MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synergistetes bacterium SGP1

Total Repeats: 31077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021038	AAG	2	6	502	507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479197641
2	NC_021038	TGT	2	6	520	525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479197641
3	NC_021038	TCG	2	6	568	573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197641
4	NC_021038	TCG	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197641
5	NC_021038	CGG	2	6	638	643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
6	NC_021038	GC	3	6	776	781	0 %	0 %	50 %	50 %	479197641
7	NC_021038	A	7	7	792	798	100 %	0 %	0 %	0 %	479197641
8	NC_021038	CG	3	6	846	851	0 %	0 %	50 %	50 %	479197641
9	NC_021038	AGG	3	9	856	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
10	NC_021038	TCC	2	6	1035	1040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197641
11	NC_021038	GGGGT	2	10	1044	1053	0 %	20 %	80 %	0 %	479197641
12	NC_021038	CCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479197641
13	NC_021038	CCT	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197641
14	NC_021038	TCC	2	6	1201	1206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197641
15	NC_021038	TCGCCG	2	12	1237	1248	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	479197641
16	NC_021038	GGC	2	6	1283	1288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
17	NC_021038	TCT	2	6	1339	1344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479197641
18	NC_021038	GGA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
19	NC_021038	CGA	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197641
20	NC_021038	CAT	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197641
21	NC_021038	GCG	2	6	1426	1431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
22	NC_021038	ACC	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479197641
23	NC_021038	CGG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
24	NC_021038	ACG	2	6	1492	1497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197641
25	NC_021038	TCT	2	6	1516	1521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479197641
26	NC_021038	GGC	2	6	1547	1552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
27	NC_021038	AGG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
28	NC_021038	CCTC	2	8	1678	1685	0 %	25 %	0 %	75 %	479197641
29	NC_021038	GCC	2	6	1764	1769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197641
30	NC_021038	GAT	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197641
31	NC_021038	ACC	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479197641
32	NC_021038	CGG	2	6	1793	1798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
33	NC_021038	CGGC	2	8	1822	1829	0 %	0 %	50 %	50 %	479197641
34	NC_021038	GC	3	6	1858	1863	0 %	0 %	50 %	50 %	479197641
35	NC_021038	G	6	6	1888	1893	0 %	0 %	100 %	0 %	479197641
36	NC_021038	GCC	2	6	1901	1906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197641
37	NC_021038	CGG	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
38	NC_021038	ACG	2	6	1972	1977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197641
39	NC_021038	CG	3	6	2014	2019	0 %	0 %	50 %	50 %	479197641
40	NC_021038	GGA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
41	NC_021038	GCC	2	6	2097	2102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197641
42	NC_021038	TGC	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197641
43	NC_021038	GAG	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
44	NC_021038	GCG	2	6	2254	2259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
45	NC_021038	TCG	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197641
46	NC_021038	GAT	2	6	2306	2311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197641
47	NC_021038	GGC	2	6	2325	2330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197641
48	NC_021038	GAG	3	9	2382	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
49	NC_021038	GCA	2	6	2446	2451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197641
50	NC_021038	GGA	2	6	2558	2563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197641
51	NC_021038	CGC	2	6	2579	2584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197641
52	NC_021038	C	6	6	2803	2808	0 %	0 %	0 %	100 %	479197642
53	NC_021038	CGA	3	9	2903	2911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197642
54	NC_021038	TGA	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197642
55	NC_021038	TCACCT	2	12	2939	2950	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	479197642
56	NC_021038	CGC	2	6	2951	2956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197642
57	NC_021038	GGGCGC	2	12	3086	3097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197642
58	NC_021038	GC	3	6	3124	3129	0 %	0 %	50 %	50 %	479197642
59	NC_021038	CCG	2	6	3140	3145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197642
60	NC_021038	CGCC	2	8	3183	3190	0 %	0 %	25 %	75 %	479197642
61	NC_021038	CG	3	6	5283	5288	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
62	NC_021038	CCCCA	2	10	5346	5355	20 %	0 %	0 %	80 %	479197643
63	NC_021038	GC	3	6	5357	5362	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
64	NC_021038	TCG	2	6	5371	5376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
65	NC_021038	TCC	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197643
66	NC_021038	CG	3	6	5482	5487	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
67	NC_021038	GC	3	6	5490	5495	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
68	NC_021038	CCG	2	6	5496	5501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197643
69	NC_021038	GTG	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479197643
70	NC_021038	GCA	2	6	5555	5560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197643
71	NC_021038	GCT	2	6	5565	5570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
72	NC_021038	GTC	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
73	NC_021038	AGC	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197643
74	NC_021038	GCG	3	9	5763	5771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197643
75	NC_021038	GTC	2	6	5796	5801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
76	NC_021038	AGGG	2	8	5845	5852	25 %	0 %	75 %	0 %	479197643
77	NC_021038	GCC	2	6	5858	5863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197643
78	NC_021038	GCA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197643
79	NC_021038	CCG	2	6	5903	5908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197643
80	NC_021038	TCC	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197643
81	NC_021038	GC	3	6	6055	6060	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
82	NC_021038	GCC	2	6	6079	6084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197643
83	NC_021038	GC	3	6	6102	6107	0 %	0 %	50 %	50 %	479197643
84	NC_021038	GGC	2	6	6108	6113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197643
85	NC_021038	CAG	2	6	6162	6167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197643
86	NC_021038	CTCG	2	8	6185	6192	0 %	25 %	25 %	50 %	479197643
87	NC_021038	CGT	2	6	6386	6391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
88	NC_021038	CGTC	2	8	6431	6438	0 %	25 %	25 %	50 %	479197643
89	NC_021038	GAA	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479197643
90	NC_021038	CGG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197643
91	NC_021038	CGA	2	6	6518	6523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197643
92	NC_021038	TCC	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197643
