MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_021026	TAAAA	2	10	1334659	1334668	80 %	20 %	0 %	0 %	480535161
21503	NC_021026	AATT	2	8	1334674	1334681	50 %	50 %	0 %	0 %	480535161
21504	NC_021026	AATA	2	8	1334848	1334855	75 %	25 %	0 %	0 %	480535162
21505	NC_021026	TGG	2	6	1334859	1334864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535162
21506	NC_021026	AGA	2	6	1334868	1334873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535162
21507	NC_021026	AAG	2	6	1334937	1334942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535162
21508	NC_021026	TTC	2	6	1334951	1334956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535162
21509	NC_021026	T	7	7	1335007	1335013	0 %	100 %	0 %	0 %	480535162
21510	NC_021026	ACG	3	9	1335020	1335028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535162
21511	NC_021026	CAA	2	6	1335047	1335052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535162
21512	NC_021026	CCA	2	6	1335107	1335112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535162
21513	NC_021026	ATCG	2	8	1335122	1335129	25 %	25 %	25 %	25 %	480535162
21514	NC_021026	AATA	2	8	1335322	1335329	75 %	25 %	0 %	0 %	480535162
21515	NC_021026	CAA	2	6	1335353	1335358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535162
21516	NC_021026	GAT	2	6	1335404	1335409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535162
21517	NC_021026	TTC	2	6	1335422	1335427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535162
21518	NC_021026	TATT	2	8	1335462	1335469	25 %	75 %	0 %	0 %	480535163
21519	NC_021026	ATA	2	6	1335472	1335477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535163
21520	NC_021026	AAAG	2	8	1335498	1335505	75 %	0 %	25 %	0 %	480535163
21521	NC_021026	TCA	2	6	1335596	1335601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535163
21522	NC_021026	TAA	2	6	1337208	1337213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535164
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21526	NC_021026	CTCTT	2	10	1337513	1337522	0 %	60 %	0 %	40 %	480535164
21527	NC_021026	TGAAA	2	10	1337603	1337612	60 %	20 %	20 %	0 %	480535164
21528	NC_021026	T	6	6	1337926	1337931	0 %	100 %	0 %	0 %	480535165
21529	NC_021026	CAT	2	6	1337950	1337955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535165
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21532	NC_021026	GCT	2	6	1338243	1338248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535165
21533	NC_021026	CGA	2	6	1338318	1338323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535165
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21536	NC_021026	T	6	6	1338388	1338393	0 %	100 %	0 %	0 %	480535165
21537	NC_021026	GTTT	2	8	1338465	1338472	0 %	75 %	25 %	0 %	480535166
21538	NC_021026	TCT	2	6	1338517	1338522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535166
21539	NC_021026	TAG	2	6	1338535	1338540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535166
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21541	NC_021026	TCT	2	6	1338826	1338831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535166
21542	NC_021026	CTT	2	6	1338842	1338847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535166
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21551	NC_021026	GCAAG	2	10	1339529	1339538	40 %	0 %	40 %	20 %	480535166
21552	NC_021026	CTT	2	6	1339578	1339583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535166
21553	NC_021026	ACG	2	6	1339626	1339631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535166
21554	NC_021026	TGA	2	6	1339643	1339648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535166
21555	NC_021026	T	6	6	1339701	1339706	0 %	100 %	0 %	0 %	480535166
21556	NC_021026	CGT	2	6	1339713	1339718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535166
21557	NC_021026	TTG	2	6	1339736	1339741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535166
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21560	NC_021026	GAA	2	6	1339822	1339827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535166
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21599	NC_021026	CTTG	2	8	1341496	1341503	0 %	50 %	25 %	25 %	480535169
21600	NC_021026	AAT	2	6	1341535	1341540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535169
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21603	NC_021026	ACG	2	6	1341604	1341609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535169
21604	NC_021026	TCAAA	2	10	1341651	1341660	60 %	20 %	0 %	20 %	480535169
21605	NC_021026	CTG	2	6	1341663	1341668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535169
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21607	NC_021026	GAC	2	6	1341711	1341716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535169
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21611	NC_021026	AAT	2	6	1341966	1341971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535169
21612	NC_021026	ATA	2	6	1341998	1342003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535169
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21736	NC_021026	AGC	2	6	1351150	1351155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535174
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21968	NC_021026	ATA	2	6	1364336	1364341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535189
21969	NC_021026	AGCC	2	8	1364398	1364405	25 %	0 %	25 %	50 %	480535189
21970	NC_021026	CTT	2	6	1364422	1364427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535189
21971	NC_021026	A	6	6	1364442	1364447	100 %	0 %	0 %	0 %	480535189
21972	NC_021026	CAC	2	6	1364491	1364496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535189
21973	NC_021026	ATCA	2	8	1364633	1364640	50 %	25 %	0 %	25 %	480535189
21974	NC_021026	CTT	2	6	1364678	1364683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535190
21975	NC_021026	CTT	2	6	1364768	1364773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535190
21976	NC_021026	AGG	2	6	1364899	1364904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535190
21977	NC_021026	CTG	2	6	1364984	1364989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535190
21978	NC_021026	CTG	2	6	1365002	1365007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535190
21979	NC_021026	GTT	2	6	1365019	1365024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535190
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21981	NC_021026	TGA	2	6	1365122	1365127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535190
21982	NC_021026	TTGC	2	8	1365135	1365142	0 %	50 %	25 %	25 %	480535190
21983	NC_021026	ATC	2	6	1365210	1365215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535190
21984	NC_021026	GCT	2	6	1365343	1365348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535190
21985	NC_021026	GAT	2	6	1365462	1365467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535190
21986	NC_021026	TCA	2	6	1365472	1365477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535190
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21988	NC_021026	AG	3	6	1365509	1365514	50 %	0 %	50 %	0 %	480535190
21989	NC_021026	ACC	2	6	1365592	1365597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535190
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21991	NC_021026	GGC	2	6	1365666	1365671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480535190
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21995	NC_021026	CTA	2	6	1365859	1365864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535191
21996	NC_021026	TTA	2	6	1366062	1366067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535191
21997	NC_021026	TAA	2	6	1366083	1366088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535191
21998	NC_021026	CTG	2	6	1366142	1366147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535191
21999	NC_021026	CAAA	2	8	1366234	1366241	75 %	0 %	0 %	25 %	480535191
22000	NC_021026	ATT	2	6	1366274	1366279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535191

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