MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021028	G	7	7	682358	682364	0 %	0 %	100 %	0 %	480536411
11002	NC_021028	AAC	2	6	682365	682370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536411
11003	NC_021028	CTT	3	9	682412	682420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536411
11004	NC_021028	AAC	2	6	682501	682506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536411
11005	NC_021028	TTGA	2	8	682514	682521	25 %	50 %	25 %	0 %	480536411
11006	NC_021028	CAGGAA	2	12	682593	682604	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480536411
11007	NC_021028	TCA	2	6	682616	682621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536411
11008	NC_021028	GAA	2	6	682622	682627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536411
11009	NC_021028	ACA	2	6	683013	683018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536412
11010	NC_021028	GCA	2	6	683028	683033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536412
11011	NC_021028	TGA	2	6	683038	683043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536412
11012	NC_021028	GA	3	6	683042	683047	50 %	0 %	50 %	0 %	480536412
11013	NC_021028	TTGGT	2	10	683092	683101	0 %	60 %	40 %	0 %	480536412
11014	NC_021028	CAAG	2	8	683121	683128	50 %	0 %	25 %	25 %	480536412
11015	NC_021028	CAA	2	6	683140	683145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536412
11016	NC_021028	TCTA	2	8	683151	683158	25 %	50 %	0 %	25 %	480536412
11017	NC_021028	TCT	2	6	683171	683176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536412
11018	NC_021028	TGT	2	6	683213	683218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536412
11019	NC_021028	AGA	2	6	683243	683248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11020	NC_021028	TTA	2	6	683320	683325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536412
11021	NC_021028	GAA	2	6	683373	683378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11022	NC_021028	AGA	2	6	683402	683407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11023	NC_021028	AGA	2	6	683447	683452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11024	NC_021028	GAAA	2	8	683549	683556	75 %	0 %	25 %	0 %	480536412
11025	NC_021028	GAA	2	6	683583	683588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11026	NC_021028	TCGC	2	8	683590	683597	0 %	25 %	25 %	50 %	480536412
11027	NC_021028	AAG	2	6	683617	683622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536412
11028	NC_021028	CTT	2	6	683778	683783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536413
11029	NC_021028	ATA	2	6	683869	683874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536413
11030	NC_021028	A	6	6	683884	683889	100 %	0 %	0 %	0 %	480536413
11031	NC_021028	A	6	6	683912	683917	100 %	0 %	0 %	0 %	480536413
11032	NC_021028	T	6	6	683978	683983	0 %	100 %	0 %	0 %	480536413
11033	NC_021028	ATG	2	6	684004	684009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536413
11034	NC_021028	GATAA	2	10	684036	684045	60 %	20 %	20 %	0 %	480536413
11035	NC_021028	ACTCT	2	10	684063	684072	20 %	40 %	0 %	40 %	480536413
11036	NC_021028	CAA	2	6	684092	684097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536413
11037	NC_021028	ATCC	2	8	684111	684118	25 %	25 %	0 %	50 %	480536413
11038	NC_021028	TGG	2	6	684125	684130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536413
11039	NC_021028	GTAT	2	8	684166	684173	25 %	50 %	25 %	0 %	480536413
11040	NC_021028	TGA	2	6	684230	684235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536413
11041	NC_021028	GAT	2	6	684396	684401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536413
11042	NC_021028	GAT	2	6	684426	684431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536413
11043	NC_021028	GGT	2	6	684456	684461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536413
11044	NC_021028	TTG	2	6	684526	684531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536413
11045	NC_021028	AGA	2	6	684619	684624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536413
11046	NC_021028	TC	3	6	684642	684647	0 %	50 %	0 %	50 %	480536413
11047	NC_021028	ATGG	2	8	684765	684772	25 %	25 %	50 %	0 %	480536413
11048	NC_021028	ATT	2	6	684845	684850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536414
11049	NC_021028	GA	3	6	684856	684861	50 %	0 %	50 %	0 %	480536414
11050	NC_021028	A	6	6	684869	684874	100 %	0 %	0 %	0 %	480536414
11051	NC_021028	AAAG	2	8	685054	685061	75 %	0 %	25 %	0 %	480536414
11052	NC_021028	CGT	2	6	685076	685081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536414
11053	NC_021028	TTGG	2	8	685214	685221	0 %	50 %	50 %	0 %	480536414
11054	NC_021028	GTTC	2	8	685235	685242	0 %	50 %	25 %	25 %	480536414
11055	NC_021028	GATTGC	2	12	685279	685290	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480536414
11056	NC_021028	AAT	2	6	685304	685309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536414
11057	NC_021028	TGA	2	6	685327	685332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536414
11058	NC_021028	AAC	2	6	685405	685410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536414
11059	NC_021028	ATA	2	6	685428	685433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536414
11060	NC_021028	TCGT	2	8	685488	685495	0 %	50 %	25 %	25 %	480536414
11061	NC_021028	GAT	2	6	685523	685528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536414
11062	NC_021028	TAG	2	6	685529	685534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536414
