MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_021028	TAG	2	6	1506128	1506133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537130
24003	NC_021028	TCC	2	6	1506255	1506260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537130
24004	NC_021028	GTT	2	6	1506310	1506315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537130
24005	NC_021028	TCA	2	6	1506316	1506321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537130
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24007	NC_021028	ATA	2	6	1506387	1506392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537130
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24009	NC_021028	ATT	3	9	1506435	1506443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537130
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24011	NC_021028	CAA	2	6	1506503	1506508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537130
24012	NC_021028	ATGA	2	8	1506520	1506527	50 %	25 %	25 %	0 %	480537130
24013	NC_021028	TAT	2	6	1506560	1506565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537130
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24015	NC_021028	ATC	2	6	1506645	1506650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537130
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24101	NC_021028	TC	3	6	1512822	1512827	0 %	50 %	0 %	50 %	480537134
24102	NC_021028	TTC	2	6	1513042	1513047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537134
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24105	NC_021028	ACC	2	6	1513289	1513294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537134
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24108	NC_021028	GAT	2	6	1513420	1513425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537134
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24110	NC_021028	CGT	2	6	1513608	1513613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537134
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24112	NC_021028	TGTT	2	8	1513671	1513678	0 %	75 %	25 %	0 %	480537134
24113	NC_021028	ACA	2	6	1513757	1513762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537134
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24115	NC_021028	CTT	3	9	1513887	1513895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537134
24116	NC_021028	TTCCC	2	10	1513917	1513926	0 %	40 %	0 %	60 %	480537134
24117	NC_021028	ATAG	2	8	1513942	1513949	50 %	25 %	25 %	0 %	480537134
24118	NC_021028	CGAT	2	8	1514010	1514017	25 %	25 %	25 %	25 %	480537134
24119	NC_021028	TGA	2	6	1514100	1514105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537134
24120	NC_021028	T	8	8	1514293	1514300	0 %	100 %	0 %	0 %	480537134
24121	NC_021028	TTG	2	6	1514411	1514416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537134
24122	NC_021028	ATA	2	6	1514499	1514504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537134
24123	NC_021028	CTG	2	6	1514544	1514549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537134
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24223	NC_021028	CATCT	2	10	1522050	1522059	20 %	40 %	0 %	40 %	480537140
24224	NC_021028	CTGG	2	8	1522151	1522158	0 %	25 %	50 %	25 %	480537140
24225	NC_021028	AACC	2	8	1522161	1522168	50 %	0 %	0 %	50 %	480537140
24226	NC_021028	CTT	2	6	1522242	1522247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537140
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24231	NC_021028	T	6	6	1522626	1522631	0 %	100 %	0 %	0 %	480537141
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24233	NC_021028	ATA	2	6	1522783	1522788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537141
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24235	NC_021028	CAC	2	6	1522824	1522829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537141
24236	NC_021028	GAA	2	6	1522830	1522835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537141
24237	NC_021028	GTT	2	6	1522859	1522864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537141
24238	NC_021028	CTT	2	6	1522869	1522874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
24239	NC_021028	TTTG	2	8	1522893	1522900	0 %	75 %	25 %	0 %	480537141
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24246	NC_021028	TCT	2	6	1523369	1523374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
24247	NC_021028	CTT	2	6	1523457	1523462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537141
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24254	NC_021028	TCA	3	9	1523768	1523776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537142
24255	NC_021028	ATCAT	2	10	1523806	1523815	40 %	40 %	0 %	20 %	480537142
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24335	NC_021028	CTTT	2	8	1528278	1528285	0 %	75 %	0 %	25 %	480537146
24336	NC_021028	AT	3	6	1528348	1528353	50 %	50 %	0 %	0 %	480537146
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24339	NC_021028	TGAT	2	8	1528392	1528399	25 %	50 %	25 %	0 %	480537146
24340	NC_021028	TAA	2	6	1528446	1528451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537146
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24344	NC_021028	TCAAG	2	10	1528839	1528848	40 %	20 %	20 %	20 %	480537147
24345	NC_021028	T	7	7	1528851	1528857	0 %	100 %	0 %	0 %	480537147
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24348	NC_021028	A	6	6	1528974	1528979	100 %	0 %	0 %	0 %	480537147
24349	NC_021028	CAAG	2	8	1528985	1528992	50 %	0 %	25 %	25 %	480537147
24350	NC_021028	A	6	6	1529037	1529042	100 %	0 %	0 %	0 %	480537147
24351	NC_021028	TAT	2	6	1529064	1529069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537147
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24467	NC_021028	TGA	2	6	1535139	1535144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537155
24468	NC_021028	GTC	2	6	1535150	1535155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537155
24469	NC_021028	TGG	2	6	1535247	1535252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537155
24470	NC_021028	CAG	2	6	1535261	1535266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537155
24471	NC_021028	CAA	2	6	1535295	1535300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537155
24472	NC_021028	GTC	2	6	1535395	1535400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537155
24473	NC_021028	GAT	2	6	1535416	1535421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537155
24474	NC_021028	CTA	2	6	1535640	1535645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537156
24475	NC_021028	TGG	2	6	1535671	1535676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537156
24476	NC_021028	ATT	2	6	1535714	1535719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537156
24477	NC_021028	CGAC	2	8	1535743	1535750	25 %	0 %	25 %	50 %	480537156
24478	NC_021028	ATC	2	6	1535792	1535797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537156
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24480	NC_021028	TTA	2	6	1535865	1535870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537156
24481	NC_021028	TCTT	2	8	1535946	1535953	0 %	75 %	0 %	25 %	480537156
24482	NC_021028	TCCT	2	8	1535963	1535970	0 %	50 %	0 %	50 %	480537156
24483	NC_021028	TTC	2	6	1536104	1536109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537156
24484	NC_021028	CTA	2	6	1536229	1536234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537156
24485	NC_021028	AAT	2	6	1536265	1536270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537156
24486	NC_021028	ATC	2	6	1536663	1536668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537157
24487	NC_021028	GAA	2	6	1536674	1536679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537157
24488	NC_021028	ACC	2	6	1536718	1536723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537157
24489	NC_021028	CTCC	2	8	1536764	1536771	0 %	25 %	0 %	75 %	480537157
24490	NC_021028	AAG	2	6	1536802	1536807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537157
24491	NC_021028	A	7	7	1536882	1536888	100 %	0 %	0 %	0 %	480537157
24492	NC_021028	ATC	2	6	1536904	1536909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537157
24493	NC_021028	ACC	2	6	1537104	1537109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537157
24494	NC_021028	ACA	2	6	1537111	1537116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480537157
24495	NC_021028	CAT	2	6	1537155	1537160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537157
24496	NC_021028	GAC	2	6	1537200	1537205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537157
24497	NC_021028	AAAG	2	8	1537280	1537287	75 %	0 %	25 %	0 %	480537157
24498	NC_021028	CTG	2	6	1537301	1537306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537157
24499	NC_021028	TCA	2	6	1537342	1537347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537157
24500	NC_021028	TGAAT	2	10	1537358	1537367	40 %	40 %	20 %	0 %	480537157

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