MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_021026	AAG	2	6	1749346	1749351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535550
28002	NC_021026	CAT	2	6	1749408	1749413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535550
28003	NC_021026	TCTT	2	8	1749436	1749443	0 %	75 %	0 %	25 %	480535550
28004	NC_021026	GCC	2	6	1749460	1749465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535550
28005	NC_021026	AGA	2	6	1749473	1749478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535550
28006	NC_021026	CCA	2	6	1749530	1749535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535550
28007	NC_021026	AGTAA	2	10	1749566	1749575	60 %	20 %	20 %	0 %	480535550
28008	NC_021026	AGC	2	6	1749588	1749593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535550
28009	NC_021026	CAA	2	6	1749684	1749689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535550
28010	NC_021026	CAA	2	6	1749761	1749766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535550
28011	NC_021026	ATTG	2	8	1749788	1749795	25 %	50 %	25 %	0 %	480535550
28012	NC_021026	TGCAAC	2	12	1749916	1749927	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480535551
28013	NC_021026	GTT	2	6	1750085	1750090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535551
28014	NC_021026	AAG	2	6	1750126	1750131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535551
28015	NC_021026	CTG	2	6	1750248	1750253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535551
28016	NC_021026	CTT	3	9	1750347	1750355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535551
28017	NC_021026	CAA	2	6	1750368	1750373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535551
28018	NC_021026	AGC	2	6	1750444	1750449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535551
28019	NC_021026	CTT	2	6	1750512	1750517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535551
28020	NC_021026	TCAA	2	8	1750535	1750542	50 %	25 %	0 %	25 %	480535551
28021	NC_021026	T	8	8	1750561	1750568	0 %	100 %	0 %	0 %	480535551
28022	NC_021026	T	6	6	1750586	1750591	0 %	100 %	0 %	0 %	480535551
28023	NC_021026	ACG	2	6	1750772	1750777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535552
28024	NC_021026	TCC	2	6	1750905	1750910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535552
28025	NC_021026	ATTT	2	8	1751120	1751127	25 %	75 %	0 %	0 %	480535553
28026	NC_021026	ATC	3	9	1751205	1751213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535553
28027	NC_021026	ACT	2	6	1751346	1751351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535553
28028	NC_021026	AAG	2	6	1751353	1751358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535553
28029	NC_021026	CAA	2	6	1751373	1751378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535553
28030	NC_021026	CT	3	6	1751380	1751385	0 %	50 %	0 %	50 %	480535553
28031	NC_021026	TGC	2	6	1751387	1751392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535553
28032	NC_021026	TCC	2	6	1751443	1751448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535553
28033	NC_021026	TCT	2	6	1751461	1751466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535553
28034	NC_021026	TGC	2	6	1751480	1751485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535553
28035	NC_021026	CAAG	2	8	1751508	1751515	50 %	0 %	25 %	25 %	480535553
28036	NC_021026	TTCAC	2	10	1751597	1751606	20 %	40 %	0 %	40 %	480535553
28037	NC_021026	AGA	2	6	1751612	1751617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535553
28038	NC_021026	TCG	2	6	1751671	1751676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535553
28039	NC_021026	TCT	2	6	1751677	1751682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535553
28040	NC_021026	GGT	2	6	1751724	1751729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535553
28041	NC_021026	ATG	2	6	1751733	1751738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535553
28042	NC_021026	TCGT	2	8	1751767	1751774	0 %	50 %	25 %	25 %	480535553
28043	NC_021026	A	6	6	1751787	1751792	100 %	0 %	0 %	0 %	480535553
28044	NC_021026	GAA	2	6	1751799	1751804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535553
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28047	NC_021026	CAAG	2	8	1751890	1751897	50 %	0 %	25 %	25 %	480535553
28048	NC_021026	A	6	6	1751898	1751903	100 %	0 %	0 %	0 %	480535553
28049	NC_021026	AAC	2	6	1751926	1751931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535553
28050	NC_021026	AAG	2	6	1751941	1751946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535553
28051	NC_021026	T	6	6	1752068	1752073	0 %	100 %	0 %	0 %	480535554
28052	NC_021026	CTG	2	6	1752091	1752096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535554
28053	NC_021026	TGG	2	6	1752098	1752103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535554
28054	NC_021026	TCAA	2	8	1752225	1752232	50 %	25 %	0 %	25 %	480535554
28055	NC_021026	TCA	2	6	1752234	1752239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535554
28056	NC_021026	TCTG	2	8	1752242	1752249	0 %	50 %	25 %	25 %	480535554
28057	NC_021026	GATA	2	8	1752300	1752307	50 %	25 %	25 %	0 %	480535554
28058	NC_021026	TTC	2	6	1752362	1752367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535554
28059	NC_021026	TTA	2	6	1752444	1752449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535554
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28061	NC_021026	AG	3	6	1752538	1752543	50 %	0 %	50 %	0 %	480535554
28062	NC_021026	TCC	2	6	1752548	1752553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535554
28063	NC_021026	ACTG	2	8	1752554	1752561	25 %	25 %	25 %	25 %	480535554
28064	NC_021026	CAT	2	6	1752616	1752621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535554
28065	NC_021026	CCGT	2	8	1752625	1752632	0 %	25 %	25 %	50 %	480535554
28066	NC_021026	TTC	2	6	1752800	1752805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535554
28067	NC_021026	ATT	2	6	1752936	1752941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535555
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28069	NC_021026	CTT	2	6	1753017	1753022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535555
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28071	NC_021026	AACC	2	8	1753179	1753186	50 %	0 %	0 %	50 %	480535555
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28075	NC_021026	TGACC	2	10	1753389	1753398	20 %	20 %	20 %	40 %	480535555
28076	NC_021026	CTG	2	6	1753404	1753409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535555
