MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71501	NC_021151	CTT	2	6	3861239	3861244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906244
71502	NC_021151	GCT	2	6	3861266	3861271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71503	NC_021151	CGT	2	6	3861275	3861280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71504	NC_021151	AGC	2	6	3861397	3861402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71505	NC_021151	GCG	2	6	3861442	3861447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906244
71506	NC_021151	ACG	2	6	3861463	3861468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71507	NC_021151	GCA	3	9	3861569	3861577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71508	NC_021151	TGA	2	6	3861613	3861618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906244
71509	NC_021151	TGGCG	2	10	3861620	3861629	0 %	20 %	60 %	20 %	482906244
71510	NC_021151	TCGC	2	8	3861634	3861641	0 %	25 %	25 %	50 %	482906244
71511	NC_021151	CTGC	2	8	3861671	3861678	0 %	25 %	25 %	50 %	482906244
71512	NC_021151	AGC	2	6	3861738	3861743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71513	NC_021151	AGC	2	6	3861756	3861761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71514	NC_021151	TGA	2	6	3861817	3861822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906244
71515	NC_021151	CGCC	2	8	3861827	3861834	0 %	0 %	25 %	75 %	482906244
71516	NC_021151	GC	4	8	3861881	3861888	0 %	0 %	50 %	50 %	482906244
71517	NC_021151	ACA	2	6	3861892	3861897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906244
71518	NC_021151	GGT	2	6	3861906	3861911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906244
71519	NC_021151	TCT	2	6	3861934	3861939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906244
71520	NC_021151	CCG	2	6	3862010	3862015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906244
71521	NC_021151	CTG	2	6	3862034	3862039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71522	NC_021151	CCG	2	6	3862041	3862046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906244
71523	NC_021151	CGC	2	6	3862090	3862095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906244
71524	NC_021151	GC	3	6	3862159	3862164	0 %	0 %	50 %	50 %	482906244
71525	NC_021151	AGG	2	6	3862357	3862362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906244
71526	NC_021151	CGATA	2	10	3862364	3862373	40 %	20 %	20 %	20 %	482906244
71527	NC_021151	CGC	2	6	3862398	3862403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906244
71528	NC_021151	AG	3	6	3862526	3862531	50 %	0 %	50 %	0 %	482906244
71529	NC_021151	GCA	2	6	3862619	3862624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906244
71530	NC_021151	CAG	2	6	3862905	3862910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906245
71531	NC_021151	CAT	2	6	3862938	3862943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906245
71532	NC_021151	GCC	2	6	3862980	3862985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906245
71533	NC_021151	GCA	2	6	3862990	3862995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906245
71534	NC_021151	CCT	2	6	3863135	3863140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482906245
71535	NC_021151	GGT	2	6	3863154	3863159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906245
71536	NC_021151	TCC	2	6	3863185	3863190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482906245
71537	NC_021151	T	6	6	3863307	3863312	0 %	100 %	0 %	0 %	482906245
71538	NC_021151	CGATAT	2	12	3863315	3863326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482906245
71539	NC_021151	AC	3	6	3863487	3863492	50 %	0 %	0 %	50 %	482906245
71540	NC_021151	CATC	2	8	3863558	3863565	25 %	25 %	0 %	50 %	482906245
71541	NC_021151	AGA	2	6	3863576	3863581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906245
71542	NC_021151	AAT	2	6	3863619	3863624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906245
71543	NC_021151	CGC	2	6	3863726	3863731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906245
71544	NC_021151	ACG	2	6	3863743	3863748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906245
71545	NC_021151	GAC	2	6	3863751	3863756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906245
71546	NC_021151	CGG	2	6	3863760	3863765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906245
71547	NC_021151	GCG	2	6	3863807	3863812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906245
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71549	NC_021151	CGC	2	6	3863847	3863852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906245
71550	NC_021151	CAA	2	6	3863883	3863888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906245
71551	NC_021151	ACG	2	6	3863917	3863922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906245
71552	NC_021151	CCT	2	6	3863981	3863986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482906245
71553	NC_021151	AGG	2	6	3863999	3864004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906245
71554	NC_021151	GATC	2	8	3864020	3864027	25 %	25 %	25 %	25 %	482906245
71555	NC_021151	CGG	2	6	3864041	3864046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906245
71556	NC_021151	GCG	2	6	3864196	3864201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906245
71557	NC_021151	T	6	6	3864222	3864227	0 %	100 %	0 %	0 %	482906245
71558	NC_021151	GGA	2	6	3864231	3864236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906245
71559	NC_021151	ATA	2	6	3864282	3864287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906245
71560	NC_021151	CGG	2	6	3864296	3864301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906245
