MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_021026	GAT	2	6	1680022	1680027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535488
27003	NC_021026	CTG	2	6	1680066	1680071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535488
27004	NC_021026	TCA	2	6	1680195	1680200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535488
27005	NC_021026	ATG	2	6	1680218	1680223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535488
27006	NC_021026	ATG	2	6	1680266	1680271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535488
27007	NC_021026	CTTTT	2	10	1680279	1680288	0 %	80 %	0 %	20 %	480535488
27008	NC_021026	GCGA	2	8	1680298	1680305	25 %	0 %	50 %	25 %	480535488
27009	NC_021026	AGACA	2	10	1680349	1680358	60 %	0 %	20 %	20 %	480535488
27010	NC_021026	TGA	2	6	1680360	1680365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535488
27011	NC_021026	AAT	2	6	1680378	1680383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535488
27012	NC_021026	GTTG	2	8	1680433	1680440	0 %	50 %	50 %	0 %	480535488
27013	NC_021026	TTTC	2	8	1680566	1680573	0 %	75 %	0 %	25 %	480535488
27014	NC_021026	TCA	2	6	1680582	1680587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535488
27015	NC_021026	GAT	2	6	1680632	1680637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535489
27016	NC_021026	AAG	2	6	1680654	1680659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535489
27017	NC_021026	TGGCAT	2	12	1680676	1680687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480535489
27018	NC_021026	GTT	2	6	1680698	1680703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535489
27019	NC_021026	ACC	3	9	1680758	1680766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535489
27020	NC_021026	CTTG	2	8	1680874	1680881	0 %	50 %	25 %	25 %	480535489
27021	NC_021026	TGC	2	6	1680902	1680907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535489
27022	NC_021026	GAT	3	9	1680950	1680958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535489
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27024	NC_021026	CTTG	2	8	1681093	1681100	0 %	50 %	25 %	25 %	480535489
27025	NC_021026	GAA	3	9	1681139	1681147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535489
27026	NC_021026	GAA	2	6	1681157	1681162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535489
27027	NC_021026	ACCA	2	8	1681223	1681230	50 %	0 %	0 %	50 %	480535489
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27031	NC_021026	AAG	2	6	1681507	1681512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535490
27032	NC_021026	TTG	2	6	1681602	1681607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535490
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27034	NC_021026	GTA	2	6	1681719	1681724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535490
27035	NC_021026	AT	3	6	1681750	1681755	50 %	50 %	0 %	0 %	480535490
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27038	NC_021026	TTTTC	2	10	1681846	1681855	0 %	80 %	0 %	20 %	480535490
27039	NC_021026	ATC	2	6	1682043	1682048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535490
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27041	NC_021026	TCC	2	6	1682118	1682123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535490
27042	NC_021026	ATTG	2	8	1682147	1682154	25 %	50 %	25 %	0 %	480535490
27043	NC_021026	TTC	2	6	1682274	1682279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535490
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27049	NC_021026	CAAA	2	8	1682684	1682691	75 %	0 %	0 %	25 %	480535490
27050	NC_021026	AAG	2	6	1682709	1682714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535490
27051	NC_021026	T	7	7	1682720	1682726	0 %	100 %	0 %	0 %	480535490
27052	NC_021026	CCATT	2	10	1682730	1682739	20 %	40 %	0 %	40 %	480535490
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27054	NC_021026	A	6	6	1682804	1682809	100 %	0 %	0 %	0 %	480535491
27055	NC_021026	GATAA	2	10	1682819	1682828	60 %	20 %	20 %	0 %	480535491
27056	NC_021026	TTTTAA	2	12	1682914	1682925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535491
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27061	NC_021026	CTG	2	6	1683046	1683051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535491
27062	NC_021026	ACT	2	6	1683062	1683067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535491
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27065	NC_021026	CTG	2	6	1683225	1683230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535491
27066	NC_021026	TAT	2	6	1683309	1683314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535491
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27101	NC_021026	ACT	2	6	1685400	1685405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535492
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27103	NC_021026	TCA	2	6	1685547	1685552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535492
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27112	NC_021026	CAG	2	6	1686228	1686233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535493
27113	NC_021026	CAC	2	6	1686264	1686269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535493
27114	NC_021026	GGT	2	6	1686272	1686277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535493
27115	NC_021026	AC	3	6	1686333	1686338	50 %	0 %	0 %	50 %	480535493
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27236	NC_021026	GCT	2	6	1700537	1700542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535501
27237	NC_021026	TCT	2	6	1700588	1700593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535501
27238	NC_021026	CTA	2	6	1700676	1700681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535501
27239	NC_021026	CAT	2	6	1700739	1700744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535501
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27262	NC_021026	T	6	6	1702424	1702429	0 %	100 %	0 %	0 %	480535504
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27336	NC_021026	CAAC	2	8	1707105	1707112	50 %	0 %	0 %	50 %	480535512
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27339	NC_021026	TCT	2	6	1707300	1707305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535513
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27346	NC_021026	GTG	2	6	1707662	1707667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535513
27347	NC_021026	CAT	2	6	1707692	1707697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535513
27348	NC_021026	TCA	2	6	1707702	1707707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535513
27349	NC_021026	CAT	2	6	1707790	1707795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535513
27350	NC_021026	TCA	2	6	1707871	1707876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535513
27351	NC_021026	CCAGTC	2	12	1707900	1707911	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	480535513
27352	NC_021026	CAA	2	6	1707916	1707921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535513
27353	NC_021026	CCA	2	6	1707985	1707990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535513
27354	NC_021026	CTG	2	6	1708000	1708005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535513
27355	NC_021026	CGT	2	6	1708009	1708014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535513
27356	NC_021026	GACCT	2	10	1708166	1708175	20 %	20 %	20 %	40 %	480535513
27357	NC_021026	TCA	2	6	1708185	1708190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535513
27358	NC_021026	AGA	2	6	1708220	1708225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535513
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27362	NC_021026	TTCATC	2	12	1709251	1709262	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480535514
27363	NC_021026	A	7	7	1709296	1709302	100 %	0 %	0 %	0 %	480535514
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27365	NC_021026	A	6	6	1709507	1709512	100 %	0 %	0 %	0 %	480535514
27366	NC_021026	CCCA	2	8	1709533	1709540	25 %	0 %	0 %	75 %	480535514
27367	NC_021026	TGA	2	6	1709591	1709596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535514
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27387	NC_021026	AG	3	6	1711502	1711507	50 %	0 %	50 %	0 %	480535516
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27464	NC_021026	TA	3	6	1717784	1717789	50 %	50 %	0 %	0 %	480535522
27465	NC_021026	TTC	2	6	1717797	1717802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535522
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27472	NC_021026	TCT	2	6	1718343	1718348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535523
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