MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_021028	GAA	2	6	1920540	1920545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537511
30502	NC_021028	ACC	2	6	1920595	1920600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537511
30503	NC_021028	AGA	2	6	1920636	1920641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537511
30504	NC_021028	AAC	2	6	1920667	1920672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537511
30505	NC_021028	TACT	2	8	1920699	1920706	25 %	50 %	0 %	25 %	480537511
30506	NC_021028	ACC	2	6	1920709	1920714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537511
30507	NC_021028	CTG	2	6	1920885	1920890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537511
30508	NC_021028	ACT	2	6	1920937	1920942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537511
30509	NC_021028	TA	3	6	1920955	1920960	50 %	50 %	0 %	0 %	480537511
30510	NC_021028	AAT	2	6	1920985	1920990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537511
30511	NC_021028	A	6	6	1921037	1921042	100 %	0 %	0 %	0 %	480537511
30512	NC_021028	TTGATT	2	12	1921074	1921085	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	480537511
30513	NC_021028	AT	3	6	1921181	1921186	50 %	50 %	0 %	0 %	480537511
30514	NC_021028	ATA	3	9	1921214	1921222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537511
30515	NC_021028	TCC	2	6	1921234	1921239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537511
30516	NC_021028	AT	3	6	1921304	1921309	50 %	50 %	0 %	0 %	480537511
30517	NC_021028	GTG	2	6	1921315	1921320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537511
30518	NC_021028	A	7	7	1921328	1921334	100 %	0 %	0 %	0 %	480537511
30519	NC_021028	TGT	2	6	1921417	1921422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537511
30520	NC_021028	AGCTAC	2	12	1921426	1921437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480537511
30521	NC_021028	ATT	2	6	1921447	1921452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537511
30522	NC_021028	CAC	2	6	1921530	1921535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537511
30523	NC_021028	CAA	2	6	1921554	1921559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537511
30524	NC_021028	TAA	2	6	1921578	1921583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537511
30525	NC_021028	TCT	3	9	1921596	1921604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537511
30526	NC_021028	GAA	2	6	1921605	1921610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537511
30527	NC_021028	CTA	2	6	1921635	1921640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537511
30528	NC_021028	TCA	2	6	1921677	1921682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537511
30529	NC_021028	CCT	2	6	1921692	1921697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537512
30530	NC_021028	TTC	2	6	1921711	1921716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537512
30531	NC_021028	TAAT	2	8	1921728	1921735	50 %	50 %	0 %	0 %	480537512
30532	NC_021028	AAT	2	6	1921756	1921761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537512
30533	NC_021028	CAA	2	6	1921818	1921823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537512
30534	NC_021028	TCC	2	6	1921988	1921993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537513
30535	NC_021028	T	6	6	1922024	1922029	0 %	100 %	0 %	0 %	480537513
30536	NC_021028	GAT	2	6	1922030	1922035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537513
30537	NC_021028	TTG	2	6	1922070	1922075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537513
30538	NC_021028	CAA	2	6	1922131	1922136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537513
30539	NC_021028	AATA	2	8	1922162	1922169	75 %	25 %	0 %	0 %	480537513
30540	NC_021028	TTC	2	6	1922176	1922181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537513
30541	NC_021028	TTCA	2	8	1922206	1922213	25 %	50 %	0 %	25 %	480537513
30542	NC_021028	TCCCT	2	10	1922248	1922257	0 %	40 %	0 %	60 %	480537513
30543	NC_021028	TAA	2	6	1922262	1922267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30544	NC_021028	TTATC	2	10	1922319	1922328	20 %	60 %	0 %	20 %	480537513
30545	NC_021028	GCT	2	6	1922348	1922353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537513
30546	NC_021028	CCT	2	6	1922364	1922369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537513
30547	NC_021028	TAA	2	6	1922412	1922417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30548	NC_021028	GTT	2	6	1922418	1922423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537513
30549	NC_021028	T	7	7	1922453	1922459	0 %	100 %	0 %	0 %	480537513
30550	NC_021028	TAA	2	6	1922505	1922510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30551	NC_021028	CTA	2	6	1922595	1922600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
30552	NC_021028	TTGC	2	8	1922607	1922614	0 %	50 %	25 %	25 %	480537513
30553	NC_021028	TCA	2	6	1922622	1922627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
30554	NC_021028	A	6	6	1922676	1922681	100 %	0 %	0 %	0 %	480537513
