MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus M1 complete genome

Total Repeats: 56050

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021059	TAAT	2	8	47	54	50 %	50 %	0 %	0 %	479328022
2	NC_021059	ATT	2	6	78	83	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
3	NC_021059	TTA	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
4	NC_021059	AAC	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328022
5	NC_021059	AGT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
6	NC_021059	TTG	2	6	300	305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328022
7	NC_021059	A	7	7	313	319	100 %	0 %	0 %	0 %	479328022
8	NC_021059	ATTA	2	8	367	374	50 %	50 %	0 %	0 %	479328022
9	NC_021059	AATTT	2	10	390	399	40 %	60 %	0 %	0 %	479328022
10	NC_021059	TTA	2	6	428	433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
11	NC_021059	CAATT	2	10	456	465	40 %	40 %	0 %	20 %	479328022
12	NC_021059	CAAA	2	8	497	504	75 %	0 %	0 %	25 %	479328022
13	NC_021059	GACT	2	8	589	596	25 %	25 %	25 %	25 %	479328022
14	NC_021059	AGA	2	6	628	633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
15	NC_021059	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328022
16	NC_021059	TAAA	2	8	684	691	75 %	25 %	0 %	0 %	479328022
17	NC_021059	GAA	2	6	707	712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
18	NC_021059	TCT	2	6	723	728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
19	NC_021059	TTTA	2	8	745	752	25 %	75 %	0 %	0 %	479328022
20	NC_021059	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
21	NC_021059	ACA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328022
22	NC_021059	AAATT	2	10	834	843	60 %	40 %	0 %	0 %	479328022
23	NC_021059	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
24	NC_021059	GGT	2	6	905	910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328022
25	NC_021059	TTA	2	6	918	923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328022
26	NC_021059	TGA	2	6	937	942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
27	NC_021059	GTT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328022
28	NC_021059	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
29	NC_021059	AGA	2	6	988	993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328022
30	NC_021059	GGT	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328022
31	NC_021059	TTCA	2	8	1033	1040	25 %	50 %	0 %	25 %	479328022
32	NC_021059	AT	3	6	1048	1053	50 %	50 %	0 %	0 %	479328022
33	NC_021059	GATG	2	8	1054	1061	25 %	25 %	50 %	0 %	479328022
34	NC_021059	ATG	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
35	NC_021059	GTTGAA	2	12	1088	1099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328022
36	NC_021059	TTC	2	6	1100	1105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328022
37	NC_021059	GAC	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328022
38	NC_021059	AATT	2	8	1158	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	479328022
39	NC_021059	AAG	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328023
40	NC_021059	GTA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328023
41	NC_021059	ATT	2	6	1639	1644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328023
42	NC_021059	TGG	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328023
43	NC_021059	ATTA	2	8	1689	1696	50 %	50 %	0 %	0 %	479328023
44	NC_021059	TTCT	2	8	1779	1786	0 %	75 %	0 %	25 %	479328023
45	NC_021059	TCAT	2	8	1790	1797	25 %	50 %	0 %	25 %	479328023
46	NC_021059	ATG	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
47	NC_021059	A	6	6	2073	2078	100 %	0 %	0 %	0 %	479328024
48	NC_021059	GTC	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328024
49	NC_021059	AT	3	6	2126	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	479328024
50	NC_021059	AGA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
51	NC_021059	CTC	2	6	2188	2193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479328024
52	NC_021059	GAC	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328024
53	NC_021059	CTG	2	6	2236	2241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328024
54	NC_021059	AAT	2	6	2289	2294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328024
55	NC_021059	A	7	7	2320	2326	100 %	0 %	0 %	0 %	479328024
56	NC_021059	CAG	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328024
57	NC_021059	AAG	2	6	2461	2466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
58	NC_021059	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
59	NC_021059	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328024
60	NC_021059	ATA	2	6	2557	2562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328024
61	NC_021059	GAT	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
62	NC_021059	TTA	3	9	2745	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
63	NC_021059	GAT	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328024
64	NC_021059	TTA	2	6	2796	2801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328024
65	NC_021059	ACA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328025
66	NC_021059	GTAT	2	8	3028	3035	25 %	50 %	25 %	0 %	479328025
67	NC_021059	AG	4	8	3050	3057	50 %	0 %	50 %	0 %	479328025
68	NC_021059	ATA	2	6	3088	3093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328025
69	NC_021059	CAAAT	2	10	3121	3130	60 %	20 %	0 %	20 %	479328025
70	NC_021059	GTT	2	6	3135	3140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328025
71	NC_021059	A	6	6	3205	3210	100 %	0 %	0 %	0 %	479328025
72	NC_021059	TGG	2	6	3254	3259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
73	NC_021059	TGGCGG	2	12	3266	3277	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	479328025
74	NC_021059	TGG	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
