MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021026	T	6	6	1108676	1108681	0 %	100 %	0 %	0 %	480534956
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18003	NC_021026	TC	3	6	1108744	1108749	0 %	50 %	0 %	50 %	480534957
18004	NC_021026	CAA	2	6	1108772	1108777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534957
18005	NC_021026	TCA	2	6	1108783	1108788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534957
18006	NC_021026	ACCA	2	8	1108851	1108858	50 %	0 %	0 %	50 %	480534957
18007	NC_021026	GTC	2	6	1108871	1108876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534957
18008	NC_021026	T	6	6	1108941	1108946	0 %	100 %	0 %	0 %	480534957
18009	NC_021026	TGA	2	6	1108955	1108960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534957
18010	NC_021026	TTG	2	6	1108967	1108972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534957
18011	NC_021026	ATT	2	6	1108989	1108994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534958
18012	NC_021026	CAT	2	6	1109017	1109022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534958
18013	NC_021026	TTC	2	6	1109023	1109028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534958
18014	NC_021026	TCT	2	6	1109060	1109065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534958
18015	NC_021026	TCT	2	6	1109111	1109116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534958
18016	NC_021026	TAG	2	6	1109223	1109228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534958
18017	NC_021026	TTCT	2	8	1109317	1109324	0 %	75 %	0 %	25 %	480534959
18018	NC_021026	TCT	2	6	1109478	1109483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534959
18019	NC_021026	GTT	2	6	1109562	1109567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534959
18020	NC_021026	CAT	2	6	1109607	1109612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534959
18021	NC_021026	ATC	2	6	1109707	1109712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534959
18022	NC_021026	CAT	2	6	1109745	1109750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534959
18023	NC_021026	GGTTTT	2	12	1109788	1109799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534959
18024	NC_021026	GAA	2	6	1109825	1109830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534959
18025	NC_021026	CCATA	2	10	1109895	1109904	40 %	20 %	0 %	40 %	480534959
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18031	NC_021026	CTT	3	9	1110160	1110168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534960
18032	NC_021026	TGT	2	6	1110252	1110257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534960
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18034	NC_021026	ACC	2	6	1110296	1110301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534960
18035	NC_021026	ATC	2	6	1110402	1110407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534960
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18039	NC_021026	T	6	6	1110563	1110568	0 %	100 %	0 %	0 %	480534960
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18045	NC_021026	TTCG	2	8	1110856	1110863	0 %	50 %	25 %	25 %	480534960
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18053	NC_021026	CTT	2	6	1111109	1111114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534960
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18055	NC_021026	TGAG	2	8	1111227	1111234	25 %	25 %	50 %	0 %	480534960
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18058	NC_021026	TGAT	2	8	1111347	1111354	25 %	50 %	25 %	0 %	480534960
18059	NC_021026	TAA	2	6	1111391	1111396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534960
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18063	NC_021026	ATT	2	6	1111482	1111487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534960
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18067	NC_021026	CG	3	6	1111640	1111645	0 %	0 %	50 %	50 %	480534961
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18089	NC_021026	CAT	2	6	1112868	1112873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534962
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18101	NC_021026	TCC	2	6	1113367	1113372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534962
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18115	NC_021026	TCAA	2	8	1114976	1114983	50 %	25 %	0 %	25 %	480534963
18116	NC_021026	TTG	2	6	1114997	1115002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534963
18117	NC_021026	GCAT	2	8	1115015	1115022	25 %	25 %	25 %	25 %	480534963
18118	NC_021026	CAC	2	6	1115076	1115081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534963
18119	NC_021026	CAG	2	6	1115082	1115087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534963
18120	NC_021026	CAC	2	6	1115088	1115093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534963
