MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021026	TCT	2	6	185951	185956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534142
3002	NC_021026	ACA	2	6	185970	185975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534142
3003	NC_021026	AGA	3	9	185988	185996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534142
3004	NC_021026	AGA	2	6	186003	186008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534142
3005	NC_021026	AAGG	2	8	186228	186235	50 %	0 %	50 %	0 %	480534143
3006	NC_021026	T	6	6	186272	186277	0 %	100 %	0 %	0 %	480534143
3007	NC_021026	GAC	2	6	186332	186337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534143
3008	NC_021026	TAA	2	6	186416	186421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534143
3009	NC_021026	TAT	2	6	186527	186532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534143
3010	NC_021026	AGA	2	6	186894	186899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534144
3011	NC_021026	AATC	2	8	186919	186926	50 %	25 %	0 %	25 %	480534144
3012	NC_021026	AAG	2	6	186951	186956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534144
3013	NC_021026	AAAG	2	8	187003	187010	75 %	0 %	25 %	0 %	480534144
3014	NC_021026	GAA	2	6	187069	187074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534144
3015	NC_021026	ATG	2	6	187082	187087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534144
3016	NC_021026	GAT	2	6	187093	187098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534144
3017	NC_021026	GA	3	6	187165	187170	50 %	0 %	50 %	0 %	480534144
3018	NC_021026	GA	3	6	187299	187304	50 %	0 %	50 %	0 %	480534144
3019	NC_021026	AGC	2	6	187318	187323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534144
3020	NC_021026	AGA	2	6	187374	187379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534144
3021	NC_021026	TCT	2	6	187430	187435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534144
3022	NC_021026	CATC	2	8	187510	187517	25 %	25 %	0 %	50 %	480534144
3023	NC_021026	AGG	2	6	187520	187525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534144
3024	NC_021026	TCT	2	6	187563	187568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534144
3025	NC_021026	CCG	2	6	187602	187607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480534144
3026	NC_021026	GAT	2	6	187774	187779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534144
3027	NC_021026	TTGAG	2	10	188002	188011	20 %	40 %	40 %	0 %	480534144
3028	NC_021026	GCTT	2	8	188076	188083	0 %	50 %	25 %	25 %	480534144
3029	NC_021026	TTGA	2	8	188091	188098	25 %	50 %	25 %	0 %	480534144
3030	NC_021026	TTGA	2	8	188452	188459	25 %	50 %	25 %	0 %	480534145
3031	NC_021026	T	6	6	188470	188475	0 %	100 %	0 %	0 %	480534145
3032	NC_021026	CT	3	6	188479	188484	0 %	50 %	0 %	50 %	480534145
3033	NC_021026	GAT	2	6	188503	188508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534145
3034	NC_021026	AACC	2	8	188567	188574	50 %	0 %	0 %	50 %	480534145
3035	NC_021026	AGCC	2	8	188598	188605	25 %	0 %	25 %	50 %	480534145
3036	NC_021026	GAA	2	6	188614	188619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534145
3037	NC_021026	GA	3	6	188770	188775	50 %	0 %	50 %	0 %	480534145
3038	NC_021026	GTG	2	6	188787	188792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534145
3039	NC_021026	T	6	6	188881	188886	0 %	100 %	0 %	0 %	480534145
3040	NC_021026	GA	3	6	188996	189001	50 %	0 %	50 %	0 %	480534146
3041	NC_021026	TGA	2	6	189014	189019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534146
3042	NC_021026	TAGA	2	8	189168	189175	50 %	25 %	25 %	0 %	480534146
3043	NC_021026	ATC	2	6	189180	189185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534146
3044	NC_021026	T	6	6	189200	189205	0 %	100 %	0 %	0 %	480534146
3045	NC_021026	TCC	2	6	189286	189291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534146
3046	NC_021026	ATT	2	6	189691	189696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534147
3047	NC_021026	ATTGAG	2	12	189814	189825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3048	NC_021026	AAG	2	6	189838	189843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534147
3049	NC_021026	A	6	6	189924	189929	100 %	0 %	0 %	0 %	480534147
3050	NC_021026	TTCGGA	2	12	189944	189955	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480534147
3051	NC_021026	GTG	2	6	189968	189973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534147
3052	NC_021026	GCCTT	2	10	189976	189985	0 %	40 %	20 %	40 %	480534147
3053	NC_021026	CGG	2	6	190019	190024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534147
3054	NC_021026	CG	4	8	190056	190063	0 %	0 %	50 %	50 %	480534147
3055	NC_021026	TG	3	6	190117	190122	0 %	50 %	50 %	0 %	480534147
