MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_021026	ATA	2	6	1616289	1616294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26002	NC_021026	GTA	2	6	1616319	1616324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535429
26003	NC_021026	ACA	2	6	1616384	1616389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535429
26004	NC_021026	TTG	2	6	1616412	1616417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535429
26005	NC_021026	TGT	2	6	1616419	1616424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535429
26006	NC_021026	GCA	2	6	1616426	1616431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535429
26007	NC_021026	ATA	2	6	1616432	1616437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26008	NC_021026	AATA	2	8	1616439	1616446	75 %	25 %	0 %	0 %	480535429
26009	NC_021026	GA	3	6	1616463	1616468	50 %	0 %	50 %	0 %	480535429
26010	NC_021026	TAAAG	2	10	1616506	1616515	60 %	20 %	20 %	0 %	480535429
26011	NC_021026	T	6	6	1616658	1616663	0 %	100 %	0 %	0 %	480535429
26012	NC_021026	T	6	6	1616665	1616670	0 %	100 %	0 %	0 %	480535429
26013	NC_021026	AAT	2	6	1616764	1616769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26014	NC_021026	TAA	2	6	1616817	1616822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26015	NC_021026	ACC	2	6	1616851	1616856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535429
26016	NC_021026	TGC	2	6	1616869	1616874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535429
26017	NC_021026	ATA	2	6	1616903	1616908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26018	NC_021026	ACT	2	6	1616945	1616950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535429
26019	NC_021026	AGC	2	6	1616989	1616994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535429
26020	NC_021026	AAG	2	6	1617117	1617122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535429
26021	NC_021026	AATC	2	8	1617148	1617155	50 %	25 %	0 %	25 %	480535429
26022	NC_021026	CTC	2	6	1617198	1617203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535429
26023	NC_021026	TAA	2	6	1617306	1617311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26024	NC_021026	ATA	2	6	1617341	1617346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535429
26025	NC_021026	TCC	2	6	1617403	1617408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535429
26026	NC_021026	ACT	2	6	1617425	1617430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535429
26027	NC_021026	ATAA	2	8	1617445	1617452	75 %	25 %	0 %	0 %	480535429
26028	NC_021026	ATTTA	2	10	1617505	1617514	40 %	60 %	0 %	0 %	480535429
26029	NC_021026	CCT	2	6	1617529	1617534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535430
26030	NC_021026	ATAA	2	8	1617562	1617569	75 %	25 %	0 %	0 %	480535430
26031	NC_021026	AGC	2	6	1617597	1617602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535430
26032	NC_021026	AAT	2	6	1617690	1617695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535430
26033	NC_021026	T	6	6	1617765	1617770	0 %	100 %	0 %	0 %	480535430
26034	NC_021026	AAT	2	6	1617799	1617804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535430
26035	NC_021026	AGT	2	6	1617987	1617992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535430
26036	NC_021026	TGT	2	6	1618129	1618134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535430
26037	NC_021026	TGC	2	6	1618194	1618199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535430
26038	NC_021026	CTG	2	6	1618202	1618207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535430
26039	NC_021026	TAA	2	6	1618220	1618225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535430
26040	NC_021026	CTT	2	6	1618239	1618244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535430
26041	NC_021026	AATAC	2	10	1618309	1618318	60 %	20 %	0 %	20 %	480535430
26042	NC_021026	TGA	2	6	1618380	1618385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535430
26043	NC_021026	A	6	6	1618393	1618398	100 %	0 %	0 %	0 %	480535430
26044	NC_021026	AGT	2	6	1618416	1618421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535430
26045	NC_021026	CAA	2	6	1618499	1618504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535430
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26047	NC_021026	CAA	2	6	1618739	1618744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535431
26048	NC_021026	T	6	6	1618746	1618751	0 %	100 %	0 %	0 %	480535431
26049	NC_021026	T	6	6	1618806	1618811	0 %	100 %	0 %	0 %	480535431
26050	NC_021026	ACCAA	2	10	1618839	1618848	60 %	0 %	0 %	40 %	480535431
26051	NC_021026	T	6	6	1618875	1618880	0 %	100 %	0 %	0 %	480535431
26052	NC_021026	CTTT	2	8	1619017	1619024	0 %	75 %	0 %	25 %	480535431
26053	NC_021026	AAC	2	6	1619037	1619042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535431
26054	NC_021026	TCA	2	6	1619134	1619139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535431
26055	NC_021026	ACC	2	6	1619181	1619186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535431
26056	NC_021026	TACT	2	8	1619218	1619225	25 %	50 %	0 %	25 %	480535431
26057	NC_021026	TAA	2	6	1619308	1619313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535431
26058	NC_021026	TTATCT	2	12	1619314	1619325	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	480535431
26059	NC_021026	TGTAC	2	10	1619363	1619372	20 %	40 %	20 %	20 %	480535431
