MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synergistetes bacterium SGP1

Total Repeats: 31077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021038	CTC	2	6	2698909	2698914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199071
31002	NC_021038	CTC	2	6	2698948	2698953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199071
31003	NC_021038	CG	3	6	2698969	2698974	0 %	0 %	50 %	50 %	479199071
31004	NC_021038	CTG	2	6	2698981	2698986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31005	NC_021038	TCC	2	6	2699000	2699005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199071
31006	NC_021038	GGC	2	6	2699028	2699033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199071
31007	NC_021038	CGGA	2	8	2699045	2699052	25 %	0 %	50 %	25 %	479199071
31008	NC_021038	CGG	2	6	2699056	2699061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199071
31009	NC_021038	TCG	2	6	2699096	2699101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31010	NC_021038	GAG	2	6	2699150	2699155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199071
31011	NC_021038	CGT	2	6	2699178	2699183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31012	NC_021038	TGG	2	6	2699198	2699203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199071
31013	NC_021038	CTC	2	6	2699263	2699268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199071
31014	NC_021038	GCG	2	6	2699287	2699292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199071
31015	NC_021038	GTC	2	6	2699339	2699344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31016	NC_021038	ATC	2	6	2699351	2699356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479199071
31017	NC_021038	CG	3	6	2699367	2699372	0 %	0 %	50 %	50 %	479199071
31018	NC_021038	CGA	2	6	2699430	2699435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31019	NC_021038	GCG	2	6	2699497	2699502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199071
31020	NC_021038	CTC	2	6	2699509	2699514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199071
31021	NC_021038	C	6	6	2699520	2699525	0 %	0 %	0 %	100 %	479199071
31022	NC_021038	GAT	2	6	2699566	2699571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199071
31023	NC_021038	CGGCG	2	10	2699593	2699602	0 %	0 %	60 %	40 %	479199071
31024	NC_021038	CGA	2	6	2699631	2699636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31025	NC_021038	CGG	2	6	2699714	2699719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199071
31026	NC_021038	C	8	8	2699867	2699874	0 %	0 %	0 %	100 %	479199071
31027	NC_021038	GAT	2	6	2699896	2699901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199071
31028	NC_021038	GGT	2	6	2699902	2699907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199071
31029	NC_021038	ACC	2	6	2699960	2699965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199071
31030	NC_021038	TGC	2	6	2699967	2699972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199071
31031	NC_021038	GCC	3	9	2700196	2700204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479199071
31032	NC_021038	AGG	2	6	2700224	2700229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199071
31033	NC_021038	CCA	2	6	2700240	2700245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199071
31034	NC_021038	GTG	2	6	2700271	2700276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199071
31035	NC_021038	CT	3	6	2700291	2700296	0 %	50 %	0 %	50 %	479199071
31036	NC_021038	GCA	2	6	2700381	2700386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479199072
31037	NC_021038	TCG	2	6	2700458	2700463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199072
31038	NC_021038	GGA	2	6	2700534	2700539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479199072
31039	NC_021038	GGC	3	9	2700540	2700548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479199072
31040	NC_021038	CTC	2	6	2700601	2700606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199072
31041	NC_021038	CTC	2	6	2700610	2700615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199072
31042	NC_021038	GCCC	2	8	2700648	2700655	0 %	0 %	25 %	75 %	479199072
31043	NC_021038	CCA	2	6	2700666	2700671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479199072
31044	NC_021038	GGAG	2	8	2700762	2700769	25 %	0 %	75 %	0 %	479199072
31045	NC_021038	TCCGTC	2	12	2700779	2700790	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	479199072
31046	NC_021038	ATG	2	6	2701969	2701974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199073
31047	NC_021038	A	6	6	2702005	2702010	100 %	0 %	0 %	0 %	479199073
31048	NC_021038	TGG	2	6	2702037	2702042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199073
31049	NC_021038	TCC	2	6	2702059	2702064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479199073
31050	NC_021038	TGG	2	6	2702074	2702079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199073
31051	NC_021038	TGG	2	6	2702110	2702115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199073
31052	NC_021038	GTG	2	6	2702146	2702151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199073
31053	NC_021038	T	6	6	2702245	2702250	0 %	100 %	0 %	0 %	479199073
31054	NC_021038	TG	3	6	2702303	2702308	0 %	50 %	50 %	0 %	479199073
31055	NC_021038	A	6	6	2702688	2702693	100 %	0 %	0 %	0 %	479199074
31056	NC_021038	GCT	2	6	2702697	2702702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199074
31057	NC_021038	A	7	7	2702735	2702741	100 %	0 %	0 %	0 %	479199074
31058	NC_021038	CTG	2	6	2702749	2702754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479199074
31059	NC_021038	GAA	2	6	2702790	2702795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479199074
31060	NC_021038	T	6	6	2702820	2702825	0 %	100 %	0 %	0 %	479199074
31061	NC_021038	GT	3	6	2702845	2702850	0 %	50 %	50 %	0 %	479199074
31062	NC_021038	TTG	2	6	2702851	2702856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479199074
31063	NC_021038	TAA	2	6	2702857	2702862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479199074
31064	NC_021038	GAT	2	6	2719547	2719552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199075
31065	NC_021038	TGG	2	6	2719566	2719571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479199075
31066	NC_021038	T	6	6	2719605	2719610	0 %	100 %	0 %	0 %	479199075
31067	NC_021038	TCT	2	6	2719621	2719626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199075
31068	NC_021038	GT	3	6	2719687	2719692	0 %	50 %	50 %	0 %	479199075
31069	NC_021038	T	6	6	2719697	2719702	0 %	100 %	0 %	0 %	479199075
31070	NC_021038	TTTA	2	8	2719709	2719716	25 %	75 %	0 %	0 %	479199075
31071	NC_021038	T	7	7	2719730	2719736	0 %	100 %	0 %	0 %	479199075
31072	NC_021038	T	6	6	2719764	2719769	0 %	100 %	0 %	0 %	479199075
31073	NC_021038	TAT	2	6	2719781	2719786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479199075
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31075	NC_021038	CTT	2	6	2719854	2719859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479199075
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31077	NC_021038	ATG	2	6	2719908	2719913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479199075

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.