MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021028	TGG	2	6	620911	620916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536345
10002	NC_021028	TTA	2	6	620920	620925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536345
10003	NC_021028	GGAA	2	8	620946	620953	50 %	0 %	50 %	0 %	480536345
10004	NC_021028	CAAG	2	8	620957	620964	50 %	0 %	25 %	25 %	480536345
10005	NC_021028	CTT	2	6	620970	620975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536345
10006	NC_021028	CTG	2	6	621003	621008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536345
10007	NC_021028	A	8	8	621052	621059	100 %	0 %	0 %	0 %	480536345
10008	NC_021028	GTAT	2	8	621061	621068	25 %	50 %	25 %	0 %	480536345
10009	NC_021028	ATG	2	6	621266	621271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536346
10010	NC_021028	ATT	2	6	621281	621286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536346
10011	NC_021028	TGG	2	6	621298	621303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536346
10012	NC_021028	AAC	2	6	621328	621333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536346
10013	NC_021028	TCAA	2	8	621359	621366	50 %	25 %	0 %	25 %	480536346
10014	NC_021028	TGA	2	6	621400	621405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536346
10015	NC_021028	CTTG	2	8	621436	621443	0 %	50 %	25 %	25 %	480536346
10016	NC_021028	GCA	2	6	621449	621454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10017	NC_021028	CAAA	2	8	621559	621566	75 %	0 %	0 %	25 %	480536346
10018	NC_021028	ATG	2	6	621606	621611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536346
10019	NC_021028	AGC	2	6	621619	621624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10020	NC_021028	AACC	2	8	621656	621663	50 %	0 %	0 %	50 %	480536346
10021	NC_021028	TGG	2	6	621697	621702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536346
10022	NC_021028	TCG	2	6	621708	621713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10023	NC_021028	GCA	2	6	621746	621751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10024	NC_021028	TCG	2	6	621862	621867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10025	NC_021028	TTGA	2	8	621908	621915	25 %	50 %	25 %	0 %	480536346
10026	NC_021028	GAA	2	6	621923	621928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536346
10027	NC_021028	GAC	2	6	621968	621973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10028	NC_021028	CAA	2	6	622053	622058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536346
10029	NC_021028	GGT	3	9	622067	622075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536346
10030	NC_021028	GT	3	6	622074	622079	0 %	50 %	50 %	0 %	480536346
10031	NC_021028	CTA	2	6	622155	622160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536346
10032	NC_021028	AGC	2	6	622204	622209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536346
10033	NC_021028	AAGG	2	8	622373	622380	50 %	0 %	50 %	0 %	480536347
10034	NC_021028	AAG	2	6	622530	622535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536347
10035	NC_021028	ACT	2	6	622599	622604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536347
10036	NC_021028	GTT	2	6	622658	622663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536347
10037	NC_021028	CGC	2	6	622721	622726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536347
10038	NC_021028	ATT	2	6	622730	622735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536347
10039	NC_021028	GAA	2	6	622760	622765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536347
10040	NC_021028	GCT	2	6	622774	622779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536347
10041	NC_021028	ATCT	2	8	622829	622836	25 %	50 %	0 %	25 %	480536347
10042	NC_021028	TGG	2	6	622872	622877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536347
10043	NC_021028	CAC	2	6	622880	622885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536347
10044	NC_021028	GAT	3	9	622915	622923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536347
10045	NC_021028	TTC	2	6	622955	622960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536347
10046	NC_021028	TCA	2	6	622965	622970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536347
10047	NC_021028	AGA	2	6	623098	623103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536347
10048	NC_021028	TGG	2	6	623112	623117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536347
10049	NC_021028	CGA	2	6	623228	623233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536348
10050	NC_021028	GCT	2	6	623234	623239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536348
10051	NC_021028	T	6	6	623239	623244	0 %	100 %	0 %	0 %	480536348
10052	NC_021028	TTC	2	6	623251	623256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536348
10053	NC_021028	GCT	2	6	623264	623269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536348
10054	NC_021028	CTTT	2	8	623292	623299	0 %	75 %	0 %	25 %	480536348
10055	NC_021028	AAT	2	6	623514	623519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536349
10056	NC_021028	TTG	2	6	623525	623530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536349
10057	NC_021028	CTG	2	6	623537	623542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536349
10058	NC_021028	AGA	2	6	623658	623663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536349
10059	NC_021028	GCAG	2	8	623664	623671	25 %	0 %	50 %	25 %	480536349
10060	NC_021028	TCA	2	6	623679	623684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536349