18121	NC_021026	TCG	2	6	1115324	1115329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534963
18122	NC_021026	ACA	2	6	1115351	1115356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534963
18123	NC_021026	CAA	2	6	1115358	1115363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534963
18124	NC_021026	TTCA	2	8	1115405	1115412	25 %	50 %	0 %	25 %	480534963
18125	NC_021026	GTTT	2	8	1115765	1115772	0 %	75 %	25 %	0 %	480534964
18126	NC_021026	CCTAA	2	10	1115810	1115819	40 %	20 %	0 %	40 %	480534964
18127	NC_021026	TACCAA	2	12	1115833	1115844	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	480534964
18128	NC_021026	AAGC	2	8	1115983	1115990	50 %	0 %	25 %	25 %	480534964
18129	NC_021026	ATC	2	6	1115994	1115999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534964
18130	NC_021026	TTC	2	6	1116010	1116015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534964
18131	NC_021026	TGA	2	6	1116019	1116024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534964
18132	NC_021026	GGAAT	2	10	1116076	1116085	40 %	20 %	40 %	0 %	480534964
18133	NC_021026	CTA	2	6	1116087	1116092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534964
18134	NC_021026	CTG	2	6	1116113	1116118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534964
18135	NC_021026	ATC	2	6	1116135	1116140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534964
18136	NC_021026	ATC	2	6	1116188	1116193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534964
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18141	NC_021026	A	7	7	1116411	1116417	100 %	0 %	0 %	0 %	480534965
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18144	NC_021026	ATTT	2	8	1116575	1116582	25 %	75 %	0 %	0 %	480534965
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18148	NC_021026	CTA	2	6	1116796	1116801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534965
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18152	NC_021026	A	6	6	1116878	1116883	100 %	0 %	0 %	0 %	480534965
18153	NC_021026	T	6	6	1116911	1116916	0 %	100 %	0 %	0 %	480534966
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18156	NC_021026	ATT	2	6	1117019	1117024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534966
18157	NC_021026	ACGATT	2	12	1117088	1117099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480534966
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18159	NC_021026	CTTA	2	8	1117197	1117204	25 %	50 %	0 %	25 %	480534966
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18191	NC_021026	T	6	6	1119398	1119403	0 %	100 %	0 %	0 %	480534970
18192	NC_021026	GC	3	6	1119418	1119423	0 %	0 %	50 %	50 %	480534970
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18216	NC_021026	CAT	2	6	1120236	1120241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534971
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18218	NC_021026	CT	3	6	1120302	1120307	0 %	50 %	0 %	50 %	480534971
18219	NC_021026	TAAA	2	8	1120318	1120325	75 %	25 %	0 %	0 %	480534971
18220	NC_021026	CAT	2	6	1120363	1120368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534972
18221	NC_021026	GCC	2	6	1120382	1120387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	480534972
18222	NC_021026	CTT	2	6	1120413	1120418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534972
18223	NC_021026	TTGT	2	8	1120459	1120466	0 %	75 %	25 %	0 %	480534972
18224	NC_021026	TTTC	2	8	1120539	1120546	0 %	75 %	0 %	25 %	480534972
18225	NC_021026	CGG	2	6	1120604	1120609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	480534972
18226	NC_021026	ATG	2	6	1120661	1120666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534972
18227	NC_021026	AGC	2	6	1120687	1120692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534972
18228	NC_021026	CGTT	2	8	1120718	1120725	0 %	50 %	25 %	25 %	480534972
18229	NC_021026	CCTT	2	8	1120736	1120743	0 %	50 %	0 %	50 %	480534972
18230	NC_021026	TCCG	2	8	1120856	1120863	0 %	25 %	25 %	50 %	480534972
18231	NC_021026	AGT	2	6	1120920	1120925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534972
18232	NC_021026	T	7	7	1120979	1120985	0 %	100 %	0 %	0 %	480534972
18233	NC_021026	TCA	2	6	1121015	1121020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534972
18234	NC_021026	CGGA	2	8	1121035	1121042	25 %	0 %	50 %	25 %	480534972
18235	NC_021026	TGA	2	6	1121150	1121155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534972
18236	NC_021026	CTC	2	6	1121170	1121175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534972
18237	NC_021026	ATC	2	6	1121317	1121322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534972
18238	NC_021026	GAA	2	6	1121326	1121331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534972
