MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021151	CGTT	2	8	540047	540054	0 %	50 %	25 %	25 %	482903050
10002	NC_021151	GAA	2	6	540212	540217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903050
10003	NC_021151	CGGTAT	2	12	540239	540250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482903050
10004	NC_021151	GAA	2	6	540264	540269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903050
10005	NC_021151	CG	3	6	540288	540293	0 %	0 %	50 %	50 %	482903050
10006	NC_021151	GC	3	6	540402	540407	0 %	0 %	50 %	50 %	482903050
10007	NC_021151	CGG	2	6	540416	540421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903050
10008	NC_021151	CGG	2	6	540434	540439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903050
10009	NC_021151	CAA	2	6	540516	540521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903050
10010	NC_021151	CGG	2	6	540535	540540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903050
10011	NC_021151	ACG	2	6	540544	540549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903050
10012	NC_021151	GGC	2	6	540596	540601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903050
10013	NC_021151	CGGTAT	2	12	540611	540622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482903050
10014	NC_021151	CGA	2	6	540644	540649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903050
10015	NC_021151	GTT	2	6	540656	540661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903050
10016	NC_021151	ATT	2	6	540723	540728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903050
10017	NC_021151	GAT	2	6	540740	540745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903050
10018	NC_021151	GCT	2	6	540860	540865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903050
10019	NC_021151	TAA	2	6	540906	540911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903050
10020	NC_021151	A	7	7	541420	541426	100 %	0 %	0 %	0 %	482903051
10021	NC_021151	TGT	2	6	541472	541477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903051
10022	NC_021151	CTTT	2	8	541542	541549	0 %	75 %	0 %	25 %	482903051
10023	NC_021151	ATTC	2	8	541632	541639	25 %	50 %	0 %	25 %	482903051
10024	NC_021151	ATA	2	6	541662	541667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903051
10025	NC_021151	GTG	2	6	541702	541707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903051
10026	NC_021151	CT	3	6	541723	541728	0 %	50 %	0 %	50 %	482903051
10027	NC_021151	TGG	2	6	541741	541746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903051
10028	NC_021151	GCA	2	6	541785	541790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903051
10029	NC_021151	TC	4	8	541804	541811	0 %	50 %	0 %	50 %	482903051
10030	NC_021151	A	6	6	541814	541819	100 %	0 %	0 %	0 %	482903051
10031	NC_021151	TGC	2	6	542027	542032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903051
10032	NC_021151	T	6	6	542085	542090	0 %	100 %	0 %	0 %	482903051
10033	NC_021151	AAAC	2	8	542110	542117	75 %	0 %	0 %	25 %	482903051
10034	NC_021151	T	7	7	542225	542231	0 %	100 %	0 %	0 %	482903051
10035	NC_021151	TA	3	6	542322	542327	50 %	50 %	0 %	0 %	482903051
10036	NC_021151	ATGT	2	8	542347	542354	25 %	50 %	25 %	0 %	482903051
10037	NC_021151	ATA	2	6	542466	542471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903051
10038	NC_021151	T	8	8	542948	542955	0 %	100 %	0 %	0 %	482903052
10039	NC_021151	T	6	6	542960	542965	0 %	100 %	0 %	0 %	482903052
10040	NC_021151	A	8	8	542978	542985	100 %	0 %	0 %	0 %	482903052
10041	NC_021151	GAA	2	6	542987	542992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903052
10042	NC_021151	ATAA	2	8	542997	543004	75 %	25 %	0 %	0 %	482903052
10043	NC_021151	A	6	6	543015	543020	100 %	0 %	0 %	0 %	482903052
10044	NC_021151	ATT	2	6	543118	543123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903052
10045	NC_021151	A	6	6	543127	543132	100 %	0 %	0 %	0 %	482903052
10046	NC_021151	TTC	2	6	543133	543138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903052
10047	NC_021151	T	6	6	543465	543470	0 %	100 %	0 %	0 %	482903053
10048	NC_021151	CTG	2	6	543477	543482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903053
10049	NC_021151	GCT	2	6	543502	543507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903053
10050	NC_021151	T	6	6	543507	543512	0 %	100 %	0 %	0 %	482903053
10051	NC_021151	CAA	2	6	543545	543550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903053
10052	NC_021151	CTT	2	6	543569	543574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903053
10053	NC_021151	T	7	7	543573	543579	0 %	100 %	0 %	0 %	482903053
10054	NC_021151	ATG	2	6	543745	543750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903053
10055	NC_021151	CTT	2	6	543845	543850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903053
