MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN994038 draft genome

Total Repeats: 32667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021026	GAGG	2	8	1016173	1016180	25 %	0 %	75 %	0 %	480534893
16502	NC_021026	TTC	2	6	1016260	1016265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534893
16503	NC_021026	AGA	2	6	1016301	1016306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534893
16504	NC_021026	ATT	2	6	1016349	1016354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534893
16505	NC_021026	AAG	2	6	1016391	1016396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534893
16506	NC_021026	TAT	2	6	1016462	1016467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534893
16507	NC_021026	TGCAG	2	10	1016591	1016600	20 %	20 %	40 %	20 %	480534894
16508	NC_021026	GACA	2	8	1016689	1016696	50 %	0 %	25 %	25 %	480534894
16509	NC_021026	TAT	2	6	1016735	1016740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534894
16510	NC_021026	TCG	2	6	1016780	1016785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534894
16511	NC_021026	TTGT	2	8	1016809	1016816	0 %	75 %	25 %	0 %	480534894
16512	NC_021026	TTTC	2	8	1016836	1016843	0 %	75 %	0 %	25 %	480534894
16513	NC_021026	GAT	2	6	1016861	1016866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534894
16514	NC_021026	TTG	2	6	1016878	1016883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534894
16515	NC_021026	GTG	2	6	1016949	1016954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534894
16516	NC_021026	TCCT	2	8	1017033	1017040	0 %	50 %	0 %	50 %	480534894
16517	NC_021026	T	6	6	1017092	1017097	0 %	100 %	0 %	0 %	480534894
16518	NC_021026	TTCC	2	8	1017120	1017127	0 %	50 %	0 %	50 %	480534894
16519	NC_021026	GA	3	6	1017170	1017175	50 %	0 %	50 %	0 %	480534894
16520	NC_021026	TCT	2	6	1017232	1017237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534894
16521	NC_021026	T	6	6	1017267	1017272	0 %	100 %	0 %	0 %	480534894
16522	NC_021026	CAT	2	6	1017365	1017370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534894
16523	NC_021026	CTAG	2	8	1017381	1017388	25 %	25 %	25 %	25 %	480534894
16524	NC_021026	ATG	2	6	1017453	1017458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534894
16525	NC_021026	TTTC	2	8	1017477	1017484	0 %	75 %	0 %	25 %	480534894
16526	NC_021026	T	6	6	1017537	1017542	0 %	100 %	0 %	0 %	480534894
16527	NC_021026	CTATT	2	10	1017610	1017619	20 %	60 %	0 %	20 %	480534894
16528	NC_021026	TC	3	6	1017665	1017670	0 %	50 %	0 %	50 %	480534894
16529	NC_021026	GTG	2	6	1017691	1017696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534894
16530	NC_021026	ATC	2	6	1017699	1017704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534894
16531	NC_021026	TTTA	2	8	1017720	1017727	25 %	75 %	0 %	0 %	480534894
16532	NC_021026	GAAT	2	8	1017861	1017868	50 %	25 %	25 %	0 %	480534895
16533	NC_021026	TGG	2	6	1018027	1018032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534895
16534	NC_021026	TCA	2	6	1018063	1018068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534895
16535	NC_021026	GAG	2	6	1018106	1018111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480534895
16536	NC_021026	TATC	2	8	1018188	1018195	25 %	50 %	0 %	25 %	480534895
16537	NC_021026	AGA	2	6	1018312	1018317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16538	NC_021026	GCA	2	6	1018430	1018435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16539	NC_021026	CAG	2	6	1018458	1018463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16540	NC_021026	AAG	2	6	1018500	1018505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16541	NC_021026	AAC	2	6	1018554	1018559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480534895
16542	NC_021026	AAG	2	6	1018626	1018631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16543	NC_021026	AAG	2	6	1018704	1018709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16544	NC_021026	CTG	2	6	1018761	1018766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16545	NC_021026	AAG	2	6	1018773	1018778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16546	NC_021026	TA	3	6	1018944	1018949	50 %	50 %	0 %	0 %	480534895
16547	NC_021026	CAT	2	6	1018960	1018965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534895
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16549	NC_021026	TTG	2	6	1019054	1019059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534895
16550	NC_021026	TTG	2	6	1019181	1019186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534895
16551	NC_021026	TGC	2	6	1019197	1019202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16552	NC_021026	AAG	2	6	1019241	1019246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534895
16553	NC_021026	TCC	2	6	1019253	1019258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480534895
16554	NC_021026	GCT	2	6	1019285	1019290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16555	NC_021026	TTTGG	2	10	1019345	1019354	0 %	60 %	40 %	0 %	480534895
16556	NC_021026	GAAA	2	8	1019536	1019543	75 %	0 %	25 %	0 %	480534895
