MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. U288

Total Repeats: 89429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_021151	GC	3	6	3834799	3834804	0 %	0 %	50 %	50 %	482906220
71003	NC_021151	AGC	2	6	3834807	3834812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906220
71004	NC_021151	TCAA	2	8	3834817	3834824	50 %	25 %	0 %	25 %	482906220
71005	NC_021151	GCA	2	6	3834872	3834877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906220
71006	NC_021151	CCG	2	6	3834905	3834910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906220
71007	NC_021151	CTT	2	6	3834911	3834916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906220
71008	NC_021151	CGC	3	9	3834990	3834998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906220
71009	NC_021151	CTT	2	6	3835010	3835015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906220
71010	NC_021151	GAC	2	6	3835076	3835081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906220
71011	NC_021151	CAT	2	6	3835166	3835171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906220
71012	NC_021151	CTT	2	6	3835217	3835222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906220
71013	NC_021151	TTC	2	6	3835252	3835257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906220
71014	NC_021151	GAT	2	6	3835263	3835268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906220
71015	NC_021151	GCA	2	6	3835271	3835276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906220
71016	NC_021151	ACG	2	6	3835290	3835295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906220
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71020	NC_021151	CAT	2	6	3835475	3835480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906220
71021	NC_021151	GC	3	6	3835482	3835487	0 %	0 %	50 %	50 %	482906220
71022	NC_021151	TCA	2	6	3835541	3835546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906220
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71025	NC_021151	CGGT	2	8	3835723	3835730	0 %	25 %	50 %	25 %	482906220
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71050	NC_021151	CAG	2	6	3836955	3836960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906221
71051	NC_021151	CTG	2	6	3836961	3836966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906221
71052	NC_021151	CTT	2	6	3836969	3836974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482906221
71053	NC_021151	GGT	2	6	3837075	3837080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906221
71054	NC_021151	GCC	2	6	3837198	3837203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906221
71055	NC_021151	CTG	2	6	3837207	3837212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906221
71056	NC_021151	TGT	2	6	3837377	3837382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906221
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71100	NC_021151	GCT	2	6	3839829	3839834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906225
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71103	NC_021151	CGCGC	2	10	3839975	3839984	0 %	0 %	40 %	60 %	482906225
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71227	NC_021151	CTG	3	9	3847158	3847166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906229
71228	NC_021151	CAGCCG	2	12	3847291	3847302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	482906229
71229	NC_021151	CAA	2	6	3847362	3847367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482906229
71230	NC_021151	CGA	2	6	3847415	3847420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906229
71231	NC_021151	GTC	2	6	3847431	3847436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906229
71232	NC_021151	GGGC	2	8	3847438	3847445	0 %	0 %	75 %	25 %	482906229
71233	NC_021151	CGC	2	6	3847446	3847451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906229
71234	NC_021151	GGA	2	6	3847687	3847692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482906230
71235	NC_021151	ACG	2	6	3847698	3847703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906230
71236	NC_021151	ACGC	2	8	3847708	3847715	25 %	0 %	25 %	50 %	482906230
71237	NC_021151	CAT	2	6	3847723	3847728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906230
71238	NC_021151	GGC	2	6	3847733	3847738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906230
71239	NC_021151	CA	3	6	3847749	3847754	50 %	0 %	0 %	50 %	482906230
71240	NC_021151	ATT	2	6	3847770	3847775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482906230
71241	NC_021151	TGGGA	2	10	3847899	3847908	20 %	20 %	60 %	0 %	482906230
71242	NC_021151	GAC	2	6	3848066	3848071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906230
71243	NC_021151	CTG	2	6	3848102	3848107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906230
71244	NC_021151	GAA	2	6	3848159	3848164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906230
71245	NC_021151	GAT	2	6	3848170	3848175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906230
71246	NC_021151	CAAC	2	8	3848190	3848197	50 %	0 %	0 %	50 %	482906230
71247	NC_021151	CGA	2	6	3848218	3848223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906230
71248	NC_021151	TGA	2	6	3848229	3848234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906230
