MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021028	ATCA	2	8	875845	875852	50 %	25 %	0 %	25 %	480536575
14002	NC_021028	TGA	2	6	875859	875864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536575
14003	NC_021028	TGGGA	2	10	875907	875916	20 %	20 %	60 %	0 %	480536575
14004	NC_021028	TAT	2	6	876011	876016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536575
14005	NC_021028	ATT	2	6	876083	876088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536576
14006	NC_021028	TAT	2	6	876157	876162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536576
14007	NC_021028	CTG	2	6	876225	876230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536576
14008	NC_021028	GTT	2	6	876272	876277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536576
14009	NC_021028	TAT	2	6	876325	876330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536576
14010	NC_021028	ATG	2	6	876489	876494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536576
14011	NC_021028	AGC	2	6	876502	876507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536576
14012	NC_021028	AGA	2	6	876586	876591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536576
14013	NC_021028	CAG	2	6	876699	876704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536576
14014	NC_021028	ACA	2	6	876746	876751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536576
14015	NC_021028	G	6	6	876772	876777	0 %	0 %	100 %	0 %	480536576
14016	NC_021028	CTGG	2	8	876812	876819	0 %	25 %	50 %	25 %	480536576
14017	NC_021028	TGCC	2	8	876865	876872	0 %	25 %	25 %	50 %	480536576
14018	NC_021028	CAT	2	6	876877	876882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536576
14019	NC_021028	GAA	2	6	876929	876934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536576
14020	NC_021028	GAA	2	6	877068	877073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14021	NC_021028	ATTT	2	8	877080	877087	25 %	75 %	0 %	0 %	480536577
14022	NC_021028	T	7	7	877085	877091	0 %	100 %	0 %	0 %	480536577
14023	NC_021028	AGA	2	6	877170	877175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14024	NC_021028	AGC	2	6	877185	877190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536577
14025	NC_021028	TA	3	6	877231	877236	50 %	50 %	0 %	0 %	480536577
14026	NC_021028	AATG	2	8	877261	877268	50 %	25 %	25 %	0 %	480536577
14027	NC_021028	GAC	2	6	877282	877287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536577
14028	NC_021028	TGG	2	6	877305	877310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14029	NC_021028	AGA	2	6	877335	877340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14030	NC_021028	TAT	2	6	877354	877359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536577
14031	NC_021028	AGA	2	6	877437	877442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14032	NC_021028	AGAA	2	8	877505	877512	75 %	0 %	25 %	0 %	480536577
14033	NC_021028	TAT	2	6	877537	877542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536577
14034	NC_021028	GGT	2	6	877552	877557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14035	NC_021028	GTG	2	6	877604	877609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14036	NC_021028	ACAA	2	8	877637	877644	75 %	0 %	0 %	25 %	480536577
14037	NC_021028	TAT	3	9	877717	877725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536577
14038	NC_021028	TGG	2	6	877734	877739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14039	NC_021028	AATG	2	8	877753	877760	50 %	25 %	25 %	0 %	480536577
14040	NC_021028	TAC	2	6	877852	877857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536577
14041	NC_021028	AATG	2	8	877885	877892	50 %	25 %	25 %	0 %	480536577
14042	NC_021028	TAC	2	6	877984	877989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536577
14043	NC_021028	GGT	2	6	877999	878004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14044	NC_021028	AATG	2	8	878017	878024	50 %	25 %	25 %	0 %	480536577
14045	NC_021028	TAC	2	6	878116	878121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536577
14046	NC_021028	TGG	2	6	878130	878135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536577
14047	NC_021028	GGA	2	6	878197	878202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536577
14048	NC_021028	TGC	2	6	878220	878225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536577
14049	NC_021028	AGT	2	6	878235	878240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536577
14050	NC_021028	TA	3	6	878287	878292	50 %	50 %	0 %	0 %	480536577
14051	NC_021028	TGA	2	6	878334	878339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536577
