MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_021026	AGA	2	6	1168701	1168706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535008
19002	NC_021026	GGTG	2	8	1168899	1168906	0 %	25 %	75 %	0 %	480535009
19003	NC_021026	C	7	7	1168927	1168933	0 %	0 %	0 %	100 %	480535009
19004	NC_021026	CAT	2	6	1168972	1168977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535009
19005	NC_021026	TAG	2	6	1169144	1169149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535009
19006	NC_021026	TCA	3	9	1169193	1169201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535009
19007	NC_021026	CCACC	2	10	1169220	1169229	20 %	0 %	0 %	80 %	480535009
19008	NC_021026	CAT	2	6	1169231	1169236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535009
19009	NC_021026	TGAC	2	8	1169322	1169329	25 %	25 %	25 %	25 %	480535009
19010	NC_021026	TTC	2	6	1169354	1169359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535009
19011	NC_021026	TAG	2	6	1169375	1169380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535009
19012	NC_021026	GCA	2	6	1169391	1169396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535009
19013	NC_021026	ATC	2	6	1169447	1169452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535009
19014	NC_021026	ATG	2	6	1169454	1169459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535009
19015	NC_021026	AACCA	2	10	1169630	1169639	60 %	0 %	0 %	40 %	480535009
19016	NC_021026	AACC	2	8	1169665	1169672	50 %	0 %	0 %	50 %	480535009
19017	NC_021026	CAA	2	6	1169680	1169685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535009
19018	NC_021026	CAA	2	6	1169711	1169716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535009
19019	NC_021026	TTGC	2	8	1169736	1169743	0 %	50 %	25 %	25 %	480535009
19020	NC_021026	ACA	2	6	1169755	1169760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535009
19021	NC_021026	ATA	2	6	1169860	1169865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535010
19022	NC_021026	ACA	2	6	1169905	1169910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535010
19023	NC_021026	ATTTT	2	10	1169938	1169947	20 %	80 %	0 %	0 %	480535010
19024	NC_021026	CTC	2	6	1169961	1169966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535010
19025	NC_021026	CTGCAA	2	12	1170014	1170025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480535010
19026	NC_021026	CTG	2	6	1170074	1170079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535010
19027	NC_021026	GCC	2	6	1170091	1170096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535010
19028	NC_021026	TCAA	2	8	1170166	1170173	50 %	25 %	0 %	25 %	480535010
19029	NC_021026	CCT	2	6	1170227	1170232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535010
19030	NC_021026	ACA	2	6	1170283	1170288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535010
19031	NC_021026	AAT	2	6	1170309	1170314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535010
19032	NC_021026	CTTG	2	8	1170440	1170447	0 %	50 %	25 %	25 %	480535011
19033	NC_021026	GAA	2	6	1170558	1170563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535011
19034	NC_021026	CGATT	2	10	1170584	1170593	20 %	40 %	20 %	20 %	480535011
19035	NC_021026	TTC	2	6	1170601	1170606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535011
19036	NC_021026	CTT	2	6	1170636	1170641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535011
19037	NC_021026	ATT	2	6	1170711	1170716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535011
19038	NC_021026	CAAGA	2	10	1170816	1170825	60 %	0 %	20 %	20 %	480535011
19039	NC_021026	TGG	2	6	1170914	1170919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535011
19040	NC_021026	ATT	2	6	1170959	1170964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535011
19041	NC_021026	AGAAA	2	10	1171061	1171070	80 %	0 %	20 %	0 %	480535011
19042	NC_021026	A	6	6	1171068	1171073	100 %	0 %	0 %	0 %	480535011
19043	NC_021026	AAAT	2	8	1171082	1171089	75 %	25 %	0 %	0 %	480535011
19044	NC_021026	TTC	2	6	1171608	1171613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535012
19045	NC_021026	GAAA	2	8	1171647	1171654	75 %	0 %	25 %	0 %	480535012
19046	NC_021026	G	8	8	1171656	1171663	0 %	0 %	100 %	0 %	480535012
19047	NC_021026	CTG	2	6	1171670	1171675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535012
19048	NC_021026	TTG	2	6	1171715	1171720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535012
19049	NC_021026	CCA	2	6	1171768	1171773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535012
19050	NC_021026	ATC	2	6	1171792	1171797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535012
19051	NC_021026	GTT	2	6	1171882	1171887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535012
19052	NC_021026	TGC	2	6	1171899	1171904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535012
19053	NC_021026	AAAAGG	2	12	1171917	1171928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535012
19054	NC_021026	CATTC	2	10	1171941	1171950	20 %	40 %	0 %	40 %	480535012
19055	NC_021026	GGT	2	6	1171966	1171971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535012
19056	NC_021026	CTTGG	2	10	1171990	1171999	0 %	40 %	40 %	20 %	480535012
19057	NC_021026	GGT	2	6	1172068	1172073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535012
19058	NC_021026	CCTT	2	8	1172261	1172268	0 %	50 %	0 %	50 %	480535012
19059	NC_021026	TGG	2	6	1172430	1172435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535012
19060	NC_021026	TCA	2	6	1172525	1172530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535012
19061	NC_021026	CTTGGA	2	12	1172551	1172562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	480535012
19062	NC_021026	ATC	2	6	1172626	1172631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535012
19063	NC_021026	TCT	2	6	1172873	1172878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535013
