MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021028	GCA	2	6	1179924	1179929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536832
19002	NC_021028	ATC	2	6	1179980	1179985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536832
19003	NC_021028	ATG	2	6	1179987	1179992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536832
19004	NC_021028	AACCA	2	10	1180163	1180172	60 %	0 %	0 %	40 %	480536832
19005	NC_021028	AACC	2	8	1180198	1180205	50 %	0 %	0 %	50 %	480536832
19006	NC_021028	CAA	2	6	1180213	1180218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536832
19007	NC_021028	CAA	2	6	1180244	1180249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536832
19008	NC_021028	TTGC	2	8	1180269	1180276	0 %	50 %	25 %	25 %	480536832
19009	NC_021028	ACA	2	6	1180288	1180293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536832
19010	NC_021028	ATA	2	6	1180393	1180398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536833
19011	NC_021028	ACA	2	6	1180438	1180443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536833
19012	NC_021028	ATTTT	2	10	1180471	1180480	20 %	80 %	0 %	0 %	480536833
19013	NC_021028	CTC	2	6	1180494	1180499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536833
19014	NC_021028	CTGCAA	2	12	1180547	1180558	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480536833
19015	NC_021028	CTG	2	6	1180607	1180612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536833
19016	NC_021028	GCC	2	6	1180624	1180629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536833
19017	NC_021028	TCAA	2	8	1180699	1180706	50 %	25 %	0 %	25 %	480536833
19018	NC_021028	CCT	2	6	1180760	1180765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536833
19019	NC_021028	ACA	2	6	1180816	1180821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536833
19020	NC_021028	AAT	2	6	1180842	1180847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536833
19021	NC_021028	CTTG	2	8	1180973	1180980	0 %	50 %	25 %	25 %	480536834
19022	NC_021028	GAA	2	6	1181091	1181096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536834
19023	NC_021028	CGATT	2	10	1181117	1181126	20 %	40 %	20 %	20 %	480536834
19024	NC_021028	TTC	2	6	1181134	1181139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536834
19025	NC_021028	CTT	2	6	1181169	1181174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536834
19026	NC_021028	ATT	2	6	1181244	1181249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536834
19027	NC_021028	CAAGA	2	10	1181349	1181358	60 %	0 %	20 %	20 %	480536834
19028	NC_021028	TGG	2	6	1181447	1181452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536834
19029	NC_021028	ATT	2	6	1181492	1181497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536834
19030	NC_021028	AGAAA	2	10	1181594	1181603	80 %	0 %	20 %	0 %	480536834
19031	NC_021028	A	6	6	1181601	1181606	100 %	0 %	0 %	0 %	480536834
19032	NC_021028	AAAT	2	8	1181615	1181622	75 %	25 %	0 %	0 %	480536834
19033	NC_021028	TTC	2	6	1182141	1182146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536835
19034	NC_021028	GAAA	2	8	1182180	1182187	75 %	0 %	25 %	0 %	480536835
19035	NC_021028	G	8	8	1182189	1182196	0 %	0 %	100 %	0 %	480536835
19036	NC_021028	CTG	2	6	1182203	1182208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536835
19037	NC_021028	TTG	2	6	1182248	1182253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536835
19038	NC_021028	CCA	2	6	1182301	1182306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536835
19039	NC_021028	ATC	2	6	1182325	1182330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
19040	NC_021028	GTT	2	6	1182415	1182420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536835
19041	NC_021028	TGC	2	6	1182432	1182437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536835
19042	NC_021028	AAAAGG	2	12	1182450	1182461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536835
19043	NC_021028	CATTC	2	10	1182474	1182483	20 %	40 %	0 %	40 %	480536835
19044	NC_021028	GGT	2	6	1182499	1182504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
19045	NC_021028	CTTGG	2	10	1182523	1182532	0 %	40 %	40 %	20 %	480536835
19046	NC_021028	GGT	2	6	1182601	1182606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
19047	NC_021028	CCTT	2	8	1182794	1182801	0 %	50 %	0 %	50 %	480536835
19048	NC_021028	TGG	2	6	1182963	1182968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536835
19049	NC_021028	TCA	2	6	1183058	1183063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
19050	NC_021028	CTTGGA	2	12	1183084	1183095	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536835
19051	NC_021028	ATC	2	6	1183159	1183164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536835
19052	NC_021028	TCT	2	6	1183406	1183411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
19053	NC_021028	TTC	2	6	1183417	1183422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
19054	NC_021028	CCA	2	6	1183489	1183494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536836
19055	NC_021028	CTC	2	6	1183523	1183528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536836
19056	NC_021028	CAT	2	6	1183563	1183568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
19057	NC_021028	TCC	2	6	1183593	1183598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536836
19058	NC_021028	TCA	2	6	1183649	1183654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
19059	NC_021028	TGA	2	6	1183715	1183720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536836
19060	NC_021028	CGA	2	6	1183733	1183738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536836
19061	NC_021028	CAG	2	6	1183754	1183759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536836
19062	NC_021028	ACG	2	6	1183764	1183769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536836
