MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_021026	A	6	6	1049603	1049608	100 %	0 %	0 %	0 %	480534907
17003	NC_021026	TTGA	2	8	1049627	1049634	25 %	50 %	25 %	0 %	480534907
17004	NC_021026	GA	3	6	1049678	1049683	50 %	0 %	50 %	0 %	480534907
17005	NC_021026	CGT	2	6	1049768	1049773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534907
17006	NC_021026	ACT	2	6	1049785	1049790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534907
17007	NC_021026	GCT	2	6	1049792	1049797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534907
17008	NC_021026	ATGGT	2	10	1049811	1049820	20 %	40 %	40 %	0 %	480534907
17009	NC_021026	AT	3	6	1049824	1049829	50 %	50 %	0 %	0 %	480534907
17010	NC_021026	GAA	2	6	1049843	1049848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534907
17011	NC_021026	ACA	2	6	1049857	1049862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534907
17012	NC_021026	AAT	2	6	1050071	1050076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480534907
17013	NC_021026	AG	3	6	1050183	1050188	50 %	0 %	50 %	0 %	480534907
17014	NC_021026	A	6	6	1050248	1050253	100 %	0 %	0 %	0 %	480534907
17015	NC_021026	CTA	2	6	1050707	1050712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534908
17016	NC_021026	TTG	2	6	1050773	1050778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534908
17017	NC_021026	TAG	2	6	1050794	1050799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534908
17018	NC_021026	TTG	2	6	1050845	1050850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534908
17019	NC_021026	GCTA	2	8	1050951	1050958	25 %	25 %	25 %	25 %	480534908
17020	NC_021026	AAG	2	6	1051006	1051011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534908
17021	NC_021026	AGAA	2	8	1051037	1051044	75 %	0 %	25 %	0 %	480534908
17022	NC_021026	TGA	2	6	1051112	1051117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534908
17023	NC_021026	TGT	2	6	1051143	1051148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534908
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17026	NC_021026	GCTG	2	8	1051365	1051372	0 %	25 %	50 %	25 %	480534908
17027	NC_021026	CAAA	2	8	1051380	1051387	75 %	0 %	0 %	25 %	480534908
17028	NC_021026	GAA	3	9	1051396	1051404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534908
17029	NC_021026	ATT	2	6	1051414	1051419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534908
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17032	NC_021026	T	7	7	1051602	1051608	0 %	100 %	0 %	0 %	480534909
17033	NC_021026	TGA	2	6	1051765	1051770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534909
17034	NC_021026	AAG	2	6	1051995	1052000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534909
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17036	NC_021026	CT	3	6	1052105	1052110	0 %	50 %	0 %	50 %	480534909
17037	NC_021026	GCA	3	9	1052114	1052122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534909
17038	NC_021026	TAG	2	6	1052127	1052132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534909
17039	NC_021026	TGA	2	6	1052146	1052151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534909
17040	NC_021026	TGA	2	6	1052154	1052159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534909
17041	NC_021026	CAG	2	6	1052171	1052176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534909
17042	NC_021026	CTA	2	6	1052196	1052201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534909
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17044	NC_021026	GGA	2	6	1052338	1052343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534910
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17051	NC_021026	A	6	6	1052684	1052689	100 %	0 %	0 %	0 %	480534910
17052	NC_021026	TGG	2	6	1052767	1052772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534910
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17055	NC_021026	GCA	2	6	1052876	1052881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534910
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17083	NC_021026	A	6	6	1054875	1054880	100 %	0 %	0 %	0 %	480534911
17084	NC_021026	AAGAAA	2	12	1054890	1054901	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	480534911
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17088	NC_021026	CAT	2	6	1055023	1055028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534911
17089	NC_021026	CAA	2	6	1055030	1055035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534911
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17091	NC_021026	ATG	2	6	1055136	1055141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534911
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17094	NC_021026	T	7	7	1055272	1055278	0 %	100 %	0 %	0 %	480534911
17095	NC_021026	CT	3	6	1055281	1055286	0 %	50 %	0 %	50 %	480534911
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17099	NC_021026	TGA	2	6	1055498	1055503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534911
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17102	NC_021026	GCA	2	6	1055726	1055731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534912
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17108	NC_021026	T	8	8	1056012	1056019	0 %	100 %	0 %	0 %	480534912
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17117	NC_021026	TTC	2	6	1056430	1056435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534912
17118	NC_021026	GAC	2	6	1056450	1056455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534912
17119	NC_021026	CAA	2	6	1056456	1056461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534912
17120	NC_021026	TTC	2	6	1056529	1056534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534912
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17221	NC_021026	A	6	6	1062073	1062078	100 %	0 %	0 %	0 %	480534917
17222	NC_021026	AAGG	2	8	1062147	1062154	50 %	0 %	50 %	0 %	480534917
17223	NC_021026	CAT	2	6	1062215	1062220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534917
17224	NC_021026	ATAGCC	2	12	1062256	1062267	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	480534917
17225	NC_021026	TCCT	2	8	1062432	1062439	0 %	50 %	0 %	50 %	480534917
17226	NC_021026	TAAA	2	8	1062503	1062510	75 %	25 %	0 %	0 %	480534917
17227	NC_021026	CAGAA	2	10	1062513	1062522	60 %	0 %	20 %	20 %	480534917
17228	NC_021026	CAAG	2	8	1062527	1062534	50 %	0 %	25 %	25 %	480534917
17229	NC_021026	ACCAGC	2	12	1062561	1062572	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	480534917
17230	NC_021026	CAA	2	6	1062717	1062722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534917
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17232	NC_021026	CTG	2	6	1062776	1062781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534917
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