MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_021026	ACC	2	6	1936777	1936782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535711
31002	NC_021026	CAT	2	6	1936899	1936904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535711
31003	NC_021026	AGC	2	6	1936960	1936965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535711
31004	NC_021026	TTC	2	6	1937062	1937067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535711
31005	NC_021026	T	6	6	1937143	1937148	0 %	100 %	0 %	0 %	480535711
31006	NC_021026	CCA	2	6	1937186	1937191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535711
31007	NC_021026	TGA	2	6	1937250	1937255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535711
31008	NC_021026	AGC	2	6	1937281	1937286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535711
31009	NC_021026	ACA	2	6	1937474	1937479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535711
31010	NC_021026	TTTA	2	8	1937668	1937675	25 %	75 %	0 %	0 %	480535712
31011	NC_021026	CAA	2	6	1937687	1937692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535712
31012	NC_021026	CTG	2	6	1937710	1937715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535712
31013	NC_021026	TCT	2	6	1937724	1937729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535712
31014	NC_021026	ATT	2	6	1937876	1937881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535712
31015	NC_021026	AGAC	2	8	1937893	1937900	50 %	0 %	25 %	25 %	480535712
31016	NC_021026	AGT	2	6	1937939	1937944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535712
31017	NC_021026	AGA	2	6	1938048	1938053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535712
31018	NC_021026	ATT	2	6	1938066	1938071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535712
31019	NC_021026	TCC	3	9	1938110	1938118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535712
31020	NC_021026	TGG	2	6	1938140	1938145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535712
31021	NC_021026	CACTT	2	10	1938173	1938182	20 %	40 %	0 %	40 %	480535712
31022	NC_021026	AAG	2	6	1938279	1938284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535712
31023	NC_021026	GCA	2	6	1938291	1938296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535712
31024	NC_021026	AC	3	6	1938409	1938414	50 %	0 %	0 %	50 %	480535712
31025	NC_021026	CTA	2	6	1938553	1938558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535712
31026	NC_021026	CTT	3	9	1938577	1938585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535712
31027	NC_021026	ACCA	2	8	1938614	1938621	50 %	0 %	0 %	50 %	480535712
31028	NC_021026	TAA	2	6	1938649	1938654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535712
31029	NC_021026	TTC	2	6	1938677	1938682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535712
31030	NC_021026	CTT	2	6	1938721	1938726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535712
31031	NC_021026	TTTC	2	8	1938733	1938740	0 %	75 %	0 %	25 %	480535712
31032	NC_021026	GAA	2	6	1938851	1938856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535712
31033	NC_021026	ACC	2	6	1938875	1938880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535712
31034	NC_021026	TC	3	6	1938921	1938926	0 %	50 %	0 %	50 %	480535712
31035	NC_021026	TCT	2	6	1938981	1938986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535712
31036	NC_021026	TTG	2	6	1939192	1939197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535712
31037	NC_021026	T	6	6	1939211	1939216	0 %	100 %	0 %	0 %	480535712
31038	NC_021026	AAC	2	6	1939218	1939223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535712
31039	NC_021026	TAG	2	6	1939258	1939263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535712
31040	NC_021026	AAATC	2	10	1939318	1939327	60 %	20 %	0 %	20 %	480535712
31041	NC_021026	GAC	3	9	1939384	1939392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535712
31042	NC_021026	TTTC	2	8	1939459	1939466	0 %	75 %	0 %	25 %	480535713
31043	NC_021026	TAC	2	6	1939468	1939473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535713
31044	NC_021026	GAC	2	6	1939504	1939509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535713
31045	NC_021026	CTC	2	6	1939574	1939579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535713
31046	NC_021026	TTC	2	6	1939603	1939608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535713
31047	NC_021026	GTA	2	6	1939652	1939657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535713
31048	NC_021026	CAT	2	6	1939714	1939719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535713
31049	NC_021026	TG	3	6	1939843	1939848	0 %	50 %	50 %	0 %	480535713
31050	NC_021026	AAC	2	6	1939886	1939891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535713
31051	NC_021026	TTC	2	6	1939910	1939915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535713
31052	NC_021026	TC	3	6	1939978	1939983	0 %	50 %	0 %	50 %	480535713
31053	NC_021026	TAA	2	6	1940017	1940022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535713
31054	NC_021026	AGC	2	6	1940096	1940101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535713
31055	NC_021026	CCAA	2	8	1940105	1940112	50 %	0 %	0 %	50 %	480535713
31056	NC_021026	AATT	2	8	1940153	1940160	50 %	50 %	0 %	0 %	480535713
31057	NC_021026	GA	3	6	1940269	1940274	50 %	0 %	50 %	0 %	480535714
31058	NC_021026	ATT	2	6	1940290	1940295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31059	NC_021026	AATG	2	8	1940306	1940313	50 %	25 %	25 %	0 %	480535714
31060	NC_021026	TAG	2	6	1940316	1940321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535714
31061	NC_021026	TC	3	6	1940364	1940369	0 %	50 %	0 %	50 %	480535714
31062	NC_021026	TTC	2	6	1940395	1940400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535714
31063	NC_021026	ATT	2	6	1940500	1940505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31064	NC_021026	TC	3	6	1940533	1940538	0 %	50 %	0 %	50 %	480535714
31065	NC_021026	CATT	2	8	1940571	1940578	25 %	50 %	0 %	25 %	480535714
31066	NC_021026	TAT	2	6	1940652	1940657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31067	NC_021026	CTA	2	6	1940777	1940782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
31068	NC_021026	A	6	6	1941001	1941006	100 %	0 %	0 %	0 %	480535714
31069	NC_021026	TTA	2	6	1941012	1941017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31070	NC_021026	CTTT	2	8	1941035	1941042	0 %	75 %	0 %	25 %	480535714
