MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021028	TCT	2	6	336976	336981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536110
5502	NC_021028	TTC	2	6	337195	337200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536110
5503	NC_021028	TGG	2	6	337220	337225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536110
5504	NC_021028	TTC	2	6	337236	337241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536110
5505	NC_021028	CCA	2	6	337331	337336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536110
5506	NC_021028	CT	3	6	337345	337350	0 %	50 %	0 %	50 %	480536110
5507	NC_021028	AAC	2	6	337379	337384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536110
5508	NC_021028	ATG	2	6	337392	337397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536110
5509	NC_021028	GGT	2	6	337422	337427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536110
5510	NC_021028	CTT	3	9	337520	337528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536110
5511	NC_021028	AAC	2	6	338201	338206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
5512	NC_021028	TAA	2	6	338209	338214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536111
5513	NC_021028	TAA	2	6	338218	338223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536111
5514	NC_021028	GAT	2	6	338228	338233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
5515	NC_021028	GGT	2	6	338252	338257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536111
5516	NC_021028	TTAA	2	8	338291	338298	50 %	50 %	0 %	0 %	480536111
5517	NC_021028	CAG	2	6	338445	338450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5518	NC_021028	CGC	2	6	338525	338530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480536111
5519	NC_021028	CAG	2	6	338577	338582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5520	NC_021028	CTG	2	6	338625	338630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5521	NC_021028	ATT	2	6	338648	338653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
5522	NC_021028	GAA	2	6	338705	338710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5523	NC_021028	AAG	2	6	338739	338744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5524	NC_021028	CTT	2	6	338761	338766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
5525	NC_021028	TGA	2	6	338767	338772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
5526	NC_021028	CT	4	8	338850	338857	0 %	50 %	0 %	50 %	480536111
5527	NC_021028	CAA	2	6	338883	338888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
5528	NC_021028	GAA	2	6	338917	338922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5529	NC_021028	TGC	2	6	338923	338928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5530	NC_021028	TCG	2	6	338935	338940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5531	NC_021028	CAG	2	6	338970	338975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5532	NC_021028	TTC	2	6	338991	338996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
5533	NC_021028	CAA	2	6	339017	339022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
5534	NC_021028	CAC	2	6	339023	339028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536111
5535	NC_021028	AGC	2	6	339058	339063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5536	NC_021028	ATT	2	6	339069	339074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
5537	NC_021028	GCT	2	6	339137	339142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5538	NC_021028	GGC	2	6	339148	339153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536111
5539	NC_021028	CAAG	2	8	339211	339218	50 %	0 %	25 %	25 %	480536111
5540	NC_021028	AGA	2	6	339235	339240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5541	NC_021028	AGC	2	6	339247	339252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5542	NC_021028	GGAAA	2	10	339283	339292	60 %	0 %	40 %	0 %	480536111
5543	NC_021028	CA	3	6	339302	339307	50 %	0 %	0 %	50 %	480536111
5544	NC_021028	CGT	2	6	339488	339493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5545	NC_021028	TGA	2	6	339508	339513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
5546	NC_021028	ACA	2	6	339680	339685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536111
5547	NC_021028	ATG	2	6	339702	339707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
5548	NC_021028	TCG	2	6	339736	339741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5549	NC_021028	TTA	2	6	339795	339800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
5550	NC_021028	TCC	2	6	339807	339812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480536111
5551	NC_021028	GAT	2	6	339821	339826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536111
5552	NC_021028	ATT	2	6	339878	339883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480536111
5553	NC_021028	AGA	2	6	339925	339930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5554	NC_021028	CTT	2	6	339967	339972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536111
5555	NC_021028	AAGA	2	8	340088	340095	75 %	0 %	25 %	0 %	480536111
5556	NC_021028	AGTC	2	8	340108	340115	25 %	25 %	25 %	25 %	480536111
5557	NC_021028	AGA	2	6	340138	340143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536111
5558	NC_021028	ACG	2	6	340149	340154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536111
5559	NC_021028	CAT	2	6	340619	340624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536112
5560	NC_021028	AGA	2	6	340670	340675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536112
