MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_021026	TAT	2	6	1431026	1431031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535254
23002	NC_021026	CAA	2	6	1431071	1431076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535254
23003	NC_021026	TC	3	6	1431098	1431103	0 %	50 %	0 %	50 %	480535254
23004	NC_021026	GAA	2	6	1431178	1431183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535254
23005	NC_021026	AAT	2	6	1431279	1431284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535254
23006	NC_021026	T	6	6	1431284	1431289	0 %	100 %	0 %	0 %	480535254
23007	NC_021026	GACA	2	8	1431290	1431297	50 %	0 %	25 %	25 %	480535254
23008	NC_021026	TCA	2	6	1431310	1431315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535254
23009	NC_021026	TAG	2	6	1431320	1431325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535254
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23011	NC_021026	TAC	2	6	1431356	1431361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535254
23012	NC_021026	GA	3	6	1431392	1431397	50 %	0 %	50 %	0 %	480535254
23013	NC_021026	TATAT	2	10	1431405	1431414	40 %	60 %	0 %	0 %	480535254
23014	NC_021026	TC	4	8	1431439	1431446	0 %	50 %	0 %	50 %	480535254
23015	NC_021026	CAAA	2	8	1431465	1431472	75 %	0 %	0 %	25 %	480535254
23016	NC_021026	CT	3	6	1431646	1431651	0 %	50 %	0 %	50 %	480535254
23017	NC_021026	TAC	2	6	1431675	1431680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535254
23018	NC_021026	CAA	2	6	1431741	1431746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535254
23019	NC_021026	CTT	2	6	1431826	1431831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535254
23020	NC_021026	AATG	2	8	1431867	1431874	50 %	25 %	25 %	0 %	480535254
23021	NC_021026	TTG	2	6	1431892	1431897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535254
23022	NC_021026	AATTT	2	10	1431935	1431944	40 %	60 %	0 %	0 %	480535254
23023	NC_021026	AT	3	6	1431965	1431970	50 %	50 %	0 %	0 %	480535254
23024	NC_021026	CAA	2	6	1431996	1432001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535254
23025	NC_021026	TCTT	2	8	1432553	1432560	0 %	75 %	0 %	25 %	480535255
23026	NC_021026	CAT	2	6	1432614	1432619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535255
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23028	NC_021026	CCT	2	6	1432708	1432713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535255
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23032	NC_021026	TGG	2	6	1432974	1432979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535255
23033	NC_021026	AAAATC	2	12	1433032	1433043	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480535255
23034	NC_021026	GACC	2	8	1433050	1433057	25 %	0 %	25 %	50 %	480535255
23035	NC_021026	AGGA	2	8	1433092	1433099	50 %	0 %	50 %	0 %	480535255
23036	NC_021026	CGA	2	6	1433155	1433160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535255
23037	NC_021026	CAT	2	6	1433183	1433188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535255
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23039	NC_021026	GAT	2	6	1433346	1433351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535255
23040	NC_021026	TGA	2	6	1433362	1433367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535255
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23043	NC_021026	CTG	2	6	1433561	1433566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535255
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23046	NC_021026	C	6	6	1433783	1433788	0 %	0 %	0 %	100 %	480535255
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23049	NC_021026	CG	3	6	1434023	1434028	0 %	0 %	50 %	50 %	480535255
23050	NC_021026	CGA	2	6	1434156	1434161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535255
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23053	NC_021026	AG	3	6	1434215	1434220	50 %	0 %	50 %	0 %	480535255
23054	NC_021026	GCA	2	6	1434331	1434336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535255
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23062	NC_021026	TG	3	6	1435267	1435272	0 %	50 %	50 %	0 %	480535256
23063	NC_021026	A	7	7	1435338	1435344	100 %	0 %	0 %	0 %	480535256
23064	NC_021026	CT	3	6	1435352	1435357	0 %	50 %	0 %	50 %	480535256
23065	NC_021026	CAT	2	6	1435358	1435363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535256
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23072	NC_021026	TGG	2	6	1435656	1435661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535256
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23100	NC_021026	T	6	6	1437624	1437629	0 %	100 %	0 %	0 %	480535258
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23103	NC_021026	GAT	2	6	1437732	1437737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535258