10061	NC_021028	AG	3	6	623698	623703	50 %	0 %	50 %	0 %	480536349
10062	NC_021028	GGACT	2	10	623801	623810	20 %	20 %	40 %	20 %	480536349
10063	NC_021028	ACC	2	6	623837	623842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536349
10064	NC_021028	CTC	2	6	623855	623860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536349
10065	NC_021028	GAG	2	6	623863	623868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536349
10066	NC_021028	TGG	2	6	623924	623929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536349
10067	NC_021028	AGCA	2	8	623930	623937	50 %	0 %	25 %	25 %	480536349
10068	NC_021028	TCG	3	9	623961	623969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536349
10069	NC_021028	GAT	2	6	624055	624060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536349
10070	NC_021028	ACC	2	6	624089	624094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536349
10071	NC_021028	GCT	2	6	624169	624174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536349
10072	NC_021028	CGT	2	6	624262	624267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536349
10073	NC_021028	GAT	2	6	624379	624384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536349
10074	NC_021028	A	6	6	624395	624400	100 %	0 %	0 %	0 %	480536350
10075	NC_021028	GAG	2	6	624401	624406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536350
10076	NC_021028	CTG	2	6	624413	624418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536350
10077	NC_021028	GAA	2	6	624464	624469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536350
10078	NC_021028	TCG	2	6	624552	624557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536350
10079	NC_021028	TGG	2	6	624588	624593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536350
10080	NC_021028	AGA	2	6	624598	624603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536350
10081	NC_021028	ACT	2	6	624608	624613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536350
10082	NC_021028	CAA	2	6	624622	624627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536350
10083	NC_021028	TTGG	2	8	624788	624795	0 %	50 %	50 %	0 %	480536350
10084	NC_021028	CAGG	2	8	624818	624825	25 %	0 %	50 %	25 %	480536350
10085	NC_021028	CGT	2	6	624872	624877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536350
10086	NC_021028	AATCA	2	10	624887	624896	60 %	20 %	0 %	20 %	480536350
10087	NC_021028	GGT	2	6	624919	624924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536350
10088	NC_021028	GAA	2	6	625196	625201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536350
10089	NC_021028	AGCA	2	8	625202	625209	50 %	0 %	25 %	25 %	480536350
10090	NC_021028	GAG	2	6	625256	625261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536350
10091	NC_021028	A	6	6	625266	625271	100 %	0 %	0 %	0 %	480536350
10092	NC_021028	TC	3	6	625276	625281	0 %	50 %	0 %	50 %	480536350
10093	NC_021028	CAT	2	6	625282	625287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536350
10094	NC_021028	TAA	2	6	625330	625335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536350
10095	NC_021028	TGG	2	6	625344	625349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536350
10096	NC_021028	ATT	2	6	625426	625431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536350
10097	NC_021028	AG	3	6	625510	625515	50 %	0 %	50 %	0 %	480536350
10098	NC_021028	GAA	2	6	625529	625534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536350
10099	NC_021028	AAAT	2	8	625585	625592	75 %	25 %	0 %	0 %	480536350
10100	NC_021028	AGA	2	6	625600	625605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536350
10101	NC_021028	TTA	2	6	625720	625725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536351
10102	NC_021028	GTT	2	6	625740	625745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536351
10103	NC_021028	A	7	7	625773	625779	100 %	0 %	0 %	0 %	480536351
10104	NC_021028	ATT	2	6	625798	625803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536351
10105	NC_021028	TCAG	2	8	625813	625820	25 %	25 %	25 %	25 %	480536351
10106	NC_021028	TCTG	2	8	625886	625893	0 %	50 %	25 %	25 %	480536351
10107	NC_021028	GAG	2	6	625953	625958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536351
10108	NC_021028	AAG	2	6	626161	626166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536351
10109	NC_021028	CTG	2	6	626167	626172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536351
10110	NC_021028	TA	3	6	626221	626226	50 %	50 %	0 %	0 %	480536351
10111	NC_021028	ATTA	2	8	626230	626237	50 %	50 %	0 %	0 %	480536351
10112	NC_021028	TTA	2	6	626427	626432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536352
10113	NC_021028	CAGA	2	8	626507	626514	50 %	0 %	25 %	25 %	480536352
10114	NC_021028	GT	3	6	626568	626573	0 %	50 %	50 %	0 %	480536352
10115	NC_021028	CATT	2	8	626596	626603	25 %	50 %	0 %	25 %	480536352
10116	NC_021028	GCT	2	6	626756	626761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536352
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10118	NC_021028	TGA	2	6	626974	626979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536352
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10120	NC_021028	CCT	2	6	627055	627060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536352
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10152	NC_021028	GA	3	6	628819	628824	50 %	0 %	50 %	0 %	480536354
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