MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_021026	CTA	2	6	1525802	1525807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535334
24502	NC_021026	AAT	2	6	1525838	1525843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535334
24503	NC_021026	ATC	2	6	1526236	1526241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535335
24504	NC_021026	GAA	2	6	1526247	1526252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535335
24505	NC_021026	ACC	2	6	1526291	1526296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535335
24506	NC_021026	CTCC	2	8	1526337	1526344	0 %	25 %	0 %	75 %	480535335
24507	NC_021026	AAG	2	6	1526375	1526380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535335
24508	NC_021026	A	7	7	1526455	1526461	100 %	0 %	0 %	0 %	480535335
24509	NC_021026	ATC	2	6	1526477	1526482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535335
24510	NC_021026	ACC	2	6	1526677	1526682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535335
24511	NC_021026	ACA	2	6	1526684	1526689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535335
24512	NC_021026	CAT	2	6	1526728	1526733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535335
24513	NC_021026	GAC	2	6	1526773	1526778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535335
24514	NC_021026	AAAG	2	8	1526853	1526860	75 %	0 %	25 %	0 %	480535335
24515	NC_021026	CTG	2	6	1526874	1526879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535335
24516	NC_021026	TCA	2	6	1526915	1526920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535335
24517	NC_021026	TGAAT	2	10	1526931	1526940	40 %	40 %	20 %	0 %	480535335
24518	NC_021026	TCT	2	6	1527092	1527097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535335
24519	NC_021026	TCT	2	6	1527128	1527133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535335
24520	NC_021026	CTT	2	6	1527141	1527146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535335
24521	NC_021026	TTC	2	6	1527191	1527196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535335
24522	NC_021026	TGT	2	6	1527220	1527225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535335
24523	NC_021026	ACT	2	6	1527227	1527232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535335
24524	NC_021026	TAT	2	6	1527240	1527245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535335
24525	NC_021026	AGA	2	6	1527256	1527261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535335
24526	NC_021026	AGA	2	6	1527324	1527329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535335
24527	NC_021026	TTG	2	6	1527438	1527443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535336
24528	NC_021026	AT	3	6	1527457	1527462	50 %	50 %	0 %	0 %	480535336
24529	NC_021026	TCC	2	6	1527508	1527513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535336
24530	NC_021026	TTC	2	6	1527579	1527584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535336
24531	NC_021026	ATTG	2	8	1527626	1527633	25 %	50 %	25 %	0 %	480535336
24532	NC_021026	ATC	2	6	1527679	1527684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535336
24533	NC_021026	TAA	2	6	1527857	1527862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535336
24534	NC_021026	TCT	2	6	1527872	1527877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535336
24535	NC_021026	CTTTC	2	10	1527918	1527927	0 %	60 %	0 %	40 %	480535336
24536	NC_021026	CTT	2	6	1527968	1527973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535336
24537	NC_021026	TTC	2	6	1528047	1528052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535336
24538	NC_021026	GTT	2	6	1528156	1528161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535336
24539	NC_021026	T	6	6	1528174	1528179	0 %	100 %	0 %	0 %	480535336
24540	NC_021026	CAAA	2	8	1528226	1528233	75 %	0 %	0 %	25 %	480535336
24541	NC_021026	CTTG	2	8	1528235	1528242	0 %	50 %	25 %	25 %	480535336
24542	NC_021026	CTT	2	6	1528264	1528269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535336
24543	NC_021026	CT	3	6	1529736	1529741	0 %	50 %	0 %	50 %	480535337
24544	NC_021026	CAG	2	6	1529751	1529756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535337
24545	NC_021026	CT	3	6	1529776	1529781	0 %	50 %	0 %	50 %	480535337
24546	NC_021026	GTC	2	6	1529808	1529813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535337
24547	NC_021026	CAT	2	6	1529867	1529872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535337
24548	NC_021026	GTC	2	6	1529964	1529969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535337
24549	NC_021026	GGCT	2	8	1529997	1530004	0 %	25 %	50 %	25 %	480535337
24550	NC_021026	CTT	2	6	1530029	1530034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535337