19064	NC_021026	TTC	2	6	1172884	1172889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535013
19065	NC_021026	CCA	2	6	1172956	1172961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535013
19066	NC_021026	CTC	2	6	1172990	1172995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535013
19067	NC_021026	CAT	2	6	1173030	1173035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19068	NC_021026	TCC	2	6	1173060	1173065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535013
19069	NC_021026	TCA	2	6	1173116	1173121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19070	NC_021026	TGA	2	6	1173182	1173187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535013
19071	NC_021026	CGA	2	6	1173200	1173205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535013
19072	NC_021026	CAG	2	6	1173221	1173226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535013
19073	NC_021026	ACG	2	6	1173231	1173236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535013
19074	NC_021026	TTC	2	6	1173273	1173278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535013
19075	NC_021026	TTG	2	6	1173355	1173360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535013
19076	NC_021026	ATC	2	6	1173373	1173378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19077	NC_021026	TCT	2	6	1173464	1173469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535013
19078	NC_021026	TCAA	2	8	1173517	1173524	50 %	25 %	0 %	25 %	480535013
19079	NC_021026	T	6	6	1173596	1173601	0 %	100 %	0 %	0 %	480535013
19080	NC_021026	ACAG	2	8	1173646	1173653	50 %	0 %	25 %	25 %	480535013
19081	NC_021026	AGC	2	6	1173654	1173659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535013
19082	NC_021026	ACC	2	6	1173660	1173665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480535013
19083	NC_021026	GCT	2	6	1173742	1173747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535013
19084	NC_021026	CAAG	2	8	1173773	1173780	50 %	0 %	25 %	25 %	480535013
19085	NC_021026	TCAT	2	8	1173820	1173827	25 %	50 %	0 %	25 %	480535013
19086	NC_021026	GAG	2	6	1173828	1173833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535013
19087	NC_021026	TCA	2	6	1173835	1173840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19088	NC_021026	ATCA	2	8	1173861	1173868	50 %	25 %	0 %	25 %	480535013
19089	NC_021026	TGT	2	6	1173970	1173975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535013
19090	NC_021026	CCG	2	6	1174019	1174024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535013
19091	NC_021026	ATC	2	6	1174027	1174032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19092	NC_021026	TCT	2	6	1174048	1174053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535013
19093	NC_021026	TTG	2	6	1174063	1174068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535013
19094	NC_021026	GTT	2	6	1174087	1174092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535013
19095	NC_021026	ACCA	2	8	1174110	1174117	50 %	0 %	0 %	50 %	480535013
19096	NC_021026	ATG	3	9	1174120	1174128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535013
19097	NC_021026	TCA	2	6	1174192	1174197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535013
19098	NC_021026	TAA	2	6	1174205	1174210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535013
19099	NC_021026	ACA	2	6	1174288	1174293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535013
19100	NC_021026	GGCAA	2	10	1174294	1174303	40 %	0 %	40 %	20 %	480535013
19101	NC_021026	T	6	6	1174374	1174379	0 %	100 %	0 %	0 %	480535013
19102	NC_021026	TAT	2	6	1174453	1174458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535014
19103	NC_021026	ATC	2	6	1174496	1174501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535014
19104	NC_021026	GAC	2	6	1174630	1174635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535014
19105	NC_021026	CTC	2	6	1174646	1174651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535014
19106	NC_021026	ATC	2	6	1174673	1174678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535014
19107	NC_021026	GTA	2	6	1174682	1174687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535014
19108	NC_021026	TA	3	6	1174694	1174699	50 %	50 %	0 %	0 %	480535014
19109	NC_021026	T	6	6	1174762	1174767	0 %	100 %	0 %	0 %	480535014
19110	NC_021026	AGCT	2	8	1174933	1174940	25 %	25 %	25 %	25 %	480535015
19111	NC_021026	ACTATC	2	12	1175023	1175034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535015
19112	NC_021026	TCA	2	6	1175076	1175081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535015
19113	NC_021026	TAA	2	6	1175103	1175108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535015
19114	NC_021026	TTTTCC	2	12	1175114	1175125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535015
19115	NC_021026	CAT	2	6	1175175	1175180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535015
19116	NC_021026	TCA	2	6	1175207	1175212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535015
19117	NC_021026	AAT	2	6	1175364	1175369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535016
19118	NC_021026	ATC	2	6	1175373	1175378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535016
19119	NC_021026	AAC	2	6	1175425	1175430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535016
19120	NC_021026	TC	3	6	1175476	1175481	0 %	50 %	0 %	50 %	480535016
19121	NC_021026	ACG	2	6	1175507	1175512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535016
19122	NC_021026	GAA	2	6	1175529	1175534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535016
19123	NC_021026	GGAAT	2	10	1175546	1175555	40 %	20 %	40 %	0 %	480535016
19124	NC_021026	TC	3	6	1175565	1175570	0 %	50 %	0 %	50 %	480535016
19125	NC_021026	GCT	2	6	1175583	1175588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535016
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19127	NC_021026	TAA	2	6	1175771	1175776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535016