31071	NC_021026	ATT	2	6	1941043	1941048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31072	NC_021026	CTT	2	6	1941117	1941122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535714
31073	NC_021026	ACC	2	6	1941241	1941246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535714
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31076	NC_021026	T	6	6	1941395	1941400	0 %	100 %	0 %	0 %	480535714
31077	NC_021026	ATT	2	6	1941427	1941432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
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31082	NC_021026	CAG	2	6	1941630	1941635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535714
31083	NC_021026	T	6	6	1941668	1941673	0 %	100 %	0 %	0 %	480535714
31084	NC_021026	GCT	2	6	1941698	1941703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535714
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31087	NC_021026	ATC	2	6	1941757	1941762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
31088	NC_021026	TCC	2	6	1941835	1941840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535714
31089	NC_021026	CAT	2	6	1941892	1941897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
31090	NC_021026	ATT	2	6	1941913	1941918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31091	NC_021026	ACG	2	6	1941925	1941930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535714
31092	NC_021026	ATGT	2	8	1942017	1942024	25 %	50 %	25 %	0 %	480535714
31093	NC_021026	TGA	2	6	1942132	1942137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535714
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31099	NC_021026	ATTTT	2	10	1942344	1942353	20 %	80 %	0 %	0 %	480535714
31100	NC_021026	ATT	2	6	1942354	1942359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31101	NC_021026	TTA	2	6	1942367	1942372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31102	NC_021026	TCA	2	6	1942418	1942423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
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31107	NC_021026	ATGT	2	8	1942563	1942570	25 %	50 %	25 %	0 %	480535714
31108	NC_021026	T	7	7	1942596	1942602	0 %	100 %	0 %	0 %	480535714
31109	NC_021026	TAA	2	6	1942626	1942631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535714
31110	NC_021026	TAT	2	6	1942644	1942649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535714
31111	NC_021026	ACT	2	6	1942675	1942680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
31112	NC_021026	ATTTCT	2	12	1942703	1942714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480535714
31113	NC_021026	ACT	2	6	1942724	1942729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
31114	NC_021026	TA	3	6	1942771	1942776	50 %	50 %	0 %	0 %	480535714
31115	NC_021026	ATC	2	6	1942876	1942881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535714
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31234	NC_021026	TAT	2	6	1947996	1948001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535717
31235	NC_021026	CACC	2	8	1948065	1948072	25 %	0 %	0 %	75 %	480535717
31236	NC_021026	AAT	2	6	1948086	1948091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535717
31237	NC_021026	ATA	2	6	1948098	1948103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535717
31238	NC_021026	GAT	2	6	1948215	1948220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535717
31239	NC_021026	TCAA	2	8	1948259	1948266	50 %	25 %	0 %	25 %	480535717
31240	NC_021026	TTG	2	6	1948350	1948355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535717
31241	NC_021026	CAAA	3	12	1948380	1948391	75 %	0 %	0 %	25 %	480535717
31242	NC_021026	CAT	2	6	1948395	1948400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535717
31243	NC_021026	TGA	2	6	1948529	1948534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535717
31244	NC_021026	GAATA	2	10	1948560	1948569	60 %	20 %	20 %	0 %	480535717
31245	NC_021026	AATG	2	8	1948578	1948585	50 %	25 %	25 %	0 %	480535717
31246	NC_021026	CTA	2	6	1948622	1948627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535717
31247	NC_021026	TTTC	2	8	1949514	1949521	0 %	75 %	0 %	25 %	480535718
31248	NC_021026	GCA	2	6	1949664	1949669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535718
31249	NC_021026	TGC	2	6	1949717	1949722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535718
31250	NC_021026	ATC	2	6	1949754	1949759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535718
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31253	NC_021026	CTT	2	6	1949824	1949829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535718
31254	NC_021026	AGA	2	6	1949881	1949886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535718
31255	NC_021026	CTA	2	6	1949905	1949910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535718
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31261	NC_021026	AATT	2	8	1950166	1950173	50 %	50 %	0 %	0 %	480535718
31262	NC_021026	A	6	6	1950185	1950190	100 %	0 %	0 %	0 %	480535718
31263	NC_021026	AAT	2	6	1950225	1950230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535718
31264	NC_021026	TAC	2	6	1950305	1950310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535718
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31270	NC_021026	AAAC	2	8	1950422	1950429	75 %	0 %	0 %	25 %	480535718
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31272	NC_021026	TA	3	6	1950443	1950448	50 %	50 %	0 %	0 %	480535718
31273	NC_021026	CAAT	2	8	1950513	1950520	50 %	25 %	0 %	25 %	480535719
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31341	NC_021026	A	6	6	1953989	1953994	100 %	0 %	0 %	0 %	480535721
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31348	NC_021026	GTA	2	6	1955406	1955411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535722
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31350	NC_021026	CTT	2	6	1955444	1955449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535722
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31470	NC_021026	CCAC	2	8	1961551	1961558	25 %	0 %	0 %	75 %	480535728
31471	NC_021026	AGA	2	6	1961576	1961581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535728
31472	NC_021026	GCA	2	6	1961650	1961655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535728
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31477	NC_021026	CAT	2	6	1961828	1961833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535729
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