MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_021026	AGA	2	6	1878784	1878789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535664
30003	NC_021026	TTA	2	6	1878802	1878807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535664
30004	NC_021026	CTG	2	6	1878825	1878830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535664
30005	NC_021026	GTC	2	6	1878870	1878875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535664
30006	NC_021026	CAAA	2	8	1878971	1878978	75 %	0 %	0 %	25 %	480535664
30007	NC_021026	CAA	2	6	1879069	1879074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535664
30008	NC_021026	GCA	2	6	1879089	1879094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535664
30009	NC_021026	TCC	2	6	1879110	1879115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535664
30010	NC_021026	ATG	2	6	1879148	1879153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535664
30011	NC_021026	A	6	6	1879169	1879174	100 %	0 %	0 %	0 %	480535664
30012	NC_021026	CTT	2	6	1879234	1879239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535664
30013	NC_021026	GGT	2	6	1879277	1879282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535664
30014	NC_021026	TCG	2	6	1879324	1879329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535664
30015	NC_021026	A	6	6	1879388	1879393	100 %	0 %	0 %	0 %	480535664
30016	NC_021026	GACGCT	2	12	1879481	1879492	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480535664
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30018	NC_021026	TGA	2	6	1879528	1879533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535664
30019	NC_021026	AGC	2	6	1879561	1879566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535664
30020	NC_021026	GTT	2	6	1879607	1879612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535664
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30026	NC_021026	CGT	2	6	1879925	1879930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535664
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30029	NC_021026	ATCT	2	8	1880039	1880046	25 %	50 %	0 %	25 %	480535665
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30032	NC_021026	AAGCCA	2	12	1880135	1880146	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	480535665
30033	NC_021026	ACT	2	6	1880152	1880157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535665
30034	NC_021026	TGA	2	6	1880190	1880195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535665
30035	NC_021026	GAT	3	9	1880207	1880215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535665
30036	NC_021026	GAA	2	6	1880233	1880238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535665
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30039	NC_021026	CTA	2	6	1880397	1880402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535665
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30041	NC_021026	CTT	2	6	1880550	1880555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535665
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30044	NC_021026	AT	3	6	1880756	1880761	50 %	50 %	0 %	0 %	480535665
30045	NC_021026	GCTT	2	8	1880807	1880814	0 %	50 %	25 %	25 %	480535665
30046	NC_021026	GAT	2	6	1880835	1880840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535665
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30048	NC_021026	GAAA	2	8	1881100	1881107	75 %	0 %	25 %	0 %	480535665
30049	NC_021026	CAGCC	2	10	1881142	1881151	20 %	0 %	20 %	60 %	480535665
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30051	NC_021026	TGA	2	6	1881189	1881194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535665
30052	NC_021026	GTT	2	6	1881201	1881206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535665
30053	NC_021026	TTC	2	6	1881220	1881225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535665
30054	NC_021026	TCA	2	6	1881234	1881239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535665
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30057	NC_021026	CT	3	6	1881362	1881367	0 %	50 %	0 %	50 %	480535665
30058	NC_021026	ACT	2	6	1881407	1881412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535665
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30062	NC_021026	AAG	2	6	1881535	1881540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535665
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30065	NC_021026	CT	3	6	1881836	1881841	0 %	50 %	0 %	50 %	480535665
30066	NC_021026	TCA	2	6	1881861	1881866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535665
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30089	NC_021026	CAG	2	6	1883254	1883259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535667
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30118	NC_021026	CTTTGA	2	12	1885933	1885944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480535670
30119	NC_021026	AAG	2	6	1885961	1885966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535670
30120	NC_021026	TTG	2	6	1885983	1885988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535670
30121	NC_021026	GCT	2	6	1886112	1886117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535670
30122	NC_021026	AGATGT	2	12	1886158	1886169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535670
30123	NC_021026	TCT	2	6	1886172	1886177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535670
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30125	NC_021026	CTT	2	6	1886272	1886277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535670
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30129	NC_021026	GCT	2	6	1886460	1886465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535670
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30132	NC_021026	TTG	2	6	1886555	1886560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535670
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30135	NC_021026	GCT	2	6	1886700	1886705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535670
30136	NC_021026	AGT	2	6	1886779	1886784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535670
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30140	NC_021026	TGT	2	6	1886842	1886847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535670
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30146	NC_021026	CTT	2	6	1887070	1887075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535670
30147	NC_021026	TG	3	6	1887119	1887124	0 %	50 %	50 %	0 %	480535670
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30156	NC_021026	AAAGT	2	10	1887546	1887555	60 %	20 %	20 %	0 %	480535670
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30201	NC_021026	ATA	2	6	1889599	1889604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535671
