MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20118	NC_021026	ACC	2	6	1241382	1241387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535077
20119	NC_021026	ACA	2	6	1241518	1241523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535077
20120	NC_021026	ATAG	2	8	1241529	1241536	50 %	25 %	25 %	0 %	480535077
20121	NC_021026	GTT	2	6	1241555	1241560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535077
20122	NC_021026	TGT	2	6	1241618	1241623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535077
20123	NC_021026	GA	3	6	1241685	1241690	50 %	0 %	50 %	0 %	480535077
20124	NC_021026	GAG	2	6	1241694	1241699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535077
20125	NC_021026	CTT	2	6	1241781	1241786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535077
20126	NC_021026	TAT	2	6	1241789	1241794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535077
20127	NC_021026	TGG	2	6	1241879	1241884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535078
20128	NC_021026	TCAA	2	8	1241929	1241936	50 %	25 %	0 %	25 %	480535078
20129	NC_021026	AAG	2	6	1241950	1241955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535078
20130	NC_021026	AGC	2	6	1241976	1241981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535078
20131	NC_021026	CTG	2	6	1241982	1241987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535078
20132	NC_021026	ATG	3	9	1242004	1242012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535078
20133	NC_021026	TCT	2	6	1242043	1242048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535078
20134	NC_021026	AGGCTG	2	12	1242074	1242085	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	480535078
20135	NC_021026	GTT	2	6	1242143	1242148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535078
20136	NC_021026	ACC	2	6	1242153	1242158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535078
20137	NC_021026	TCAT	2	8	1242442	1242449	25 %	50 %	0 %	25 %	480535078
20138	NC_021026	GTAG	2	8	1242468	1242475	25 %	25 %	50 %	0 %	480535078
20139	NC_021026	TTTC	2	8	1242517	1242524	0 %	75 %	0 %	25 %	480535078
20140	NC_021026	TAG	2	6	1242584	1242589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535078
20141	NC_021026	TTC	2	6	1242603	1242608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535078
20142	NC_021026	CTG	2	6	1242759	1242764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535079
20143	NC_021026	CTG	2	6	1242912	1242917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535079
20144	NC_021026	AAC	2	6	1243003	1243008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535079
20145	NC_021026	CAAGGC	2	12	1243129	1243140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535079
20146	NC_021026	CAC	3	9	1243204	1243212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535079
20147	NC_021026	T	6	6	1243270	1243275	0 %	100 %	0 %	0 %	480535079
20148	NC_021026	AAT	2	6	1243324	1243329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535079
20149	NC_021026	CAC	2	6	1243380	1243385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535079
20150	NC_021026	AGA	2	6	1243399	1243404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535079
20151	NC_021026	AAGA	2	8	1243415	1243422	75 %	0 %	25 %	0 %	480535079
20152	NC_021026	ATG	2	6	1243487	1243492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535079
20153	NC_021026	GC	3	6	1243541	1243546	0 %	0 %	50 %	50 %	480535079
20154	NC_021026	CTTT	2	8	1243563	1243570	0 %	75 %	0 %	25 %	480535080
20155	NC_021026	TCA	2	6	1243606	1243611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535080
20156	NC_021026	ATT	3	9	1243643	1243651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535080
20157	NC_021026	GCC	2	6	1243830	1243835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535080
20158	NC_021026	ATA	2	6	1243898	1243903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535080
20159	NC_021026	CGCA	2	8	1243913	1243920	25 %	0 %	25 %	50 %	480535080
20160	NC_021026	CCA	2	6	1244004	1244009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535080
20161	NC_021026	ACG	2	6	1244031	1244036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535080
20162	NC_021026	ACT	2	6	1244061	1244066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535080
20163	NC_021026	CTG	2	6	1244143	1244148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535080
20164	NC_021026	GA	3	6	1244181	1244186	50 %	0 %	50 %	0 %	480535080
20165	NC_021026	TCC	2	6	1244255	1244260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535080
20166	NC_021026	AAAG	2	8	1244263	1244270	75 %	0 %	25 %	0 %	480535080
20167	NC_021026	AAG	2	6	1244295	1244300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535080
20168	NC_021026	AAAG	2	8	1244358	1244365	75 %	0 %	25 %	0 %	480535080
20169	NC_021026	TTC	2	6	1244441	1244446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535080
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20171	NC_021026	GCA	2	6	1244489	1244494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535081
