MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021026	CTT	2	6	1204535	1204540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535044
19503	NC_021026	TTA	2	6	1204572	1204577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535044
19504	NC_021026	TG	4	8	1204582	1204589	0 %	50 %	50 %	0 %	480535044
19505	NC_021026	GACCT	2	10	1204685	1204694	20 %	20 %	20 %	40 %	480535044
19506	NC_021026	TAG	2	6	1204722	1204727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535044
19507	NC_021026	CAT	2	6	1204801	1204806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535044
19508	NC_021026	ACG	2	6	1204811	1204816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535044
19509	NC_021026	ACA	2	6	1204839	1204844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535044
19510	NC_021026	TTG	2	6	1204846	1204851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535044
19511	NC_021026	GTA	2	6	1204880	1204885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535044
19512	NC_021026	TAGG	2	8	1204963	1204970	25 %	25 %	50 %	0 %	480535044
19513	NC_021026	GCA	2	6	1204989	1204994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535044
19514	NC_021026	GAA	2	6	1205001	1205006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535044
19515	NC_021026	AACC	2	8	1205020	1205027	50 %	0 %	0 %	50 %	480535044
19516	NC_021026	AGCTAC	2	12	1205054	1205065	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480535044
19517	NC_021026	TCT	2	6	1205067	1205072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535044
19518	NC_021026	CAT	2	6	1205104	1205109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535044
19519	NC_021026	TCG	2	6	1205188	1205193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535044
19520	NC_021026	CAT	2	6	1205236	1205241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535044
19521	NC_021026	CTT	2	6	1205254	1205259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535044
19522	NC_021026	CCA	2	6	1205260	1205265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535044
19523	NC_021026	ACT	2	6	1205298	1205303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535044
19524	NC_021026	CG	3	6	1205311	1205316	0 %	0 %	50 %	50 %	480535044
19525	NC_021026	GAA	2	6	1205353	1205358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535044
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19527	NC_021026	CTG	2	6	1205377	1205382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535044
19528	NC_021026	GTA	2	6	1205387	1205392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535044
19529	NC_021026	AAC	2	6	1205468	1205473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535044
19530	NC_021026	ATC	2	6	1205573	1205578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535044
19531	NC_021026	CTG	2	6	1205608	1205613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535044
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19533	NC_021026	T	7	7	1205625	1205631	0 %	100 %	0 %	0 %	480535044
19534	NC_021026	TGAT	3	12	1205681	1205692	25 %	50 %	25 %	0 %	480535044
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19538	NC_021026	T	6	6	1205932	1205937	0 %	100 %	0 %	0 %	480535045
19539	NC_021026	TCA	2	6	1205962	1205967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535045
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19542	NC_021026	GTA	2	6	1206197	1206202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535045
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19544	NC_021026	CTT	2	6	1206229	1206234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535045
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19617	NC_021026	T	6	6	1209894	1209899	0 %	100 %	0 %	0 %	480535048
19618	NC_021026	TCA	2	6	1209977	1209982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535048
19619	NC_021026	TCT	2	6	1210025	1210030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535048
19620	NC_021026	TGGA	2	8	1210066	1210073	25 %	25 %	50 %	0 %	480535048
19621	NC_021026	ATC	2	6	1210078	1210083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535048
19622	NC_021026	CAT	2	6	1210128	1210133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535048
19623	NC_021026	CA	3	6	1210206	1210211	50 %	0 %	0 %	50 %	480535048
19624	NC_021026	CAT	2	6	1210236	1210241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535048
19625	NC_021026	CAA	2	6	1210242	1210247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535048
19626	NC_021026	AAT	2	6	1210249	1210254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535048
19627	NC_021026	TAAT	2	8	1210341	1210348	50 %	50 %	0 %	0 %	480535048
19628	NC_021026	CTC	2	6	1210364	1210369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535049
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19630	NC_021026	TTG	2	6	1210412	1210417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535049
19631	NC_021026	CTT	2	6	1210525	1210530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535049
19632	NC_021026	CTT	2	6	1210615	1210620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535049
19633	NC_021026	TAGACA	2	12	1210624	1210635	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480535049
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19636	NC_021026	GAT	2	6	1210771	1210776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535049
19637	NC_021026	T	6	6	1210779	1210784	0 %	100 %	0 %	0 %	480535049
19638	NC_021026	TAA	2	6	1210796	1210801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535049
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19642	NC_021026	T	6	6	1210998	1211003	0 %	100 %	0 %	0 %	480535049
19643	NC_021026	GCA	2	6	1211025	1211030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535049
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19646	NC_021026	TCT	2	6	1211107	1211112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535049
19647	NC_021026	CTTCT	2	10	1211116	1211125	0 %	60 %	0 %	40 %	480535049
19648	NC_021026	AAC	2	6	1211133	1211138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535049