24551	NC_021026	ATG	2	6	1530042	1530047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535337
24552	NC_021026	GCTG	2	8	1530083	1530090	0 %	25 %	50 %	25 %	480535337
24553	NC_021026	CAT	3	9	1530125	1530133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535337
24554	NC_021026	TAT	2	6	1530182	1530187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535337
24555	NC_021026	CTT	2	6	1530543	1530548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535338
24556	NC_021026	CTG	2	6	1530594	1530599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535338
24557	NC_021026	CTGGTA	2	12	1530624	1530635	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480535338
24558	NC_021026	AAG	2	6	1530646	1530651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535338
24559	NC_021026	TGT	2	6	1530686	1530691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535338
24560	NC_021026	CCA	2	6	1530707	1530712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535338
24561	NC_021026	TAG	2	6	1530770	1530775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535338
24562	NC_021026	GTT	2	6	1530796	1530801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535338
24563	NC_021026	ATA	2	6	1530937	1530942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535338
24564	NC_021026	CAC	2	6	1530966	1530971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535338
24565	NC_021026	CAC	2	6	1530981	1530986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535338
24566	NC_021026	GTA	2	6	1531024	1531029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535338
24567	NC_021026	ACC	2	6	1531048	1531053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535338
24568	NC_021026	TGT	2	6	1531102	1531107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535338
24569	NC_021026	CGA	2	6	1531133	1531138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535338
24570	NC_021026	CAAG	2	8	1531146	1531153	50 %	0 %	25 %	25 %	480535338
24571	NC_021026	GTC	2	6	1531181	1531186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535338
24572	NC_021026	GAA	2	6	1531276	1531281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535338
24573	NC_021026	GTT	3	9	1531313	1531321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535338
24574	NC_021026	T	6	6	1531332	1531337	0 %	100 %	0 %	0 %	480535338
24575	NC_021026	TCA	2	6	1531355	1531360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535338
24576	NC_021026	CCGC	2	8	1531385	1531392	0 %	0 %	25 %	75 %	480535338
24577	NC_021026	GATT	2	8	1531562	1531569	25 %	50 %	25 %	0 %	480535339
24578	NC_021026	TTG	2	6	1531666	1531671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535339
24579	NC_021026	ATC	2	6	1531673	1531678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535339
24580	NC_021026	TTTG	2	8	1531697	1531704	0 %	75 %	25 %	0 %	480535339
24581	NC_021026	TTA	2	6	1531740	1531745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535339
24582	NC_021026	CTTGG	2	10	1531906	1531915	0 %	40 %	40 %	20 %	480535339
24583	NC_021026	ACA	2	6	1531983	1531988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535339
24584	NC_021026	ACT	2	6	1532043	1532048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535339
24585	NC_021026	TCA	2	6	1532100	1532105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535339
24586	NC_021026	GCT	2	6	1532118	1532123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24587	NC_021026	GGC	2	6	1532156	1532161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480535339
24588	NC_021026	TA	3	6	1532186	1532191	50 %	50 %	0 %	0 %	480535339
24589	NC_021026	AGA	2	6	1532314	1532319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535339
24590	NC_021026	AG	3	6	1532350	1532355	50 %	0 %	50 %	0 %	480535339
24591	NC_021026	AAGG	2	8	1532372	1532379	50 %	0 %	50 %	0 %	480535339
24592	NC_021026	CAG	2	6	1532386	1532391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24593	NC_021026	T	6	6	1532421	1532426	0 %	100 %	0 %	0 %	480535339
24594	NC_021026	AAG	2	6	1532430	1532435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535339
24595	NC_021026	CAA	3	9	1532482	1532490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535339
24596	NC_021026	TTA	2	6	1532517	1532522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535339
24597	NC_021026	ACA	2	6	1532533	1532538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535339
24598	NC_021026	CCA	2	6	1532601	1532606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535339
24599	NC_021026	TGT	2	6	1532630	1532635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535339
24600	NC_021026	CAAC	2	8	1532677	1532684	50 %	0 %	0 %	50 %	480535339
24601	NC_021026	ATC	2	6	1532724	1532729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535339
