MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_021028	CAA	2	6	807369	807374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536519
13003	NC_021028	AAGC	2	8	807401	807408	50 %	0 %	25 %	25 %	480536519
13004	NC_021028	AAC	2	6	807427	807432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536519
13005	NC_021028	AAAAT	2	10	807484	807493	80 %	20 %	0 %	0 %	480536519
13006	NC_021028	GTT	2	6	807566	807571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536519
13007	NC_021028	GAG	2	6	807576	807581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536519
13008	NC_021028	ACA	2	6	807711	807716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536519
13009	NC_021028	TAC	2	6	807741	807746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536519
13010	NC_021028	TAA	2	6	807754	807759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536519
13011	NC_021028	TAT	2	6	807833	807838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536519
13012	NC_021028	AAT	3	9	807852	807860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536519
13013	NC_021028	A	8	8	807914	807921	100 %	0 %	0 %	0 %	480536519
13014	NC_021028	TAT	2	6	811999	812004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536520
13015	NC_021028	TGG	2	6	812019	812024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536520
13016	NC_021028	T	6	6	812031	812036	0 %	100 %	0 %	0 %	480536520
13017	NC_021028	TTC	2	6	812040	812045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536520
13018	NC_021028	GAT	2	6	812079	812084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536520
13019	NC_021028	AGAC	2	8	812086	812093	50 %	0 %	25 %	25 %	480536520
13020	NC_021028	TAG	2	6	812184	812189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536520
13021	NC_021028	ATA	2	6	812286	812291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536520
13022	NC_021028	TCT	2	6	812299	812304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536520
13023	NC_021028	AAG	2	6	812382	812387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536520
13024	NC_021028	T	6	6	812419	812424	0 %	100 %	0 %	0 %	480536520
13025	NC_021028	TGG	2	6	812446	812451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536520
13026	NC_021028	ATA	2	6	812470	812475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536520
13027	NC_021028	AAGGT	2	10	812493	812502	40 %	20 %	40 %	0 %	480536521
13028	NC_021028	AGT	2	6	812572	812577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13029	NC_021028	CTT	2	6	812604	812609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
13030	NC_021028	TCCA	2	8	812648	812655	25 %	25 %	0 %	50 %	480536521
13031	NC_021028	CTA	2	6	812676	812681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536521
13032	NC_021028	TTGT	2	8	812882	812889	0 %	75 %	25 %	0 %	480536521
13033	NC_021028	TGAGC	2	10	812910	812919	20 %	20 %	40 %	20 %	480536521
13034	NC_021028	CTT	2	6	813069	813074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
13035	NC_021028	ATTG	2	8	813242	813249	25 %	50 %	25 %	0 %	480536521
13036	NC_021028	CTTTA	2	10	813391	813400	20 %	60 %	0 %	20 %	480536521
13037	NC_021028	ACC	2	6	813586	813591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536521
13038	NC_021028	GTA	2	6	813619	813624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13039	NC_021028	ATG	2	6	813633	813638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13040	NC_021028	TGT	2	6	813727	813732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536521
13041	NC_021028	CTTGA	2	10	813760	813769	20 %	40 %	20 %	20 %	480536521
13042	NC_021028	GGAA	2	8	813926	813933	50 %	0 %	50 %	0 %	480536521
13043	NC_021028	AG	3	6	814092	814097	50 %	0 %	50 %	0 %	480536521
13044	NC_021028	TGA	2	6	814127	814132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13045	NC_021028	GCTG	2	8	814138	814145	0 %	25 %	50 %	25 %	480536521
13046	NC_021028	ATG	2	6	814148	814153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13047	NC_021028	AAT	2	6	814183	814188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536521
13048	NC_021028	AGT	2	6	814305	814310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536521
13049	NC_021028	TCC	2	6	814322	814327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536521
13050	NC_021028	T	6	6	814372	814377	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
13051	NC_021028	TCAA	2	8	814409	814416	50 %	25 %	0 %	25 %	480536521
13052	NC_021028	AT	3	6	814423	814428	50 %	50 %	0 %	0 %	480536521
13053	NC_021028	A	6	6	814518	814523	100 %	0 %	0 %	0 %	480536521
13054	NC_021028	CTG	2	6	814527	814532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536521
13055	NC_021028	TCT	2	6	814541	814546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536521
13056	NC_021028	A	6	6	814552	814557	100 %	0 %	0 %	0 %	480536521