19063	NC_021028	TTC	2	6	1183806	1183811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
19064	NC_021028	TTG	2	6	1183888	1183893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536836
19065	NC_021028	ATC	2	6	1183906	1183911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
19066	NC_021028	TCT	2	6	1183997	1184002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536836
19067	NC_021028	TCAA	2	8	1184050	1184057	50 %	25 %	0 %	25 %	480536836
19068	NC_021028	T	6	6	1184129	1184134	0 %	100 %	0 %	0 %	480536836
19069	NC_021028	ACAG	2	8	1184179	1184186	50 %	0 %	25 %	25 %	480536836
19070	NC_021028	AGC	2	6	1184187	1184192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536836
19071	NC_021028	ACC	2	6	1184193	1184198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536836
19072	NC_021028	GCT	2	6	1184275	1184280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536836
19073	NC_021028	CAAG	2	8	1184306	1184313	50 %	0 %	25 %	25 %	480536836
19074	NC_021028	TCAT	2	8	1184353	1184360	25 %	50 %	0 %	25 %	480536836
19075	NC_021028	GAG	2	6	1184361	1184366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536836
19076	NC_021028	TCA	2	6	1184368	1184373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
19077	NC_021028	ATCA	2	8	1184394	1184401	50 %	25 %	0 %	25 %	480536836
19078	NC_021028	TGT	2	6	1184503	1184508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536836
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19080	NC_021028	ATC	2	6	1184560	1184565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
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19082	NC_021028	TTG	2	6	1184596	1184601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536836
19083	NC_021028	GTT	2	6	1184620	1184625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536836
19084	NC_021028	ACCA	2	8	1184643	1184650	50 %	0 %	0 %	50 %	480536836
19085	NC_021028	ATG	3	9	1184653	1184661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536836
19086	NC_021028	TCA	2	6	1184725	1184730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536836
19087	NC_021028	TAA	2	6	1184738	1184743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536836
19088	NC_021028	ACA	2	6	1184821	1184826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536836
19089	NC_021028	GGCAA	2	10	1184827	1184836	40 %	0 %	40 %	20 %	480536836
19090	NC_021028	T	6	6	1184907	1184912	0 %	100 %	0 %	0 %	480536836
19091	NC_021028	TAT	2	6	1184986	1184991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536837
19092	NC_021028	ATC	2	6	1185029	1185034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536837
19093	NC_021028	GAC	2	6	1185163	1185168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536837
19094	NC_021028	CTC	2	6	1185179	1185184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536837
19095	NC_021028	ATC	2	6	1185206	1185211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536837
19096	NC_021028	GTA	2	6	1185215	1185220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536837
19097	NC_021028	TA	3	6	1185227	1185232	50 %	50 %	0 %	0 %	480536837
19098	NC_021028	T	6	6	1185295	1185300	0 %	100 %	0 %	0 %	480536837
19099	NC_021028	AGCT	2	8	1185466	1185473	25 %	25 %	25 %	25 %	480536838
19100	NC_021028	ACTATC	2	12	1185556	1185567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536838
19101	NC_021028	TCA	2	6	1185609	1185614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536838
19102	NC_021028	TAA	2	6	1185636	1185641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536838
19103	NC_021028	TTTTCC	2	12	1185647	1185658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536838
19104	NC_021028	CAT	2	6	1185708	1185713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536838
19105	NC_021028	TCA	2	6	1185740	1185745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536838
19106	NC_021028	AAT	2	6	1185897	1185902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536839
19107	NC_021028	ATC	2	6	1185906	1185911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536839
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19110	NC_021028	ACG	2	6	1186040	1186045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536839
19111	NC_021028	GAA	2	6	1186062	1186067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536839
19112	NC_021028	GGAAT	2	10	1186079	1186088	40 %	20 %	40 %	0 %	480536839
19113	NC_021028	TC	3	6	1186098	1186103	0 %	50 %	0 %	50 %	480536839
19114	NC_021028	GCT	2	6	1186116	1186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536839
19115	NC_021028	ATT	2	6	1186206	1186211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536839
19116	NC_021028	TAA	2	6	1186304	1186309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536839
19117	NC_021028	TCC	2	6	1186420	1186425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536839
19118	NC_021028	TCT	2	6	1186571	1186576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536839
19119	NC_021028	CCT	2	6	1186637	1186642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536839
19120	NC_021028	A	7	7	1186654	1186660	100 %	0 %	0 %	0 %	480536839
19121	NC_021028	TGAC	2	8	1186669	1186676	25 %	25 %	25 %	25 %	480536839
19122	NC_021028	GAT	2	6	1186689	1186694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536839
19123	NC_021028	TGA	2	6	1186699	1186704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536839
19124	NC_021028	ATCGC	2	10	1186757	1186766	20 %	20 %	20 %	40 %	480536839
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19127	NC_021028	CT	3	6	1186986	1186991	0 %	50 %	0 %	50 %	480536839
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19220	NC_021028	TTCAA	2	10	1193133	1193142	40 %	40 %	0 %	20 %	480536848
19221	NC_021028	CTG	2	6	1193382	1193387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536848