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28083	NC_021026	GTT	2	6	1753891	1753896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535555
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28088	NC_021026	TCA	2	6	1754108	1754113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535555
28089	NC_021026	CAA	2	6	1754142	1754147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535555
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28091	NC_021026	TTC	2	6	1754362	1754367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535556
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28101	NC_021026	TAGT	2	8	1755009	1755016	25 %	50 %	25 %	0 %	480535556
28102	NC_021026	ATT	2	6	1755025	1755030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535556
28103	NC_021026	CTT	3	9	1755065	1755073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535556
28104	NC_021026	ATTTC	2	10	1755075	1755084	20 %	60 %	0 %	20 %	480535556
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28106	NC_021026	TC	3	6	1755407	1755412	0 %	50 %	0 %	50 %	480535557
28107	NC_021026	CCA	2	6	1755419	1755424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535557
28108	NC_021026	CAT	4	12	1755441	1755452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535557
28109	NC_021026	ATA	2	6	1755496	1755501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535557
28110	NC_021026	GGAC	2	8	1755505	1755512	25 %	0 %	50 %	25 %	480535557
28111	NC_021026	CAAG	2	8	1755527	1755534	50 %	0 %	25 %	25 %	480535557
28112	NC_021026	GTG	2	6	1755537	1755542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535557
28113	NC_021026	ATGAC	2	10	1755550	1755559	40 %	20 %	20 %	20 %	480535557
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28116	NC_021026	ATCA	2	8	1755627	1755634	50 %	25 %	0 %	25 %	480535557
28117	NC_021026	AAG	2	6	1755648	1755653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535557
28118	NC_021026	GGTCT	2	10	1755675	1755684	0 %	40 %	40 %	20 %	480535557
28119	NC_021026	TGG	2	6	1755835	1755840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535557
28120	NC_021026	AGGC	2	8	1756026	1756033	25 %	0 %	50 %	25 %	480535557
28121	NC_021026	TTGA	2	8	1756044	1756051	25 %	50 %	25 %	0 %	480535557
28122	NC_021026	ATC	2	6	1756170	1756175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535557
28123	NC_021026	TGATT	2	10	1756230	1756239	20 %	60 %	20 %	0 %	480535557
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28132	NC_021026	ATC	2	6	1756615	1756620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535558
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28139	NC_021026	TCGT	2	8	1756942	1756949	0 %	50 %	25 %	25 %	480535558
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28147	NC_021026	CTGG	2	8	1757365	1757372	0 %	25 %	50 %	25 %	480535558
28148	NC_021026	TCC	2	6	1757429	1757434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535558
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28152	NC_021026	CTAT	2	8	1757601	1757608	25 %	50 %	0 %	25 %	480535559
28153	NC_021026	AT	3	6	1757607	1757612	50 %	50 %	0 %	0 %	480535559
28154	NC_021026	T	6	6	1757630	1757635	0 %	100 %	0 %	0 %	480535559
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28174	NC_021026	T	6	6	1758853	1758858	0 %	100 %	0 %	0 %	480535561
28175	NC_021026	ATGGGT	2	12	1758970	1758981	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	480535561
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28182	NC_021026	CG	4	8	1759628	1759635	0 %	0 %	50 %	50 %	480535561
28183	NC_021026	TAG	2	6	1759667	1759672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535561
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28187	NC_021026	GGCT	2	8	1759943	1759950	0 %	25 %	50 %	25 %	480535562
28188	NC_021026	GAC	2	6	1759954	1759959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535562
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28194	NC_021026	GTA	2	6	1760195	1760200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535562
28195	NC_021026	TGC	2	6	1760256	1760261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535562
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28199	NC_021026	TC	3	6	1760720	1760725	0 %	50 %	0 %	50 %	480535563
28200	NC_021026	A	7	7	1760739	1760745	100 %	0 %	0 %	0 %	480535563
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28208	NC_021026	ACC	2	6	1760964	1760969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535563
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28210	NC_021026	CA	3	6	1761014	1761019	50 %	0 %	0 %	50 %	480535563
28211	NC_021026	TCA	2	6	1761047	1761052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535564
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28216	NC_021026	T	6	6	1761258	1761263	0 %	100 %	0 %	0 %	480535564
28217	NC_021026	CAA	2	6	1761348	1761353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535564
28218	NC_021026	CCAAAT	2	12	1761357	1761368	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480535564
28219	NC_021026	TGAT	2	8	1761375	1761382	25 %	50 %	25 %	0 %	480535564
28220	NC_021026	CCA	2	6	1761488	1761493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535564
28221	NC_021026	CAG	2	6	1761523	1761528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535564
28222	NC_021026	CGT	2	6	1761529	1761534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535564
28223	NC_021026	TCCACT	2	12	1761538	1761549	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	480535564
28224	NC_021026	CG	3	6	1761610	1761615	0 %	0 %	50 %	50 %	480535564
28225	NC_021026	ATCA	2	8	1761646	1761653	50 %	25 %	0 %	25 %	480535564
28226	NC_021026	CTT	3	9	1761688	1761696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535565
28227	NC_021026	T	6	6	1761695	1761700	0 %	100 %	0 %	0 %	480535565
28228	NC_021026	CAAG	2	8	1761802	1761809	50 %	0 %	25 %	25 %	480535565
28229	NC_021026	CTC	2	6	1761814	1761819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535565
28230	NC_021026	AGA	2	6	1761912	1761917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535565
28231	NC_021026	GA	3	6	1761974	1761979	50 %	0 %	50 %	0 %	480535565
28232	NC_021026	A	6	6	1762016	1762021	100 %	0 %	0 %	0 %	480535565
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28234	NC_021026	AAT	2	6	1762187	1762192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535565
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