MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_021026	CAGA	2	8	1559567	1559574	50 %	0 %	25 %	25 %	480535365
25002	NC_021026	CCAG	2	8	1559620	1559627	25 %	0 %	25 %	50 %	480535365
25003	NC_021026	T	6	6	1559726	1559731	0 %	100 %	0 %	0 %	480535365
25004	NC_021026	CAT	2	6	1559741	1559746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535365
25005	NC_021026	T	7	7	1559801	1559807	0 %	100 %	0 %	0 %	480535365
25006	NC_021026	TC	3	6	1560157	1560162	0 %	50 %	0 %	50 %	480535366
25007	NC_021026	TCCTA	2	10	1560214	1560223	20 %	40 %	0 %	40 %	480535366
25008	NC_021026	TGT	2	6	1560289	1560294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535366
25009	NC_021026	CGC	2	6	1560324	1560329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535367
25010	NC_021026	CAC	2	6	1560404	1560409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535367
25011	NC_021026	ATCTT	2	10	1560499	1560508	20 %	60 %	0 %	20 %	480535367
25012	NC_021026	GA	3	6	1560534	1560539	50 %	0 %	50 %	0 %	480535367
25013	NC_021026	ATC	2	6	1560607	1560612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535367
25014	NC_021026	TTG	2	6	1560728	1560733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535367
25015	NC_021026	CTT	3	9	1560759	1560767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535367
25016	NC_021026	CTA	2	6	1560932	1560937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535367
25017	NC_021026	AGC	2	6	1561044	1561049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535367
25018	NC_021026	CTT	2	6	1561093	1561098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535367
25019	NC_021026	TTG	2	6	1561151	1561156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535367
25020	NC_021026	GGTT	2	8	1561158	1561165	0 %	50 %	50 %	0 %	480535367
25021	NC_021026	CCG	2	6	1561232	1561237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535367
25022	NC_021026	GCA	2	6	1561249	1561254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535367
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25024	NC_021026	TGTCT	2	10	1561280	1561289	0 %	60 %	20 %	20 %	480535367
25025	NC_021026	TTA	2	6	1561309	1561314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535367
25026	NC_021026	TGCC	2	8	1561372	1561379	0 %	25 %	25 %	50 %	480535368
25027	NC_021026	TGCT	2	8	1561380	1561387	0 %	50 %	25 %	25 %	480535368
25028	NC_021026	TCA	2	6	1561403	1561408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535368
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25031	NC_021026	CTTG	2	8	1561726	1561733	0 %	50 %	25 %	25 %	480535368
25032	NC_021026	TGG	2	6	1561785	1561790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535368
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25034	NC_021026	GACG	2	8	1561844	1561851	25 %	0 %	50 %	25 %	480535368
25035	NC_021026	AAG	2	6	1561893	1561898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535368
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25043	NC_021026	AGAA	2	8	1562461	1562468	75 %	0 %	25 %	0 %	480535369
25044	NC_021026	CTA	2	6	1562543	1562548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535369
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25049	NC_021026	TA	3	6	1562915	1562920	50 %	50 %	0 %	0 %	480535370
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25059	NC_021026	A	6	6	1563369	1563374	100 %	0 %	0 %	0 %	480535371
25060	NC_021026	CA	3	6	1563408	1563413	50 %	0 %	0 %	50 %	480535371
25061	NC_021026	CAT	2	6	1563431	1563436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535371
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25118	NC_021026	ACC	2	6	1567099	1567104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535376
25119	NC_021026	AGC	2	6	1567123	1567128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535376
25120	NC_021026	CTT	2	6	1567146	1567151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535376
25121	NC_021026	GTCCAA	2	12	1567255	1567266	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480535376
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25133	NC_021026	TTC	2	6	1568414	1568419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535377
25134	NC_021026	CTA	2	6	1568425	1568430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535377
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25136	NC_021026	GCTT	2	8	1568509	1568516	0 %	50 %	25 %	25 %	480535377
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25139	NC_021026	T	6	6	1568558	1568563	0 %	100 %	0 %	0 %	480535377
25140	NC_021026	CG	3	6	1568773	1568778	0 %	0 %	50 %	50 %	480535377
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25147	NC_021026	CAT	2	6	1569266	1569271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535378
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25154	NC_021026	GTCC	2	8	1569483	1569490	0 %	25 %	25 %	50 %	480535378
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25230	NC_021026	CT	3	6	1574179	1574184	0 %	50 %	0 %	50 %	480535384
25231	NC_021026	TCA	2	6	1574200	1574205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535384
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25471	NC_021026	ATA	2	6	1586193	1586198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535398
25472	NC_021026	TCCA	2	8	1586249	1586256	25 %	25 %	0 %	50 %	480535398
25473	NC_021026	GCT	2	6	1586262	1586267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535398
25474	NC_021026	CTA	2	6	1586269	1586274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535398
25475	NC_021026	AGCCC	2	10	1586318	1586327	20 %	0 %	20 %	60 %	480535398
25476	NC_021026	AAG	2	6	1586367	1586372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535398
25477	NC_021026	AAG	2	6	1586385	1586390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535398
25478	NC_021026	AGAA	2	8	1586411	1586418	75 %	0 %	25 %	0 %	480535398
25479	NC_021026	TTG	2	6	1586421	1586426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535398
25480	NC_021026	TCC	2	6	1586432	1586437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535398
25481	NC_021026	AGA	2	6	1586446	1586451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535398
25482	NC_021026	AAC	3	9	1586471	1586479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535398
25483	NC_021026	T	6	6	1586519	1586524	0 %	100 %	0 %	0 %	480535398
25484	NC_021026	TTGA	2	8	1586543	1586550	25 %	50 %	25 %	0 %	480535398
25485	NC_021026	ATA	2	6	1586553	1586558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535398
25486	NC_021026	TGG	2	6	1586570	1586575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535398
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25489	NC_021026	TCA	2	6	1586791	1586796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535398
25490	NC_021026	T	6	6	1587027	1587032	0 %	100 %	0 %	0 %	480535399
25491	NC_021026	GTT	2	6	1587033	1587038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535399
25492	NC_021026	CAA	2	6	1587046	1587051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535399
25493	NC_021026	CAAA	2	8	1587103	1587110	75 %	0 %	0 %	25 %	480535399
25494	NC_021026	CTT	2	6	1587121	1587126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535399
25495	NC_021026	TTC	2	6	1587134	1587139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535399
25496	NC_021026	GTT	2	6	1587145	1587150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535399
25497	NC_021026	AAT	2	6	1587206	1587211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535399
25498	NC_021026	CAT	2	6	1587217	1587222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535399
25499	NC_021026	T	7	7	1587240	1587246	0 %	100 %	0 %	0 %	480535399
25500	NC_021026	AGA	2	6	1587305	1587310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535399

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