20172	NC_021026	CTT	2	6	1244550	1244555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535081
20173	NC_021026	GA	3	6	1244567	1244572	50 %	0 %	50 %	0 %	480535081
20174	NC_021026	ATT	2	6	1244650	1244655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535081
20175	NC_021026	ATC	2	6	1244713	1244718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535081
20176	NC_021026	TA	3	6	1244719	1244724	50 %	50 %	0 %	0 %	480535081
20177	NC_021026	ATAA	2	8	1244733	1244740	75 %	25 %	0 %	0 %	480535081
20178	NC_021026	GATT	2	8	1244767	1244774	25 %	50 %	25 %	0 %	480535081
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20180	NC_021026	ATCAAC	2	12	1244971	1244982	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480535081
20181	NC_021026	AGCCA	2	10	1245001	1245010	40 %	0 %	20 %	40 %	480535081
20182	NC_021026	CAA	2	6	1245030	1245035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535081
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20185	NC_021026	T	7	7	1245324	1245330	0 %	100 %	0 %	0 %	480535081
20186	NC_021026	AAT	2	6	1245933	1245938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535082
20187	NC_021026	ACCA	2	8	1246002	1246009	50 %	0 %	0 %	50 %	480535082
20188	NC_021026	CTT	2	6	1246065	1246070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535082
20189	NC_021026	TCT	2	6	1246146	1246151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535082
20190	NC_021026	CAA	2	6	1246383	1246388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535082
20191	NC_021026	TGA	2	6	1246409	1246414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535082
20192	NC_021026	CCATT	2	10	1246455	1246464	20 %	40 %	0 %	40 %	480535082
20193	NC_021026	CAA	2	6	1246480	1246485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535082
20194	NC_021026	GAC	2	6	1246566	1246571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535082
20195	NC_021026	TCC	2	6	1246598	1246603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535082
20196	NC_021026	CAC	2	6	1246774	1246779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535082
20197	NC_021026	CCCCT	2	10	1246861	1246870	0 %	20 %	0 %	80 %	480535082
20198	NC_021026	AGTTG	2	10	1246886	1246895	20 %	40 %	40 %	0 %	480535082
20199	NC_021026	C	6	6	1246901	1246906	0 %	0 %	0 %	100 %	480535082
20200	NC_021026	GCA	2	6	1246910	1246915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535082
20201	NC_021026	CCA	2	6	1246962	1246967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535082
20202	NC_021026	AGC	2	6	1246972	1246977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535082
20203	NC_021026	TAAAC	2	10	1246991	1247000	60 %	20 %	0 %	20 %	480535082
20204	NC_021026	CTT	2	6	1247088	1247093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535082
20205	NC_021026	TCC	2	6	1247126	1247131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535082
20206	NC_021026	CAA	2	6	1247187	1247192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535082
20207	NC_021026	TCC	2	6	1247249	1247254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535083
20208	NC_021026	CAT	2	6	1247272	1247277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535083
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20210	NC_021026	CAGC	2	8	1247484	1247491	25 %	0 %	25 %	50 %	480535083
20211	NC_021026	CATT	2	8	1247495	1247502	25 %	50 %	0 %	25 %	480535083
20212	NC_021026	CAC	2	6	1247604	1247609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535083
20213	NC_021026	CAT	2	6	1247634	1247639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535083
20214	NC_021026	CAT	2	6	1247680	1247685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535083
20215	NC_021026	CTG	2	6	1247701	1247706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535083
20216	NC_021026	ATT	2	6	1247716	1247721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535083
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20218	NC_021026	ACCA	2	8	1247830	1247837	50 %	0 %	0 %	50 %	480535083
20219	NC_021026	CTT	2	6	1247850	1247855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535083
20220	NC_021026	CAAATT	2	12	1247964	1247975	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	480535083
20221	NC_021026	TTCC	2	8	1247995	1248002	0 %	50 %	0 %	50 %	480535084
20222	NC_021026	CTTG	2	8	1248089	1248096	0 %	50 %	25 %	25 %	480535084
20223	NC_021026	CAT	2	6	1248172	1248177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535084
20224	NC_021026	A	7	7	1248179	1248185	100 %	0 %	0 %	0 %	480535084
20225	NC_021026	CTT	2	6	1248279	1248284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535085
20226	NC_021026	AAT	3	9	1248367	1248375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535085
20227	NC_021026	GAC	2	6	1248378	1248383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535085
20228	NC_021026	TCAA	2	8	1248404	1248411	50 %	25 %	0 %	25 %	480535085