26060	NC_021026	ATT	2	6	1619442	1619447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535431
26061	NC_021026	CTT	2	6	1619516	1619521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535431
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26063	NC_021026	TTC	2	6	1619604	1619609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535431
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26066	NC_021026	GTA	2	6	1619659	1619664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535431
26067	NC_021026	T	7	7	1619705	1619711	0 %	100 %	0 %	0 %	480535431
26068	NC_021026	TCT	2	6	1619825	1619830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535432
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26071	NC_021026	CCT	2	6	1619879	1619884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535432
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26073	NC_021026	TCT	2	6	1619989	1619994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535432
26074	NC_021026	TGTTT	2	10	1620035	1620044	0 %	80 %	20 %	0 %	480535432
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26083	NC_021026	AAT	2	6	1621343	1621348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535433
26084	NC_021026	TTTA	2	8	1621418	1621425	25 %	75 %	0 %	0 %	480535433
26085	NC_021026	ATA	2	6	1621434	1621439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535433
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26091	NC_021026	TAT	2	6	1621661	1621666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535434
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26100	NC_021026	ACT	2	6	1621990	1621995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535434
26101	NC_021026	TAA	2	6	1622013	1622018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535434
26102	NC_021026	GTT	2	6	1622030	1622035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535434
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26104	NC_021026	T	6	6	1622065	1622070	0 %	100 %	0 %	0 %	480535434
26105	NC_021026	AT	3	6	1622159	1622164	50 %	50 %	0 %	0 %	480535434
26106	NC_021026	ACC	2	6	1622176	1622181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535434
26107	NC_021026	TTTA	2	8	1622184	1622191	25 %	75 %	0 %	0 %	480535434
26108	NC_021026	GCT	2	6	1622239	1622244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535434
26109	NC_021026	CT	3	6	1622266	1622271	0 %	50 %	0 %	50 %	480535434
26110	NC_021026	CAT	2	6	1622346	1622351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535434
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26112	NC_021026	GT	3	6	1622415	1622420	0 %	50 %	50 %	0 %	480535434
26113	NC_021026	T	6	6	1622496	1622501	0 %	100 %	0 %	0 %	480535434
26114	NC_021026	CAT	3	9	1622504	1622512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535434
26115	NC_021026	CTTA	2	8	1622565	1622572	25 %	50 %	0 %	25 %	480535434
26116	NC_021026	T	6	6	1622698	1622703	0 %	100 %	0 %	0 %	480535434
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26118	NC_021026	T	6	6	1622764	1622769	0 %	100 %	0 %	0 %	480535434
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26236	NC_021026	GAA	2	6	1631991	1631996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535441
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26238	NC_021026	TGG	2	6	1632237	1632242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535441
26239	NC_021026	GCA	2	6	1632250	1632255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535441
26240	NC_021026	CAA	2	6	1632269	1632274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535441
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26243	NC_021026	CTTTCT	2	12	1632526	1632537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535442
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26346	NC_021026	AG	3	6	1638442	1638447	50 %	0 %	50 %	0 %	480535449
26347	NC_021026	CTGA	2	8	1638538	1638545	25 %	25 %	25 %	25 %	480535449
26348	NC_021026	TCAA	2	8	1638731	1638738	50 %	25 %	0 %	25 %	480535449
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26352	NC_021026	CTT	2	6	1639074	1639079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535450
26353	NC_021026	TG	3	6	1639090	1639095	0 %	50 %	50 %	0 %	480535450
26354	NC_021026	TCA	2	6	1639161	1639166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535450
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26458	NC_021026	AG	3	6	1645260	1645265	50 %	0 %	50 %	0 %	480535456
26459	NC_021026	AAAT	2	8	1645286	1645293	75 %	25 %	0 %	0 %	480535456
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26469	NC_021026	GCTG	2	8	1646119	1646126	0 %	25 %	50 %	25 %	480535457
26470	NC_021026	ATTGAG	2	12	1646139	1646150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535457
26471	NC_021026	ATTG	2	8	1646158	1646165	25 %	50 %	25 %	0 %	480535457
26472	NC_021026	GCCT	2	8	1646211	1646218	0 %	25 %	25 %	50 %	480535457
26473	NC_021026	T	6	6	1646235	1646240	0 %	100 %	0 %	0 %	480535457
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26475	NC_021026	T	6	6	1646472	1646477	0 %	100 %	0 %	0 %	480535457
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26485	NC_021026	AGA	2	6	1646763	1646768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535457
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