19128	NC_021026	TCC	2	6	1175887	1175892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535016
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19130	NC_021026	CCT	2	6	1176104	1176109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535016
19131	NC_021026	A	7	7	1176121	1176127	100 %	0 %	0 %	0 %	480535016
19132	NC_021026	TGAC	2	8	1176136	1176143	25 %	25 %	25 %	25 %	480535016
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19134	NC_021026	TGA	2	6	1176166	1176171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535016
19135	NC_021026	ATCGC	2	10	1176224	1176233	20 %	20 %	20 %	40 %	480535016
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19138	NC_021026	CT	3	6	1176453	1176458	0 %	50 %	0 %	50 %	480535016
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19144	NC_021026	GA	3	6	1176809	1176814	50 %	0 %	50 %	0 %	480535017
19145	NC_021026	CATG	2	8	1176950	1176957	25 %	25 %	25 %	25 %	480535017
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19147	NC_021026	GAA	2	6	1177059	1177064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535017
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19202	NC_021026	ATG	3	9	1180018	1180026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535023
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19208	NC_021026	TGC	2	6	1180334	1180339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535023
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19211	NC_021026	ATCC	2	8	1180500	1180507	25 %	25 %	0 %	50 %	480535023
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19218	NC_021026	ATCC	2	8	1180739	1180746	25 %	25 %	0 %	50 %	480535024
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19222	NC_021026	CAA	2	6	1180945	1180950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535024
19223	NC_021026	A	6	6	1180949	1180954	100 %	0 %	0 %	0 %	480535024
19224	NC_021026	AAT	2	6	1180965	1180970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535024
19225	NC_021026	AT	3	6	1182370	1182375	50 %	50 %	0 %	0 %	480535025
19226	NC_021026	TCC	2	6	1182426	1182431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535025
19227	NC_021026	GAA	2	6	1182440	1182445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535025
19228	NC_021026	GAA	2	6	1182494	1182499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535025
19229	NC_021026	CTGAGC	2	12	1182519	1182530	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	480535025
19230	NC_021026	TTTC	2	8	1182537	1182544	0 %	75 %	0 %	25 %	480535025
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19232	NC_021026	CTG	2	6	1182849	1182854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535025
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19234	NC_021026	TGG	2	6	1182958	1182963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535025
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19349	NC_021026	CTT	2	6	1196212	1196217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535037
19350	NC_021026	TTC	2	6	1196234	1196239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535037
19351	NC_021026	CTT	2	6	1196260	1196265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535037
19352	NC_021026	CAA	2	6	1196287	1196292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535037
19353	NC_021026	CTT	2	6	1196302	1196307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535037
19354	NC_021026	AAGACC	2	12	1196309	1196320	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	480535037
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19356	NC_021026	GAAT	2	8	1196387	1196394	50 %	25 %	25 %	0 %	480535037
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19454	NC_021026	TAA	2	6	1201654	1201659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535041
19455	NC_021026	TTTC	2	8	1201810	1201817	0 %	75 %	0 %	25 %	480535041
19456	NC_021026	ACT	2	6	1201822	1201827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535041
19457	NC_021026	AG	3	6	1201830	1201835	50 %	0 %	50 %	0 %	480535041
19458	NC_021026	ACAATG	2	12	1201859	1201870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	480535041
19459	NC_021026	ATTG	2	8	1201983	1201990	25 %	50 %	25 %	0 %	480535041
19460	NC_021026	GGTA	2	8	1202007	1202014	25 %	25 %	50 %	0 %	480535041
19461	NC_021026	CTG	2	6	1202060	1202065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535041
19462	NC_021026	CTG	2	6	1202127	1202132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535041
19463	NC_021026	CAA	2	6	1202250	1202255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535041
19464	NC_021026	ATA	2	6	1202355	1202360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535041
19465	NC_021026	TAAG	2	8	1202437	1202444	50 %	25 %	25 %	0 %	480535042
19466	NC_021026	ATAG	2	8	1202448	1202455	50 %	25 %	25 %	0 %	480535042
19467	NC_021026	AAG	2	6	1202499	1202504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535042
19468	NC_021026	GCC	2	6	1202527	1202532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480535042
19469	NC_021026	GAACGA	2	12	1202582	1202593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	480535042
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19481	NC_021026	GATA	2	8	1203127	1203134	50 %	25 %	25 %	0 %	480535042
19482	NC_021026	ATA	2	6	1203154	1203159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535042
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19492	NC_021026	GCA	2	6	1203932	1203937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535043
19493	NC_021026	T	6	6	1203958	1203963	0 %	100 %	0 %	0 %	480535043
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19500	NC_021026	ACCG	2	8	1204426	1204433	25 %	0 %	25 %	50 %	480535043

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