MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_021028	ATA	2	6	1826204	1826209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537433
29003	NC_021028	GAA	2	6	1826212	1826217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537433
29004	NC_021028	TCT	2	6	1826253	1826258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
29005	NC_021028	CTT	2	6	1826311	1826316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
29006	NC_021028	ACG	2	6	1826342	1826347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537433
29007	NC_021028	TTC	2	6	1826351	1826356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
29008	NC_021028	ATA	2	6	1826399	1826404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537433
29009	NC_021028	CTT	2	6	1826465	1826470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
29010	NC_021028	CAT	2	6	1826537	1826542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537433
29011	NC_021028	TC	3	6	1826562	1826567	0 %	50 %	0 %	50 %	480537433
29012	NC_021028	GCTT	2	8	1826651	1826658	0 %	50 %	25 %	25 %	480537433
29013	NC_021028	TCT	2	6	1826725	1826730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537433
29014	NC_021028	TCTTA	2	10	1826792	1826801	20 %	60 %	0 %	20 %	480537433
29015	NC_021028	TCA	2	6	1826894	1826899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
29016	NC_021028	CCAT	2	8	1826921	1826928	25 %	25 %	0 %	50 %	480537434
29017	NC_021028	ATA	2	6	1826936	1826941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537434
29018	NC_021028	TGA	2	6	1826984	1826989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537434
29019	NC_021028	CTT	2	6	1826997	1827002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29020	NC_021028	CATTGA	2	12	1827069	1827080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480537434
29021	NC_021028	ATA	2	6	1827170	1827175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537434
29022	NC_021028	ACG	2	6	1827214	1827219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537434
29023	NC_021028	TCA	2	6	1827386	1827391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
29024	NC_021028	CTT	2	6	1827399	1827404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29025	NC_021028	TCT	2	6	1827458	1827463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29026	NC_021028	TCA	2	6	1827512	1827517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
29027	NC_021028	CTT	2	6	1827531	1827536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29028	NC_021028	T	7	7	1827543	1827549	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
29029	NC_021028	TTC	2	6	1827583	1827588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29030	NC_021028	T	7	7	1827624	1827630	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
29031	NC_021028	TAC	2	6	1827643	1827648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
29032	NC_021028	ACA	2	6	1827665	1827670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537434
29033	NC_021028	T	6	6	1827709	1827714	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
29034	NC_021028	T	6	6	1827736	1827741	0 %	100 %	0 %	0 %	480537434
29035	NC_021028	CTT	2	6	1827813	1827818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537434
29036	NC_021028	TAC	2	6	1827838	1827843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537434
29037	NC_021028	TTAT	2	8	1827861	1827868	25 %	75 %	0 %	0 %	480537435
29038	NC_021028	CTTTT	2	10	1827894	1827903	0 %	80 %	0 %	20 %	480537435
29039	NC_021028	TAC	2	6	1827931	1827936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537435
29040	NC_021028	ATT	2	6	1827967	1827972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537435
29041	NC_021028	CAT	2	6	1828081	1828086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537435
29042	NC_021028	TTG	2	6	1828121	1828126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537435
29043	NC_021028	CTG	2	6	1828155	1828160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537435
29044	NC_021028	GAA	2	6	1828170	1828175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537435
29045	NC_021028	AG	3	6	1828298	1828303	50 %	0 %	50 %	0 %	480537435
29046	NC_021028	CCA	2	6	1828443	1828448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537435
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29050	NC_021028	ACA	2	6	1828791	1828796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537436
29051	NC_021028	TCT	2	6	1828806	1828811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537436
29052	NC_021028	ATA	2	6	1828836	1828841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537436
29053	NC_021028	T	6	6	1828889	1828894	0 %	100 %	0 %	0 %	480537436
29054	NC_021028	CCT	2	6	1828978	1828983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537436
29055	NC_021028	TC	3	6	1829005	1829010	0 %	50 %	0 %	50 %	480537436
29056	NC_021028	TTC	2	6	1829028	1829033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537436
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29058	NC_021028	TTC	2	6	1829223	1829228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537437
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29064	NC_021028	GCT	2	6	1829506	1829511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537437
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29066	NC_021028	GT	3	6	1829594	1829599	0 %	50 %	50 %	0 %	480537437
29067	NC_021028	CAT	2	6	1829667	1829672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537437
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29072	NC_021028	GAAG	2	8	1829928	1829935	50 %	0 %	50 %	0 %	480537437
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29088	NC_021028	CAT	2	6	1830802	1830807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537438
29089	NC_021028	ATA	2	6	1830812	1830817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537438
29090	NC_021028	TGA	2	6	1830835	1830840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537438
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29092	NC_021028	AGCC	2	8	1830892	1830899	25 %	0 %	25 %	50 %	480537438
29093	NC_021028	ATCA	2	8	1830935	1830942	50 %	25 %	0 %	25 %	480537438
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29101	NC_021028	AGAT	2	8	1831260	1831267	50 %	25 %	25 %	0 %	480537438
29102	NC_021028	CCA	2	6	1831279	1831284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537438
29103	NC_021028	T	6	6	1831363	1831368	0 %	100 %	0 %	0 %	480537438
29104	NC_021028	TCTT	2	8	1832180	1832187	0 %	75 %	0 %	25 %	480537439
29105	NC_021028	CTTCT	2	10	1832194	1832203	0 %	60 %	0 %	40 %	480537439
29106	NC_021028	T	6	6	1832206	1832211	0 %	100 %	0 %	0 %	480537439
29107	NC_021028	TCT	2	6	1832267	1832272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537439
29108	NC_021028	CAA	2	6	1832506	1832511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537439
29109	NC_021028	GCT	2	6	1832525	1832530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537439
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29111	NC_021028	TGACTT	2	12	1832729	1832740	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480537440
29112	NC_021028	TTG	2	6	1832867	1832872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537440
29113	NC_021028	GAG	2	6	1832894	1832899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537440
29114	NC_021028	TGA	2	6	1832935	1832940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537440
29115	NC_021028	CAA	2	6	1833003	1833008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537440
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29117	NC_021028	T	7	7	1833166	1833172	0 %	100 %	0 %	0 %	480537441
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