MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021151	TGCG	2	8	430761	430768	0 %	25 %	50 %	25 %	482902937
8002	NC_021151	ATT	2	6	430913	430918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902938
8003	NC_021151	CATT	2	8	430934	430941	25 %	50 %	0 %	25 %	482902938
8004	NC_021151	AAG	2	6	430986	430991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902938
8005	NC_021151	TGG	2	6	431138	431143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902938
8006	NC_021151	TGAC	2	8	431200	431207	25 %	25 %	25 %	25 %	482902938
8007	NC_021151	AGTGAC	2	12	431363	431374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482902938
8008	NC_021151	ATA	2	6	431432	431437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902938
8009	NC_021151	TCG	2	6	431482	431487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902938
8010	NC_021151	ACT	2	6	431517	431522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902938
8011	NC_021151	TCA	2	6	431524	431529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902938
8012	NC_021151	CG	3	6	431639	431644	0 %	0 %	50 %	50 %	482902938
8013	NC_021151	AT	3	6	431692	431697	50 %	50 %	0 %	0 %	482902938
8014	NC_021151	T	6	6	431729	431734	0 %	100 %	0 %	0 %	482902938
8015	NC_021151	CGC	2	6	432157	432162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902939
8016	NC_021151	CAC	2	6	432167	432172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902939
8017	NC_021151	AGA	2	6	432199	432204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902939
8018	NC_021151	ATA	2	6	432252	432257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902939
8019	NC_021151	TAAC	2	8	432436	432443	50 %	25 %	0 %	25 %	482902939
8020	NC_021151	T	7	7	432475	432481	0 %	100 %	0 %	0 %	482902939
8021	NC_021151	GATA	2	8	432496	432503	50 %	25 %	25 %	0 %	482902939
8022	NC_021151	AAC	2	6	432514	432519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902939
8023	NC_021151	GCT	2	6	432536	432541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902939
8024	NC_021151	GCA	2	6	432558	432563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902939
8025	NC_021151	GCG	2	6	432573	432578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902939
8026	NC_021151	GCC	2	6	432635	432640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902939
8027	NC_021151	TAA	2	6	432659	432664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902939
8028	NC_021151	ATA	2	6	432680	432685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902939
8029	NC_021151	ACAA	2	8	432687	432694	75 %	0 %	0 %	25 %	482902939
8030	NC_021151	GCCGA	2	10	432696	432705	20 %	0 %	40 %	40 %	482902939
8031	NC_021151	A	6	6	432710	432715	100 %	0 %	0 %	0 %	482902939
8032	NC_021151	GTAA	2	8	432750	432757	50 %	25 %	25 %	0 %	482902939
8033	NC_021151	TTC	2	6	432762	432767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902939
8034	NC_021151	AGTC	2	8	432781	432788	25 %	25 %	25 %	25 %	482902939
8035	NC_021151	ATC	2	6	432855	432860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902939
8036	NC_021151	CTG	2	6	432926	432931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902939
8037	NC_021151	TCA	2	6	432948	432953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902939
8038	NC_021151	GCC	2	6	432956	432961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902939
8039	NC_021151	ACA	2	6	433186	433191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902939
8040	NC_021151	A	6	6	433277	433282	100 %	0 %	0 %	0 %	482902939
8041	NC_021151	A	6	6	433297	433302	100 %	0 %	0 %	0 %	482902939
8042	NC_021151	GTA	2	6	433404	433409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902939
8043	NC_021151	GCC	2	6	433428	433433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902939
8044	NC_021151	CCA	2	6	433449	433454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902939
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8046	NC_021151	CTG	2	6	433471	433476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902939
8047	NC_021151	T	6	6	433477	433482	0 %	100 %	0 %	0 %	482902939
8048	NC_021151	CAT	2	6	433511	433516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902939
8049	NC_021151	AGG	2	6	433521	433526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902939
8050	NC_021151	ATA	2	6	433534	433539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902939
8051	NC_021151	GCC	2	6	434013	434018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902940
8052	NC_021151	TTCA	2	8	434180	434187	25 %	50 %	0 %	25 %	482902940
