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903122
11073	NC_021151	AATT	2	8	607395	607402	50 %	50 %	0 %	0 %	482903122
11074	NC_021151	TCCT	2	8	607517	607524	0 %	50 %	0 %	50 %	482903123
11075	NC_021151	AGC	2	6	607544	607549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903123
11076	NC_021151	ATTA	2	8	607620	607627	50 %	50 %	0 %	0 %	482903123
11077	NC_021151	T	7	7	607660	607666	0 %	100 %	0 %	0 %	482903123
11078	NC_021151	CGG	2	6	607728	607733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903123
11079	NC_021151	T	6	6	607780	607785	0 %	100 %	0 %	0 %	482903123
11080	NC_021151	GCC	2	6	607828	607833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903123
11081	NC_021151	GGC	2	6	607848	607853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903123
11082	NC_021151	CTGG	2	8	607908	607915	0 %	25 %	50 %	25 %	482903123
11083	NC_021151	GTG	2	6	607916	607921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903123
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11085	NC_021151	TGG	2	6	607952	607957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903123
11086	NC_021151	TAT	2	6	608064	608069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11087	NC_021151	TC	3	6	608070	608075	0 %	50 %	0 %	50 %	482903123
11088	NC_021151	TAT	2	6	608076	608081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11089	NC_021151	ATT	2	6	608086	608091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11090	NC_021151	ATT	2	6	608131	608136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11091	NC_021151	CGC	2	6	608153	608158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903123
11092	NC_021151	GCT	2	6	608208	608213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903123
11093	NC_021151	CAT	2	6	608265	608270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903123
11094	NC_021151	CAG	2	6	608305	608310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903123
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11097	NC_021151	GCG	2	6	608402	608407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903123
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11099	NC_021151	CG	3	6	608449	608454	0 %	0 %	50 %	50 %	482903123
11100	NC_021151	ATT	2	6	608533	608538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11101	NC_021151	GGC	2	6	608586	608591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903123
11102	NC_021151	TGG	2	6	608600	608605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903123
11103	NC_021151	TAT	2	6	608619	608624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903123
11104	NC_021151	CCG	2	6	608626	608631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903123
11105	NC_021151	CGC	2	6	608700	608705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903123
11106	NC_021151	GTG	3	9	608761	608769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903123
11107	NC_021151	GAA	2	6	608800	608805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903123
11108	NC_021151	GAA	2	6	608809	608814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903123
11109	NC_021151	TGT	2	6	608909	608914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903124
11110	NC_021151	GAA	2	6	608943	608948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903124
11111	NC_021151	ATC	2	6	608964	608969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903124
11112	NC_021151	GC	3	6	608982	608987	0 %	0 %	50 %	50 %	482903124
11113	NC_021151	GC	3	6	609001	609006	0 %	0 %	50 %	50 %	482903124
11114	NC_021151	AAG	2	6	609019	609024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903124
11115	NC_021151	GGC	2	6	609035	609040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903124
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11117	NC_021151	AGTC	2	8	609137	609144	25 %	25 %	25 %	25 %	482903124
11118	NC_021151	TGA	2	6	609172	609177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903124
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11120	NC_021151	GAT	2	6	609249	609254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903125
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11126	NC_021151	GTTTT	2	10	609579	609588	0 %	80 %	20 %	0 %	482903125
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11152	NC_021151	GATT	2	8	610953	610960	25 %	50 %	25 %	0 %	482903126
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11228	NC_021151	ATCA	2	8	615474	615481	50 %	25 %	0 %	25 %	482903130
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11353	NC_021151	AAAG	2	8	622467	622474	75 %	0 %	25 %	0 %	482903138
11354	NC_021151	TGG	2	6	622501	622506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903138
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11357	NC_021151	GT	3	6	622653	622658	0 %	50 %	50 %	0 %	482903138
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11479	NC_021151	A	6	6	630147	630152	100 %	0 %	0 %	0 %	482903144
11480	NC_021151	TAAACG	2	12	630158	630169	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482903144
11481	NC_021151	TGCC	2	8	630225	630232	0 %	25 %	25 %	50 %	482903144
11482	NC_021151	GTG	2	6	630309	630314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903145
11483	NC_021151	CTA	2	6	630361	630366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903145
11484	NC_021151	CGT	2	6	630440	630445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903145
11485	NC_021151	GCA	3	9	630491	630499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903145
11486	NC_021151	TCA	2	6	630528	630533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903145
11487	NC_021151	A	6	6	630542	630547	100 %	0 %	0 %	0 %	482903145
11488	NC_021151	AGC	2	6	630634	630639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903145
11489	NC_021151	GCC	2	6	630987	630992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903146
11490	NC_021151	GAC	2	6	631076	631081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903146
11491	NC_021151	GCC	2	6	631094	631099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903146
11492	NC_021151	CGC	2	6	631133	631138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903146
11493	NC_021151	ACA	2	6	631151	631156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903146
11494	NC_021151	CG	3	6	631166	631171	0 %	0 %	50 %	50 %	482903146
11495	NC_021151	AGCGC	2	10	631188	631197	20 %	0 %	40 %	40 %	482903146
11496	NC_021151	GGT	2	6	631260	631265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903146
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11498	NC_021151	TCA	2	6	631391	631396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903146
11499	NC_021151	CTG	2	6	631443	631448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903146
11500	NC_021151	GCA	2	6	631490	631495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903146

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