MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_021028	TCA	2	6	498357	498362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536245
8002	NC_021028	GGT	2	6	498481	498486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536245
8003	NC_021028	GGCT	2	8	498535	498542	0 %	25 %	50 %	25 %	480536245
8004	NC_021028	GTTT	2	8	498571	498578	0 %	75 %	25 %	0 %	480536245
8005	NC_021028	T	6	6	498646	498651	0 %	100 %	0 %	0 %	480536246
8006	NC_021028	TAA	2	6	498689	498694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536246
8007	NC_021028	G	7	7	498727	498733	0 %	0 %	100 %	0 %	480536246
8008	NC_021028	TCT	2	6	498768	498773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536246
8009	NC_021028	AAC	2	6	498842	498847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536246
8010	NC_021028	TCTT	2	8	498866	498873	0 %	75 %	0 %	25 %	480536246
8011	NC_021028	TTC	2	6	498907	498912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536246
8012	NC_021028	TCT	2	6	498919	498924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536246
8013	NC_021028	CAG	2	6	498954	498959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536246
8014	NC_021028	AGG	2	6	499010	499015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536246
8015	NC_021028	CTT	2	6	499033	499038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536246
8016	NC_021028	CT	4	8	499086	499093	0 %	50 %	0 %	50 %	480536246
8017	NC_021028	TTTC	2	8	499094	499101	0 %	75 %	0 %	25 %	480536246
8018	NC_021028	T	6	6	499133	499138	0 %	100 %	0 %	0 %	480536246
8019	NC_021028	TTG	2	6	499153	499158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536246
8020	NC_021028	ACA	2	6	499220	499225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536246
8021	NC_021028	TAT	2	6	499240	499245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536246
8022	NC_021028	CTAG	2	8	499541	499548	25 %	25 %	25 %	25 %	480536247
8023	NC_021028	ATT	2	6	499567	499572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536247
8024	NC_021028	GTC	2	6	499578	499583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536247
8025	NC_021028	TG	3	6	499605	499610	0 %	50 %	50 %	0 %	480536247
8026	NC_021028	TATGA	2	10	499646	499655	40 %	40 %	20 %	0 %	480536247
8027	NC_021028	TGA	2	6	499707	499712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536247
8028	NC_021028	TAC	2	6	499758	499763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536247
8029	NC_021028	AGTGA	2	10	499814	499823	40 %	20 %	40 %	0 %	480536247
8030	NC_021028	AG	3	6	499856	499861	50 %	0 %	50 %	0 %	480536247
8031	NC_021028	ATTT	2	8	499928	499935	25 %	75 %	0 %	0 %	480536247
8032	NC_021028	GGAA	2	8	500019	500026	50 %	0 %	50 %	0 %	480536247
8033	NC_021028	CTA	2	6	500035	500040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536247
8034	NC_021028	TAT	2	6	500120	500125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536247
8035	NC_021028	AGA	2	6	500198	500203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536247
8036	NC_021028	TGACT	2	10	500496	500505	20 %	40 %	20 %	20 %	480536248
8037	NC_021028	ACT	2	6	500507	500512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536248
8038	NC_021028	A	6	6	500566	500571	100 %	0 %	0 %	0 %	480536248
8039	NC_021028	CGT	2	6	500584	500589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536248
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8041	NC_021028	GTCCT	2	10	501148	501157	0 %	40 %	20 %	40 %	480536249
8042	NC_021028	TTG	2	6	501327	501332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536249
8043	NC_021028	AT	3	6	501362	501367	50 %	50 %	0 %	0 %	480536249
8044	NC_021028	GAA	2	6	501523	501528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536250
8045	NC_021028	A	6	6	501541	501546	100 %	0 %	0 %	0 %	480536250
8046	NC_021028	ATC	2	6	501553	501558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536250
8047	NC_021028	AGT	2	6	501564	501569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536250
8048	NC_021028	GTCA	2	8	501605	501612	25 %	25 %	25 %	25 %	480536250
8049	NC_021028	A	6	6	501638	501643	100 %	0 %	0 %	0 %	480536250
8050	NC_021028	GTT	2	6	501676	501681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536250
8051	NC_021028	GAA	2	6	501772	501777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536250
8052	NC_021028	AGC	2	6	501801	501806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536250
8053	NC_021028	CAAA	2	8	501816	501823	75 %	0 %	0 %	25 %	480536250
8054	NC_021028	CAT	2	6	501825	501830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536250
8055	NC_021028	A	6	6	501833	501838	100 %	0 %	0 %	0 %	480536250
8056	NC_021028	GCAA	2	8	501842	501849	50 %	0 %	25 %	25 %	480536250
8057	NC_021028	GTG	2	6	502055	502060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536250
8058	NC_021028	ATG	2	6	502133	502138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536250