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19224	NC_021028	GGTTT	2	10	1193528	1193537	0 %	60 %	40 %	0 %	480536848
19225	NC_021028	GAA	2	6	1193546	1193551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536848
19226	NC_021028	TTTCTG	2	12	1193664	1193675	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	480536848
19227	NC_021028	CGT	2	6	1193744	1193749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536848
19228	NC_021028	AGC	2	6	1193875	1193880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536848
19229	NC_021028	TGG	2	6	1194007	1194012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536848
19230	NC_021028	GAA	2	6	1194071	1194076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536848
19231	NC_021028	TGA	2	6	1194079	1194084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536848
19232	NC_021028	CAT	2	6	1194097	1194102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536848
19233	NC_021028	TGC	2	6	1194181	1194186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536848
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19350	NC_021028	TTCAA	2	10	1207026	1207035	40 %	40 %	0 %	20 %	480536860
19351	NC_021028	CTT	2	6	1207045	1207050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536860
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19380	NC_021028	TTC	2	6	1208453	1208458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536862
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19450	NC_021028	CTG	2	6	1212593	1212598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536864
19451	NC_021028	CTG	2	6	1212660	1212665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536864
19452	NC_021028	CAA	2	6	1212783	1212788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536864
19453	NC_021028	ATA	2	6	1212888	1212893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536864
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19455	NC_021028	ATAG	2	8	1212981	1212988	50 %	25 %	25 %	0 %	480536865
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19459	NC_021028	TCCAT	2	10	1213139	1213148	20 %	40 %	0 %	40 %	480536865
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19461	NC_021028	A	6	6	1213240	1213245	100 %	0 %	0 %	0 %	480536865
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19463	NC_021028	TG	3	6	1213337	1213342	0 %	50 %	50 %	0 %	480536865
19464	NC_021028	TGC	2	6	1213405	1213410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536865
19465	NC_021028	ATCA	2	8	1213411	1213418	50 %	25 %	0 %	25 %	480536865
19466	NC_021028	TTC	2	6	1213466	1213471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536865
19467	NC_021028	TGG	2	6	1213484	1213489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536865
19468	NC_021028	ATA	2	6	1213609	1213614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536865
19469	NC_021028	TTG	2	6	1213651	1213656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536865
19470	NC_021028	GATA	2	8	1213660	1213667	50 %	25 %	25 %	0 %	480536865
19471	NC_021028	ATA	2	6	1213687	1213692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536865
19472	NC_021028	TC	3	6	1213701	1213706	0 %	50 %	0 %	50 %	480536865
19473	NC_021028	CTTC	2	8	1213716	1213723	0 %	50 %	0 %	50 %	480536865
19474	NC_021028	ACC	2	6	1213873	1213878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536865
19475	NC_021028	TTG	2	6	1214238	1214243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536866
19476	NC_021028	AGGT	2	8	1214294	1214301	25 %	25 %	50 %	0 %	480536866
19477	NC_021028	ATC	2	6	1214336	1214341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536866
19478	NC_021028	TTGC	2	8	1214397	1214404	0 %	50 %	25 %	25 %	480536866
19479	NC_021028	CAA	2	6	1214428	1214433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536866
19480	NC_021028	GCA	2	6	1214435	1214440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536866
19481	NC_021028	GCA	2	6	1214465	1214470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536866
19482	NC_021028	T	6	6	1214491	1214496	0 %	100 %	0 %	0 %	480536866
19483	NC_021028	AGTTG	2	10	1214703	1214712	20 %	40 %	40 %	0 %	480536866
19484	NC_021028	GTTG	2	8	1214718	1214725	0 %	50 %	50 %	0 %	480536866
19485	NC_021028	GAA	2	6	1214759	1214764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536866
19486	NC_021028	CG	3	6	1214772	1214777	0 %	0 %	50 %	50 %	480536866
19487	NC_021028	TCA	2	6	1214864	1214869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536866
19488	NC_021028	TTC	2	6	1214917	1214922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536866
19489	NC_021028	ACCG	2	8	1214959	1214966	25 %	0 %	25 %	50 %	480536866
19490	NC_021028	AAT	2	6	1215007	1215012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536866
19491	NC_021028	CTT	2	6	1215068	1215073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536867
19492	NC_021028	TTA	2	6	1215105	1215110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536867
19493	NC_021028	TG	4	8	1215115	1215122	0 %	50 %	50 %	0 %	480536867
19494	NC_021028	GACCT	2	10	1215218	1215227	20 %	20 %	20 %	40 %	480536867
19495	NC_021028	TAG	2	6	1215255	1215260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536867
19496	NC_021028	CAT	2	6	1215334	1215339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536867
19497	NC_021028	ACG	2	6	1215344	1215349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536867
19498	NC_021028	ACA	2	6	1215372	1215377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536867
19499	NC_021028	TTG	2	6	1215379	1215384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536867
19500	NC_021028	GTA	2	6	1215413	1215418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536867

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