MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_021151	CAT	2	6	373950	373955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902881
7003	NC_021151	CAC	2	6	374003	374008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902881
7004	NC_021151	AAG	2	6	374019	374024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902881
7005	NC_021151	TCT	2	6	374026	374031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482902881
7006	NC_021151	CGT	2	6	374234	374239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902882
7007	NC_021151	CGT	2	6	374293	374298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902882
7008	NC_021151	CTTCT	2	10	374318	374327	0 %	60 %	0 %	40 %	482902882
7009	NC_021151	GCA	2	6	374338	374343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902882
7010	NC_021151	GGC	2	6	374375	374380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902882
7011	NC_021151	GCT	2	6	374416	374421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902882
7012	NC_021151	GAA	2	6	374432	374437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902882
7013	NC_021151	T	6	6	374446	374451	0 %	100 %	0 %	0 %	482902882
7014	NC_021151	GCCC	2	8	374458	374465	0 %	0 %	25 %	75 %	482902882
7015	NC_021151	GC	3	6	374473	374478	0 %	0 %	50 %	50 %	482902882
7016	NC_021151	TGA	2	6	374545	374550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902882
7017	NC_021151	TTG	2	6	374636	374641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902882
7018	NC_021151	ATC	2	6	374679	374684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902882
7019	NC_021151	CCT	2	6	374995	375000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482902882
7020	NC_021151	GGC	2	6	375105	375110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902882
7021	NC_021151	AAT	2	6	375422	375427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482902882
7022	NC_021151	CGC	2	6	375433	375438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902882
7023	NC_021151	TGA	2	6	375447	375452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902882
7024	NC_021151	GAC	2	6	375536	375541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902882
7025	NC_021151	TG	3	6	375543	375548	0 %	50 %	50 %	0 %	482902882
7026	NC_021151	GCGCG	2	10	375577	375586	0 %	0 %	60 %	40 %	482902882
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7028	NC_021151	AAAGT	2	10	375670	375679	60 %	20 %	20 %	0 %	482902882
7029	NC_021151	GAT	2	6	375723	375728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902882
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7031	NC_021151	TGGAAA	2	12	376111	376122	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482902883
7032	NC_021151	TGC	2	6	376179	376184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902883
7033	NC_021151	TGT	2	6	376202	376207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902883
7034	NC_021151	AAAC	2	8	376285	376292	75 %	0 %	0 %	25 %	482902883
7035	NC_021151	A	6	6	376345	376350	100 %	0 %	0 %	0 %	482902883
7036	NC_021151	AGA	2	6	376443	376448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902883
7037	NC_021151	TTA	2	6	376510	376515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482902883
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7039	NC_021151	CGA	2	6	376654	376659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902884
7040	NC_021151	CAA	2	6	376793	376798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482902884
7041	NC_021151	GCTG	2	8	376907	376914	0 %	25 %	50 %	25 %	482902884
7042	NC_021151	CTG	2	6	376932	376937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902884
7043	NC_021151	GTTGAA	2	12	376962	376973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902884
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7050	NC_021151	TAG	2	6	377240	377245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482902884
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7052	NC_021151	CCATA	2	10	377283	377292	40 %	20 %	0 %	40 %	482902884
7053	NC_021151	TGT	2	6	377387	377392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482902884
7054	NC_021151	ACC	2	6	377463	377468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482902884
7055	NC_021151	CAT	2	6	377507	377512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902884
7056	NC_021151	TGAA	2	8	377515	377522	50 %	25 %	25 %	0 %	482902884
7057	NC_021151	CCAG	2	8	377611	377618	25 %	0 %	25 %	50 %	482902884
7058	NC_021151	T	6	6	377651	377656	0 %	100 %	0 %	0 %	482902884
7059	NC_021151	TACC	2	8	378103	378110	25 %	25 %	0 %	50 %	482902885
7060	NC_021151	GCT	2	6	378114	378119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482902885
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7063	NC_021151	CCAA	2	8	378164	378171	50 %	0 %	0 %	50 %	482902885
7064	NC_021151	ATC	2	6	378207	378212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902885
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7069	NC_021151	GAA	2	6	378486	378491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482902885
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7088	NC_021151	GCGTC	2	10	379747	379756	0 %	20 %	40 %	40 %	482902887
7089	NC_021151	GC	3	6	379843	379848	0 %	0 %	50 %	50 %	482902887
7090	NC_021151	CGA	2	6	379937	379942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902887
7091	NC_021151	CG	3	6	379943	379948	0 %	0 %	50 %	50 %	482902887
7092	NC_021151	AGG	2	6	379975	379980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482902887
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7100	NC_021151	ATC	2	6	380376	380381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902887
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7102	NC_021151	GGTT	2	8	380468	380475	0 %	50 %	50 %	0 %	482902887
7103	NC_021151	CAG	2	6	380496	380501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902887
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7106	NC_021151	GCG	2	6	380539	380544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902887
7107	NC_021151	GC	3	6	380610	380615	0 %	0 %	50 %	50 %	482902887
7108	NC_021151	GCCTGC	2	12	380629	380640	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	482902887
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7121	NC_021151	AGC	2	6	381229	381234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482902887
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7238	NC_021151	TAAT	2	8	387147	387154	50 %	50 %	0 %	0 %	482902894
7239	NC_021151	GCG	2	6	387155	387160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902894
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7241	NC_021151	A	6	6	387200	387205	100 %	0 %	0 %	0 %	482902894
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7243	NC_021151	CAGG	2	8	387231	387238	25 %	0 %	50 %	25 %	482902894
7244	NC_021151	T	6	6	387283	387288	0 %	100 %	0 %	0 %	482902894
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7352	NC_021151	TC	3	6	394119	394124	0 %	50 %	0 %	50 %	482902903
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7357	NC_021151	GC	3	6	394291	394296	0 %	0 %	50 %	50 %	482902903
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7488	NC_021151	TATG	2	8	403854	403861	25 %	50 %	25 %	0 %	482902912
7489	NC_021151	CAGC	2	8	403897	403904	25 %	0 %	25 %	50 %	482902912
7490	NC_021151	TC	3	6	403926	403931	0 %	50 %	0 %	50 %	482902912
7491	NC_021151	GCC	2	6	403948	403953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902912
7492	NC_021151	TCA	2	6	403971	403976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482902912
7493	NC_021151	GCG	2	6	404043	404048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902912
7494	NC_021151	GCG	3	9	404099	404107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482902912
7495	NC_021151	AG	3	6	404155	404160	50 %	0 %	50 %	0 %	482902912
7496	NC_021151	GCGAT	2	10	404364	404373	20 %	20 %	40 %	20 %	482902912
7497	NC_021151	CGC	2	6	404385	404390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902912
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7499	NC_021151	CGCC	2	8	404485	404492	0 %	0 %	25 %	75 %	482902912
7500	NC_021151	CGC	2	6	404583	404588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482902912

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