MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_021028	GGC	2	6	399185	399190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536155
6502	NC_021028	TGAT	2	8	399223	399230	25 %	50 %	25 %	0 %	480536155
6503	NC_021028	AG	3	6	399330	399335	50 %	0 %	50 %	0 %	480536155
6504	NC_021028	GAG	2	6	399357	399362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536155
6505	NC_021028	A	6	6	399413	399418	100 %	0 %	0 %	0 %	480536156
6506	NC_021028	TGC	2	6	399440	399445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6507	NC_021028	ACA	2	6	399465	399470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536156
6508	NC_021028	CAT	2	6	399503	399508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536156
6509	NC_021028	T	6	6	399577	399582	0 %	100 %	0 %	0 %	480536156
6510	NC_021028	CAA	2	6	399586	399591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536156
6511	NC_021028	TCT	2	6	399666	399671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536156
6512	NC_021028	AGTT	2	8	399683	399690	25 %	50 %	25 %	0 %	480536156
6513	NC_021028	TCG	2	6	399717	399722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6514	NC_021028	TTC	2	6	399758	399763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536156
6515	NC_021028	TCA	2	6	399873	399878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536156
6516	NC_021028	GTT	2	6	399920	399925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536156
6517	NC_021028	GAA	2	6	399967	399972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536156
6518	NC_021028	TGGT	2	8	400052	400059	0 %	50 %	50 %	0 %	480536156
6519	NC_021028	ATA	2	6	400062	400067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536156
6520	NC_021028	CAG	2	6	400132	400137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6521	NC_021028	GATTT	2	10	400184	400193	20 %	60 %	20 %	0 %	480536156
6522	NC_021028	TTC	2	6	400250	400255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536156
6523	NC_021028	ATG	2	6	400278	400283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536156
6524	NC_021028	GCA	2	6	400371	400376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6525	NC_021028	GCT	2	6	400404	400409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6526	NC_021028	TTC	2	6	400436	400441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536156
6527	NC_021028	T	6	6	400480	400485	0 %	100 %	0 %	0 %	480536156
6528	NC_021028	AGC	2	6	400523	400528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536156
6529	NC_021028	GTA	2	6	400589	400594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536156
6530	NC_021028	ACG	2	6	400664	400669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536156
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6532	NC_021028	ATT	2	6	401090	401095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536157
6533	NC_021028	TG	3	6	401169	401174	0 %	50 %	50 %	0 %	480536157
6534	NC_021028	AGA	2	6	401203	401208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536157
6535	NC_021028	TCT	2	6	401253	401258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536157
6536	NC_021028	GGATGA	2	12	401296	401307	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	480536157
6537	NC_021028	CAT	2	6	401313	401318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536157
6538	NC_021028	TGTTGG	2	12	401485	401496	0 %	50 %	50 %	0 %	480536157
6539	NC_021028	TGC	2	6	401554	401559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536157
6540	NC_021028	GGTT	2	8	401613	401620	0 %	50 %	50 %	0 %	480536157
6541	NC_021028	GA	3	6	401656	401661	50 %	0 %	50 %	0 %	480536157
6542	NC_021028	CTT	2	6	401666	401671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536157
6543	NC_021028	A	6	6	401672	401677	100 %	0 %	0 %	0 %	480536157
6544	NC_021028	TGC	2	6	401704	401709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536157
6545	NC_021028	AAG	2	6	401714	401719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536157
6546	NC_021028	AAG	2	6	401811	401816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536157
6547	NC_021028	GA	3	6	401834	401839	50 %	0 %	50 %	0 %	480536157
6548	NC_021028	AGA	3	9	401837	401845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536157
6549	NC_021028	A	6	6	401865	401870	100 %	0 %	0 %	0 %	480536157
6550	NC_021028	CAAGT	2	10	402114	402123	40 %	20 %	20 %	20 %	480536158
6551	NC_021028	TCG	2	6	402220	402225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536158
6552	NC_021028	AAG	2	6	402248	402253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536158
6553	NC_021028	A	6	6	402303	402308	100 %	0 %	0 %	0 %	480536158
6554	NC_021028	GAA	2	6	402329	402334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536158
6555	NC_021028	GGA	2	6	402379	402384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536158
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6557	NC_021028	ATG	2	6	402482	402487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536159
6558	NC_021028	ATC	2	6	402619	402624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536159
6559	NC_021028	GAT	2	6	402648	402653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536159
6560	NC_021028	GCT	2	6	402664	402669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536159
6561	NC_021028	TAA	2	6	402693	402698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536159
6562	NC_021028	CTG	2	6	402755	402760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536159
6563	NC_021028	CT	3	6	402817	402822	0 %	50 %	0 %	50 %	480536159
6564	NC_021028	GATC	2	8	402841	402848	25 %	25 %	25 %	25 %	480536159
6565	NC_021028	TGT	2	6	402857	402862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536159
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6570	NC_021028	ATG	2	6	403213	403218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536159
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6574	NC_021028	TGA	2	6	403511	403516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536160
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6586	NC_021028	G	6	6	404194	404199	0 %	0 %	100 %	0 %	480536161
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6590	NC_021028	TGC	2	6	404298	404303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536161
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6592	NC_021028	TAC	2	6	404421	404426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536161
6593	NC_021028	TCAGC	2	10	404431	404440	20 %	20 %	20 %	40 %	480536161
6594	NC_021028	GTT	2	6	404578	404583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536161
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6599	NC_021028	CGAG	2	8	404840	404847	25 %	0 %	50 %	25 %	480536162
6600	NC_021028	GAA	2	6	404888	404893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536162
6601	NC_021028	TGG	2	6	405027	405032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536162
6602	NC_021028	GCG	2	6	405036	405041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536162
6603	NC_021028	GAA	2	6	405095	405100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536162
6604	NC_021028	CTG	2	6	405108	405113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536162
6605	NC_021028	GAA	2	6	405161	405166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536162
6606	NC_021028	AC	3	6	405216	405221	50 %	0 %	0 %	50 %	480536162
6607	NC_021028	AAG	2	6	405282	405287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536162
6608	NC_021028	GCT	2	6	405431	405436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536162
6609	NC_021028	CGTT	2	8	405490	405497	0 %	50 %	25 %	25 %	480536162
6610	NC_021028	AAG	2	6	405522	405527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536162
6611	NC_021028	A	7	7	405584	405590	100 %	0 %	0 %	0 %	480536162
6612	NC_021028	TAG	2	6	405636	405641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536162
6613	NC_021028	A	7	7	405686	405692	100 %	0 %	0 %	0 %	480536163
6614	NC_021028	TTA	2	6	405717	405722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536163
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6617	NC_021028	TGAT	2	8	405903	405910	25 %	50 %	25 %	0 %	480536163
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