71249	NC_021151	TGAT	2	8	3848274	3848281	25 %	50 %	25 %	0 %	482906230
71250	NC_021151	GC	3	6	3848324	3848329	0 %	0 %	50 %	50 %	482906230
71251	NC_021151	ATC	2	6	3848405	3848410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906230
71252	NC_021151	CAT	2	6	3848452	3848457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906230
71253	NC_021151	GAT	2	6	3848488	3848493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906230
71254	NC_021151	CTG	2	6	3848519	3848524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906230
71255	NC_021151	CTA	2	6	3848554	3848559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906230
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71260	NC_021151	TTTC	2	8	3848740	3848747	0 %	75 %	0 %	25 %	482906230
71261	NC_021151	CA	4	8	3848771	3848778	50 %	0 %	0 %	50 %	482906230
71262	NC_021151	GGCG	2	8	3848824	3848831	0 %	0 %	75 %	25 %	482906230
71263	NC_021151	AGA	2	6	3848845	3848850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482906230
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71265	NC_021151	TGC	2	6	3848954	3848959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906231
71266	NC_021151	CACG	2	8	3848996	3849003	25 %	0 %	25 %	50 %	482906231
71267	NC_021151	GC	3	6	3849049	3849054	0 %	0 %	50 %	50 %	482906231
71268	NC_021151	CCA	2	6	3849067	3849072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482906231
71269	NC_021151	CCGTGG	2	12	3849220	3849231	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482906231
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71301	NC_021151	CGC	2	6	3851180	3851185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906233
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71303	NC_021151	CGA	2	6	3851416	3851421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906233
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71315	NC_021151	TCAT	2	8	3851878	3851885	25 %	50 %	0 %	25 %	482906234
71316	NC_021151	TAA	2	6	3851946	3851951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906234
71317	NC_021151	ATA	2	6	3852040	3852045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906235
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71320	NC_021151	GAAGAG	2	12	3852099	3852110	50 %	0 %	50 %	0 %	482906235
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71330	NC_021151	GC	3	6	3852465	3852470	0 %	0 %	50 %	50 %	482906235
71331	NC_021151	GC	3	6	3852627	3852632	0 %	0 %	50 %	50 %	482906235
71332	NC_021151	CT	3	6	3852656	3852661	0 %	50 %	0 %	50 %	482906235
71333	NC_021151	GCA	2	6	3852677	3852682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906235
71334	NC_021151	TGGA	2	8	3852733	3852740	25 %	25 %	50 %	0 %	482906235
71335	NC_021151	TGA	2	6	3852799	3852804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906235
71336	NC_021151	CCG	3	9	3852832	3852840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906235
71337	NC_021151	TTG	2	6	3852873	3852878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482906235
71338	NC_021151	AT	3	6	3852916	3852921	50 %	50 %	0 %	0 %	482906235
71339	NC_021151	ATG	2	6	3852939	3852944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906235
71340	NC_021151	CGC	2	6	3852957	3852962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906235
71341	NC_021151	TATT	2	8	3853162	3853169	25 %	75 %	0 %	0 %	482906236
71342	NC_021151	TTACG	2	10	3853179	3853188	20 %	40 %	20 %	20 %	482906236
71343	NC_021151	TGG	2	6	3853306	3853311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482906236
71344	NC_021151	CGT	2	6	3853335	3853340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906236
71345	NC_021151	GCT	2	6	3853346	3853351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482906236
71346	NC_021151	TAA	2	6	3853531	3853536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482906236
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71454	NC_021151	CGA	2	6	3858261	3858266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482906241
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71463	NC_021151	GGC	2	6	3858890	3858895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906242
71464	NC_021151	TCA	2	6	3858979	3858984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482906242
71465	NC_021151	TGA	2	6	3859009	3859014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482906242
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71474	NC_021151	CGAGTA	2	12	3859277	3859288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482906242
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71488	NC_021151	CGG	2	6	3860301	3860306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482906243
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71492	NC_021151	CTGG	2	8	3860447	3860454	0 %	25 %	50 %	25 %	482906243
71493	NC_021151	AAAT	2	8	3860475	3860482	75 %	25 %	0 %	0 %	482906243
71494	NC_021151	CCG	2	6	3860486	3860491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906243
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71500	NC_021151	CCG	2	6	3861109	3861114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482906244

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