8053	NC_021151	TATCAA	2	12	434245	434256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482902940
8054	NC_021151	ATA	2	6	434289	434294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902940
8055	NC_021151	CCTG	2	8	434301	434308	0 %	25 %	25 %	50 %	482902940
8056	NC_021151	AAT	2	6	434384	434389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902940
8057	NC_021151	CCG	2	6	434458	434463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902940
8058	NC_021151	ATG	2	6	435129	435134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902941
8059	NC_021151	CAC	2	6	435167	435172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902941
8060	NC_021151	ACG	2	6	435186	435191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902941
8061	NC_021151	ATA	2	6	435238	435243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902941
8062	NC_021151	TGG	2	6	435344	435349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902941
8063	NC_021151	ATG	2	6	435382	435387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902941
8064	NC_021151	TGG	2	6	435401	435406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482902941
8065	NC_021151	A	8	8	435414	435421	100 %	0 %	0 %	0 %	482902941
8066	NC_021151	TTA	2	6	435559	435564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902941
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8069	NC_021151	ATT	2	6	435658	435663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902941
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8072	NC_021151	T	7	7	435686	435692	0 %	100 %	0 %	0 %	482902941
8073	NC_021151	GAA	2	6	435734	435739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902941
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8081	NC_021151	AT	3	6	436106	436111	50 %	50 %	0 %	0 %	482902941
8082	NC_021151	AAC	2	6	436123	436128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902941
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8087	NC_021151	AAT	2	6	436255	436260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902941
8088	NC_021151	CAA	2	6	436313	436318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902942
8089	NC_021151	TCT	2	6	436322	436327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902942
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8091	NC_021151	TAA	2	6	436415	436420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902942
8092	NC_021151	GAG	2	6	436492	436497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902942
8093	NC_021151	TCG	2	6	436531	436536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902942
8094	NC_021151	TTATAA	2	12	436562	436573	50 %	50 %	0 %	0 %	482902942
8095	NC_021151	TTTTG	2	10	436586	436595	0 %	80 %	20 %	0 %	482902942
8096	NC_021151	TGA	3	9	436736	436744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902942
8097	NC_021151	TA	3	6	436767	436772	50 %	50 %	0 %	0 %	482902942
8098	NC_021151	TGA	2	6	436784	436789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902942
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8100	NC_021151	AAATT	2	10	436831	436840	60 %	40 %	0 %	0 %	482902942
8101	NC_021151	A	7	7	436848	436854	100 %	0 %	0 %	0 %	482902942
8102	NC_021151	ATA	2	6	436942	436947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902942
8103	NC_021151	GA	3	6	436953	436958	50 %	0 %	50 %	0 %	482902942
8104	NC_021151	TTC	2	6	437292	437297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902943
8105	NC_021151	A	7	7	437326	437332	100 %	0 %	0 %	0 %	482902943
8106	NC_021151	CTG	2	6	437502	437507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902943
8107	NC_021151	TGA	2	6	437533	437538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902943
8108	NC_021151	AGCG	2	8	437705	437712	25 %	0 %	50 %	25 %	482902943
8109	NC_021151	CAT	2	6	437744	437749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902943
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8112	NC_021151	T	7	7	437801	437807	0 %	100 %	0 %	0 %	482902943
8113	NC_021151	GAA	2	6	437874	437879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902943
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8115	NC_021151	GTTCT	2	10	437994	438003	0 %	60 %	20 %	20 %	482902943
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8122	NC_021151	ACT	2	6	438322	438327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902943
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8487	NC_021151	A	6	6	457666	457671	100 %	0 %	0 %	0 %	482902965
8488	NC_021151	CAGCC	2	10	457672	457681	20 %	0 %	20 %	60 %	482902965
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