13057	NC_021028	CAG	2	6	814561	814566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536521
13058	NC_021028	T	7	7	814572	814578	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
13059	NC_021028	GCT	2	6	814583	814588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536521
13060	NC_021028	ACG	2	6	814633	814638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536521
13061	NC_021028	T	7	7	814696	814702	0 %	100 %	0 %	0 %	480536521
13062	NC_021028	TCGA	2	8	815162	815169	25 %	25 %	25 %	25 %	480536522
13063	NC_021028	AGC	2	6	815182	815187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536522
13064	NC_021028	ATG	2	6	815216	815221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13065	NC_021028	A	7	7	815266	815272	100 %	0 %	0 %	0 %	480536522
13066	NC_021028	GAT	2	6	815318	815323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13067	NC_021028	CAG	2	6	815369	815374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536522
13068	NC_021028	TGA	2	6	815376	815381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13069	NC_021028	GGA	2	6	815440	815445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536522
13070	NC_021028	TA	3	6	815507	815512	50 %	50 %	0 %	0 %	480536522
13071	NC_021028	TCA	2	6	815545	815550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
13072	NC_021028	TTC	2	6	815604	815609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536522
13073	NC_021028	CAG	2	6	815817	815822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536522
13074	NC_021028	GA	3	6	815833	815838	50 %	0 %	50 %	0 %	480536522
13075	NC_021028	TAGAC	2	10	815893	815902	40 %	20 %	20 %	20 %	480536522
13076	NC_021028	TGA	2	6	815935	815940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13077	NC_021028	GTT	2	6	815951	815956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536522
13078	NC_021028	TTG	2	6	815963	815968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536522
13079	NC_021028	TAT	2	6	815990	815995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536522
13080	NC_021028	ATGGGA	2	12	815996	816007	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	480536522
13081	NC_021028	TGATAT	3	18	816124	816141	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	480536522
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13084	NC_021028	CAAG	2	8	816238	816245	50 %	0 %	25 %	25 %	480536522
13085	NC_021028	TTGC	2	8	816408	816415	0 %	50 %	25 %	25 %	480536522
13086	NC_021028	TGA	2	6	816511	816516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13087	NC_021028	ATG	2	6	816534	816539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13088	NC_021028	AGA	2	6	816609	816614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536522
13089	NC_021028	TTGC	2	8	816623	816630	0 %	50 %	25 %	25 %	480536522
13090	NC_021028	GAA	2	6	816659	816664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536522
13091	NC_021028	ATTT	2	8	816693	816700	25 %	75 %	0 %	0 %	480536522
13092	NC_021028	ACT	2	6	816800	816805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
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13094	NC_021028	GAA	2	6	816869	816874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536522
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13099	NC_021028	ATT	2	6	817242	817247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536522
13100	NC_021028	CT	3	6	817297	817302	0 %	50 %	0 %	50 %	480536522
13101	NC_021028	CAA	2	6	817339	817344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536522
13102	NC_021028	TCTA	2	8	817346	817353	25 %	50 %	0 %	25 %	480536522
13103	NC_021028	TA	3	6	817352	817357	50 %	50 %	0 %	0 %	480536522
13104	NC_021028	ATT	2	6	817403	817408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536522
13105	NC_021028	A	7	7	817521	817527	100 %	0 %	0 %	0 %	480536522
13106	NC_021028	TAA	2	6	817543	817548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536522
13107	NC_021028	GTTT	2	8	817587	817594	0 %	75 %	25 %	0 %	480536522
13108	NC_021028	GCTAT	2	10	817761	817770	20 %	40 %	20 %	20 %	480536522
13109	NC_021028	CTT	2	6	817831	817836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536522
13110	NC_021028	GAT	2	6	817844	817849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536522
13111	NC_021028	A	6	6	817856	817861	100 %	0 %	0 %	0 %	480536522
13112	NC_021028	CT	3	6	817872	817877	0 %	50 %	0 %	50 %	480536522
13113	NC_021028	CTA	2	6	817927	817932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
13114	NC_021028	TCA	2	6	818091	818096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
13115	NC_021028	CAT	2	6	818135	818140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536522
13116	NC_021028	TGAA	2	8	818175	818182	50 %	25 %	25 %	0 %	480536522