30555	NC_021028	ACT	2	6	1922695	1922700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
30556	NC_021028	ATC	2	6	1922716	1922721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
30557	NC_021028	AAT	2	6	1922756	1922761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30558	NC_021028	GAA	2	6	1922789	1922794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537513
30559	NC_021028	TGC	2	6	1922818	1922823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537513
30560	NC_021028	CTTT	2	8	1922853	1922860	0 %	75 %	0 %	25 %	480537513
30561	NC_021028	AAAT	2	8	1922962	1922969	75 %	25 %	0 %	0 %	480537513
30562	NC_021028	TAGG	2	8	1923012	1923019	25 %	25 %	50 %	0 %	480537513
30563	NC_021028	GGC	2	6	1923054	1923059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480537513
30564	NC_021028	TC	3	6	1923068	1923073	0 %	50 %	0 %	50 %	480537513
30565	NC_021028	ATA	2	6	1923192	1923197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30566	NC_021028	ATC	2	6	1923217	1923222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
30567	NC_021028	GAAT	2	8	1923357	1923364	50 %	25 %	25 %	0 %	480537513
30568	NC_021028	ATA	2	6	1923424	1923429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30569	NC_021028	GGA	2	6	1923514	1923519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537513
30570	NC_021028	TCTT	2	8	1923636	1923643	0 %	75 %	0 %	25 %	480537513
30571	NC_021028	CTTA	2	8	1923673	1923680	25 %	50 %	0 %	25 %	480537513
30572	NC_021028	ATT	2	6	1923703	1923708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537513
30573	NC_021028	AGAT	2	8	1923740	1923747	50 %	25 %	25 %	0 %	480537513
30574	NC_021028	TAA	2	6	1923792	1923797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537513
30575	NC_021028	T	6	6	1923847	1923852	0 %	100 %	0 %	0 %	480537513
30576	NC_021028	TTA	2	6	1923869	1923874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537513
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30578	NC_021028	CTT	2	6	1923903	1923908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537513
30579	NC_021028	TCA	2	6	1923981	1923986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537513
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30582	NC_021028	GTG	2	6	1924521	1924526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537514
30583	NC_021028	T	6	6	1924546	1924551	0 %	100 %	0 %	0 %	480537514
30584	NC_021028	ATC	2	6	1924561	1924566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537514
30585	NC_021028	ATG	2	6	1924575	1924580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537514
30586	NC_021028	A	6	6	1924644	1924649	100 %	0 %	0 %	0 %	480537514
30587	NC_021028	TAC	2	6	1924828	1924833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537514
30588	NC_021028	TTG	2	6	1924881	1924886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537514
30589	NC_021028	AGA	2	6	1924921	1924926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537514
30590	NC_021028	TGC	2	6	1924984	1924989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537514
30591	NC_021028	CAA	2	6	1925006	1925011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537514
30592	NC_021028	ATT	2	6	1925021	1925026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537514
30593	NC_021028	GAT	2	6	1925038	1925043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537514
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30595	NC_021028	ATG	2	6	1925172	1925177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537514
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30597	NC_021028	CAA	2	6	1925255	1925260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537515
30598	NC_021028	CAT	2	6	1925279	1925284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537515
30599	NC_021028	AGA	2	6	1925289	1925294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537515
30600	NC_021028	CTC	2	6	1925329	1925334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537515
30601	NC_021028	GT	3	6	1925340	1925345	0 %	50 %	50 %	0 %	480537515
30602	NC_021028	A	6	6	1925356	1925361	100 %	0 %	0 %	0 %	480537515
30603	NC_021028	GAA	2	6	1925599	1925604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537516
30604	NC_021028	AAAC	2	8	1925605	1925612	75 %	0 %	0 %	25 %	480537516
30605	NC_021028	AC	3	6	1925618	1925623	50 %	0 %	0 %	50 %	480537516
30606	NC_021028	ACT	2	6	1925660	1925665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537516
30607	NC_021028	TAC	2	6	1925705	1925710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537516
30608	NC_021028	AAT	2	6	1925745	1925750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537516
30609	NC_021028	AAAC	2	8	1925827	1925834	75 %	0 %	0 %	25 %	480537517
30610	NC_021028	GAA	2	6	1925860	1925865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537517
30611	NC_021028	TAAG	2	8	1925908	1925915	50 %	25 %	25 %	0 %	480537517
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30615	NC_021028	GCCA	2	8	1926471	1926478	25 %	0 %	25 %	50 %	480537518
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