MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
78001	NC_021151	GGT	2	6	4212525	4212530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906558
78002	NC_021151	TGC	2	6	4212565	4212570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78003	NC_021151	TGG	2	6	4212571	4212576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906558
78004	NC_021151	A	6	6	4212621	4212626	100 %	0 %	0 %	0 %	482906558
78005	NC_021151	CAA	2	6	4212662	4212667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906558
78006	NC_021151	GC	4	8	4212682	4212689	0 %	0 %	50 %	50 %	482906558
78007	NC_021151	GTT	2	6	4212699	4212704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906558
78008	NC_021151	TGTT	2	8	4212721	4212728	0 %	75 %	25 %	0 %	482906558
78009	NC_021151	CGAC	2	8	4212739	4212746	25 %	0 %	25 %	50 %	482906558
78010	NC_021151	ATC	2	6	4212765	4212770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906558
78011	NC_021151	TTG	2	6	4212850	4212855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906558
78012	NC_021151	TGCAGA	2	12	4212895	4212906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482906558
78013	NC_021151	ACA	2	6	4212922	4212927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906558
78014	NC_021151	CAG	2	6	4212984	4212989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78015	NC_021151	ATC	2	6	4212996	4213001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906558
78016	NC_021151	TGA	2	6	4213187	4213192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906558
78017	NC_021151	TTC	2	6	4213209	4213214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906558
78018	NC_021151	AAG	2	6	4213243	4213248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906558
78019	NC_021151	GAA	2	6	4213323	4213328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906558
78020	NC_021151	GATGCG	2	12	4213335	4213346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482906558
78021	NC_021151	CGT	2	6	4213401	4213406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78022	NC_021151	AGC	2	6	4213507	4213512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78023	NC_021151	CATGAC	2	12	4213646	4213657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482906558
78024	NC_021151	CTG	2	6	4213671	4213676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78025	NC_021151	ACG	2	6	4213696	4213701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78026	NC_021151	ATT	2	6	4213848	4213853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906558
78027	NC_021151	TGCG	2	8	4213918	4213925	0 %	25 %	50 %	25 %	482906558
78028	NC_021151	TGA	2	6	4213997	4214002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906558
78029	NC_021151	CGA	2	6	4214003	4214008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906558
78030	NC_021151	TATCCG	2	12	4214033	4214044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482906558
78031	NC_021151	CGC	2	6	4214070	4214075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906558
78032	NC_021151	AGAA	2	8	4214092	4214099	75 %	0 %	25 %	0 %	482906558
78033	NC_021151	T	7	7	4214155	4214161	0 %	100 %	0 %	0 %	482906559
78034	NC_021151	A	6	6	4214191	4214196	100 %	0 %	0 %	0 %	482906559
78035	NC_021151	TAT	2	6	4214213	4214218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906559
78036	NC_021151	TGCTGT	2	12	4214356	4214367	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482906559
78037	NC_021151	TGA	2	6	4214422	4214427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906559
78038	NC_021151	GTT	2	6	4214489	4214494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906559
78039	NC_021151	TCA	2	6	4214548	4214553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906559
78040	NC_021151	ATT	2	6	4214563	4214568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906559
78041	NC_021151	ATC	2	6	4214571	4214576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906559
78042	NC_021151	T	6	6	4214618	4214623	0 %	100 %	0 %	0 %	482906559
78043	NC_021151	CAGCGG	2	12	4214640	4214651	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	482906559
78044	NC_021151	CTG	2	6	4214661	4214666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906559
78045	NC_021151	ACA	2	6	4214697	4214702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906559
78046	NC_021151	ATC	2	6	4214704	4214709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906559
78047	NC_021151	ATA	2	6	4214733	4214738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906559
78048	NC_021151	ATT	2	6	4214776	4214781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906559
78049	NC_021151	TTA	2	6	4214839	4214844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906559
78050	NC_021151	AGC	2	6	4214851	4214856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906559
78051	NC_021151	GTT	2	6	4215016	4215021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906560
78052	NC_021151	TTC	2	6	4215097	4215102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906560