5561	NC_021028	AGT	3	9	340734	340742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536112
5562	NC_021028	GAT	2	6	340971	340976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536112
5563	NC_021028	TTC	2	6	340995	341000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536112
5564	NC_021028	CTT	2	6	341066	341071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536112
5565	NC_021028	TTAC	2	8	341173	341180	25 %	50 %	0 %	25 %	480536113
5566	NC_021028	GTA	2	6	341200	341205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
5567	NC_021028	TCA	2	6	341255	341260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536113
5568	NC_021028	GAT	2	6	341266	341271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
5569	NC_021028	GCTTC	2	10	341282	341291	0 %	40 %	20 %	40 %	480536113
5570	NC_021028	TTC	2	6	341308	341313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
5571	NC_021028	GCA	2	6	341324	341329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
5572	NC_021028	TGAA	2	8	341377	341384	50 %	25 %	25 %	0 %	480536113
5573	NC_021028	GAT	2	6	341406	341411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
5574	NC_021028	AAC	2	6	341437	341442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536113
5575	NC_021028	CTT	2	6	341463	341468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
5576	NC_021028	T	6	6	341485	341490	0 %	100 %	0 %	0 %	480536113
5577	NC_021028	CCA	2	6	341588	341593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480536113
5578	NC_021028	TCT	2	6	341597	341602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
5579	NC_021028	GC	3	6	341611	341616	0 %	0 %	50 %	50 %	480536113
5580	NC_021028	CGG	2	6	341738	341743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480536113
5581	NC_021028	CAG	2	6	341769	341774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
5582	NC_021028	ACCA	2	8	341797	341804	50 %	0 %	0 %	50 %	480536113
5583	NC_021028	CAT	2	6	341958	341963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536113
5584	NC_021028	GAT	2	6	342003	342008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
5585	NC_021028	ATG	2	6	342197	342202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536113
5586	NC_021028	GTTG	2	8	342270	342277	0 %	50 %	50 %	0 %	480536113
5587	NC_021028	CAA	2	6	342330	342335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536113
5588	NC_021028	TCAA	2	8	342359	342366	50 %	25 %	0 %	25 %	480536113
5589	NC_021028	GAA	2	6	342369	342374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536113
5590	NC_021028	CTT	2	6	342375	342380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
5591	NC_021028	CAACCT	2	12	342450	342461	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	480536113
5592	NC_021028	TGT	2	6	342492	342497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480536113
5593	NC_021028	AGGA	2	8	342511	342518	50 %	0 %	50 %	0 %	480536113
5594	NC_021028	AGC	2	6	342523	342528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480536113
5595	NC_021028	TCT	2	6	342536	342541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480536113
5596	NC_021028	T	6	6	342649	342654	0 %	100 %	0 %	0 %	480536113
5597	NC_021028	T	6	6	342657	342662	0 %	100 %	0 %	0 %	480536113
5598	NC_021028	TGG	2	6	342821	342826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
5599	NC_021028	ATGGAG	2	12	342876	342887	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	480536114
5600	NC_021028	AGCTA	2	10	342928	342937	40 %	20 %	20 %	20 %	480536114
5601	NC_021028	GAT	2	6	342983	342988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536114
5602	NC_021028	GGA	2	6	343042	343047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536114
5603	NC_021028	AAG	2	6	343073	343078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536114
5604	NC_021028	ATC	2	6	343091	343096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536114
5605	NC_021028	TGG	2	6	343104	343109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
5606	NC_021028	ACT	2	6	343179	343184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480536114
5607	NC_021028	GAT	2	6	343342	343347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536114
5608	NC_021028	TGG	2	6	343372	343377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480536114
5609	NC_021028	AAT	2	6	343433	343438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480536114
5610	NC_021028	ACTCT	2	10	343546	343555	20 %	40 %	0 %	40 %	480536114
5611	NC_021028	CAA	2	6	343681	343686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536114
5612	NC_021028	CAGA	2	8	343691	343698	50 %	0 %	25 %	25 %	480536114
5613	NC_021028	AAC	2	6	343736	343741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480536114
5614	NC_021028	CCTC	2	8	343747	343754	0 %	25 %	0 %	75 %	480536114
5615	NC_021028	GAG	2	6	343862	343867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480536114
5616	NC_021028	AGA	2	6	343909	343914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480536114
5617	NC_021028	TC	3	6	343922	343927	0 %	50 %	0 %	50 %	480536114
5618	NC_021028	TTGG	2	8	344068	344075	0 %	50 %	50 %	0 %	480536114
5619	NC_021028	GAT	2	6	344095	344100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480536114
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5621	NC_021028	TA	3	6	344237	344242	50 %	50 %	0 %	0 %	480536114
5622	NC_021028	TTGA	2	8	344333	344340	25 %	50 %	25 %	0 %	480536114
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