MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_021026	GTA	2	6	1962818	1962823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535729
31503	NC_021026	ATC	2	6	1962827	1962832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535729
31504	NC_021026	GTT	2	6	1962860	1962865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535729
31505	NC_021026	CTT	2	6	1962880	1962885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535729
31506	NC_021026	AAT	2	6	1962947	1962952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535729
31507	NC_021026	CCA	2	6	1963080	1963085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535729
31508	NC_021026	AAC	2	6	1963088	1963093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535729
31509	NC_021026	GT	3	6	1963173	1963178	0 %	50 %	50 %	0 %	480535729
31510	NC_021026	AAG	2	6	1963343	1963348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535730
31511	NC_021026	AGC	2	6	1963352	1963357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535730
31512	NC_021026	AAGA	2	8	1963393	1963400	75 %	0 %	25 %	0 %	480535730
31513	NC_021026	TCA	2	6	1963422	1963427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535730
31514	NC_021026	ATC	2	6	1963782	1963787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535731
31515	NC_021026	GAA	2	6	1963917	1963922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535731
31516	NC_021026	CTT	2	6	1963938	1963943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535731
31517	NC_021026	ATA	2	6	1963977	1963982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535731
31518	NC_021026	AGC	2	6	1964068	1964073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535731
31519	NC_021026	TAA	2	6	1964173	1964178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535731
31520	NC_021026	GAA	2	6	1964204	1964209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535731
31521	NC_021026	A	6	6	1964226	1964231	100 %	0 %	0 %	0 %	480535731
31522	NC_021026	AACT	2	8	1964281	1964288	50 %	25 %	0 %	25 %	480535731
31523	NC_021026	GAA	2	6	1964352	1964357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535731
31524	NC_021026	GGTA	2	8	1964407	1964414	25 %	25 %	50 %	0 %	480535731
31525	NC_021026	TTG	2	6	1964424	1964429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535731
31526	NC_021026	AGC	2	6	1964467	1964472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535731
31527	NC_021026	TGC	2	6	1964551	1964556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535731
31528	NC_021026	CAA	3	9	1964580	1964588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535731
31529	NC_021026	ATAG	2	8	1964589	1964596	50 %	25 %	25 %	0 %	480535731
31530	NC_021026	AACT	2	8	1965355	1965362	50 %	25 %	0 %	25 %	480535732
31531	NC_021026	TAA	2	6	1965384	1965389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535732
31532	NC_021026	CTA	2	6	1965463	1965468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535732
31533	NC_021026	CCAG	2	8	1965485	1965492	25 %	0 %	25 %	50 %	480535732
31534	NC_021026	GTC	2	6	1965544	1965549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535732
31535	NC_021026	TCT	2	6	1965556	1965561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535732
31536	NC_021026	ATCC	2	8	1965657	1965664	25 %	25 %	0 %	50 %	480535732
31537	NC_021026	TTC	2	6	1965732	1965737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535732
31538	NC_021026	GAC	2	6	1965775	1965780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535732
31539	NC_021026	TGA	2	6	1965794	1965799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535732
31540	NC_021026	CTGGT	2	10	1965835	1965844	0 %	40 %	40 %	20 %	480535732
31541	NC_021026	CA	3	6	1965950	1965955	50 %	0 %	0 %	50 %	480535732
31542	NC_021026	ATC	2	6	1965956	1965961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535732
31543	NC_021026	AG	3	6	1966033	1966038	50 %	0 %	50 %	0 %	480535732
31544	NC_021026	TCC	2	6	1966049	1966054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535732
31545	NC_021026	ATA	2	6	1966098	1966103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535732
31546	NC_021026	TGAA	2	8	1966106	1966113	50 %	25 %	25 %	0 %	480535732
31547	NC_021026	ATCT	2	8	1966177	1966184	25 %	50 %	0 %	25 %	480535732
31548	NC_021026	ATG	2	6	1966266	1966271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535732
31549	NC_021026	TAA	2	6	1966342	1966347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535732
31550	NC_021026	ATA	2	6	1966603	1966608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535732
31551	NC_021026	TTG	2	6	1967683	1967688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535733
31552	NC_021026	TGA	2	6	1967696	1967701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535733
31553	NC_021026	TCA	2	6	1967757	1967762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535733
31554	NC_021026	ACG	2	6	1967849	1967854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535733
31555	NC_021026	AT	3	6	1967920	1967925	50 %	50 %	0 %	0 %	480535733
31556	NC_021026	G	6	6	1968059	1968064	0 %	0 %	100 %	0 %	480535733
31557	NC_021026	AAT	2	6	1968077	1968082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535733
