MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
77001	NC_021151	CG	3	6	4153257	4153262	0 %	0 %	50 %	50 %	482906509
77002	NC_021151	CTT	2	6	4153263	4153268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906509
77003	NC_021151	GAAGAC	2	12	4153270	4153281	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482906509
77004	NC_021151	CTT	4	12	4153299	4153310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906509
77005	NC_021151	GC	3	6	4153422	4153427	0 %	0 %	50 %	50 %	482906509
77006	NC_021151	ACG	2	6	4153583	4153588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906509
77007	NC_021151	CG	3	6	4153660	4153665	0 %	0 %	50 %	50 %	482906509
77008	NC_021151	GC	3	6	4153687	4153692	0 %	0 %	50 %	50 %	482906509
77009	NC_021151	CTG	2	6	4153747	4153752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906509
77010	NC_021151	GGC	2	6	4153797	4153802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906509
77011	NC_021151	TCA	2	6	4153811	4153816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906509
77012	NC_021151	TAT	2	6	4153833	4153838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906509
77013	NC_021151	TCT	2	6	4153844	4153849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906509
77014	NC_021151	GGT	2	6	4153851	4153856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906509
77015	NC_021151	GTG	2	6	4153861	4153866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906509
77016	NC_021151	GCC	2	6	4153872	4153877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906509
77017	NC_021151	ACA	2	6	4154150	4154155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906510
77018	NC_021151	AATA	2	8	4154188	4154195	75 %	25 %	0 %	0 %	482906510
77019	NC_021151	TAA	2	6	4154209	4154214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906510
77020	NC_021151	T	6	6	4154230	4154235	0 %	100 %	0 %	0 %	482906510
77021	NC_021151	ACAA	2	8	4154249	4154256	75 %	0 %	0 %	25 %	482906510
77022	NC_021151	GAA	2	6	4154269	4154274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906510
77023	NC_021151	CAT	2	6	4154427	4154432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906510
77024	NC_021151	TTG	2	6	4154471	4154476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906511
77025	NC_021151	G	7	7	4154492	4154498	0 %	0 %	100 %	0 %	482906511
77026	NC_021151	AGG	2	6	4154595	4154600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906511
77027	NC_021151	CATA	2	8	4154624	4154631	50 %	25 %	0 %	25 %	482906511
77028	NC_021151	TA	3	6	4154638	4154643	50 %	50 %	0 %	0 %	482906511
77029	NC_021151	GTA	2	6	4154697	4154702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906511
77030	NC_021151	ATA	2	6	4154742	4154747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906511
77031	NC_021151	CCAA	2	8	4154753	4154760	50 %	0 %	0 %	50 %	482906511
77032	NC_021151	ATATT	2	10	4154769	4154778	40 %	60 %	0 %	0 %	482906511
77033	NC_021151	ATA	2	6	4154793	4154798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906511
77034	NC_021151	TC	3	6	4154821	4154826	0 %	50 %	0 %	50 %	482906511
77035	NC_021151	CGT	2	6	4154880	4154885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906511
77036	NC_021151	C	6	6	4154904	4154909	0 %	0 %	0 %	100 %	482906511
77037	NC_021151	T	6	6	4154963	4154968	0 %	100 %	0 %	0 %	482906512
77038	NC_021151	CATC	2	8	4154986	4154993	25 %	25 %	0 %	50 %	482906512
77039	NC_021151	AGACGC	2	12	4155129	4155140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906512
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77041	NC_021151	CGC	2	6	4155188	4155193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906512
77042	NC_021151	TCT	2	6	4155334	4155339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906512
77043	NC_021151	CGC	2	6	4155427	4155432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906512
77044	NC_021151	GCCA	2	8	4155450	4155457	25 %	0 %	25 %	50 %	482906512
77045	NC_021151	ATC	2	6	4155489	4155494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906512
77046	NC_021151	ATT	2	6	4155557	4155562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906512
77047	NC_021151	CCG	2	6	4155591	4155596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906512
77048	NC_021151	CGG	2	6	4155604	4155609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906512
77049	NC_021151	CAG	2	6	4155617	4155622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906512
77050	NC_021151	TCT	2	6	4155628	4155633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906512
77051	NC_021151	AGC	2	6	4155684	4155689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906512
77052	NC_021151	CCA	2	6	4155691	4155696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906512
77053	NC_021151	AAATA	2	10	4155787	4155796	80 %	20 %	0 %	0 %	482906512
77054	NC_021151	GGC	2	6	4155797	4155802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906512
77055	NC_021151	GTTT	2	8	4155828	4155835	0 %	75 %	25 %	0 %	482906512
77056	NC_021151	CCA	2	6	4155893	4155898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906513
77057	NC_021151	GC	3	6	4155979	4155984	0 %	0 %	50 %	50 %	482906513
77058	NC_021151	TGG	2	6	4155995	4156000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906513
77059	NC_021151	TGC	2	6	4156118	4156123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906513
77060	NC_021151	CGG	2	6	4156139	4156144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906513
77061	NC_021151	CGC	2	6	4156169	4156174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906513
77062	NC_021151	CAT	2	6	4156206	4156211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906513
77063	NC_021151	GTT	2	6	4156218	4156223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906513
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77065	NC_021151	GTT	2	6	4156540	4156545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906514
77066	NC_021151	GCCA	2	8	4156546	4156553	25 %	0 %	25 %	50 %	482906514
77067	NC_021151	AAG	2	6	4156581	4156586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906514
77068	NC_021151	ATG	2	6	4156605	4156610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906514
77069	NC_021151	ATC	2	6	4156631	4156636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906514
77070	NC_021151	ACT	2	6	4156692	4156697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906514
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77072	NC_021151	CTGG	2	8	4157083	4157090	0 %	25 %	50 %	25 %	482906514
77073	NC_021151	GAT	2	6	4157126	4157131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906514
77074	NC_021151	AT	3	6	4157149	4157154	50 %	50 %	0 %	0 %	482906514
77075	NC_021151	TTA	2	6	4157158	4157163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906514
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77084	NC_021151	GTC	2	6	4157677	4157682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906515
77085	NC_021151	TGA	2	6	4157702	4157707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906515
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77088	NC_021151	CTG	2	6	4157824	4157829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906515
77089	NC_021151	ATC	2	6	4157870	4157875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906515
77090	NC_021151	TCCG	2	8	4157945	4157952	0 %	25 %	25 %	50 %	482906515
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77098	NC_021151	GC	3	6	4158232	4158237	0 %	0 %	50 %	50 %	482906515
77099	NC_021151	GCG	2	6	4158259	4158264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906515
77100	NC_021151	CGA	2	6	4158324	4158329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906515
77101	NC_021151	GTG	2	6	4158340	4158345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906515
77102	NC_021151	AAAC	2	8	4158372	4158379	75 %	0 %	0 %	25 %	482906515
77103	NC_021151	ACGT	2	8	4158383	4158390	25 %	25 %	25 %	25 %	482906515
77104	NC_021151	TCG	2	6	4158392	4158397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906515
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77107	NC_021151	CGT	2	6	4158517	4158522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906515
77108	NC_021151	GCC	3	9	4158611	4158619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906515
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77110	NC_021151	TCAT	2	8	4158899	4158906	25 %	50 %	0 %	25 %	482906515
77111	NC_021151	GCA	2	6	4158933	4158938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906515
77112	NC_021151	CG	3	6	4158963	4158968	0 %	0 %	50 %	50 %	482906515
77113	NC_021151	TCG	2	6	4159016	4159021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906515
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77229	NC_021151	GCG	2	6	4164230	4164235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906521
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