11063	NC_021028	T	6	6	685536	685541	0 %	100 %	0 %	0 %	480536415
11064	NC_021028	ATTT	2	8	685546	685553	25 %	75 %	0 %	0 %	480536415
11065	NC_021028	GCT	2	6	685596	685601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536415
11066	NC_021028	TCAGT	2	10	685603	685612	20 %	40 %	20 %	20 %	480536415
11067	NC_021028	TGG	2	6	685630	685635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536415
11068	NC_021028	AAT	2	6	685689	685694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
11069	NC_021028	GTA	2	6	685701	685706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
11070	NC_021028	ATA	2	6	685732	685737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
11071	NC_021028	AAG	2	6	685753	685758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
11072	NC_021028	AAT	2	6	685773	685778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536415
11073	NC_021028	GAA	2	6	685805	685810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
11074	NC_021028	AGA	2	6	685847	685852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536415
11075	NC_021028	CT	3	6	685918	685923	0 %	50 %	0 %	50 %	480536415
11076	NC_021028	ATG	2	6	685924	685929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
11077	NC_021028	ATG	2	6	685957	685962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
11078	NC_021028	A	7	7	685986	685992	100 %	0 %	0 %	0 %	480536415
11079	NC_021028	ATT	2	6	686142	686147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536415
11080	NC_021028	CAA	2	6	686306	686311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536415
11081	NC_021028	ATTT	2	8	686350	686357	25 %	75 %	0 %	0 %	480536415
11082	NC_021028	TGA	2	6	686365	686370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536415
11083	NC_021028	CTA	2	6	686376	686381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536415
11084	NC_021028	ATG	2	6	686735	686740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
11085	NC_021028	TGTCT	2	10	686758	686767	0 %	60 %	20 %	20 %	480536416
11086	NC_021028	GCT	2	6	686825	686830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11087	NC_021028	TGA	2	6	686835	686840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
11088	NC_021028	TGA	2	6	686862	686867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
11089	NC_021028	CAC	2	6	686883	686888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536416
11090	NC_021028	TCA	2	6	686892	686897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
11091	NC_021028	G	6	6	686925	686930	0 %	0 %	100 %	0 %	480536416
11092	NC_021028	TTTG	2	8	686950	686957	0 %	75 %	25 %	0 %	480536416
11093	NC_021028	GGA	2	6	686969	686974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536416
11094	NC_021028	TGG	2	6	686995	687000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
11095	NC_021028	CGC	2	6	687007	687012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536416
11096	NC_021028	ACT	2	6	687101	687106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
11097	NC_021028	TGG	2	6	687112	687117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
11098	NC_021028	TCAA	2	8	687119	687126	50 %	25 %	0 %	25 %	480536416
11099	NC_021028	ACA	2	6	687222	687227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536416
11100	NC_021028	TAC	2	6	687230	687235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536416
11101	NC_021028	TTC	2	6	687266	687271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
11102	NC_021028	TTC	2	6	687303	687308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
11103	NC_021028	TGC	2	6	687334	687339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11104	NC_021028	AGT	2	6	687349	687354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
11105	NC_021028	AAT	2	6	687368	687373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536416
11106	NC_021028	CAC	2	6	687470	687475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536416
11107	NC_021028	TGG	2	6	687508	687513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536416
11108	NC_021028	TTG	2	6	687714	687719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536416
11109	NC_021028	ATG	2	6	687767	687772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
11110	NC_021028	CATGTT	2	12	687826	687837	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480536416
11111	NC_021028	TGC	2	6	687880	687885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11112	NC_021028	CGT	2	6	687901	687906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11113	NC_021028	TGGTAT	2	12	687973	687984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	480536416
11114	NC_021028	CTG	2	6	688104	688109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11115	NC_021028	AGA	2	6	688117	688122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536416
11116	NC_021028	CAG	2	6	688126	688131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11117	NC_021028	GCA	2	6	688145	688150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536416
11118	NC_021028	CTT	2	6	688178	688183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536416
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11120	NC_021028	TGA	2	6	688305	688310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536416
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11252	NC_021028	TG	3	6	697023	697028	0 %	50 %	50 %	0 %	480536424
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