MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021028	CATT	2	8	1950959	1950966	25 %	50 %	0 %	25 %	480537533
31002	NC_021028	TAT	2	6	1951040	1951045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31003	NC_021028	CTA	2	6	1951165	1951170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31004	NC_021028	A	6	6	1951389	1951394	100 %	0 %	0 %	0 %	480537533
31005	NC_021028	TTA	2	6	1951400	1951405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31006	NC_021028	CTTT	2	8	1951423	1951430	0 %	75 %	0 %	25 %	480537533
31007	NC_021028	ATT	2	6	1951431	1951436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31008	NC_021028	CTT	2	6	1951505	1951510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537533
31009	NC_021028	ACC	2	6	1951629	1951634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537533
31010	NC_021028	CAG	3	9	1951703	1951711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537533
31011	NC_021028	TTC	2	6	1951738	1951743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537533
31012	NC_021028	T	6	6	1951783	1951788	0 %	100 %	0 %	0 %	480537533
31013	NC_021028	ATT	2	6	1951815	1951820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31014	NC_021028	TCC	2	6	1951842	1951847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537533
31015	NC_021028	GCC	2	6	1951876	1951881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480537533
31016	NC_021028	AAT	2	6	1951910	1951915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31017	NC_021028	TAA	2	6	1952002	1952007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31018	NC_021028	CAG	2	6	1952018	1952023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537533
31019	NC_021028	T	6	6	1952056	1952061	0 %	100 %	0 %	0 %	480537533
31020	NC_021028	GCT	2	6	1952086	1952091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537533
31021	NC_021028	TCT	2	6	1952092	1952097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537533
31022	NC_021028	AGC	2	6	1952121	1952126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537533
31023	NC_021028	ATC	2	6	1952145	1952150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31024	NC_021028	TCC	2	6	1952223	1952228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537533
31025	NC_021028	CAT	2	6	1952280	1952285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31026	NC_021028	ATT	2	6	1952301	1952306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31027	NC_021028	ACG	2	6	1952313	1952318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537533
31028	NC_021028	ATGT	2	8	1952405	1952412	25 %	50 %	25 %	0 %	480537533
31029	NC_021028	TGA	2	6	1952520	1952525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537533
31030	NC_021028	CAA	2	6	1952546	1952551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537533
31031	NC_021028	AAAT	2	8	1952621	1952628	75 %	25 %	0 %	0 %	480537533
31032	NC_021028	CAT	2	6	1952651	1952656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31033	NC_021028	TTGC	2	8	1952674	1952681	0 %	50 %	25 %	25 %	480537533
31034	NC_021028	TTA	2	6	1952698	1952703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31035	NC_021028	ATTTT	2	10	1952732	1952741	20 %	80 %	0 %	0 %	480537533
31036	NC_021028	ATT	2	6	1952742	1952747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31037	NC_021028	TTA	2	6	1952755	1952760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31038	NC_021028	TCA	2	6	1952806	1952811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31039	NC_021028	CTC	2	6	1952852	1952857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537533
31040	NC_021028	AAG	2	6	1952874	1952879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537533
31041	NC_021028	TAA	2	6	1952912	1952917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31042	NC_021028	TCA	2	6	1952941	1952946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31043	NC_021028	ATGT	2	8	1952951	1952958	25 %	50 %	25 %	0 %	480537533
31044	NC_021028	T	7	7	1952984	1952990	0 %	100 %	0 %	0 %	480537533
31045	NC_021028	TAA	2	6	1953014	1953019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31046	NC_021028	TAT	2	6	1953032	1953037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31047	NC_021028	ACT	2	6	1953063	1953068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31048	NC_021028	ATTTCT	2	12	1953091	1953102	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480537533
31049	NC_021028	ACT	2	6	1953112	1953117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31050	NC_021028	TA	3	6	1953159	1953164	50 %	50 %	0 %	0 %	480537533
31051	NC_021028	ATC	2	6	1953264	1953269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537533
31052	NC_021028	TGT	2	6	1953312	1953317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537533
31053	NC_021028	TGTTTT	2	12	1953339	1953350	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	480537533
31054	NC_021028	AGA	2	6	1953372	1953377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537533
31055	NC_021028	TCTTTA	2	12	1953418	1953429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480537533
31056	NC_021028	TAA	2	6	1953431	1953436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31057	NC_021028	TTA	2	6	1953487	1953492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537533