13117	NC_021028	GCT	2	6	818343	818348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536523
13118	NC_021028	GTT	2	6	818358	818363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536523
13119	NC_021028	CAT	2	6	818468	818473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536523
13120	NC_021028	GTG	2	6	818479	818484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536523
13121	NC_021028	TTC	2	6	818491	818496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536523
13122	NC_021028	A	6	6	818559	818564	100 %	0 %	0 %	0 %	480536523
13123	NC_021028	GTT	2	6	818583	818588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536523
13124	NC_021028	GGT	2	6	818592	818597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536523
13125	NC_021028	TAC	2	6	818720	818725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536523
13126	NC_021028	CAT	2	6	818758	818763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536523
13127	NC_021028	CGT	2	6	818772	818777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536523
13128	NC_021028	TGA	2	6	818849	818854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536523
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13132	NC_021028	ATC	2	6	818940	818945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536523
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13142	NC_021028	A	6	6	819418	819423	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
13143	NC_021028	ATTG	2	8	819489	819496	25 %	50 %	25 %	0 %	480536524
13144	NC_021028	ACC	2	6	819539	819544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536524
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13146	NC_021028	A	6	6	819598	819603	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
13147	NC_021028	CTT	2	6	819613	819618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536524
13148	NC_021028	A	6	6	819692	819697	100 %	0 %	0 %	0 %	480536524
13149	NC_021028	AATCA	2	10	819720	819729	60 %	20 %	0 %	20 %	480536524
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13151	NC_021028	GTC	2	6	819794	819799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536524
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13222	NC_021028	CTAAAA	2	12	826072	826083	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480536529
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13228	NC_021028	ATC	2	6	826325	826330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536530
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13230	NC_021028	A	6	6	826447	826452	100 %	0 %	0 %	0 %	480536530
13231	NC_021028	TCA	2	6	826454	826459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536530
13232	NC_021028	T	7	7	826486	826492	0 %	100 %	0 %	0 %	480536530
13233	NC_021028	TTTC	2	8	826539	826546	0 %	75 %	0 %	25 %	480536530
13234	NC_021028	T	7	7	826733	826739	0 %	100 %	0 %	0 %	480536530
13235	NC_021028	TGA	2	6	826752	826757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536530
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13238	NC_021028	A	6	6	826810	826815	100 %	0 %	0 %	0 %	480536530
13239	NC_021028	GAAGG	2	10	826912	826921	40 %	0 %	60 %	0 %	480536530
13240	NC_021028	GA	3	6	826937	826942	50 %	0 %	50 %	0 %	480536530
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13482	NC_021028	GAA	2	6	843091	843096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536543
13483	NC_021028	AGC	2	6	843120	843125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536543
13484	NC_021028	CAA	2	6	843150	843155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536543
13485	NC_021028	CCAG	2	8	843250	843257	25 %	0 %	25 %	50 %	480536543
13486	NC_021028	GGT	2	6	843271	843276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536543
13487	NC_021028	CAA	2	6	843298	843303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536543
13488	NC_021028	CAA	2	6	843377	843382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536544
13489	NC_021028	GCT	2	6	843415	843420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536544
13490	NC_021028	ATT	2	6	843436	843441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536544
13491	NC_021028	GTT	2	6	843453	843458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536544
13492	NC_021028	ACT	2	6	843494	843499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536544
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13495	NC_021028	GGTATC	2	12	843769	843780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536544
13496	NC_021028	GCA	2	6	843925	843930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536544
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13500	NC_021028	CTGTT	2	10	844094	844103	0 %	60 %	20 %	20 %	480536544

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