31558	NC_021026	TGG	2	6	1968083	1968088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535733
31559	NC_021026	TAC	2	6	1968147	1968152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535733
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31562	NC_021026	AGCTC	2	10	1968399	1968408	20 %	20 %	20 %	40 %	480535734
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31564	NC_021026	CTA	2	6	1968493	1968498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535734
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31566	NC_021026	ACA	2	6	1968802	1968807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535735
31567	NC_021026	GTCTCC	2	12	1968828	1968839	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	480535735
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31569	NC_021026	CCTG	2	8	1968976	1968983	0 %	25 %	25 %	50 %	480535735
31570	NC_021026	CAAAG	2	10	1968999	1969008	60 %	0 %	20 %	20 %	480535735
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31584	NC_021026	ACG	2	6	1969689	1969694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535736
31585	NC_021026	AAG	2	6	1969695	1969700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535736
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31588	NC_021026	CAG	2	6	1970168	1970173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535736
31589	NC_021026	T	6	6	1970192	1970197	0 %	100 %	0 %	0 %	480535736
31590	NC_021026	GA	3	6	1970203	1970208	50 %	0 %	50 %	0 %	480535736
31591	NC_021026	TCA	2	6	1970245	1970250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535736
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31601	NC_021026	TAA	2	6	1970660	1970665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535736
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31607	NC_021026	TGGC	2	8	1970892	1970899	0 %	25 %	50 %	25 %	480535736
31608	NC_021026	GT	3	6	1970942	1970947	0 %	50 %	50 %	0 %	480535736
31609	NC_021026	TG	3	6	1971062	1971067	0 %	50 %	50 %	0 %	480535736
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31612	NC_021026	TCAA	2	8	1971205	1971212	50 %	25 %	0 %	25 %	480535736
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31615	NC_021026	T	7	7	1971308	1971314	0 %	100 %	0 %	0 %	480535736
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31968	NC_021026	GCT	2	6	1990435	1990440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535755
31969	NC_021026	TAC	2	6	1990499	1990504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535755
31970	NC_021026	GAGATA	2	12	1990516	1990527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480535755
31971	NC_021026	TTC	2	6	1990540	1990545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535755
31972	NC_021026	CTG	2	6	1990592	1990597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535755
31973	NC_021026	TAA	2	6	1990604	1990609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535755
31974	NC_021026	TTC	2	6	1990707	1990712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535755
31975	NC_021026	CG	3	6	1990757	1990762	0 %	0 %	50 %	50 %	480535755
31976	NC_021026	TAGC	2	8	1990771	1990778	25 %	25 %	25 %	25 %	480535755
31977	NC_021026	CAT	2	6	1990830	1990835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535755
31978	NC_021026	CTTG	2	8	1990852	1990859	0 %	50 %	25 %	25 %	480535755
31979	NC_021026	ACT	2	6	1990926	1990931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535755
31980	NC_021026	CAC	2	6	1990934	1990939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535755
31981	NC_021026	TAA	2	6	1990952	1990957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535755
31982	NC_021026	TGG	2	6	1990990	1990995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535755
31983	NC_021026	TAAA	2	8	1991015	1991022	75 %	25 %	0 %	0 %	480535755
31984	NC_021026	CAA	2	6	1991076	1991081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535755
31985	NC_021026	ACA	2	6	1991120	1991125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535755
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31988	NC_021026	TTC	2	6	1991187	1991192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535755
31989	NC_021026	AAC	2	6	1991233	1991238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535755
31990	NC_021026	CAG	2	6	1991249	1991254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535755
31991	NC_021026	TCA	2	6	1991336	1991341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535755
31992	NC_021026	GC	3	6	1991344	1991349	0 %	0 %	50 %	50 %	480535755
31993	NC_021026	TTGA	2	8	1991368	1991375	25 %	50 %	25 %	0 %	480535755
31994	NC_021026	AGC	2	6	1991376	1991381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535755
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31996	NC_021026	TCG	2	6	1991416	1991421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535755
31997	NC_021026	AAC	2	6	1991430	1991435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535755
31998	NC_021026	CCA	2	6	1991446	1991451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535755
31999	NC_021026	AGCAA	2	10	1991476	1991485	60 %	0 %	20 %	20 %	480535755
32000	NC_021026	TCA	2	6	1991497	1991502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535755

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