MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_021026	TTC	2	6	1850306	1850311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535640
29502	NC_021026	AAG	2	6	1850346	1850351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535640
29503	NC_021026	CTG	3	9	1850389	1850397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535640
29504	NC_021026	CAA	2	6	1850434	1850439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535640
29505	NC_021026	AAT	2	6	1850458	1850463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535640
29506	NC_021026	TTCA	2	8	1850658	1850665	25 %	50 %	0 %	25 %	480535641
29507	NC_021026	AAT	2	6	1850677	1850682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535641
29508	NC_021026	TCT	2	6	1850695	1850700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535641
29509	NC_021026	TCG	2	6	1850749	1850754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535641
29510	NC_021026	CTTT	2	8	1850860	1850867	0 %	75 %	0 %	25 %	480535641
29511	NC_021026	CCA	2	6	1850882	1850887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535641
29512	NC_021026	CTTC	2	8	1850890	1850897	0 %	50 %	0 %	50 %	480535641
29513	NC_021026	TTGA	2	8	1850958	1850965	25 %	50 %	25 %	0 %	480535641
29514	NC_021026	CCA	2	6	1850971	1850976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535641
29515	NC_021026	CTTC	2	8	1851041	1851048	0 %	50 %	0 %	50 %	480535641
29516	NC_021026	ATC	2	6	1851087	1851092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535641
29517	NC_021026	TC	3	6	1851110	1851115	0 %	50 %	0 %	50 %	480535641
29518	NC_021026	CCT	2	6	1851142	1851147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535641
29519	NC_021026	TCA	2	6	1851196	1851201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535641
29520	NC_021026	ACC	2	6	1851225	1851230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535641
29521	NC_021026	ATGA	3	12	1851269	1851280	50 %	25 %	25 %	0 %	480535641
29522	NC_021026	GCA	2	6	1851313	1851318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535641
29523	NC_021026	ATG	2	6	1851340	1851345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535641
29524	NC_021026	ATTG	2	8	1851494	1851501	25 %	50 %	25 %	0 %	480535642
29525	NC_021026	TGG	2	6	1851544	1851549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535642
29526	NC_021026	AAT	2	6	1851585	1851590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535642
29527	NC_021026	ACC	2	6	1851655	1851660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535642
29528	NC_021026	TCA	2	6	1851743	1851748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535642
29529	NC_021026	TCA	3	9	1851802	1851810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535642
29530	NC_021026	TGC	2	6	1851870	1851875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535642
29531	NC_021026	ACC	2	6	1852032	1852037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535642
29532	NC_021026	CAT	2	6	1852046	1852051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535642
29533	NC_021026	TGA	2	6	1852061	1852066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535642
29534	NC_021026	ATA	2	6	1852072	1852077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535642
29535	NC_021026	CAA	2	6	1852103	1852108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535642
29536	NC_021026	CTG	2	6	1852109	1852114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535642
29537	NC_021026	TCC	2	6	1852249	1852254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535642
29538	NC_021026	ATA	2	6	1852333	1852338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535642
29539	NC_021026	GTA	2	6	1852344	1852349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535642
29540	NC_021026	CTG	2	6	1852350	1852355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535642
29541	NC_021026	TTC	2	6	1852508	1852513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535642
29542	NC_021026	CAT	2	6	1852563	1852568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535642
29543	NC_021026	CTG	2	6	1852653	1852658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535642
29544	NC_021026	TGA	2	6	1852733	1852738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535642
29545	NC_021026	GGA	2	6	1852835	1852840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535642
29546	NC_021026	TAT	2	6	1852841	1852846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535642
29547	NC_021026	AAAG	2	8	1852896	1852903	75 %	0 %	25 %	0 %	480535642
29548	NC_021026	CG	3	6	1852970	1852975	0 %	0 %	50 %	50 %	480535642
29549	NC_021026	CAG	2	6	1853022	1853027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535642
29550	NC_021026	ATC	2	6	1853173	1853178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535642
29551	NC_021026	AAT	2	6	1853216	1853221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535642
29552	NC_021026	A	7	7	1853225	1853231	100 %	0 %	0 %	0 %	480535642
29553	NC_021026	TTG	2	6	1854058	1854063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535643
29554	NC_021026	CAAT	2	8	1854092	1854099	50 %	25 %	0 %	25 %	480535643
29555	NC_021026	T	6	6	1854149	1854154	0 %	100 %	0 %	0 %	480535643
29556	NC_021026	AAT	3	9	1854159	1854167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535643
29557	NC_021026	GTC	2	6	1854172	1854177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535643
29558	NC_021026	CTT	2	6	1854200	1854205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535643
29559	NC_021026	CCA	2	6	1854313	1854318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535643