75	NC_021059	TCA	2	6	3312	3317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
76	NC_021059	TA	3	6	3371	3376	50 %	50 %	0 %	0 %	479328025
77	NC_021059	TCA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
78	NC_021059	A	6	6	3390	3395	100 %	0 %	0 %	0 %	479328025
79	NC_021059	AAG	2	6	3418	3423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
80	NC_021059	CAG	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328025
81	NC_021059	AG	3	6	3528	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	479328025
82	NC_021059	TGA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
83	NC_021059	AGA	2	6	3599	3604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
84	NC_021059	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
85	NC_021059	TCA	2	6	3692	3697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328025
86	NC_021059	GAT	2	6	3705	3710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328025
87	NC_021059	GGT	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479328025
88	NC_021059	AGA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
89	NC_021059	TATC	2	8	3931	3938	25 %	50 %	0 %	25 %	479328025
90	NC_021059	ATT	2	6	4016	4021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
91	NC_021059	TAT	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
92	NC_021059	GGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479328025
93	NC_021059	TGC	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328025
94	NC_021059	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	479328025
95	NC_021059	CGT	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328025
96	NC_021059	GAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
97	NC_021059	G	6	6	4248	4253	0 %	0 %	100 %	0 %	479328025
98	NC_021059	TAGA	2	8	4336	4343	50 %	25 %	25 %	0 %	479328025
99	NC_021059	TGGA	2	8	4462	4469	25 %	25 %	50 %	0 %	479328025
100	NC_021059	TTA	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
101	NC_021059	TTC	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479328025
102	NC_021059	TAT	2	6	4590	4595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328025
103	NC_021059	TGAAT	2	10	4631	4640	40 %	40 %	20 %	0 %	479328025
104	NC_021059	AATG	2	8	4685	4692	50 %	25 %	25 %	0 %	479328025
105	NC_021059	ACA	2	6	4710	4715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328025
106	NC_021059	AGA	2	6	4829	4834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328025
107	NC_021059	TCAA	2	8	4916	4923	50 %	25 %	0 %	25 %	479328026
108	NC_021059	TCG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328026
109	NC_021059	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	479328026
110	NC_021059	GTTATC	2	12	5194	5205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	479328026
111	NC_021059	TTG	2	6	5209	5214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
112	NC_021059	ATGG	2	8	5238	5245	25 %	25 %	50 %	0 %	479328026
113	NC_021059	GCA	3	9	5253	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479328026
114	NC_021059	TAA	2	6	5318	5323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479328026
115	NC_021059	ATG	2	6	5350	5355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
116	NC_021059	AG	3	6	5364	5369	50 %	0 %	50 %	0 %	479328026
117	NC_021059	TTA	2	6	5400	5405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
118	NC_021059	GGTA	2	8	5429	5436	25 %	25 %	50 %	0 %	479328026
119	NC_021059	CCA	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479328026
120	NC_021059	TAAG	2	8	5494	5501	50 %	25 %	25 %	0 %	479328026
121	NC_021059	GGA	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479328026
122	NC_021059	CTG	2	6	5560	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479328026
123	NC_021059	TTCAA	2	10	5618	5627	40 %	40 %	0 %	20 %	479328026
124	NC_021059	GAA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
125	NC_021059	TTG	2	6	5677	5682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
126	NC_021059	A	6	6	5725	5730	100 %	0 %	0 %	0 %	479328026
127	NC_021059	TCGT	2	8	5740	5747	0 %	50 %	25 %	25 %	479328026
128	NC_021059	TGA	2	6	5780	5785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
129	NC_021059	ACAA	2	8	5866	5873	75 %	0 %	0 %	25 %	479328026
130	NC_021059	CAT	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479328026
131	NC_021059	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
132	NC_021059	AAG	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
133	NC_021059	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
134	NC_021059	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479328026
135	NC_021059	AGA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
136	NC_021059	ATT	2	6	6081	6086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
137	NC_021059	CAGATA	2	12	6103	6114	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	479328026
138	NC_021059	CAA	2	6	6135	6140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479328026
139	NC_021059	CAAGCT	2	12	6162	6173	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	479328026
140	NC_021059	AG	4	8	6209	6216	50 %	0 %	50 %	0 %	479328026
141	NC_021059	TTA	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479328026
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144	NC_021059	AGTT	2	8	6301	6308	25 %	50 %	25 %	0 %	479328026
145	NC_021059	TGA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
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158	NC_021059	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479328026
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166	NC_021059	GAA	2	6	7188	7193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479328026
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