10056	NC_021151	CTC	2	6	543858	543863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903053
10057	NC_021151	C	7	7	543904	543910	0 %	0 %	0 %	100 %	482903053
10058	NC_021151	GTT	2	6	543918	543923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903053
10059	NC_021151	GAAT	3	12	543968	543979	50 %	25 %	25 %	0 %	482903053
10060	NC_021151	GAA	2	6	543990	543995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482903053
10061	NC_021151	AAT	2	6	544005	544010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903053
10062	NC_021151	ATTG	2	8	544084	544091	25 %	50 %	25 %	0 %	482903053
10063	NC_021151	T	6	6	544112	544117	0 %	100 %	0 %	0 %	482903053
10064	NC_021151	T	7	7	544135	544141	0 %	100 %	0 %	0 %	482903053
10065	NC_021151	TTCT	2	8	544802	544809	0 %	75 %	0 %	25 %	482903054
10066	NC_021151	GAT	2	6	544913	544918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903054
10067	NC_021151	CGA	2	6	544969	544974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903054
10068	NC_021151	CAACA	2	10	545214	545223	60 %	0 %	0 %	40 %	482903055
10069	NC_021151	AAT	2	6	545241	545246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903055
10070	NC_021151	ATC	2	6	545295	545300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903055
10071	NC_021151	CTT	2	6	545357	545362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903055
10072	NC_021151	TAA	2	6	545542	545547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903055
10073	NC_021151	TCG	2	6	545621	545626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903055
10074	NC_021151	AGAGG	2	10	545643	545652	40 %	0 %	60 %	0 %	482903055
10075	NC_021151	GGC	2	6	546123	546128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903056
10076	NC_021151	TGA	2	6	546254	546259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903056
10077	NC_021151	ACAA	2	8	546314	546321	75 %	0 %	0 %	25 %	482903056
10078	NC_021151	ATT	2	6	547533	547538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903057
10079	NC_021151	TTA	2	6	547552	547557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482903057
10080	NC_021151	AAAGT	2	10	547624	547633	60 %	20 %	20 %	0 %	482903057
10081	NC_021151	GACA	2	8	547731	547738	50 %	0 %	25 %	25 %	482903057
10082	NC_021151	TCG	3	9	547996	548004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903057
10083	NC_021151	GAAG	2	8	548016	548023	50 %	0 %	50 %	0 %	482903057
10084	NC_021151	GTTA	2	8	549317	549324	25 %	50 %	25 %	0 %	482903058
10085	NC_021151	ATC	2	6	549354	549359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903058
10086	NC_021151	CCA	2	6	549365	549370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482903058
10087	NC_021151	ATC	2	6	549469	549474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903058
10088	NC_021151	CTGA	2	8	549483	549490	25 %	25 %	25 %	25 %	482903058
10089	NC_021151	TA	3	6	549562	549567	50 %	50 %	0 %	0 %	482903058
10090	NC_021151	GCT	2	6	549589	549594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903058
10091	NC_021151	GGT	2	6	549600	549605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903058
10092	NC_021151	TCA	2	6	549656	549661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903058
10093	NC_021151	AGG	2	6	550057	550062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482903059
10094	NC_021151	TAA	2	6	550123	550128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903059
10095	NC_021151	TGG	2	6	550372	550377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903060
10096	NC_021151	ACG	2	6	550438	550443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903060
10097	NC_021151	ATTTT	2	10	550451	550460	20 %	80 %	0 %	0 %	482903060
10098	NC_021151	TCC	2	6	550474	550479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903060
10099	NC_021151	GCC	2	6	550486	550491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903060
10100	NC_021151	GGC	2	6	550496	550501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903060
10101	NC_021151	AACC	2	8	550542	550549	50 %	0 %	0 %	50 %	482903060
10102	NC_021151	TGG	2	6	550590	550595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903060
10103	NC_021151	ATG	2	6	550786	550791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903061
10104	NC_021151	CTGG	2	8	550967	550974	0 %	25 %	50 %	25 %	482903061
10105	NC_021151	TTGAAA	2	12	550988	550999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482903061
10106	NC_021151	GGC	2	6	551005	551010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903061
10107	NC_021151	AC	3	6	551031	551036	50 %	0 %	0 %	50 %	482903061
10108	NC_021151	AAT	2	6	551134	551139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903061
10109	NC_021151	TTG	2	6	551161	551166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903061
10110	NC_021151	A	7	7	551206	551212	100 %	0 %	0 %	0 %	482903061
