MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_021026	CTC	2	6	1466527	1466532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535281
23503	NC_021026	AGC	2	6	1466546	1466551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535281
23504	NC_021026	CAA	2	6	1466570	1466575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535281
23505	NC_021026	AAG	2	6	1466591	1466596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535281
23506	NC_021026	TCC	2	6	1466603	1466608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535281
23507	NC_021026	CGA	2	6	1466617	1466622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535281
23508	NC_021026	ATA	2	6	1466655	1466660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535281
23509	NC_021026	TCT	2	6	1467112	1467117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23510	NC_021026	CTG	2	6	1467164	1467169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23511	NC_021026	TTG	2	6	1467170	1467175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535282
23512	NC_021026	ACG	2	6	1467183	1467188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23513	NC_021026	CTT	2	6	1467413	1467418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23514	NC_021026	TCT	2	6	1467478	1467483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23515	NC_021026	TCT	2	6	1467532	1467537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23516	NC_021026	TTC	2	6	1467564	1467569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23517	NC_021026	AGGA	2	8	1467579	1467586	50 %	0 %	50 %	0 %	480535282
23518	NC_021026	AGA	2	6	1467626	1467631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535282
23519	NC_021026	ACA	2	6	1467679	1467684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535282
23520	NC_021026	TCT	2	6	1468076	1468081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23521	NC_021026	TTTG	2	8	1468118	1468125	0 %	75 %	25 %	0 %	480535282
23522	NC_021026	TGA	2	6	1468164	1468169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535282
23523	NC_021026	ACCA	2	8	1468175	1468182	50 %	0 %	0 %	50 %	480535282
23524	NC_021026	ACC	2	6	1468243	1468248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535282
23525	NC_021026	TCCAT	2	10	1468251	1468260	20 %	40 %	0 %	40 %	480535282
23526	NC_021026	CAAAC	2	10	1468274	1468283	60 %	0 %	0 %	40 %	480535282
23527	NC_021026	T	6	6	1468302	1468307	0 %	100 %	0 %	0 %	480535282
23528	NC_021026	CCA	2	6	1468374	1468379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535282
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23532	NC_021026	GA	3	6	1468499	1468504	50 %	0 %	50 %	0 %	480535282
23533	NC_021026	CAC	2	6	1468514	1468519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535282
23534	NC_021026	GAT	2	6	1468647	1468652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535282
23535	NC_021026	TGAG	2	8	1468683	1468690	25 %	25 %	50 %	0 %	480535282
23536	NC_021026	TCT	2	6	1468696	1468701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23537	NC_021026	AAG	2	6	1468707	1468712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535282
23538	NC_021026	TTC	2	6	1468786	1468791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535282
23539	NC_021026	TCA	2	6	1468807	1468812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535282
23540	NC_021026	ATT	2	6	1468833	1468838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535282
23541	NC_021026	GTC	2	6	1468857	1468862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23542	NC_021026	AGTC	2	8	1468904	1468911	25 %	25 %	25 %	25 %	480535282
23543	NC_021026	CAGCC	2	10	1469021	1469030	20 %	0 %	20 %	60 %	480535282
23544	NC_021026	AAT	2	6	1469053	1469058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535282
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23546	NC_021026	CAG	2	6	1469090	1469095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23547	NC_021026	GTATCT	2	12	1469188	1469199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480535282
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23549	NC_021026	ATGACC	2	12	1469297	1469308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480535282
23550	NC_021026	CAC	2	6	1469324	1469329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535282
23551	NC_021026	TTA	2	6	1469344	1469349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535282
23552	NC_021026	GCT	2	6	1469377	1469382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23553	NC_021026	GTT	2	6	1469456	1469461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535282
23554	NC_021026	GAAC	2	8	1469623	1469630	50 %	0 %	25 %	25 %	480535282
23555	NC_021026	CAT	2	6	1469699	1469704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535282
23556	NC_021026	GAC	2	6	1469741	1469746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535282
23557	NC_021026	ACTT	2	8	1471006	1471013	25 %	50 %	0 %	25 %	480535283
23558	NC_021026	AAT	2	6	1471014	1471019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535283
23559	NC_021026	T	7	7	1471033	1471039	0 %	100 %	0 %	0 %	480535283
23560	NC_021026	T	6	6	1471046	1471051	0 %	100 %	0 %	0 %	480535283
23561	NC_021026	TCAA	2	8	1471176	1471183	50 %	25 %	0 %	25 %	480535283
23562	NC_021026	TCC	2	6	1471311	1471316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535283
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23564	NC_021026	CTG	2	6	1471373	1471378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535283
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23567	NC_021026	ATTG	2	8	1471447	1471454	25 %	50 %	25 %	0 %	480535283
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23569	NC_021026	AAT	2	6	1471555	1471560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535283
23570	NC_021026	TAA	2	6	1471568	1471573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535283
23571	NC_021026	ACTC	2	8	1471585	1471592	25 %	25 %	0 %	50 %	480535283
23572	NC_021026	ACT	2	6	1471607	1471612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535283
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23574	NC_021026	TGA	2	6	1471662	1471667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535283
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23578	NC_021026	TCCAT	2	10	1471720	1471729	20 %	40 %	0 %	40 %	480535283
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23582	NC_021026	AGCA	2	8	1471903	1471910	50 %	0 %	25 %	25 %	480535284
23583	NC_021026	A	7	7	1472039	1472045	100 %	0 %	0 %	0 %	480535284
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23588	NC_021026	CAA	2	6	1472297	1472302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535285
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23597	NC_021026	TCT	2	6	1472887	1472892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535286
23598	NC_021026	TGA	2	6	1472921	1472926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535286
23599	NC_021026	CTT	2	6	1472935	1472940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535286
23600	NC_021026	T	6	6	1472939	1472944	0 %	100 %	0 %	0 %	480535286
23601	NC_021026	AAT	2	6	1472984	1472989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535286
23602	NC_021026	ATG	2	6	1473114	1473119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535286
23603	NC_021026	CT	3	6	1473196	1473201	0 %	50 %	0 %	50 %	480535286
23604	NC_021026	CATT	2	8	1473263	1473270	25 %	50 %	0 %	25 %	480535286
23605	NC_021026	TTCATC	2	12	1473307	1473318	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	480535287
23606	NC_021026	TGT	2	6	1473367	1473372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535287
23607	NC_021026	ACG	2	6	1473436	1473441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535287
23608	NC_021026	TTTTG	2	10	1473446	1473455	0 %	80 %	20 %	0 %	480535287
23609	NC_021026	TAGT	2	8	1473530	1473537	25 %	50 %	25 %	0 %	480535287
23610	NC_021026	TCA	2	6	1473617	1473622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535287
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23612	NC_021026	CTG	2	6	1473672	1473677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535287
23613	NC_021026	TCAA	2	8	1473710	1473717	50 %	25 %	0 %	25 %	480535287
23614	NC_021026	ACC	2	6	1473730	1473735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535287
23615	NC_021026	GTT	2	6	1473773	1473778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535287
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