3056	NC_021026	CAG	2	6	190277	190282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534147
3057	NC_021026	AAG	2	6	190336	190341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534147
3058	NC_021026	TCA	2	6	190439	190444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534147
3059	NC_021026	AAGC	2	8	190500	190507	50 %	0 %	25 %	25 %	480534147
3060	NC_021026	TGA	2	6	190622	190627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3061	NC_021026	CTA	2	6	190767	190772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534147
3062	NC_021026	TGA	2	6	190836	190841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3063	NC_021026	AG	3	6	190914	190919	50 %	0 %	50 %	0 %	480534147
3064	NC_021026	GAA	2	6	191002	191007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534147
3065	NC_021026	CAT	2	6	191088	191093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534147
3066	NC_021026	GCT	2	6	191104	191109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534147
3067	NC_021026	GAG	2	6	191128	191133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534147
3068	NC_021026	CAG	2	6	191167	191172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534147
3069	NC_021026	GAT	2	6	191209	191214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3070	NC_021026	CT	3	6	191240	191245	0 %	50 %	0 %	50 %	480534147
3071	NC_021026	AGA	3	9	191322	191330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534147
3072	NC_021026	ATG	2	6	191419	191424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3073	NC_021026	ATC	2	6	191450	191455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534147
3074	NC_021026	TGA	2	6	191460	191465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534147
3075	NC_021026	CTC	2	6	191482	191487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534147
3076	NC_021026	TACA	2	8	192144	192151	50 %	25 %	0 %	25 %	480534148
3077	NC_021026	CAT	2	6	192204	192209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534148
3078	NC_021026	T	6	6	192211	192216	0 %	100 %	0 %	0 %	480534148
3079	NC_021026	TC	3	6	192300	192305	0 %	50 %	0 %	50 %	480534148
3080	NC_021026	ATA	2	6	192330	192335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534148
3081	NC_021026	ACA	2	6	192368	192373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534148
3082	NC_021026	CTA	2	6	192396	192401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534148
3083	NC_021026	ATTT	2	8	192422	192429	25 %	75 %	0 %	0 %	480534148
3084	NC_021026	TCC	2	6	192431	192436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534149
3085	NC_021026	TAAA	2	8	192475	192482	75 %	25 %	0 %	0 %	480534149
3086	NC_021026	ATT	2	6	192571	192576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534149
3087	NC_021026	CCT	2	6	192747	192752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534149
3088	NC_021026	AAGTA	2	10	192758	192767	60 %	20 %	20 %	0 %	480534149
3089	NC_021026	CAA	2	6	192786	192791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534149
3090	NC_021026	ATA	2	6	192882	192887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534149
3091	NC_021026	ATA	2	6	192914	192919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534149
3092	NC_021026	GAT	2	6	192927	192932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534149
3093	NC_021026	TA	3	6	192952	192957	50 %	50 %	0 %	0 %	480534149
3094	NC_021026	TAG	2	6	192984	192989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534149
3095	NC_021026	TGT	2	6	193074	193079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534149
3096	NC_021026	TTC	2	6	193082	193087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534149
3097	NC_021026	ATC	2	6	193102	193107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
3098	NC_021026	TCA	2	6	193113	193118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
3099	NC_021026	CAT	2	6	193125	193130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534149
3100	NC_021026	ATT	2	6	193136	193141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534149
3101	NC_021026	TAA	2	6	193180	193185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534149
3102	NC_021026	TG	3	6	193201	193206	0 %	50 %	50 %	0 %	480534149
3103	NC_021026	TTTC	2	8	193211	193218	0 %	75 %	0 %	25 %	480534149
3104	NC_021026	ACC	2	6	193225	193230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534149
3105	NC_021026	T	7	7	193231	193237	0 %	100 %	0 %	0 %	480534149
3106	NC_021026	AC	3	6	193298	193303	50 %	0 %	0 %	50 %	480534149
3107	NC_021026	TGT	2	6	193504	193509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534149
3108	NC_021026	GCT	2	6	193511	193516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534149