20229	NC_021026	CT	3	6	1248437	1248442	0 %	50 %	0 %	50 %	480535085
20230	NC_021026	ATG	2	6	1248485	1248490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535085
20231	NC_021026	TCA	2	6	1248491	1248496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535085
20232	NC_021026	AAGGA	2	10	1248512	1248521	60 %	0 %	40 %	0 %	480535085
20233	NC_021026	TTCTT	2	10	1248532	1248541	0 %	80 %	0 %	20 %	480535085
20234	NC_021026	ATA	2	6	1248557	1248562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535085
20235	NC_021026	GCCTTA	2	12	1248602	1248613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480535085
20236	NC_021026	ATG	2	6	1248618	1248623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535085
20237	NC_021026	CTTTC	2	10	1248856	1248865	0 %	60 %	0 %	40 %	480535086
20238	NC_021026	CAGATA	2	12	1248882	1248893	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480535086
20239	NC_021026	AAG	2	6	1248898	1248903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535086
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20344	NC_021026	TTTACG	2	12	1254879	1254890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	480535094
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20347	NC_021026	TAC	2	6	1255005	1255010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535094
20348	NC_021026	T	7	7	1255022	1255028	0 %	100 %	0 %	0 %	480535094
20349	NC_021026	T	6	6	1255158	1255163	0 %	100 %	0 %	0 %	480535095
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20351	NC_021026	GAT	2	6	1255198	1255203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535095
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20353	NC_021026	AAT	2	6	1255312	1255317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535095
20354	NC_021026	TTGGG	2	10	1255360	1255369	0 %	40 %	60 %	0 %	480535095
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20467	NC_021026	CAT	3	9	1267112	1267120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535104
20468	NC_021026	AAC	2	6	1267174	1267179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535104
20469	NC_021026	CCA	2	6	1267253	1267258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535104
20470	NC_021026	GCC	2	6	1267312	1267317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535104
20471	NC_021026	TTC	2	6	1267452	1267457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535104
20472	NC_021026	CCA	2	6	1267543	1267548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535104
20473	NC_021026	TTC	2	6	1267671	1267676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535104
20474	NC_021026	TAGT	2	8	1267744	1267751	25 %	50 %	25 %	0 %	480535104
20475	NC_021026	CTG	2	6	1267838	1267843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535104
20476	NC_021026	CACCAG	2	12	1267877	1267888	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480535104
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20478	NC_021026	AAAGT	2	10	1267981	1267990	60 %	20 %	20 %	0 %	480535104
20479	NC_021026	ACC	2	6	1268022	1268027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535104
20480	NC_021026	CTTT	2	8	1269385	1269392	0 %	75 %	0 %	25 %	480535105
20481	NC_021026	TAA	2	6	1269416	1269421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535105
20482	NC_021026	ATTC	2	8	1269436	1269443	25 %	50 %	0 %	25 %	480535105
20483	NC_021026	AGA	2	6	1269497	1269502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535105
20484	NC_021026	A	6	6	1269518	1269523	100 %	0 %	0 %	0 %	480535105
20485	NC_021026	ATC	2	6	1269562	1269567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535105
20486	NC_021026	ATA	2	6	1269586	1269591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535105
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20488	NC_021026	A	6	6	1269653	1269658	100 %	0 %	0 %	0 %	480535105
20489	NC_021026	ATT	2	6	1269662	1269667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535105
20490	NC_021026	ATC	2	6	1269673	1269678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535105
20491	NC_021026	TTC	2	6	1269740	1269745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535105
20492	NC_021026	TAC	2	6	1269746	1269751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535105
20493	NC_021026	TA	4	8	1269803	1269810	50 %	50 %	0 %	0 %	480535105
20494	NC_021026	ATA	2	6	1269817	1269822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535105
20495	NC_021026	AAAG	2	8	1269906	1269913	75 %	0 %	25 %	0 %	480535105
20496	NC_021026	TTA	2	6	1269945	1269950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535105
20497	NC_021026	ACT	2	6	1270017	1270022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535105
20498	NC_021026	TAG	2	6	1270024	1270029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535105
20499	NC_021026	GATT	2	8	1270061	1270068	25 %	50 %	25 %	0 %	480535105
20500	NC_021026	GAGGAA	2	12	1270173	1270184	50 %	0 %	50 %	0 %	480535105

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