14052	NC_021028	AGA	2	6	878388	878393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14053	NC_021028	TTA	2	6	878430	878435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536577
14054	NC_021028	ATT	2	6	878531	878536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536577
14055	NC_021028	CCTT	2	8	878579	878586	0 %	50 %	0 %	50 %	480536577
14056	NC_021028	GAA	2	6	878623	878628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14057	NC_021028	GAA	2	6	878704	878709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14058	NC_021028	GAA	2	6	878768	878773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14059	NC_021028	AAT	2	6	878794	878799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536577
14060	NC_021028	TGA	2	6	878853	878858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536577
14061	NC_021028	GAA	2	6	878918	878923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536577
14062	NC_021028	A	6	6	878987	878992	100 %	0 %	0 %	0 %	480536577
14063	NC_021028	TGA	3	9	879002	879010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536577
14064	NC_021028	T	6	6	879109	879114	0 %	100 %	0 %	0 %	480536578
14065	NC_021028	T	7	7	879126	879132	0 %	100 %	0 %	0 %	480536578
14066	NC_021028	CCA	2	6	879191	879196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536578
14067	NC_021028	T	6	6	879211	879216	0 %	100 %	0 %	0 %	480536578
14068	NC_021028	GA	3	6	879261	879266	50 %	0 %	50 %	0 %	480536578
14069	NC_021028	CTG	2	6	879282	879287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536578
14070	NC_021028	GTCT	2	8	879289	879296	0 %	50 %	25 %	25 %	480536578
14071	NC_021028	ACA	2	6	879332	879337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536578
14072	NC_021028	TCC	2	6	879374	879379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536578
14073	NC_021028	GAT	2	6	879436	879441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536578
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14075	NC_021028	TCT	2	6	879505	879510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536578
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14078	NC_021028	TCAA	2	8	879626	879633	50 %	25 %	0 %	25 %	480536578
14079	NC_021028	CTT	2	6	879654	879659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536578
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14084	NC_021028	TGTC	2	8	879843	879850	0 %	50 %	25 %	25 %	480536578
14085	NC_021028	T	6	6	879871	879876	0 %	100 %	0 %	0 %	480536578
14086	NC_021028	ACG	2	6	879913	879918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536578
14087	NC_021028	CTG	2	6	879934	879939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536578
14088	NC_021028	CCTTAT	2	12	879960	879971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480536578
14089	NC_021028	CAA	2	6	879982	879987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536578
14090	NC_021028	GAAG	2	8	880042	880049	50 %	0 %	50 %	0 %	480536578
14091	NC_021028	A	6	6	880082	880087	100 %	0 %	0 %	0 %	480536578
14092	NC_021028	T	6	6	880178	880183	0 %	100 %	0 %	0 %	480536578
14093	NC_021028	GA	3	6	880246	880251	50 %	0 %	50 %	0 %	480536578
14094	NC_021028	TGC	2	6	880635	880640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536578
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14096	NC_021028	TTCGC	2	10	880705	880714	0 %	40 %	20 %	40 %	480536578
14097	NC_021028	A	8	8	880736	880743	100 %	0 %	0 %	0 %	480536578
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14101	NC_021028	TCA	2	6	881053	881058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536579
14102	NC_021028	GAT	2	6	881132	881137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536579
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14104	NC_021028	CTT	2	6	881237	881242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536579
14105	NC_021028	GAA	3	9	881292	881300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536579
14106	NC_021028	AAG	2	6	881320	881325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536579
14107	NC_021028	GAA	2	6	881434	881439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536580
14108	NC_021028	GGTTTT	2	12	881488	881499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536580
14109	NC_021028	CGAAT	2	10	881509	881518	40 %	20 %	20 %	20 %	480536580
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14111	NC_021028	TGG	2	6	881588	881593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536580
14112	NC_021028	GGC	2	6	881646	881651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536580
14113	NC_021028	TAT	2	6	881726	881731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536580