23104	NC_021026	T	8	8	1437742	1437749	0 %	100 %	0 %	0 %	480535258
23105	NC_021026	ATG	2	6	1437766	1437771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535258
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23108	NC_021026	CCAAT	2	10	1437967	1437976	40 %	20 %	0 %	40 %	480535259
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23113	NC_021026	T	6	6	1438116	1438121	0 %	100 %	0 %	0 %	480535259
23114	NC_021026	GAA	2	6	1438126	1438131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535259
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23118	NC_021026	AAG	2	6	1438277	1438282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535259
23119	NC_021026	GATT	2	8	1438298	1438305	25 %	50 %	25 %	0 %	480535259
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23121	NC_021026	AAAT	2	8	1438394	1438401	75 %	25 %	0 %	0 %	480535259
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23230	NC_021026	AG	3	6	1443748	1443753	50 %	0 %	50 %	0 %	480535265
23231	NC_021026	ATT	2	6	1443786	1443791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535265
23232	NC_021026	GGAA	2	8	1443956	1443963	50 %	0 %	50 %	0 %	480535265
23233	NC_021026	T	6	6	1444030	1444035	0 %	100 %	0 %	0 %	480535265
23234	NC_021026	TCA	2	6	1444038	1444043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535265
23235	NC_021026	GGA	2	6	1444081	1444086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535265
23236	NC_021026	CTAT	2	8	1444094	1444101	25 %	50 %	0 %	25 %	480535265
23237	NC_021026	GCT	2	6	1444102	1444107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535265
23238	NC_021026	CAG	2	6	1444142	1444147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535265
23239	NC_021026	ATTC	2	8	1444230	1444237	25 %	50 %	0 %	25 %	480535265
23240	NC_021026	ATG	2	6	1444258	1444263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535265
23241	NC_021026	ATC	2	6	1444285	1444290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535265
23242	NC_021026	GAA	2	6	1444441	1444446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535265
23243	NC_021026	CTT	2	6	1444467	1444472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535265
23244	NC_021026	TCA	2	6	1444542	1444547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535265
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23247	NC_021026	ATA	2	6	1444650	1444655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535265
23248	NC_021026	CT	3	6	1445130	1445135	0 %	50 %	0 %	50 %	480535266
23249	NC_021026	TC	3	6	1445198	1445203	0 %	50 %	0 %	50 %	480535266
23250	NC_021026	CAT	2	6	1445221	1445226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535266
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23255	NC_021026	CAA	2	6	1446648	1446653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535267
23256	NC_021026	TC	3	6	1446677	1446682	0 %	50 %	0 %	50 %	480535267
23257	NC_021026	ACTG	2	8	1446759	1446766	25 %	25 %	25 %	25 %	480535267
23258	NC_021026	TTGA	2	8	1446811	1446818	25 %	50 %	25 %	0 %	480535267
23259	NC_021026	TCA	2	6	1446831	1446836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535267
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23263	NC_021026	CACT	2	8	1447090	1447097	25 %	25 %	0 %	50 %	480535267
23264	NC_021026	ACG	2	6	1447166	1447171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535267
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23335	NC_021026	AG	3	6	1452994	1452999	50 %	0 %	50 %	0 %	480535272
23336	NC_021026	TC	3	6	1453033	1453038	0 %	50 %	0 %	50 %	480535272
23337	NC_021026	GAT	2	6	1453055	1453060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535272
23338	NC_021026	AC	3	6	1453090	1453095	50 %	0 %	0 %	50 %	480535272
23339	NC_021026	GAA	2	6	1453109	1453114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535272
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23341	NC_021026	CGGA	2	8	1453240	1453247	25 %	0 %	50 %	25 %	480535272
23342	NC_021026	CTA	3	9	1453347	1453355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535272
23343	NC_021026	T	7	7	1453382	1453388	0 %	100 %	0 %	0 %	480535272
23344	NC_021026	AAT	2	6	1453519	1453524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535273
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23346	NC_021026	CTT	2	6	1453560	1453565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535273
23347	NC_021026	CAT	2	6	1453569	1453574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535273
23348	NC_021026	TCG	2	6	1453589	1453594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535273
23349	NC_021026	GTGC	2	8	1453632	1453639	0 %	25 %	50 %	25 %	480535273
23350	NC_021026	GAC	2	6	1453674	1453679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535273