93	NC_021038	GGCGA	2	10	6598	6607	20 %	0 %	60 %	20 %	479197643
94	NC_021038	AGG	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197643
95	NC_021038	CGG	2	6	6637	6642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197643
96	NC_021038	ATG	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197643
97	NC_021038	CTC	2	6	6724	6729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197643
98	NC_021038	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197643
99	NC_021038	C	6	6	6809	6814	0 %	0 %	0 %	100 %	479197643
100	NC_021038	CTG	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197643
101	NC_021038	ATC	2	6	11556	11561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197644
102	NC_021038	GCA	2	6	11562	11567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197644
103	NC_021038	CGGC	2	8	11578	11585	0 %	0 %	50 %	50 %	479197644
104	NC_021038	ACA	2	6	11620	11625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479197644
105	NC_021038	GAA	2	6	11642	11647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479197644
106	NC_021038	CTC	2	6	11655	11660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197644
107	NC_021038	AGG	2	6	11668	11673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
108	NC_021038	AGG	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
109	NC_021038	AGC	2	6	11809	11814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197644
110	NC_021038	GAG	2	6	11817	11822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
111	NC_021038	AGG	2	6	11857	11862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
112	NC_021038	AGG	2	6	11881	11886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
113	NC_021038	GCGCG	2	10	11897	11906	0 %	0 %	60 %	40 %	479197644
114	NC_021038	CAG	2	6	11928	11933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197644
115	NC_021038	GGA	2	6	11945	11950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
116	NC_021038	AGG	3	9	11968	11976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
117	NC_021038	GGA	3	9	12002	12010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
118	NC_021038	GGA	2	6	12047	12052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
119	NC_021038	TCG	3	9	12091	12099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197644
120	NC_021038	GGCGA	2	10	12132	12141	20 %	0 %	60 %	20 %	479197644
121	NC_021038	CGT	2	6	12149	12154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197644
122	NC_021038	GGA	2	6	12167	12172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
123	NC_021038	CAT	2	6	12185	12190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197644
124	NC_021038	TCA	2	6	12244	12249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197644
125	NC_021038	CGA	2	6	12251	12256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197644
126	NC_021038	CAG	2	6	12278	12283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197644
127	NC_021038	CCG	2	6	12296	12301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197644
128	NC_021038	CGCC	2	8	12308	12315	0 %	0 %	25 %	75 %	479197644
129	NC_021038	GTG	2	6	12333	12338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479197644
130	NC_021038	CG	3	6	12356	12361	0 %	0 %	50 %	50 %	479197644
131	NC_021038	GAG	2	6	12366	12371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
132	NC_021038	CA	3	6	12386	12391	50 %	0 %	0 %	50 %	479197644
133	NC_021038	GGA	2	6	12398	12403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479197644
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259	NC_021038	GCC	2	6	21333	21338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197650
260	NC_021038	TCC	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197650
261	NC_021038	GTC	2	6	21447	21452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197650
262	NC_021038	CAC	2	6	21453	21458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479197650
263	NC_021038	CCGT	2	8	21553	21560	0 %	25 %	25 %	50 %	479197650
264	NC_021038	CAC	2	6	21561	21566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479197650
265	NC_021038	CG	3	6	21645	21650	0 %	0 %	50 %	50 %	479197650
266	NC_021038	G	6	6	21654	21659	0 %	0 %	100 %	0 %	479197650
267	NC_021038	TGA	2	6	21680	21685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197650
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269	NC_021038	TCG	2	6	21703	21708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197650
270	NC_021038	GAC	2	6	21711	21716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197650
271	NC_021038	TGA	2	6	21731	21736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197650
272	NC_021038	TGA	2	6	21743	21748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197650
273	NC_021038	ATC	2	6	21781	21786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197650
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275	NC_021038	GCC	2	6	21808	21813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197650
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280	NC_021038	CGG	2	6	22019	22024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197650
281	NC_021038	CGA	2	6	22037	22042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479197650
282	NC_021038	TCC	2	6	22048	22053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479197650
283	NC_021038	GCC	2	6	22105	22110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197650
284	NC_021038	CTT	2	6	22116	22121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479197650
285	NC_021038	TTC	2	6	22246	22251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479197651
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290	NC_021038	CGT	2	6	22373	22378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197651
291	NC_021038	CGC	3	9	22413	22421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197651
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293	NC_021038	CAT	2	6	22536	22541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197651
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295	NC_021038	GC	3	6	22578	22583	0 %	0 %	50 %	50 %	479197651
296	NC_021038	TAG	2	6	22600	22605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197651
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298	NC_021038	C	6	6	22629	22634	0 %	0 %	0 %	100 %	479197651
299	NC_021038	C	6	6	22676	22681	0 %	0 %	0 %	100 %	479197651
300	NC_021038	GTA	2	6	22707	22712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479197651
301	NC_021038	GGC	2	6	22815	22820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479197651
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303	NC_021038	CTT	2	6	22917	22922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479197651
304	NC_021038	GGT	2	6	22952	22957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479197651
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352	NC_021038	TCG	2	6	27378	27383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197655
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378	NC_021038	CGTCA	2	10	28496	28505	20 %	20 %	20 %	40 %	479197655
379	NC_021038	GCGG	2	8	28532	28539	0 %	0 %	75 %	25 %	479197655
380	NC_021038	GTC	2	6	28544	28549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479197655
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382	NC_021038	CGC	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479197655
383	NC_021038	TCA	2	6	28600	28605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479197655
384	NC_021038	C	6	6	28804	28809	0 %	0 %	0 %	100 %	479197655
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