71561	NC_021151	CAC	2	6	3864314	3864319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906245
71562	NC_021151	GCA	2	6	3864578	3864583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906246
71563	NC_021151	AT	3	6	3864584	3864589	50 %	50 %	0 %	0 %	482906246
71564	NC_021151	GGA	2	6	3864603	3864608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906246
71565	NC_021151	GAA	2	6	3864645	3864650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906246
71566	NC_021151	CAT	2	6	3864657	3864662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906246
71567	NC_021151	TGG	2	6	3864715	3864720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906246
71568	NC_021151	GC	3	6	3864811	3864816	0 %	0 %	50 %	50 %	482906246
71569	NC_021151	GTT	2	6	3864848	3864853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906246
71570	NC_021151	ACG	2	6	3864889	3864894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906246
71571	NC_021151	GCG	2	6	3864903	3864908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906246
71572	NC_021151	GCA	2	6	3864935	3864940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906246
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71574	NC_021151	TAT	2	6	3864989	3864994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906246
71575	NC_021151	GC	3	6	3865018	3865023	0 %	0 %	50 %	50 %	482906246
71576	NC_021151	CGT	2	6	3865111	3865116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906246
71577	NC_021151	GCC	2	6	3865117	3865122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906246
71578	NC_021151	GGCGCT	2	12	3865124	3865135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482906246
71579	NC_021151	GCC	2	6	3865151	3865156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906246
71580	NC_021151	CGAA	2	8	3865172	3865179	50 %	0 %	25 %	25 %	482906246
71581	NC_021151	GTG	2	6	3865275	3865280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906246
71582	NC_021151	CGG	2	6	3865286	3865291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906246
71583	NC_021151	CTGG	2	8	3865424	3865431	0 %	25 %	50 %	25 %	482906246
71584	NC_021151	GCA	2	6	3865433	3865438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906246
71585	NC_021151	ATA	2	6	3865759	3865764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906247
71586	NC_021151	TAA	2	6	3865775	3865780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906247
71587	NC_021151	ACG	2	6	3865793	3865798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906247
71588	NC_021151	AATCC	2	10	3865806	3865815	40 %	20 %	0 %	40 %	482906247
71589	NC_021151	CCG	2	6	3865879	3865884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906247
71590	NC_021151	CT	4	8	3865897	3865904	0 %	50 %	0 %	50 %	482906247
71591	NC_021151	ATG	2	6	3865983	3865988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906247
71592	NC_021151	GCC	2	6	3865998	3866003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906247
71593	NC_021151	GCA	2	6	3866008	3866013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906247
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71595	NC_021151	CCA	2	6	3866066	3866071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906247
71596	NC_021151	CTG	2	6	3866114	3866119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906247
71597	NC_021151	CAAC	2	8	3866156	3866163	50 %	0 %	0 %	50 %	482906247
71598	NC_021151	CGT	2	6	3866185	3866190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906247
71599	NC_021151	TCC	2	6	3866229	3866234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482906247
71600	NC_021151	GCG	2	6	3866249	3866254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906247
71601	NC_021151	GCGG	2	8	3866336	3866343	0 %	0 %	75 %	25 %	482906247
71602	NC_021151	GC	3	6	3866350	3866355	0 %	0 %	50 %	50 %	482906247
71603	NC_021151	CGC	2	6	3866486	3866491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906247
71604	NC_021151	GCG	2	6	3866505	3866510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906247
71605	NC_021151	AAT	2	6	3866533	3866538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906247
71606	NC_021151	CAC	2	6	3866576	3866581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906247
71607	NC_021151	GCA	2	6	3866620	3866625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906247
71608	NC_021151	GCCA	2	8	3866643	3866650	25 %	0 %	25 %	50 %	482906247
71609	NC_021151	TGGC	2	8	3866715	3866722	0 %	25 %	50 %	25 %	482906247
71610	NC_021151	GCG	2	6	3866758	3866763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906247
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71616	NC_021151	GCG	2	6	3867081	3867086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906247
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71966	NC_021151	TTC	2	6	3889821	3889826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906263
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71968	NC_021151	TGC	2	6	3889961	3889966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906264
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71988	NC_021151	CTG	2	6	3891160	3891165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906265
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71995	NC_021151	CGT	2	6	3891539	3891544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906266
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71999	NC_021151	TTG	2	6	3891959	3891964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906267
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