MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021028	CAT	2	6	1119551	1119556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536781
18002	NC_021028	TTC	2	6	1119557	1119562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536781
18003	NC_021028	TCT	2	6	1119594	1119599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536781
18004	NC_021028	TCT	2	6	1119645	1119650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536781
18005	NC_021028	TAG	2	6	1119757	1119762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536781
18006	NC_021028	TTCT	2	8	1119851	1119858	0 %	75 %	0 %	25 %	480536782
18007	NC_021028	TCT	2	6	1120012	1120017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536782
18008	NC_021028	GTT	2	6	1120096	1120101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536782
18009	NC_021028	CAT	2	6	1120141	1120146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536782
18010	NC_021028	ATC	2	6	1120241	1120246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536782
18011	NC_021028	CAT	2	6	1120279	1120284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536782
18012	NC_021028	GGTTTT	2	12	1120322	1120333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536782
18013	NC_021028	GAA	2	6	1120359	1120364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536782
18014	NC_021028	CCATA	2	10	1120429	1120438	40 %	20 %	0 %	40 %	480536782
18015	NC_021028	TCT	2	6	1120509	1120514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536782
18016	NC_021028	CTT	2	6	1120583	1120588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536782
18017	NC_021028	T	6	6	1120587	1120592	0 %	100 %	0 %	0 %	480536782
18018	NC_021028	TCT	2	6	1120672	1120677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536783
18019	NC_021028	TCC	2	6	1120684	1120689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536783
18020	NC_021028	CTT	3	9	1120694	1120702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536783
18021	NC_021028	TGT	2	6	1120786	1120791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536783
18022	NC_021028	TAA	2	6	1120793	1120798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536783
18023	NC_021028	ACC	2	6	1120830	1120835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536783
18024	NC_021028	ATC	2	6	1120936	1120941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536783
18025	NC_021028	ATT	2	6	1121004	1121009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536783
18026	NC_021028	TCCA	2	8	1121053	1121060	25 %	25 %	0 %	50 %	480536783
18027	NC_021028	TC	3	6	1121080	1121085	0 %	50 %	0 %	50 %	480536783
18028	NC_021028	T	6	6	1121097	1121102	0 %	100 %	0 %	0 %	480536783
18029	NC_021028	TAA	2	6	1121150	1121155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536783
18030	NC_021028	GGA	2	6	1121219	1121224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536783
18031	NC_021028	CAT	2	6	1121241	1121246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536783
18032	NC_021028	TCA	2	6	1121257	1121262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536783
18033	NC_021028	CA	3	6	1121297	1121302	50 %	0 %	0 %	50 %	480536783
18034	NC_021028	TTCG	2	8	1121390	1121397	0 %	50 %	25 %	25 %	480536783
18035	NC_021028	TTC	2	6	1121400	1121405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536783
18036	NC_021028	CGT	2	6	1121418	1121423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536783
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18039	NC_021028	AATCA	2	10	1121553	1121562	60 %	20 %	0 %	20 %	480536783
18040	NC_021028	TCT	2	6	1121578	1121583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536783
18041	NC_021028	AACC	2	8	1121628	1121635	50 %	0 %	0 %	50 %	480536783
18042	NC_021028	CTT	2	6	1121643	1121648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536783
18043	NC_021028	CT	3	6	1121740	1121745	0 %	50 %	0 %	50 %	480536783
18044	NC_021028	TGAG	2	8	1121761	1121768	25 %	25 %	50 %	0 %	480536783
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18051	NC_021028	GTTT	2	8	1121995	1122002	0 %	75 %	25 %	0 %	480536783
18052	NC_021028	ATT	2	6	1122016	1122021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536783
18053	NC_021028	TCT	2	6	1122087	1122092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536784
18054	NC_021028	CGT	2	6	1122101	1122106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536784
18055	NC_021028	CAAG	2	8	1122162	1122169	50 %	0 %	25 %	25 %	480536784
18056	NC_021028	CG	3	6	1122174	1122179	0 %	0 %	50 %	50 %	480536784
18057	NC_021028	TGA	2	6	1122180	1122185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536784
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18063	NC_021028	CCTT	2	8	1122641	1122648	0 %	50 %	0 %	50 %	480536784
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18067	NC_021028	T	6	6	1122816	1122821	0 %	100 %	0 %	0 %	480536785
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18073	NC_021028	TTC	2	6	1123051	1123056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536785
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18115	NC_021028	CCTAA	2	10	1126344	1126353	40 %	20 %	0 %	40 %	480536787
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18117	NC_021028	AAGC	2	8	1126517	1126524	50 %	0 %	25 %	25 %	480536787
18118	NC_021028	ATC	2	6	1126528	1126533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536787
18119	NC_021028	TTC	2	6	1126544	1126549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536787
18120	NC_021028	TGA	2	6	1126553	1126558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536787
18121	NC_021028	GGAAT	2	10	1126610	1126619	40 %	20 %	40 %	0 %	480536787
18122	NC_021028	CTA	2	6	1126621	1126626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536787
18123	NC_021028	CTG	2	6	1126647	1126652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536787
18124	NC_021028	ATC	2	6	1126669	1126674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536787