18239	NC_021026	AGG	2	6	1121347	1121352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534972
18240	NC_021026	TCCA	2	8	1121368	1121375	25 %	25 %	0 %	50 %	480534972
18241	NC_021026	AAT	2	6	1121385	1121390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534972
18242	NC_021026	CCTT	2	8	1121480	1121487	0 %	50 %	0 %	50 %	480534972
18243	NC_021026	TTC	2	6	1121506	1121511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534972
18244	NC_021026	GTC	2	6	1121551	1121556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534972
18245	NC_021026	GT	3	6	1121569	1121574	0 %	50 %	50 %	0 %	480534972
18246	NC_021026	ACCTG	2	10	1121612	1121621	20 %	20 %	20 %	40 %	480534972
18247	NC_021026	A	6	6	1121662	1121667	100 %	0 %	0 %	0 %	480534972
18248	NC_021026	CAT	2	6	1121907	1121912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534972
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18250	NC_021026	TAA	2	6	1122026	1122031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534972
18251	NC_021026	TAG	2	6	1122035	1122040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534972
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18253	NC_021026	C	6	6	1122221	1122226	0 %	0 %	0 %	100 %	480534972
18254	NC_021026	CCA	2	6	1122237	1122242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534972
18255	NC_021026	TGAT	2	8	1122317	1122324	25 %	50 %	25 %	0 %	480534972
18256	NC_021026	TCTT	2	8	1122420	1122427	0 %	75 %	0 %	25 %	480534973
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18261	NC_021026	ACTA	2	8	1122572	1122579	50 %	25 %	0 %	25 %	480534973
18262	NC_021026	CCA	2	6	1122823	1122828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534973
18263	NC_021026	CTT	2	6	1122829	1122834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534973
18264	NC_021026	CTG	2	6	1122835	1122840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534973
18265	NC_021026	GAC	2	6	1122872	1122877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534973
18266	NC_021026	ACC	2	6	1122933	1122938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534973
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18269	NC_021026	TC	3	6	1123009	1123014	0 %	50 %	0 %	50 %	480534973
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18342	NC_021026	CTTT	2	8	1127575	1127582	0 %	75 %	0 %	25 %	480534976
18343	NC_021026	GACT	2	8	1127599	1127606	25 %	25 %	25 %	25 %	480534976
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18345	NC_021026	TC	3	6	1127713	1127718	0 %	50 %	0 %	50 %	480534976
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18351	NC_021026	A	7	7	1128067	1128073	100 %	0 %	0 %	0 %	480534976
18352	NC_021026	GATTA	2	10	1128110	1128119	40 %	40 %	20 %	0 %	480534977
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18355	NC_021026	CAAT	2	8	1128192	1128199	50 %	25 %	0 %	25 %	480534977
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18467	NC_021026	TAA	2	6	1133778	1133783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534980
18468	NC_021026	TCA	2	6	1133785	1133790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534980
18469	NC_021026	CTT	2	6	1133815	1133820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534980
18470	NC_021026	TAAA	2	8	1133873	1133880	75 %	25 %	0 %	0 %	480534980
18471	NC_021026	GCTT	2	8	1133928	1133935	0 %	50 %	25 %	25 %	480534980
18472	NC_021026	TTGAT	2	10	1133946	1133955	20 %	60 %	20 %	0 %	480534980
18473	NC_021026	TTG	2	6	1134005	1134010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534980
18474	NC_021026	TTTCT	2	10	1134025	1134034	0 %	80 %	0 %	20 %	480534980
18475	NC_021026	CTT	2	6	1134064	1134069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534980
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18482	NC_021026	ATC	2	6	1134770	1134775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534981
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18488	NC_021026	T	6	6	1135048	1135053	0 %	100 %	0 %	0 %	480534981
18489	NC_021026	TG	3	6	1135116	1135121	0 %	50 %	50 %	0 %	480534981
18490	NC_021026	ATA	2	6	1135779	1135784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534982
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18492	NC_021026	TCC	2	6	1135917	1135922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534982
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18494	NC_021026	ACC	2	6	1135983	1135988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534982
18495	NC_021026	TAG	2	6	1136048	1136053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534982
18496	NC_021026	TTCT	2	8	1136133	1136140	0 %	75 %	0 %	25 %	480534982
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18500	NC_021026	ATTT	2	8	1136489	1136496	25 %	75 %	0 %	0 %	480534982

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