MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021151	ACG	2	6	25776	25781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
502	NC_021151	GC	3	6	25789	25794	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
503	NC_021151	GCCT	2	8	25818	25825	0 %	25 %	25 %	50 %	482902571
504	NC_021151	GGC	3	9	25886	25894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
505	NC_021151	GCC	2	6	25929	25934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
506	NC_021151	GCA	2	6	25955	25960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
507	NC_021151	GGC	2	6	25985	25990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
508	NC_021151	GGC	2	6	26103	26108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
509	NC_021151	ACT	2	6	26176	26181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
510	NC_021151	GCG	2	6	26200	26205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
511	NC_021151	AGCGAC	2	12	26214	26225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
512	NC_021151	GCA	2	6	26228	26233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
513	NC_021151	ATT	2	6	26312	26317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
514	NC_021151	CCTT	2	8	26324	26331	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
515	NC_021151	GAC	2	6	26355	26360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
516	NC_021151	CAT	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
517	NC_021151	GCC	2	6	26474	26479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
518	NC_021151	CCG	2	6	26512	26517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
519	NC_021151	GCG	2	6	26521	26526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
520	NC_021151	CCG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902571
521	NC_021151	GGC	2	6	26614	26619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
522	NC_021151	GCG	2	6	26628	26633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
523	NC_021151	TAG	2	6	26657	26662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
524	NC_021151	TCAG	2	8	26683	26690	25 %	25 %	25 %	25 %	482902571
525	NC_021151	GCG	2	6	26779	26784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
526	NC_021151	ATA	2	6	26848	26853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902571
527	NC_021151	GAT	2	6	26967	26972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
528	NC_021151	ATT	2	6	27049	27054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
529	NC_021151	TTA	2	6	27062	27067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
530	NC_021151	AGG	2	6	27072	27077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902571
531	NC_021151	ATCA	2	8	27096	27103	50 %	25 %	0 %	25 %	482902571
532	NC_021151	TTA	2	6	27130	27135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902571
533	NC_021151	CAGC	2	8	27140	27147	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
534	NC_021151	TGA	2	6	27164	27169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
535	NC_021151	TTG	2	6	27180	27185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902571
536	NC_021151	ACA	2	6	27235	27240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
537	NC_021151	TGA	2	6	27326	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
538	NC_021151	CTG	2	6	27423	27428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902571
539	NC_021151	ACA	2	6	27448	27453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
540	NC_021151	GCG	2	6	27490	27495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
541	NC_021151	CAG	2	6	27570	27575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902571
542	NC_021151	GGC	2	6	27594	27599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902571
543	NC_021151	TGG	2	6	27601	27606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902571
544	NC_021151	AGCC	2	8	27630	27637	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
545	NC_021151	CG	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
546	NC_021151	GGT	2	6	27734	27739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902571
547	NC_021151	ACA	2	6	27750	27755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
548	NC_021151	GAT	2	6	27798	27803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
549	NC_021151	TGA	2	6	27812	27817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902571
550	NC_021151	CCGA	2	8	27837	27844	25 %	0 %	25 %	50 %	482902571
551	NC_021151	GC	3	6	27847	27852	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
552	NC_021151	GC	3	6	27883	27888	0 %	0 %	50 %	50 %	482902571
553	NC_021151	ACGGTG	2	12	27939	27950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482902571
554	NC_021151	TTG	2	6	27973	27978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902571
555	NC_021151	GCGTC	2	10	28063	28072	0 %	20 %	40 %	40 %	482902571
556	NC_021151	ATC	2	6	28075	28080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902571
557	NC_021151	TC	3	6	28079	28084	0 %	50 %	0 %	50 %	482902571
558	NC_021151	TCC	2	6	28086	28091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902571
559	NC_021151	ACA	2	6	28109	28114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902571
560	NC_021151	CTG	2	6	28155	28160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902572
561	NC_021151	GT	3	6	28197	28202	0 %	50 %	50 %	0 %	482902572
562	NC_021151	ATTA	2	8	28230	28237	50 %	50 %	0 %	0 %	482902572
563	NC_021151	A	6	6	28297	28302	100 %	0 %	0 %	0 %	482902572
564	NC_021151	GT	3	6	28326	28331	0 %	50 %	50 %	0 %	482902572
