MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23004	NC_021028	GTT	2	6	1441383	1441388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480537077
23005	NC_021028	TAT	2	6	1441456	1441461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537077
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23008	NC_021028	GAA	2	6	1441608	1441613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537077
23009	NC_021028	AAT	2	6	1441709	1441714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537077
23010	NC_021028	T	6	6	1441714	1441719	0 %	100 %	0 %	0 %	480537077
23011	NC_021028	GACA	2	8	1441720	1441727	50 %	0 %	25 %	25 %	480537077
23012	NC_021028	TCA	2	6	1441740	1441745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537077
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23021	NC_021028	TAC	2	6	1442105	1442110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537077
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23119	NC_021028	TTC	2	6	1448602	1448607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537082
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23235	NC_021028	ATT	2	6	1454216	1454221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537088
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23338	NC_021028	AG	3	6	1463422	1463427	50 %	0 %	50 %	0 %	480537095
23339	NC_021028	TC	3	6	1463461	1463466	0 %	50 %	0 %	50 %	480537095
23340	NC_021028	GAT	2	6	1463483	1463488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537095
23341	NC_021028	AC	3	6	1463518	1463523	50 %	0 %	0 %	50 %	480537095
23342	NC_021028	GAA	2	6	1463537	1463542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537095
23343	NC_021028	GGT	2	6	1463597	1463602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537095
23344	NC_021028	CGGA	2	8	1463668	1463675	25 %	0 %	50 %	25 %	480537095
23345	NC_021028	CTA	3	9	1463775	1463783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537095
23346	NC_021028	T	7	7	1463810	1463816	0 %	100 %	0 %	0 %	480537095
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23350	NC_021028	CAT	2	6	1463997	1464002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537096
23351	NC_021028	TCG	2	6	1464017	1464022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537096
23352	NC_021028	GTGC	2	8	1464060	1464067	0 %	25 %	50 %	25 %	480537096
23353	NC_021028	GAC	2	6	1464102	1464107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537096
23354	NC_021028	AGA	2	6	1464138	1464143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537096
23355	NC_021028	CTG	2	6	1464150	1464155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537096
23356	NC_021028	TC	3	6	1464167	1464172	0 %	50 %	0 %	50 %	480537096
23357	NC_021028	GCT	2	6	1464176	1464181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537096
23358	NC_021028	GCT	2	6	1464188	1464193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537096
23359	NC_021028	TCC	2	6	1464199	1464204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480537096
23360	NC_021028	GCA	2	6	1464311	1464316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537096
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23362	NC_021028	CCA	2	6	1464331	1464336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537096
23363	NC_021028	ACC	2	6	1464421	1464426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537096
23364	NC_021028	AGA	2	6	1464436	1464441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537096
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23366	NC_021028	GTA	2	6	1464514	1464519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537096
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23368	NC_021028	TTC	2	6	1464679	1464684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537096
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23372	NC_021028	GCTT	2	8	1464869	1464876	0 %	50 %	25 %	25 %	480537096
23373	NC_021028	GAT	2	6	1464894	1464899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537096
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23376	NC_021028	GA	3	6	1465036	1465041	50 %	0 %	50 %	0 %	480537096
23377	NC_021028	CTG	2	6	1465068	1465073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537096
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23379	NC_021028	GAT	2	6	1465194	1465199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537096
23380	NC_021028	TTC	2	6	1465222	1465227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537096
23381	NC_021028	AG	3	6	1465231	1465236	50 %	0 %	50 %	0 %	480537096
23382	NC_021028	CAC	2	6	1465237	1465242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537096
23383	NC_021028	CGG	2	6	1465253	1465258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480537096
23384	NC_021028	T	6	6	1465272	1465277	0 %	100 %	0 %	0 %	480537096
23385	NC_021028	TCA	2	6	1465298	1465303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537096
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23392	NC_021028	GGT	2	6	1465626	1465631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537096
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23402	NC_021028	A	6	6	1466316	1466321	100 %	0 %	0 %	0 %	480537097
23403	NC_021028	A	6	6	1466350	1466355	100 %	0 %	0 %	0 %	480537097
23404	NC_021028	TCAAGG	2	12	1466380	1466391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480537097
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23410	NC_021028	A	6	6	1466661	1466666	100 %	0 %	0 %	0 %	480537097
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23414	NC_021028	AAG	2	6	1466800	1466805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537097
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23418	NC_021028	CAT	3	9	1467076	1467084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537098
23419	NC_021028	TCT	2	6	1467143	1467148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537098
23420	NC_021028	ATC	2	6	1467164	1467169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537098
23421	NC_021028	TTA	2	6	1467252	1467257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480537098
23422	NC_021028	TTC	2	6	1467299	1467304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537098
23423	NC_021028	TGA	2	6	1467328	1467333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537098
23424	NC_021028	TTTCC	2	10	1467511	1467520	0 %	60 %	0 %	40 %	480537098
23425	NC_021028	GCT	2	6	1467608	1467613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537098
23426	NC_021028	TTTC	2	8	1467616	1467623	0 %	75 %	0 %	25 %	480537098
23427	NC_021028	CTT	2	6	1467631	1467636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480537098
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23448	NC_021028	TAC	2	6	1468855	1468860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537100
23449	NC_021028	A	6	6	1468874	1468879	100 %	0 %	0 %	0 %	480537100
23450	NC_021028	A	6	6	1468904	1468909	100 %	0 %	0 %	0 %	480537100
23451	NC_021028	CTCAA	2	10	1468948	1468957	40 %	20 %	0 %	40 %	480537100
23452	NC_021028	CGT	2	6	1468961	1468966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537100
23453	NC_021028	GAA	2	6	1468973	1468978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537100
23454	NC_021028	CTGGA	2	10	1468983	1468992	20 %	20 %	40 %	20 %	480537100
23455	NC_021028	ACCT	2	8	1469022	1469029	25 %	25 %	0 %	50 %	480537100
23456	NC_021028	GGTGC	2	10	1469046	1469055	0 %	20 %	60 %	20 %	480537100
23457	NC_021028	ACT	2	6	1469088	1469093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537100
23458	NC_021028	ATA	2	6	1469208	1469213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537100
23459	NC_021028	GCT	2	6	1469249	1469254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537100
23460	NC_021028	CAC	2	6	1472105	1472110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480537101
23461	NC_021028	GAT	2	6	1472183	1472188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537101
23462	NC_021028	TCA	2	6	1472274	1472279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
23463	NC_021028	CG	3	6	1472309	1472314	0 %	0 %	50 %	50 %	480537101
23464	NC_021028	GCTGG	2	10	1472350	1472359	0 %	20 %	60 %	20 %	480537101
23465	NC_021028	AAAC	2	8	1472494	1472501	75 %	0 %	0 %	25 %	480537101
23466	NC_021028	CAT	2	6	1472506	1472511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
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23468	NC_021028	TCA	2	6	1472583	1472588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480537101
23469	NC_021028	AAG	2	6	1472606	1472611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480537101
23470	NC_021028	ATA	2	6	1472652	1472657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480537101
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23472	NC_021028	GTA	2	6	1475489	1475494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480537102
23473	NC_021028	ACG	2	6	1475502	1475507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537102
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23475	NC_021028	TGG	2	6	1475537	1475542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480537102
23476	NC_021028	GTC	2	6	1475741	1475746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480537102
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23480	NC_021028	ACG	2	6	1475825	1475830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480537102
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