78053	NC_021151	CTG	2	6	4215134	4215139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906560
78054	NC_021151	AAT	2	6	4215235	4215240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906560
78055	NC_021151	CTG	2	6	4215254	4215259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906560
78056	NC_021151	CGG	2	6	4215325	4215330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906560
78057	NC_021151	AG	3	6	4215332	4215337	50 %	0 %	50 %	0 %	482906560
78058	NC_021151	CTG	2	6	4215347	4215352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906560
78059	NC_021151	CCG	2	6	4215420	4215425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906560
78060	NC_021151	GCC	2	6	4215525	4215530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906560
78061	NC_021151	TAA	2	6	4215534	4215539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906560
78062	NC_021151	ATC	2	6	4215570	4215575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906560
78063	NC_021151	TCG	2	6	4215633	4215638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906560
78064	NC_021151	T	6	6	4215641	4215646	0 %	100 %	0 %	0 %	482906560
78065	NC_021151	GCG	2	6	4215991	4215996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906561
78066	NC_021151	TTTCA	2	10	4215997	4216006	20 %	60 %	0 %	20 %	482906561
78067	NC_021151	CGA	2	6	4216096	4216101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906561
78068	NC_021151	GCC	2	6	4216141	4216146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906561
78069	NC_021151	CCG	2	6	4216185	4216190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906561
78070	NC_021151	CGG	2	6	4216191	4216196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906561
78071	NC_021151	GTA	2	6	4216276	4216281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906561
78072	NC_021151	ATAA	2	8	4216405	4216412	75 %	25 %	0 %	0 %	482906561
78073	NC_021151	GC	3	6	4216467	4216472	0 %	0 %	50 %	50 %	482906561
78074	NC_021151	GGC	2	6	4216474	4216479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906561
78075	NC_021151	GGC	2	6	4216485	4216490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906561
78076	NC_021151	CTG	2	6	4216581	4216586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906561
78077	NC_021151	A	7	7	4216656	4216662	100 %	0 %	0 %	0 %	482906561
78078	NC_021151	GCC	3	9	4216702	4216710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906561
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78082	NC_021151	TAAA	2	8	4216818	4216825	75 %	25 %	0 %	0 %	482906561
78083	NC_021151	TG	3	6	4216874	4216879	0 %	50 %	50 %	0 %	482906561
78084	NC_021151	GAT	2	6	4217050	4217055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906562
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78087	NC_021151	TAGCG	2	10	4217181	4217190	20 %	20 %	40 %	20 %	482906562
78088	NC_021151	CGG	2	6	4217191	4217196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906562
78089	NC_021151	CAT	2	6	4217279	4217284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906562
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78091	NC_021151	CT	3	6	4217388	4217393	0 %	50 %	0 %	50 %	482906562
78092	NC_021151	TTA	2	6	4217433	4217438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906562
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78098	NC_021151	TTA	2	6	4217778	4217783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906562
78099	NC_021151	ATT	2	6	4217913	4217918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906563
78100	NC_021151	CTG	2	6	4217919	4217924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906563
78101	NC_021151	AAATC	2	10	4217936	4217945	60 %	20 %	0 %	20 %	482906563
78102	NC_021151	AAT	2	6	4217964	4217969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906563
78103	NC_021151	TGG	2	6	4217984	4217989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906563
78104	NC_021151	GAG	2	6	4218145	4218150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906563
78105	NC_021151	CGA	2	6	4218245	4218250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906563
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78107	NC_021151	TAA	2	6	4218275	4218280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906563
78108	NC_021151	TCT	2	6	4218292	4218297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906563
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78111	NC_021151	GGC	2	6	4218392	4218397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906563
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78113	NC_021151	T	6	6	4218461	4218466	0 %	100 %	0 %	0 %	482906563
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78348	NC_021151	TAC	2	6	4230436	4230441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906573
78349	NC_021151	GCG	2	6	4230525	4230530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906573
78350	NC_021151	CGGG	2	8	4230563	4230570	0 %	0 %	75 %	25 %	482906573
78351	NC_021151	TCTT	2	8	4230596	4230603	0 %	75 %	0 %	25 %	482906573
78352	NC_021151	TGA	2	6	4230709	4230714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906574