10111	NC_021151	GAAG	2	8	551727	551734	50 %	0 %	50 %	0 %	482903062
10112	NC_021151	ATA	2	6	551770	551775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903062
10113	NC_021151	ACA	2	6	551781	551786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903062
10114	NC_021151	GGC	2	6	551798	551803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903062
10115	NC_021151	GAT	2	6	551964	551969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903062
10116	NC_021151	CG	3	6	551977	551982	0 %	0 %	50 %	50 %	482903062
10117	NC_021151	A	6	6	551990	551995	100 %	0 %	0 %	0 %	482903062
10118	NC_021151	CTG	2	6	552003	552008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903062
10119	NC_021151	GATC	2	8	552075	552082	25 %	25 %	25 %	25 %	482903062
10120	NC_021151	A	6	6	552176	552181	100 %	0 %	0 %	0 %	482903062
10121	NC_021151	TGT	2	6	552198	552203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903062
10122	NC_021151	CCT	2	6	552212	552217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482903062
10123	NC_021151	TCT	2	6	552255	552260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482903062
10124	NC_021151	TGT	2	6	552277	552282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482903062
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10237	NC_021151	GAC	2	6	559770	559775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903070
10238	NC_021151	AGCGA	2	10	559816	559825	40 %	0 %	40 %	20 %	482903070
10239	NC_021151	GCAATA	2	12	559858	559869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482903070
10240	NC_021151	AGC	2	6	559933	559938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903070
10241	NC_021151	GA	3	6	560099	560104	50 %	0 %	50 %	0 %	482903070
10242	NC_021151	CAGG	2	8	560123	560130	25 %	0 %	50 %	25 %	482903070
10243	NC_021151	A	6	6	560163	560168	100 %	0 %	0 %	0 %	482903070
10244	NC_021151	GCC	2	6	560219	560224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903070
10245	NC_021151	CAT	2	6	560231	560236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482903070
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10249	NC_021151	CGT	2	6	560346	560351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903070
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10263	NC_021151	GCG	2	6	561321	561326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482903072
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10267	NC_021151	ATCAT	2	10	561606	561615	40 %	40 %	0 %	20 %	482903072
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10270	NC_021151	CCTA	2	8	561698	561705	25 %	25 %	0 %	50 %	482903072
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10272	NC_021151	GAT	2	6	561865	561870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903073
10273	NC_021151	CTG	2	6	562016	562021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482903073
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10345	NC_021151	TGA	2	6	566846	566851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903080
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10347	NC_021151	GAT	2	6	566946	566951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482903080
10348	NC_021151	T	6	6	566970	566975	0 %	100 %	0 %	0 %	482903080
10349	NC_021151	TCAT	2	8	567019	567026	25 %	50 %	0 %	25 %	482903080
10350	NC_021151	GA	3	6	567032	567037	50 %	0 %	50 %	0 %	482903080
10351	NC_021151	ATA	2	6	567038	567043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903080
10352	NC_021151	GTCACG	2	12	567065	567076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482903081
10353	NC_021151	AAT	2	6	567077	567082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903081
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10355	NC_021151	ACG	2	6	567207	567212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482903081
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10357	NC_021151	GTG	2	6	567558	567563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482903082
10358	NC_021151	TA	3	6	567627	567632	50 %	50 %	0 %	0 %	482903082
10359	NC_021151	TCCCG	2	10	567642	567651	0 %	20 %	20 %	60 %	482903082
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10481	NC_021151	AAT	2	6	573712	573717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903092
10482	NC_021151	CCG	2	6	573744	573749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903092
10483	NC_021151	CAA	2	6	573756	573761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482903092
10484	NC_021151	AAT	2	6	573763	573768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482903092
10485	NC_021151	CGC	2	6	573780	573785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482903092
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