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30220	NC_021026	GGT	3	9	1891059	1891067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535672
30221	NC_021026	TTG	2	6	1891132	1891137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535672
30222	NC_021026	AAC	2	6	1891144	1891149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535672
30223	NC_021026	TAT	2	6	1891156	1891161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535672
30224	NC_021026	ACA	2	6	1891233	1891238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535672
30225	NC_021026	TC	3	6	1891282	1891287	0 %	50 %	0 %	50 %	480535672
30226	NC_021026	GCT	2	6	1891362	1891367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535672
30227	NC_021026	CAAA	2	8	1891400	1891407	75 %	0 %	0 %	25 %	480535672
30228	NC_021026	A	6	6	1891420	1891425	100 %	0 %	0 %	0 %	480535672
30229	NC_021026	CAA	2	6	1891541	1891546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535673
30230	NC_021026	AGC	2	6	1891555	1891560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535673
30231	NC_021026	CTG	2	6	1891562	1891567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535673
30232	NC_021026	TCA	2	6	1891692	1891697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535673
30233	NC_021026	GTG	2	6	1891746	1891751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535673
30234	NC_021026	TGA	2	6	1891971	1891976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535673
30235	NC_021026	CCA	2	6	1892009	1892014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535673
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30237	NC_021026	GGTT	2	8	1892032	1892039	0 %	50 %	50 %	0 %	480535673
30238	NC_021026	GTTCT	2	10	1892091	1892100	0 %	60 %	20 %	20 %	480535673
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30243	NC_021026	ATG	2	6	1892402	1892407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535673
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30252	NC_021026	TATC	2	8	1892906	1892913	25 %	50 %	0 %	25 %	480535674
30253	NC_021026	CAT	2	6	1892927	1892932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535674
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30262	NC_021026	CT	3	6	1893468	1893473	0 %	50 %	0 %	50 %	480535674
30263	NC_021026	CAG	2	6	1893568	1893573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535674
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30302	NC_021026	T	6	6	1896259	1896264	0 %	100 %	0 %	0 %	480535677
30303	NC_021026	T	6	6	1896270	1896275	0 %	100 %	0 %	0 %	480535677
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30306	NC_021026	AAGA	2	8	1896443	1896450	75 %	0 %	25 %	0 %	480535677
30307	NC_021026	TAC	2	6	1896453	1896458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535677
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30314	NC_021026	ACTGCT	2	12	1896845	1896856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480535677
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30317	NC_021026	TCT	2	6	1896888	1896893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535677
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30333	NC_021026	ATGG	2	8	1897408	1897415	25 %	25 %	50 %	0 %	480535678
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30337	NC_021026	CAAGC	2	10	1897505	1897514	40 %	0 %	20 %	40 %	480535678
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30341	NC_021026	CAAG	2	8	1897692	1897699	50 %	0 %	25 %	25 %	480535678
30342	NC_021026	CAT	2	6	1897909	1897914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535678
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30345	NC_021026	AAGG	2	8	1898018	1898025	50 %	0 %	50 %	0 %	480535678
30346	NC_021026	GTA	2	6	1898105	1898110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535678
30347	NC_021026	TCA	2	6	1898128	1898133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535678
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30468	NC_021026	CTTG	2	8	1904760	1904767	0 %	50 %	25 %	25 %	480535687
30469	NC_021026	ATA	2	6	1904857	1904862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535687
30470	NC_021026	TTC	2	6	1904875	1904880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535687
30471	NC_021026	ATAGT	2	10	1904910	1904919	40 %	40 %	20 %	0 %	480535687
30472	NC_021026	A	6	6	1904923	1904928	100 %	0 %	0 %	0 %	480535687
30473	NC_021026	ACTG	2	8	1905022	1905029	25 %	25 %	25 %	25 %	480535687
30474	NC_021026	AAAT	2	8	1905031	1905038	75 %	25 %	0 %	0 %	480535687
30475	NC_021026	AAT	2	6	1905075	1905080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535687
30476	NC_021026	TCCT	2	8	1905094	1905101	0 %	50 %	0 %	50 %	480535687
30477	NC_021026	CTG	2	6	1905102	1905107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535687
30478	NC_021026	TGTT	2	8	1905176	1905183	0 %	75 %	25 %	0 %	480535687
30479	NC_021026	TTTCT	2	10	1905267	1905276	0 %	80 %	0 %	20 %	480535687
30480	NC_021026	TCC	2	6	1905326	1905331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535687
30481	NC_021026	AT	3	6	1905342	1905347	50 %	50 %	0 %	0 %	480535687
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30484	NC_021026	GA	3	6	1905630	1905635	50 %	0 %	50 %	0 %	480535688
30485	NC_021026	AATC	2	8	1905753	1905760	50 %	25 %	0 %	25 %	480535688
30486	NC_021026	GCCT	2	8	1905827	1905834	0 %	25 %	25 %	50 %	480535688
30487	NC_021026	GCCT	2	8	1905903	1905910	0 %	25 %	25 %	50 %	480535688
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30490	NC_021026	GAT	2	6	1906281	1906286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535689
30491	NC_021026	GTG	2	6	1906327	1906332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535689
30492	NC_021026	GTT	2	6	1906338	1906343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535689
30493	NC_021026	TTC	3	9	1906364	1906372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535689
30494	NC_021026	CCA	2	6	1906449	1906454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535689
30495	NC_021026	CAA	2	6	1906480	1906485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535689
30496	NC_021026	ACC	2	6	1906499	1906504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535689
30497	NC_021026	CGTC	3	12	1906512	1906523	0 %	25 %	25 %	50 %	480535689
30498	NC_021026	CAA	2	6	1906555	1906560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535689
30499	NC_021026	TGA	2	6	1906565	1906570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535689
30500	NC_021026	ACC	2	6	1906598	1906603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535689

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