MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_021028	TCT	2	6	1537555	1537560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537157
24503	NC_021028	CTT	2	6	1537568	1537573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537157
24504	NC_021028	TTC	2	6	1537618	1537623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537157
24505	NC_021028	TGT	2	6	1537647	1537652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537157
24506	NC_021028	ACT	2	6	1537654	1537659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537157
24507	NC_021028	TAT	2	6	1537667	1537672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537157
24508	NC_021028	AGA	2	6	1537683	1537688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537157
24509	NC_021028	AGA	2	6	1537751	1537756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537157
24510	NC_021028	TTG	2	6	1537865	1537870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537158
24511	NC_021028	AT	3	6	1537884	1537889	50 %	50 %	0 %	0 %	480537158
24512	NC_021028	TCC	2	6	1537935	1537940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537158
24513	NC_021028	TTC	2	6	1538006	1538011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
24514	NC_021028	ATTG	2	8	1538053	1538060	25 %	50 %	25 %	0 %	480537158
24515	NC_021028	ATC	2	6	1538106	1538111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537158
24516	NC_021028	TAA	2	6	1538284	1538289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537158
24517	NC_021028	TCT	2	6	1538299	1538304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
24518	NC_021028	CTTTC	2	10	1538345	1538354	0 %	60 %	0 %	40 %	480537158
24519	NC_021028	CTT	2	6	1538395	1538400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
24520	NC_021028	TTC	2	6	1538474	1538479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
24521	NC_021028	GTT	2	6	1538583	1538588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537158
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24523	NC_021028	CAAA	2	8	1538653	1538660	75 %	0 %	0 %	25 %	480537158
24524	NC_021028	CTTG	2	8	1538662	1538669	0 %	50 %	25 %	25 %	480537158
24525	NC_021028	CTT	2	6	1538691	1538696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537158
24526	NC_021028	CT	3	6	1540163	1540168	0 %	50 %	0 %	50 %	480537159
24527	NC_021028	CAG	2	6	1540178	1540183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537159
24528	NC_021028	CT	3	6	1540203	1540208	0 %	50 %	0 %	50 %	480537159
24529	NC_021028	GTC	2	6	1540235	1540240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537159
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24532	NC_021028	GGCT	2	8	1540424	1540431	0 %	25 %	50 %	25 %	480537159
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24534	NC_021028	ATG	2	6	1540469	1540474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537159
24535	NC_021028	GCTG	2	8	1540510	1540517	0 %	25 %	50 %	25 %	480537159
24536	NC_021028	CAT	3	9	1540552	1540560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537159
24537	NC_021028	TAT	2	6	1540609	1540614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537159
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24539	NC_021028	CTG	2	6	1541021	1541026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537160
24540	NC_021028	CTGGTA	2	12	1541051	1541062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480537160
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24544	NC_021028	TAG	2	6	1541197	1541202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537160
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24551	NC_021028	TGT	2	6	1541529	1541534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537160
24552	NC_021028	CGA	2	6	1541560	1541565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537160
24553	NC_021028	CAAG	2	8	1541573	1541580	50 %	0 %	25 %	25 %	480537160
24554	NC_021028	GTC	2	6	1541608	1541613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537160
24555	NC_021028	GAA	2	6	1541703	1541708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537160
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24558	NC_021028	TCA	2	6	1541782	1541787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537160
24559	NC_021028	CCGC	2	8	1541812	1541819	0 %	0 %	25 %	75 %	480537160
24560	NC_021028	GATT	2	8	1541989	1541996	25 %	50 %	25 %	0 %	480537161
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24563	NC_021028	TTTG	2	8	1542124	1542131	0 %	75 %	25 %	0 %	480537161
24564	NC_021028	TTA	2	6	1542167	1542172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537161
24565	NC_021028	CTTGG	2	10	1542333	1542342	0 %	40 %	40 %	20 %	480537161
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24567	NC_021028	ACT	2	6	1542470	1542475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537161
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24569	NC_021028	GCT	2	6	1542545	1542550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537161
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24574	NC_021028	AAGG	2	8	1542799	1542806	50 %	0 %	50 %	0 %	480537161
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24587	NC_021028	CAA	2	6	1543245	1543250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537161
24588	NC_021028	GTTT	2	8	1543276	1543283	0 %	75 %	25 %	0 %	480537161
24589	NC_021028	CTT	2	6	1543317	1543322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537161
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24591	NC_021028	GCT	2	6	1543397	1543402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537161
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24593	NC_021028	GGA	2	6	1543422	1543427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537161
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24596	NC_021028	CAAA	2	8	1543512	1543519	75 %	0 %	0 %	25 %	480537161
24597	NC_021028	AAG	2	6	1543532	1543537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537161
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24600	NC_021028	TTA	2	6	1543646	1543651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537161
24601	NC_021028	ATC	2	6	1543666	1543671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537161
24602	NC_021028	CTT	2	6	1543680	1543685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537161
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24604	NC_021028	ATT	2	6	1543792	1543797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537161
24605	NC_021028	GCT	2	6	1543805	1543810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537161
24606	NC_021028	GCA	2	6	1543910	1543915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537161
24607	NC_021028	TA	3	6	1543947	1543952	50 %	50 %	0 %	0 %	480537161
24608	NC_021028	GAATG	2	10	1544306	1544315	40 %	20 %	40 %	0 %	480537162
24609	NC_021028	CGT	2	6	1544326	1544331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537162
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24611	NC_021028	TGA	2	6	1544550	1544555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537162
24612	NC_021028	AGG	2	6	1544735	1544740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480537162
24613	NC_021028	TTGA	2	8	1544767	1544774	25 %	50 %	25 %	0 %	480537162
24614	NC_021028	CCAG	2	8	1544775	1544782	25 %	0 %	25 %	50 %	480537162
24615	NC_021028	GTC	2	6	1544845	1544850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537162
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24971	NC_021028	AGT	2	6	1567692	1567697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537185
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