16557	NC_021026	GTA	2	6	1019576	1019581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534895
16558	NC_021026	GACC	2	8	1019707	1019714	25 %	0 %	25 %	50 %	480534895
16559	NC_021026	TCG	2	6	1019715	1019720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534895
16560	NC_021026	A	6	6	1019916	1019921	100 %	0 %	0 %	0 %	480534896
16561	NC_021026	CATT	2	8	1019941	1019948	25 %	50 %	0 %	25 %	480534896
16562	NC_021026	AGA	2	6	1020028	1020033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534896
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16564	NC_021026	GAT	2	6	1020185	1020190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
16565	NC_021026	TTA	2	6	1020196	1020201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480534896
16566	NC_021026	AAAATC	2	12	1020237	1020248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	480534896
16567	NC_021026	ATC	2	6	1020288	1020293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534896
16568	NC_021026	GCT	2	6	1020401	1020406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534896
16569	NC_021026	ATG	2	6	1020408	1020413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
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16571	NC_021026	GAA	2	6	1020506	1020511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534896
16572	NC_021026	GGTA	2	8	1020517	1020524	25 %	25 %	50 %	0 %	480534896
16573	NC_021026	TCA	2	6	1020553	1020558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534896
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16577	NC_021026	GAT	2	6	1020995	1021000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
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16582	NC_021026	TCT	2	6	1021240	1021245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480534896
16583	NC_021026	AATAT	2	10	1021260	1021269	60 %	40 %	0 %	0 %	480534896
16584	NC_021026	ATG	2	6	1021302	1021307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
16585	NC_021026	GAT	2	6	1021321	1021326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
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16588	NC_021026	ATG	2	6	1021818	1021823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
16589	NC_021026	AG	3	6	1021826	1021831	50 %	0 %	50 %	0 %	480534896
16590	NC_021026	ATG	2	6	1021974	1021979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534896
16591	NC_021026	CAT	2	6	1021988	1021993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534896
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16593	NC_021026	ATC	2	6	1022783	1022788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534897
16594	NC_021026	CAAT	2	8	1022815	1022822	50 %	25 %	0 %	25 %	480534897
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16596	NC_021026	TGA	2	6	1022867	1022872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534897
16597	NC_021026	A	6	6	1022980	1022985	100 %	0 %	0 %	0 %	480534897
16598	NC_021026	AAG	2	6	1023004	1023009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534897
16599	NC_021026	AGC	2	6	1023026	1023031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534897
16600	NC_021026	AGT	2	6	1023041	1023046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480534897
16601	NC_021026	CAG	2	6	1023052	1023057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534897
16602	NC_021026	TGC	2	6	1023071	1023076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534897
16603	NC_021026	GGT	3	9	1023114	1023122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534897
16604	NC_021026	GCA	2	6	1023129	1023134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480534897
16605	NC_021026	AAAC	2	8	1023140	1023147	75 %	0 %	0 %	25 %	480534897
16606	NC_021026	TGT	2	6	1023152	1023157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534897
16607	NC_021026	CGT	2	6	1023159	1023164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480534897
16608	NC_021026	CCA	2	6	1023273	1023278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	480534897
16609	NC_021026	TTG	2	6	1023303	1023308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534897
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16611	NC_021026	AAG	2	6	1023403	1023408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534897
16612	NC_021026	TCA	2	6	1023415	1023420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480534897
16613	NC_021026	TGG	2	6	1023494	1023499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480534897
16614	NC_021026	AGA	2	6	1023521	1023526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480534897
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16616	NC_021026	TTG	2	6	1023556	1023561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480534897
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16733	NC_021026	ATAA	2	8	1032376	1032383	75 %	25 %	0 %	0 %	480534902
16734	NC_021026	ATTT	2	8	1032483	1032490	25 %	75 %	0 %	0 %	480534902
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