MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_021028	CTGGT	2	10	1976223	1976232	0 %	40 %	40 %	20 %	480537552
31502	NC_021028	CA	3	6	1976338	1976343	50 %	0 %	0 %	50 %	480537552
31503	NC_021028	ATC	2	6	1976344	1976349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537552
31504	NC_021028	AG	3	6	1976421	1976426	50 %	0 %	50 %	0 %	480537552
31505	NC_021028	TCC	2	6	1976437	1976442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537552
31506	NC_021028	ATA	2	6	1976486	1976491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537552
31507	NC_021028	TGAA	2	8	1976494	1976501	50 %	25 %	25 %	0 %	480537552
31508	NC_021028	ATCT	2	8	1976565	1976572	25 %	50 %	0 %	25 %	480537552
31509	NC_021028	ATG	2	6	1976654	1976659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537552
31510	NC_021028	TAA	2	6	1976730	1976735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537552
31511	NC_021028	ATA	2	6	1976991	1976996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537552
31512	NC_021028	TTG	2	6	1978071	1978076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537553
31513	NC_021028	TGA	2	6	1978084	1978089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537553
31514	NC_021028	TCA	2	6	1978145	1978150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537553
31515	NC_021028	ACG	2	6	1978237	1978242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537553
31516	NC_021028	AT	3	6	1978308	1978313	50 %	50 %	0 %	0 %	480537553
31517	NC_021028	G	6	6	1978447	1978452	0 %	0 %	100 %	0 %	480537553
31518	NC_021028	AAT	2	6	1978465	1978470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537553
31519	NC_021028	TGG	2	6	1978471	1978476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537553
31520	NC_021028	TAC	2	6	1978535	1978540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537553
31521	NC_021028	AAC	2	6	1978636	1978641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537553
31522	NC_021028	T	6	6	1978774	1978779	0 %	100 %	0 %	0 %	480537554
31523	NC_021028	AGCTC	2	10	1978787	1978796	20 %	20 %	20 %	40 %	480537554
31524	NC_021028	TTC	2	6	1978810	1978815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537554
31525	NC_021028	CTA	2	6	1978881	1978886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537554
31526	NC_021028	GCT	2	6	1979169	1979174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537555
31527	NC_021028	ACA	2	6	1979190	1979195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537555
31528	NC_021028	GTCTCC	2	12	1979216	1979227	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	480537555
31529	NC_021028	TGT	2	6	1979300	1979305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537555
31530	NC_021028	CCTG	2	8	1979364	1979371	0 %	25 %	25 %	50 %	480537555
31531	NC_021028	CAAAG	2	10	1979387	1979396	60 %	0 %	20 %	20 %	480537555
31532	NC_021028	TCT	2	6	1979505	1979510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537555
31533	NC_021028	AACCA	2	10	1979535	1979544	60 %	0 %	0 %	40 %	480537555
31534	NC_021028	ACC	2	6	1979612	1979617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537555
31535	NC_021028	GAA	2	6	1979758	1979763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537555
31536	NC_021028	CAA	2	6	1979773	1979778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537555
31537	NC_021028	AGA	2	6	1979790	1979795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537555
31538	NC_021028	ATTC	2	8	1979830	1979837	25 %	50 %	0 %	25 %	480537555
31539	NC_021028	ATC	2	6	1979838	1979843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537555
31540	NC_021028	T	6	6	1979916	1979921	0 %	100 %	0 %	0 %	480537556
31541	NC_021028	GTT	2	6	1979936	1979941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537556
31542	NC_021028	GCT	2	6	1979949	1979954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537556
31543	NC_021028	TCT	3	9	1979982	1979990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537556
31544	NC_021028	TGGT	2	8	1980069	1980076	0 %	50 %	50 %	0 %	480537556
31545	NC_021028	ACG	2	6	1980077	1980082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537556
31546	NC_021028	AAG	2	6	1980083	1980088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537556