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19692	NC_021026	TA	3	6	1213277	1213282	50 %	50 %	0 %	0 %	480535051
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19699	NC_021026	AG	3	6	1213619	1213624	50 %	0 %	50 %	0 %	480535051
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19704	NC_021026	T	6	6	1213791	1213796	0 %	100 %	0 %	0 %	480535051
19705	NC_021026	AAT	2	6	1213801	1213806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535051
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19714	NC_021026	A	6	6	1214400	1214405	100 %	0 %	0 %	0 %	480535052
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19719	NC_021026	TGA	2	6	1214589	1214594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535052
19720	NC_021026	GTG	2	6	1214653	1214658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535052
19721	NC_021026	TCTT	2	8	1214778	1214785	0 %	75 %	0 %	25 %	480535053
19722	NC_021026	CTA	2	6	1214795	1214800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535053
19723	NC_021026	TTC	2	6	1214802	1214807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535053
19724	NC_021026	TAT	2	6	1214813	1214818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535053
19725	NC_021026	GTAG	2	8	1214861	1214868	25 %	25 %	50 %	0 %	480535053
19726	NC_021026	CTC	3	9	1214948	1214956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535053
19727	NC_021026	TAA	2	6	1214982	1214987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535053
19728	NC_021026	GCT	2	6	1215022	1215027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535053
19729	NC_021026	A	6	6	1215043	1215048	100 %	0 %	0 %	0 %	480535053
19730	NC_021026	TAA	2	6	1215153	1215158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535053
19731	NC_021026	ATC	2	6	1215187	1215192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19732	NC_021026	TCA	2	6	1215279	1215284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19733	NC_021026	GGT	2	6	1215294	1215299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535054
19734	NC_021026	ATC	2	6	1215350	1215355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19735	NC_021026	CCTTGA	2	12	1215429	1215440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	480535054
19736	NC_021026	CTC	2	6	1215442	1215447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535054
19737	NC_021026	CTTGGG	2	12	1215471	1215482	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	480535054
19738	NC_021026	AAT	2	6	1215496	1215501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535054
19739	NC_021026	TCA	2	6	1215509	1215514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19740	NC_021026	AGA	2	6	1215562	1215567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535054
19741	NC_021026	CAA	2	6	1215570	1215575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535054
19742	NC_021026	AAT	2	6	1215649	1215654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535054
19743	NC_021026	GCA	2	6	1215687	1215692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535054
19744	NC_021026	ACC	2	6	1215764	1215769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535054
19745	NC_021026	CTGTC	2	10	1215772	1215781	0 %	40 %	20 %	40 %	480535054
19746	NC_021026	ACC	2	6	1215832	1215837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535054
19747	NC_021026	TTG	2	6	1215841	1215846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535054
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19750	NC_021026	T	7	7	1216053	1216059	0 %	100 %	0 %	0 %	480535054
19751	NC_021026	ATC	2	6	1216102	1216107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19752	NC_021026	GCG	2	6	1216200	1216205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480535054
19753	NC_021026	AGCC	2	8	1216212	1216219	25 %	0 %	25 %	50 %	480535054
19754	NC_021026	TAA	2	6	1216239	1216244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535054
19755	NC_021026	TAC	2	6	1216407	1216412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535054
19756	NC_021026	TGTT	2	8	1216428	1216435	0 %	75 %	25 %	0 %	480535054
19757	NC_021026	TTCTT	2	10	1216530	1216539	0 %	80 %	0 %	20 %	480535055
19758	NC_021026	T	6	6	1216573	1216578	0 %	100 %	0 %	0 %	480535055
19759	NC_021026	TTG	3	9	1216604	1216612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535055
19760	NC_021026	CTGT	2	8	1216705	1216712	0 %	50 %	25 %	25 %	480535055
19761	NC_021026	TTGC	2	8	1216761	1216768	0 %	50 %	25 %	25 %	480535055
19762	NC_021026	CTG	2	6	1216777	1216782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535055
19763	NC_021026	GCT	2	6	1216797	1216802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535055
19764	NC_021026	GAC	2	6	1216896	1216901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535056
19765	NC_021026	T	6	6	1216915	1216920	0 %	100 %	0 %	0 %	480535056
19766	NC_021026	TCT	2	6	1217068	1217073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535056
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19846	NC_021026	TAT	2	6	1220801	1220806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535059
19847	NC_021026	GC	3	6	1220859	1220864	0 %	0 %	50 %	50 %	480535059
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19850	NC_021026	T	7	7	1221132	1221138	0 %	100 %	0 %	0 %	480535060
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19852	NC_021026	GA	3	6	1221228	1221233	50 %	0 %	50 %	0 %	480535060
19853	NC_021026	TCA	2	6	1221309	1221314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535060
19854	NC_021026	CAT	2	6	1221400	1221405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535060
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19859	NC_021026	TAC	2	6	1221818	1221823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535061
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19971	NC_021026	CTA	2	6	1231191	1231196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535067
19972	NC_021026	AT	3	6	1231231	1231236	50 %	50 %	0 %	0 %	480535067
19973	NC_021026	GTT	2	6	1231244	1231249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535067
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