3109	NC_021026	GTC	2	6	193558	193563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534149
3110	NC_021026	AACAAG	2	12	193567	193578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	480534149
3111	NC_021026	CTT	2	6	193605	193610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534149
3112	NC_021026	ATA	2	6	193666	193671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534150
3113	NC_021026	GTTT	2	8	193785	193792	0 %	75 %	25 %	0 %	480534150
3114	NC_021026	TG	3	6	193911	193916	0 %	50 %	50 %	0 %	480534150
3115	NC_021026	TTGAT	2	10	193917	193926	20 %	60 %	20 %	0 %	480534150
3116	NC_021026	ATC	2	6	193940	193945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534150
3117	NC_021026	T	7	7	193946	193952	0 %	100 %	0 %	0 %	480534150
3118	NC_021026	ACG	2	6	193992	193997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534150
3119	NC_021026	TCAT	2	8	194091	194098	25 %	50 %	0 %	25 %	480534150
3120	NC_021026	TGA	2	6	194118	194123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534150
3121	NC_021026	ATT	2	6	194268	194273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534150
3122	NC_021026	TCACT	2	10	194292	194301	20 %	40 %	0 %	40 %	480534151
3123	NC_021026	AT	4	8	194429	194436	50 %	50 %	0 %	0 %	480534151
3124	NC_021026	TCA	2	6	194444	194449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534151
3125	NC_021026	TGT	2	6	194456	194461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534151
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3127	NC_021026	T	6	6	194566	194571	0 %	100 %	0 %	0 %	480534151
3128	NC_021026	ATTTT	2	10	194615	194624	20 %	80 %	0 %	0 %	480534151
3129	NC_021026	TCC	2	6	194741	194746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534151
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3132	NC_021026	GATT	2	8	194867	194874	25 %	50 %	25 %	0 %	480534151
3133	NC_021026	TCCA	2	8	194893	194900	25 %	25 %	0 %	50 %	480534151
3134	NC_021026	TTAAG	2	10	194967	194976	40 %	40 %	20 %	0 %	480534151
3135	NC_021026	ATT	2	6	195013	195018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534151
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3139	NC_021026	CCA	2	6	195227	195232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534151
3140	NC_021026	A	6	6	195232	195237	100 %	0 %	0 %	0 %	480534151
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3144	NC_021026	TCAGG	2	10	195882	195891	20 %	20 %	40 %	20 %	480534152
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3156	NC_021026	CAGG	2	8	196503	196510	25 %	0 %	50 %	25 %	480534153
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3230	NC_021026	AG	3	6	200990	200995	50 %	0 %	50 %	0 %	480534158
3231	NC_021026	CTCG	2	8	201109	201116	0 %	25 %	25 %	50 %	480534158
3232	NC_021026	ACG	2	6	201126	201131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534158
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3235	NC_021026	TGTTCG	2	12	201350	201361	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	480534158
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3237	NC_021026	AGCA	2	8	201411	201418	50 %	0 %	25 %	25 %	480534158
3238	NC_021026	AGG	2	6	201457	201462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534158
3239	NC_021026	GTC	2	6	201472	201477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534158
3240	NC_021026	TCTCT	2	10	201617	201626	0 %	60 %	0 %	40 %	480534158
3241	NC_021026	AGTG	2	8	201651	201658	25 %	25 %	50 %	0 %	480534158
3242	NC_021026	ACT	2	6	201766	201771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534158
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3245	NC_021026	TGG	2	6	201914	201919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534158
3246	NC_021026	AAT	2	6	201957	201962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534158
3247	NC_021026	CGT	2	6	201969	201974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534158
3248	NC_021026	ATGA	2	8	202023	202030	50 %	25 %	25 %	0 %	480534158
3249	NC_021026	TGTC	2	8	202078	202085	0 %	50 %	25 %	25 %	480534158
3250	NC_021026	GGC	2	6	202092	202097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534158
3251	NC_021026	ACTTGG	2	12	202147	202158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480534158
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3254	NC_021026	AAT	2	6	202242	202247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534158
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3355	NC_021026	A	6	6	207895	207900	100 %	0 %	0 %	0 %	480534165
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3363	NC_021026	TCT	2	6	208399	208404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534165
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