31058	NC_021028	A	6	6	1953535	1953540	100 %	0 %	0 %	0 %	480537533
31059	NC_021028	T	7	7	1953581	1953587	0 %	100 %	0 %	0 %	480537533
31060	NC_021028	TACA	2	8	1953615	1953622	50 %	25 %	0 %	25 %	480537533
31061	NC_021028	CTT	2	6	1953624	1953629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537533
31062	NC_021028	AAT	2	6	1953638	1953643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537533
31063	NC_021028	CATT	2	8	1953702	1953709	25 %	50 %	0 %	25 %	480537534
31064	NC_021028	TCA	2	6	1953731	1953736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537534
31065	NC_021028	TTTATC	2	12	1953757	1953768	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480537534
31066	NC_021028	AAC	2	6	1953859	1953864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537534
31067	NC_021028	T	6	6	1953940	1953945	0 %	100 %	0 %	0 %	480537534
31068	NC_021028	TC	3	6	1953962	1953967	0 %	50 %	0 %	50 %	480537534
31069	NC_021028	TCT	2	6	1953980	1953985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537534
31070	NC_021028	TCA	2	6	1954107	1954112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537534
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31073	NC_021028	ATA	2	6	1954201	1954206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537534
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31077	NC_021028	TAA	2	6	1954288	1954293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537534
31078	NC_021028	AT	3	6	1954310	1954315	50 %	50 %	0 %	0 %	480537534
31079	NC_021028	CTG	2	6	1954333	1954338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537534
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31083	NC_021028	ACCAA	2	10	1954708	1954717	60 %	0 %	0 %	40 %	480537534
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31085	NC_021028	AAT	2	6	1954733	1954738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537534
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31088	NC_021028	AAAAT	2	10	1954798	1954807	80 %	20 %	0 %	0 %	480537534
31089	NC_021028	TAT	2	6	1954825	1954830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537534
31090	NC_021028	GAC	2	6	1954833	1954838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537534
31091	NC_021028	ATG	2	6	1954867	1954872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537534
31092	NC_021028	GTT	2	6	1954890	1954895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537534
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31094	NC_021028	A	6	6	1954973	1954978	100 %	0 %	0 %	0 %	480537534
31095	NC_021028	CAC	2	6	1955088	1955093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537534
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31097	NC_021028	AAAG	2	8	1955125	1955132	75 %	0 %	25 %	0 %	480537534
31098	NC_021028	TGA	2	6	1955149	1955154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537534
31099	NC_021028	CTAT	2	8	1955165	1955172	25 %	50 %	0 %	25 %	480537534
31100	NC_021028	TA	3	6	1955202	1955207	50 %	50 %	0 %	0 %	480537534
31101	NC_021028	TTA	2	6	1955306	1955311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537534
31102	NC_021028	TAT	2	6	1955316	1955321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537534
31103	NC_021028	CTAA	2	8	1955339	1955346	50 %	25 %	0 %	25 %	480537534
31104	NC_021028	AAT	2	6	1955413	1955418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537534
31105	NC_021028	ATC	2	6	1955446	1955451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537534
31106	NC_021028	AG	3	6	1955465	1955470	50 %	0 %	50 %	0 %	480537534
31107	NC_021028	CTA	2	6	1955528	1955533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537534
31108	NC_021028	CATT	2	8	1955535	1955542	25 %	50 %	0 %	25 %	480537534
31109	NC_021028	CTTGAA	2	12	1955544	1955555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480537534
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31111	NC_021028	TTC	2	6	1955632	1955637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537534
31112	NC_021028	T	7	7	1955661	1955667	0 %	100 %	0 %	0 %	480537534
31113	NC_021028	ACT	2	6	1955764	1955769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537534
31114	NC_021028	TTA	2	6	1955804	1955809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537534
31115	NC_021028	CTT	2	6	1955848	1955853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537535
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31117	NC_021028	TATTTT	2	12	1955950	1955961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	480537535
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31352	NC_021028	ATA	2	6	1968049	1968054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537543
31353	NC_021028	CCT	2	6	1968071	1968076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537544
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31356	NC_021028	ATC	2	6	1968181	1968186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537544
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31470	NC_021028	GT	3	6	1973561	1973566	0 %	50 %	50 %	0 %	480537549
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