31547	NC_021028	AGCT	2	8	1980107	1980114	25 %	25 %	25 %	25 %	480537556
31548	NC_021028	TCA	2	6	1980474	1980479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537556
31549	NC_021028	CAG	2	6	1980556	1980561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537556
31550	NC_021028	T	6	6	1980580	1980585	0 %	100 %	0 %	0 %	480537556
31551	NC_021028	GA	3	6	1980591	1980596	50 %	0 %	50 %	0 %	480537556
31552	NC_021028	TCA	2	6	1980633	1980638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537556
31553	NC_021028	CCA	2	6	1980657	1980662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537556
31554	NC_021028	CAAT	2	8	1980688	1980695	50 %	25 %	0 %	25 %	480537556
31555	NC_021028	GCT	2	6	1980713	1980718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537556
31556	NC_021028	ATC	2	6	1980725	1980730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537556
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31558	NC_021028	TCT	2	6	1980789	1980794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537556
31559	NC_021028	AAGT	2	8	1980849	1980856	50 %	25 %	25 %	0 %	480537556
31560	NC_021028	TTA	2	6	1981002	1981007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537556
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31563	NC_021028	ACA	2	6	1981104	1981109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537556
31564	NC_021028	TTGG	2	8	1981181	1981188	0 %	50 %	50 %	0 %	480537556
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31567	NC_021028	CCTT	2	8	1981263	1981270	0 %	50 %	0 %	50 %	480537556
31568	NC_021028	TGGC	2	8	1981280	1981287	0 %	25 %	50 %	25 %	480537556
31569	NC_021028	GT	3	6	1981330	1981335	0 %	50 %	50 %	0 %	480537556
31570	NC_021028	TG	3	6	1981450	1981455	0 %	50 %	50 %	0 %	480537556
31571	NC_021028	TTG	2	6	1981463	1981468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537556
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31574	NC_021028	GCC	2	6	1981623	1981628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480537556
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31588	NC_021028	ATG	3	9	1982468	1982476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537557
31589	NC_021028	GCT	2	6	1982540	1982545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537557
31590	NC_021028	ATGGA	2	10	1982593	1982602	40 %	20 %	40 %	0 %	480537557
31591	NC_021028	GAAC	2	8	1982630	1982637	50 %	0 %	25 %	25 %	480537557
31592	NC_021028	TCA	2	6	1982681	1982686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537557
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31596	NC_021028	GCTC	2	8	1982822	1982829	0 %	25 %	25 %	50 %	480537557
31597	NC_021028	AAT	2	6	1982890	1982895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537557
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31599	NC_021028	GTTG	2	8	1983039	1983046	0 %	50 %	50 %	0 %	480537557
31600	NC_021028	GATTT	2	10	1983064	1983073	20 %	60 %	20 %	0 %	480537557
31601	NC_021028	ACTG	2	8	1983110	1983117	25 %	25 %	25 %	25 %	480537557
31602	NC_021028	CAACC	2	10	1983150	1983159	40 %	0 %	0 %	60 %	480537557
31603	NC_021028	T	6	6	1983214	1983219	0 %	100 %	0 %	0 %	480537557
31604	NC_021028	ATG	2	6	1983227	1983232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537557
31605	NC_021028	ATG	2	6	1983266	1983271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537557
31606	NC_021028	AAT	2	6	1983454	1983459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537558
31607	NC_021028	T	6	6	1983499	1983504	0 %	100 %	0 %	0 %	480537558
31608	NC_021028	ATA	2	6	1983507	1983512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537558
31609	NC_021028	CTT	2	6	1983528	1983533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537558
31610	NC_021028	TAA	2	6	1983596	1983601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537558
31611	NC_021028	AT	3	6	1983712	1983717	50 %	50 %	0 %	0 %	480537558
31612	NC_021028	TCT	2	6	1983746	1983751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537558
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31615	NC_021028	TCC	2	6	1983967	1983972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537558
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