78353	NC_021151	TTG	2	6	4230749	4230754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906574
78354	NC_021151	CGC	2	6	4230776	4230781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906574
78355	NC_021151	TCA	2	6	4230820	4230825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906574
78356	NC_021151	CGG	2	6	4230826	4230831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906574
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78359	NC_021151	ACG	2	6	4230968	4230973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906574
78360	NC_021151	GC	5	10	4230986	4230995	0 %	0 %	50 %	50 %	482906574
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78363	NC_021151	GGC	2	6	4231088	4231093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906574
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78367	NC_021151	ATG	2	6	4231250	4231255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906574
78368	NC_021151	GCC	2	6	4231280	4231285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906574
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78374	NC_021151	GC	3	6	4232018	4232023	0 %	0 %	50 %	50 %	482906575
78375	NC_021151	GCC	2	6	4232025	4232030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906575
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78445	NC_021151	ATG	2	6	4236090	4236095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906581
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78453	NC_021151	GAT	3	9	4236585	4236593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906582
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78455	NC_021151	GCTT	2	8	4236757	4236764	0 %	50 %	25 %	25 %	482906582
78456	NC_021151	GAT	2	6	4236789	4236794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906582
78457	NC_021151	CGC	2	6	4236799	4236804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906582
78458	NC_021151	GGT	2	6	4236838	4236843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906582
78459	NC_021151	ATGA	2	8	4236891	4236898	50 %	25 %	25 %	0 %	482906583
78460	NC_021151	GGCA	2	8	4236967	4236974	25 %	0 %	50 %	25 %	482906583
78461	NC_021151	GCCA	2	8	4237067	4237074	25 %	0 %	25 %	50 %	482906583
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78463	NC_021151	CCT	2	6	4237236	4237241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482906584
78464	NC_021151	GC	3	6	4237249	4237254	0 %	0 %	50 %	50 %	482906584
78465	NC_021151	GCGAG	2	10	4237266	4237275	20 %	0 %	60 %	20 %	482906584
78466	NC_021151	GTC	2	6	4237276	4237281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906584
78467	NC_021151	CGC	2	6	4237344	4237349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906584
78468	NC_021151	AGT	2	6	4237392	4237397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906584
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78470	NC_021151	GC	3	6	4237552	4237557	0 %	0 %	50 %	50 %	482906584
78471	NC_021151	CG	3	6	4237570	4237575	0 %	0 %	50 %	50 %	482906584
78472	NC_021151	GCT	2	6	4237651	4237656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906584
78473	NC_021151	GC	3	6	4237683	4237688	0 %	0 %	50 %	50 %	482906584
78474	NC_021151	GCA	2	6	4237791	4237796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906584
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78476	NC_021151	GCG	2	6	4237839	4237844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906584
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78482	NC_021151	CGG	2	6	4238041	4238046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906584
78483	NC_021151	CCG	2	6	4238055	4238060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906584
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78487	NC_021151	CAG	3	9	4238367	4238375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906585
78488	NC_021151	CGC	2	6	4238391	4238396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906585
78489	NC_021151	GAC	2	6	4238454	4238459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906585
78490	NC_021151	TTC	2	6	4238473	4238478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906585
78491	NC_021151	ATC	2	6	4238490	4238495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906585
78492	NC_021151	GATT	2	8	4238498	4238505	25 %	50 %	25 %	0 %	482906585
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78494	NC_021151	AGCCC	2	10	4238642	4238651	20 %	0 %	20 %	60 %	482906585
78495	NC_021151	CCG	2	6	4238657	4238662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906585
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78497	NC_021151	CGT	2	6	4238734	4238739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906585
78498	NC_021151	TCTTCC	2	12	4238781	4238792	0 %	50 %	0 %	50 %	482906586
78499	NC_021151	GCCGAC	2	12	4238804	4238815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482906586
78500	NC_021151	GGC	2	6	4238831	4238836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906586

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