24602	NC_021026	GAA	2	6	1532783	1532788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535339
24603	NC_021026	AAC	2	6	1532805	1532810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535339
24604	NC_021026	CAA	2	6	1532818	1532823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535339
24605	NC_021026	GTTT	2	8	1532849	1532856	0 %	75 %	25 %	0 %	480535339
24606	NC_021026	CTT	2	6	1532890	1532895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535339
24607	NC_021026	ACC	2	6	1532897	1532902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535339
24608	NC_021026	GCT	2	6	1532970	1532975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24609	NC_021026	ACCA	2	8	1532981	1532988	50 %	0 %	0 %	50 %	480535339
24610	NC_021026	GGA	2	6	1532995	1533000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535339
24611	NC_021026	AGC	2	6	1533011	1533016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24612	NC_021026	ATTG	2	8	1533072	1533079	25 %	50 %	25 %	0 %	480535339
24613	NC_021026	CAAA	2	8	1533085	1533092	75 %	0 %	0 %	25 %	480535339
24614	NC_021026	AAG	2	6	1533105	1533110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535339
24615	NC_021026	ACC	2	6	1533131	1533136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535339
24616	NC_021026	ATA	2	6	1533153	1533158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535339
24617	NC_021026	TTA	2	6	1533219	1533224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535339
24618	NC_021026	ATC	2	6	1533239	1533244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535339
24619	NC_021026	CTT	2	6	1533253	1533258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535339
24620	NC_021026	TAA	2	6	1533274	1533279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535339
24621	NC_021026	ATT	2	6	1533365	1533370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535339
24622	NC_021026	GCT	2	6	1533378	1533383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24623	NC_021026	GCA	2	6	1533483	1533488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535339
24624	NC_021026	TA	3	6	1533520	1533525	50 %	50 %	0 %	0 %	480535339
24625	NC_021026	GAATG	2	10	1533879	1533888	40 %	20 %	40 %	0 %	480535340
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24628	NC_021026	TGA	2	6	1534123	1534128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535340
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24632	NC_021026	GTC	2	6	1534418	1534423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535340
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24646	NC_021026	A	6	6	1535388	1535393	100 %	0 %	0 %	0 %	480535341
24647	NC_021026	TATC	2	8	1535397	1535404	25 %	50 %	0 %	25 %	480535341
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24720	NC_021026	TCA	2	6	1540350	1540355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535346
24721	NC_021026	TGGT	2	8	1540439	1540446	0 %	50 %	50 %	0 %	480535346
24722	NC_021026	ATA	2	6	1540448	1540453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535346
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24725	NC_021026	C	6	6	1540822	1540827	0 %	0 %	0 %	100 %	480535346
24726	NC_021026	AAG	2	6	1540878	1540883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535346
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24729	NC_021026	TCT	2	6	1541006	1541011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535346
24730	NC_021026	TTC	2	6	1541095	1541100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535346
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24734	NC_021026	CAA	2	6	1541388	1541393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535347
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24968	NC_021026	T	6	6	1557863	1557868	0 %	100 %	0 %	0 %	480535363
24969	NC_021026	ACG	2	6	1557911	1557916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535363
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24971	NC_021026	GCT	2	6	1558002	1558007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535363
24972	NC_021026	ACCA	2	8	1558031	1558038	50 %	0 %	0 %	50 %	480535363
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24975	NC_021026	GTT	2	6	1558250	1558255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535363
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24996	NC_021026	TCT	2	6	1559228	1559233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535364
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24999	NC_021026	CTC	2	6	1559427	1559432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535365
25000	NC_021026	TGA	2	6	1559558	1559563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535365

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