18125	NC_021028	ATC	2	6	1126722	1126727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536787
18126	NC_021028	TTG	2	6	1126774	1126779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536787
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18129	NC_021028	A	6	6	1126837	1126842	100 %	0 %	0 %	0 %	480536787
18130	NC_021028	A	7	7	1126945	1126951	100 %	0 %	0 %	0 %	480536788
18131	NC_021028	GCT	2	6	1126985	1126990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536788
18132	NC_021028	A	7	7	1127098	1127104	100 %	0 %	0 %	0 %	480536788
18133	NC_021028	ATTT	2	8	1127109	1127116	25 %	75 %	0 %	0 %	480536788
18134	NC_021028	ACA	2	6	1127172	1127177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536788
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18137	NC_021028	CTA	2	6	1127330	1127335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536788
18138	NC_021028	GAG	2	6	1127355	1127360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536788
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18141	NC_021028	A	6	6	1127412	1127417	100 %	0 %	0 %	0 %	480536788
18142	NC_021028	T	6	6	1127445	1127450	0 %	100 %	0 %	0 %	480536789
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18145	NC_021028	ATT	2	6	1127553	1127558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536789
18146	NC_021028	ACGATT	2	12	1127622	1127633	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480536789
18147	NC_021028	TC	3	6	1127653	1127658	0 %	50 %	0 %	50 %	480536789
18148	NC_021028	CTTA	2	8	1127731	1127738	25 %	50 %	0 %	25 %	480536789
18149	NC_021028	TGA	2	6	1127749	1127754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536789
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18153	NC_021028	CAA	2	6	1127890	1127895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536789
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18157	NC_021028	AT	3	6	1128504	1128509	50 %	50 %	0 %	0 %	480536790
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18181	NC_021028	GC	3	6	1129952	1129957	0 %	0 %	50 %	50 %	480536793
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18218	NC_021028	CCTT	2	8	1131270	1131277	0 %	50 %	0 %	50 %	480536795
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18221	NC_021028	T	7	7	1131513	1131519	0 %	100 %	0 %	0 %	480536795
18222	NC_021028	TCA	2	6	1131549	1131554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536795
18223	NC_021028	CGGA	2	8	1131569	1131576	25 %	0 %	50 %	25 %	480536795
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18229	NC_021028	TCCA	2	8	1131902	1131909	25 %	25 %	0 %	50 %	480536795
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18231	NC_021028	CCTT	2	8	1132014	1132021	0 %	50 %	0 %	50 %	480536795
18232	NC_021028	TTC	2	6	1132040	1132045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536795
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18352	NC_021028	GCTG	2	8	1139054	1139061	0 %	25 %	50 %	25 %	480536800
18353	NC_021028	TAC	2	6	1139084	1139089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536800
18354	NC_021028	TCG	2	6	1139102	1139107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536800
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18356	NC_021028	CTG	2	6	1139152	1139157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536800
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18467	NC_021028	GATA	2	8	1144772	1144779	50 %	25 %	25 %	0 %	480536803
18468	NC_021028	CAA	2	6	1144997	1145002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536803
18469	NC_021028	CTGCT	2	10	1145126	1145135	0 %	40 %	20 %	40 %	480536804
18470	NC_021028	CAA	2	6	1145179	1145184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536804
18471	NC_021028	ATC	2	6	1145304	1145309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536804
18472	NC_021028	GATA	2	8	1145347	1145354	50 %	25 %	25 %	0 %	480536804
18473	NC_021028	AAG	2	6	1145387	1145392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536804
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18476	NC_021028	CTC	2	6	1145522	1145527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536804
18477	NC_021028	T	6	6	1145582	1145587	0 %	100 %	0 %	0 %	480536804
18478	NC_021028	TG	3	6	1145650	1145655	0 %	50 %	50 %	0 %	480536804
18479	NC_021028	ATA	2	6	1146313	1146318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536805
18480	NC_021028	ATCATG	2	12	1146392	1146403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480536805
18481	NC_021028	TCC	2	6	1146451	1146456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536805
18482	NC_021028	AGC	2	6	1146502	1146507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536805
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18485	NC_021028	TTCT	2	8	1146667	1146674	0 %	75 %	0 %	25 %	480536805
18486	NC_021028	TAA	2	6	1146837	1146842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536805
18487	NC_021028	TCA	2	6	1146860	1146865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536805
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18492	NC_021028	AAT	2	6	1147279	1147284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536806
18493	NC_021028	TCT	2	6	1147298	1147303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536806
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18495	NC_021028	CTT	2	6	1147369	1147374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536806
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18497	NC_021028	T	6	6	1147534	1147539	0 %	100 %	0 %	0 %	480536806
18498	NC_021028	CAA	2	6	1147669	1147674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536806
18499	NC_021028	T	6	6	1147728	1147733	0 %	100 %	0 %	0 %	480536806
18500	NC_021028	ATC	2	6	1147772	1147777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536806

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