8059	NC_021028	GTG	3	9	502244	502252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536250
8060	NC_021028	AAG	2	6	502261	502266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536250
8061	NC_021028	GAA	2	6	502327	502332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536250
8062	NC_021028	CTG	2	6	502394	502399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536250
8063	NC_021028	TGA	2	6	502419	502424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536250
8064	NC_021028	TGG	2	6	502445	502450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536250
8065	NC_021028	GTC	2	6	502484	502489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536250
8066	NC_021028	GGC	2	6	502509	502514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536250
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8070	NC_021028	TGAT	2	8	502694	502701	25 %	50 %	25 %	0 %	480536251
8071	NC_021028	AAGG	2	8	502732	502739	50 %	0 %	50 %	0 %	480536251
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8083	NC_021028	AAG	2	6	503299	503304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536253
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8089	NC_021028	AGAAA	2	10	503453	503462	80 %	0 %	20 %	0 %	480536253
8090	NC_021028	GCAG	2	8	503606	503613	25 %	0 %	50 %	25 %	480536253
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8093	NC_021028	ACG	2	6	503677	503682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536253
8094	NC_021028	TGG	2	6	503690	503695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536253
8095	NC_021028	TCG	2	6	503723	503728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536253
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8102	NC_021028	A	6	6	504039	504044	100 %	0 %	0 %	0 %	480536253
8103	NC_021028	CGT	2	6	504063	504068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536253
8104	NC_021028	A	6	6	504069	504074	100 %	0 %	0 %	0 %	480536253
8105	NC_021028	GAA	2	6	504114	504119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536253
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8109	NC_021028	A	6	6	504210	504215	100 %	0 %	0 %	0 %	480536253
8110	NC_021028	AAC	2	6	504228	504233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536253
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8112	NC_021028	CA	3	6	504392	504397	50 %	0 %	0 %	50 %	480536253
8113	NC_021028	CTC	2	6	504429	504434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536253
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8122	NC_021028	TGCG	2	8	504736	504743	0 %	25 %	50 %	25 %	480536253
8123	NC_021028	GTG	2	6	504745	504750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536253
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8128	NC_021028	TTG	2	6	505005	505010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536253
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8231	NC_021028	GAG	2	6	512486	512491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536264
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8235	NC_021028	TAA	2	6	512800	512805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536264
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8238	NC_021028	TAG	2	6	512835	512840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536264
8239	NC_021028	TAT	2	6	512885	512890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536264
8240	NC_021028	CAC	2	6	512946	512951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536264
8241	NC_021028	GCA	2	6	512954	512959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536264
8242	NC_021028	TTGGT	2	10	513000	513009	0 %	60 %	40 %	0 %	480536264
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8489	NC_021028	GAA	2	6	528978	528983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536275
8490	NC_021028	CCG	2	6	529073	529078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536275
8491	NC_021028	ATC	2	6	529119	529124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536275
8492	NC_021028	TCC	2	6	529222	529227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536275
8493	NC_021028	AACA	2	8	529324	529331	75 %	0 %	0 %	25 %	480536275
8494	NC_021028	AGA	2	6	529343	529348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536275
8495	NC_021028	CTTTGC	2	12	529370	529381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	480536275
8496	NC_021028	CAG	3	9	529417	529425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536275
8497	NC_021028	TCT	2	6	529438	529443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536275
8498	NC_021028	CTG	2	6	529675	529680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536275
8499	NC_021028	CAG	2	6	529708	529713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536275
8500	NC_021028	AAG	2	6	529759	529764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536275

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