14114	NC_021028	CAT	2	6	881845	881850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536581
14115	NC_021028	AC	3	6	881928	881933	50 %	0 %	0 %	50 %	480536581
14116	NC_021028	CTG	2	6	882030	882035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536581
14117	NC_021028	TGG	2	6	882105	882110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536581
14118	NC_021028	TCCA	2	8	882129	882136	25 %	25 %	0 %	50 %	480536581
14119	NC_021028	TGA	2	6	882157	882162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536581
14120	NC_021028	AGT	2	6	882385	882390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536581
14121	NC_021028	AGAC	2	8	882417	882424	50 %	0 %	25 %	25 %	480536581
14122	NC_021028	CAT	2	6	882445	882450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536581
14123	NC_021028	ATC	2	6	882479	882484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536581
14124	NC_021028	CGT	2	6	882527	882532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536581
14125	NC_021028	GTCAAG	2	12	882578	882589	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	480536581
14126	NC_021028	AGA	2	6	882762	882767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536582
14127	NC_021028	GAT	2	6	882796	882801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536582
14128	NC_021028	CGT	2	6	882863	882868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536582
14129	NC_021028	GACA	2	8	882892	882899	50 %	0 %	25 %	25 %	480536582
14130	NC_021028	TAT	2	6	882941	882946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536582
14131	NC_021028	TTC	2	6	882983	882988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536582
14132	NC_021028	A	6	6	883088	883093	100 %	0 %	0 %	0 %	480536582
14133	NC_021028	AGACC	2	10	883186	883195	40 %	0 %	20 %	40 %	480536582
14134	NC_021028	CAG	2	6	883281	883286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536582
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14137	NC_021028	CCA	2	6	883353	883358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536582
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14147	NC_021028	GA	3	6	883821	883826	50 %	0 %	50 %	0 %	480536583
14148	NC_021028	CAGA	2	8	883837	883844	50 %	0 %	25 %	25 %	480536583
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14150	NC_021028	TTGG	2	8	883911	883918	0 %	50 %	50 %	0 %	480536583
14151	NC_021028	A	7	7	884018	884024	100 %	0 %	0 %	0 %	480536583
14152	NC_021028	GCCA	2	8	884035	884042	25 %	0 %	25 %	50 %	480536583
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14159	NC_021028	TGG	2	6	884578	884583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536584
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14163	NC_021028	TCT	2	6	884773	884778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536584
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14190	NC_021028	CAAG	2	8	886321	886328	50 %	0 %	25 %	25 %	480536587
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14223	NC_021028	GAAA	2	8	888028	888035	75 %	0 %	25 %	0 %	480536587
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14230	NC_021028	CG	3	6	888507	888512	0 %	0 %	50 %	50 %	480536588
14231	NC_021028	TGA	2	6	888515	888520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536588
14232	NC_021028	AAAC	2	8	888598	888605	75 %	0 %	0 %	25 %	480536589
14233	NC_021028	ATTGA	2	10	888691	888700	40 %	40 %	20 %	0 %	480536589
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14235	NC_021028	GAT	2	6	888799	888804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536589
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14237	NC_021028	A	6	6	888853	888858	100 %	0 %	0 %	0 %	480536589
14238	NC_021028	TTCA	2	8	888875	888882	25 %	50 %	0 %	25 %	480536589
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14482	NC_021028	ATG	2	6	903567	903572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536604
14483	NC_021028	ATG	2	6	903574	903579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536604
14484	NC_021028	GGA	2	6	903632	903637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536604
14485	NC_021028	A	6	6	903756	903761	100 %	0 %	0 %	0 %	480536604
14486	NC_021028	ATG	2	6	903774	903779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536604
14487	NC_021028	TGC	2	6	903800	903805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536604
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14489	NC_021028	ATG	2	6	903874	903879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536604
14490	NC_021028	TCA	2	6	903898	903903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536604
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