29560	NC_021026	TTC	2	6	1854336	1854341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535643
29561	NC_021026	ATGA	2	8	1854372	1854379	50 %	25 %	25 %	0 %	480535643
29562	NC_021026	GC	3	6	1854406	1854411	0 %	0 %	50 %	50 %	480535643
29563	NC_021026	TTCCC	2	10	1854434	1854443	0 %	40 %	0 %	60 %	480535643
29564	NC_021026	TCAC	2	8	1854526	1854533	25 %	25 %	0 %	50 %	480535643
29565	NC_021026	ACCA	2	8	1854642	1854649	50 %	0 %	0 %	50 %	480535643
29566	NC_021026	CCAA	2	8	1854742	1854749	50 %	0 %	0 %	50 %	480535643
29567	NC_021026	ACG	2	6	1854810	1854815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535643
29568	NC_021026	AAG	2	6	1854902	1854907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535643
29569	NC_021026	CAA	2	6	1854917	1854922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535643
29570	NC_021026	AG	3	6	1854963	1854968	50 %	0 %	50 %	0 %	480535643
29571	NC_021026	AACC	2	8	1854983	1854990	50 %	0 %	0 %	50 %	480535643
29572	NC_021026	CAT	2	6	1854993	1854998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29573	NC_021026	ACT	2	6	1855009	1855014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29574	NC_021026	AAG	2	6	1855047	1855052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535643
29575	NC_021026	AAG	2	6	1855161	1855166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535643
29576	NC_021026	CAT	2	6	1855194	1855199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29577	NC_021026	CAT	2	6	1855203	1855208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29578	NC_021026	CAG	2	6	1855211	1855216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535643
29579	NC_021026	CACC	2	8	1855251	1855258	25 %	0 %	0 %	75 %	480535643
29580	NC_021026	AAGGT	2	10	1855265	1855274	40 %	20 %	40 %	0 %	480535643
29581	NC_021026	TCA	2	6	1855337	1855342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29582	NC_021026	TCC	2	6	1855453	1855458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535643
29583	NC_021026	ACA	2	6	1855501	1855506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535643
29584	NC_021026	CCA	2	6	1855513	1855518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535643
29585	NC_021026	AGG	2	6	1855591	1855596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535643
29586	NC_021026	TCA	2	6	1855658	1855663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535643
29587	NC_021026	CTA	2	6	1855882	1855887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535644
29588	NC_021026	TAGGA	2	10	1855946	1855955	40 %	20 %	40 %	0 %	480535644
29589	NC_021026	GAG	2	6	1856017	1856022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535644
29590	NC_021026	CT	3	6	1856025	1856030	0 %	50 %	0 %	50 %	480535644
29591	NC_021026	CTG	2	6	1856083	1856088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535644
29592	NC_021026	GAAG	2	8	1856155	1856162	50 %	0 %	50 %	0 %	480535644
29593	NC_021026	AT	3	6	1856289	1856294	50 %	50 %	0 %	0 %	480535644
29594	NC_021026	GAT	2	6	1856297	1856302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535644
29595	NC_021026	TCA	2	6	1856352	1856357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535644
29596	NC_021026	GA	3	6	1856366	1856371	50 %	0 %	50 %	0 %	480535644
29597	NC_021026	ATT	2	6	1856396	1856401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535644
29598	NC_021026	CAT	2	6	1856408	1856413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535644
29599	NC_021026	CCA	2	6	1856416	1856421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535644
29600	NC_021026	TGAC	2	8	1856429	1856436	25 %	25 %	25 %	25 %	480535644
29601	NC_021026	CTG	2	6	1856452	1856457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535644
29602	NC_021026	CAG	2	6	1856506	1856511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535644
29603	NC_021026	CCG	2	6	1856539	1856544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535644
29604	NC_021026	TCT	2	6	1856616	1856621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535644
29605	NC_021026	CTC	2	6	1856879	1856884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535644
29606	NC_021026	TTC	2	6	1856921	1856926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535644
29607	NC_021026	TAG	2	6	1857015	1857020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535644
29608	NC_021026	TCA	2	6	1857144	1857149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535644
29609	NC_021026	GAG	2	6	1857187	1857192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535644
29610	NC_021026	CTGT	2	8	1857414	1857421	0 %	50 %	25 %	25 %	480535644
29611	NC_021026	CAC	2	6	1857461	1857466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535644
29612	NC_021026	ATCA	2	8	1857494	1857501	50 %	25 %	0 %	25 %	480535644
29613	NC_021026	GAGC	2	8	1857594	1857601	25 %	0 %	50 %	25 %	480535644
29614	NC_021026	GGT	2	6	1857685	1857690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535644
29615	NC_021026	AGC	2	6	1857726	1857731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535644
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29617	NC_021026	AG	3	6	1857809	1857814	50 %	0 %	50 %	0 %	480535644
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29853	NC_021026	TAA	2	6	1871545	1871550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535657
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29970	NC_021026	TAGA	2	8	1877113	1877120	50 %	25 %	25 %	0 %	480535663
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30000	NC_021026	TGA	2	6	1878718	1878723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535664

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