565	NC_021151	CCG	2	6	28333	28338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902572
566	NC_021151	TTC	2	6	28466	28471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902572
567	NC_021151	GGCG	2	8	28472	28479	0 %	0 %	75 %	25 %	482902572
568	NC_021151	ATG	2	6	28516	28521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902572
569	NC_021151	TCG	2	6	28597	28602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902572
570	NC_021151	CCG	2	6	28651	28656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902572
571	NC_021151	A	6	6	28824	28829	100 %	0 %	0 %	0 %	482902572
572	NC_021151	ATG	2	6	28990	28995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902572
573	NC_021151	ACA	2	6	29070	29075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902572
574	NC_021151	GAC	2	6	29208	29213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902573
575	NC_021151	AAC	2	6	29336	29341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902573
576	NC_021151	ATG	2	6	29518	29523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902573
577	NC_021151	AAT	2	6	29544	29549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902573
578	NC_021151	GGT	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902573
579	NC_021151	CGG	2	6	29650	29655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902573
580	NC_021151	ATGA	2	8	29677	29684	50 %	25 %	25 %	0 %	482902573
581	NC_021151	TGC	2	6	29731	29736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902574
582	NC_021151	GGC	2	6	29738	29743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902574
583	NC_021151	CT	3	6	29811	29816	0 %	50 %	0 %	50 %	482902574
584	NC_021151	GCA	2	6	29929	29934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902574
585	NC_021151	GCG	2	6	29941	29946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902574
586	NC_021151	GCG	2	6	29967	29972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902574
587	NC_021151	AG	3	6	30080	30085	50 %	0 %	50 %	0 %	482902574
588	NC_021151	CG	3	6	30137	30142	0 %	0 %	50 %	50 %	482902574
589	NC_021151	GGC	2	6	30156	30161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902574
590	NC_021151	AT	3	6	30238	30243	50 %	50 %	0 %	0 %	482902575
591	NC_021151	TGCT	2	8	30247	30254	0 %	50 %	25 %	25 %	482902575
592	NC_021151	TATC	2	8	30303	30310	25 %	50 %	0 %	25 %	482902575
593	NC_021151	GTAA	2	8	30340	30347	50 %	25 %	25 %	0 %	482902575
594	NC_021151	TGG	2	6	30390	30395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902575
595	NC_021151	CGC	2	6	30446	30451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902575
596	NC_021151	ATT	2	6	30453	30458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902575
597	NC_021151	GC	3	6	30469	30474	0 %	0 %	50 %	50 %	482902575
598	NC_021151	GGT	2	6	30492	30497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902575
599	NC_021151	CCG	2	6	30518	30523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902575
600	NC_021151	CGC	2	6	30552	30557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902575
601	NC_021151	TTCG	2	8	30602	30609	0 %	50 %	25 %	25 %	482902575
602	NC_021151	GCA	2	6	30654	30659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902575
603	NC_021151	ATCTG	2	10	30671	30680	20 %	40 %	20 %	20 %	482902575
604	NC_021151	TTACG	2	10	30726	30735	20 %	40 %	20 %	20 %	482902575
605	NC_021151	TTA	2	6	30742	30747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902575
606	NC_021151	GC	3	6	30759	30764	0 %	0 %	50 %	50 %	482902575
607	NC_021151	TAT	2	6	30976	30981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902576
608	NC_021151	TAT	2	6	30983	30988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902576
609	NC_021151	CGC	2	6	31057	31062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902576
610	NC_021151	CGG	2	6	31095	31100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902576
611	NC_021151	GTCA	2	8	31112	31119	25 %	25 %	25 %	25 %	482902576
612	NC_021151	CGC	2	6	31180	31185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902576
613	NC_021151	CAG	2	6	31208	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902576
614	NC_021151	CAA	2	6	31220	31225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902576
615	NC_021151	AGC	2	6	31274	31279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902576
616	NC_021151	GCG	2	6	31310	31315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902576
617	NC_021151	GTG	2	6	31316	31321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902576
618	NC_021151	GTG	2	6	31345	31350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902576
619	NC_021151	T	6	6	31428	31433	0 %	100 %	0 %	0 %	482902576
620	NC_021151	GGC	2	6	31459	31464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902576
621	NC_021151	GGGCG	2	10	31495	31504	0 %	0 %	80 %	20 %	482902576
622	NC_021151	GCC	2	6	31616	31621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902576
623	NC_021151	AAG	2	6	31626	31631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902576
624	NC_021151	AGC	2	6	31637	31642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902576
625	NC_021151	ATG	2	6	31653	31658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902576
626	NC_021151	CTC	2	6	31661	31666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902576
627	NC_021151	GCA	2	6	31684	31689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902576
628	NC_021151	GTC	2	6	31718	31723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902576
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