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23352	NC_021026	CTG	2	6	1453722	1453727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535273
23353	NC_021026	TC	3	6	1453739	1453744	0 %	50 %	0 %	50 %	480535273
23354	NC_021026	GCT	2	6	1453748	1453753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535273
23355	NC_021026	GCT	2	6	1453760	1453765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535273
23356	NC_021026	TCC	2	6	1453771	1453776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535273
23357	NC_021026	GCA	2	6	1453883	1453888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535273
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23359	NC_021026	CCA	2	6	1453903	1453908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535273
23360	NC_021026	ACC	2	6	1453993	1453998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535273
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23363	NC_021026	GTA	2	6	1454086	1454091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535273
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23365	NC_021026	TTC	2	6	1454251	1454256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535273
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23369	NC_021026	GCTT	2	8	1454441	1454448	0 %	50 %	25 %	25 %	480535273
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23372	NC_021026	ACA	2	6	1454579	1454584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535273
23373	NC_021026	GA	3	6	1454608	1454613	50 %	0 %	50 %	0 %	480535273
23374	NC_021026	CTG	2	6	1454640	1454645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535273
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23420	NC_021026	TGA	2	6	1456900	1456905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535275
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23441	NC_021026	AAG	2	6	1458154	1458159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535276
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23445	NC_021026	TAC	2	6	1458427	1458432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535277
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23447	NC_021026	A	6	6	1458476	1458481	100 %	0 %	0 %	0 %	480535277
23448	NC_021026	CTCAA	2	10	1458520	1458529	40 %	20 %	0 %	40 %	480535277
23449	NC_021026	CGT	2	6	1458533	1458538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535277
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23451	NC_021026	CTGGA	2	10	1458555	1458564	20 %	20 %	40 %	20 %	480535277
23452	NC_021026	ACCT	2	8	1458594	1458601	25 %	25 %	0 %	50 %	480535277
23453	NC_021026	GGTGC	2	10	1458618	1458627	0 %	20 %	60 %	20 %	480535277
23454	NC_021026	ACT	2	6	1458660	1458665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535277
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23456	NC_021026	GCT	2	6	1458821	1458826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535277
23457	NC_021026	CAC	2	6	1461677	1461682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535278
23458	NC_021026	GAT	2	6	1461755	1461760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535278
23459	NC_021026	TCA	2	6	1461846	1461851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535278
23460	NC_021026	CG	3	6	1461881	1461886	0 %	0 %	50 %	50 %	480535278
23461	NC_021026	GCTGG	2	10	1461922	1461931	0 %	20 %	60 %	20 %	480535278
23462	NC_021026	AAAC	2	8	1462066	1462073	75 %	0 %	0 %	25 %	480535278
23463	NC_021026	CAT	2	6	1462078	1462083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535278
23464	NC_021026	TGG	2	6	1462104	1462109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535278
23465	NC_021026	TCA	2	6	1462155	1462160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535278
23466	NC_021026	AAG	2	6	1462178	1462183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535278
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23468	NC_021026	T	6	6	1465045	1465050	0 %	100 %	0 %	0 %	480535279
23469	NC_021026	GTA	2	6	1465061	1465066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535279
23470	NC_021026	ACG	2	6	1465074	1465079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535279
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23473	NC_021026	GTC	2	6	1465313	1465318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535279
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23481	NC_021026	CGTT	2	8	1465479	1465486	0 %	50 %	25 %	25 %	480535279
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23497	NC_021026	TCC	2	6	1466321	1466326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535281
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23500	NC_021026	GAATG	2	10	1466360	1466369	40 %	20 %	40 %	0 %	480535281

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